FuNGI

A0A074RU11

Protein Details

Accession

A0A074RU11

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
716-735	KPPETPKKSRGGRGRGRGGG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
596-632	EKGKDREKDKEGGGKRGKNRQKEKMPAAVGPKSPKPA
717-739	PPETPKKSRGGRGRGRGGGAVSK
777-811	RGEGGGGSGRGRGGRVRGRGRGGGGGGGKGAGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MFAPPPQDPPFLSNYVYDHHSDVYVVKSCQHERGRGLLAVAGESRVEVLLRDSSQRFLSLTPIASFHVGATVIALDWSPEAVSPNSSDNWNIELGVACADGNMRILRKTPQSPPTGEIRVFGGGTTGHSARISSLAFSSAREGMHVASVGEDCNLLIWNLSKRIKTEDDPDSSMDLGDDQQDQDQAPSAYPIAFSHPLQDVIAHDANARVLLVADSRGTVSLVDWAGAEAEEDAPDGWHRQRVVELMDPRRVAEGITGVRTSGVPMNSSLGGGADWKPDDPNLIGATYGSRWMIWDLRRVQGGKPVATGEGFLSGGHRFRWCPTDENLFAVSTTSPVPGAAIKVYHISFPGATIMSSAAKPEPPSKSKTKSSRTKQSAGGNTPRLKVVVRRLPPNLPETIFWQSVAQWVTDESSSWKLYVPGKLRTKLNRENTPSRAYVEFTTPEAVVVFNRDYNGHVFRDKQGNESVVVVEYAPYQKVPHEKRKADGKIGTIEADEDFISFLEALNKPAEPTTDVNELVVHATTTTTEPMSTPLLDALKAAKEANTIKGYHSHYRDQPAQSRHRTHDLDDAETFNRKAPLKGQQDANPPETKETEKGKDREKDKEGGGKRGKNRQKEKMPAAVGPKSPKPASATPQQPPTPSRAESSRARPPASAAVGMNARVLAALGGGAPSGRKGGKQRDPSASDPPTSEPAPASTPAVPLPAGVLAMPAGVKPPETPKKSRGGRGRGRGGGAVSKESKEGGSGGSAATALVDMPRIDDPGQALPPVASTQRGRGEGGGGSGRGRGGRVRGRGRGGGGGGGKGAGRGGGEPSPSAGQT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.28
3	0.29
4	0.27
5	0.24
6	0.22
7	0.21
8	0.19
9	0.19
10	0.21
11	0.23
12	0.22
13	0.24
14	0.29
15	0.32
16	0.4
17	0.45
18	0.46
19	0.44
20	0.5
21	0.51
22	0.46
23	0.43
24	0.36
25	0.31
26	0.26
27	0.23
28	0.17
29	0.12
30	0.11
31	0.11
32	0.09
33	0.08
34	0.07
35	0.09
36	0.13
37	0.14
38	0.2
39	0.21
40	0.24
41	0.25
42	0.26
43	0.24
44	0.2
45	0.24
46	0.22
47	0.23
48	0.21
49	0.21
50	0.21
51	0.21
52	0.21
53	0.16
54	0.15
55	0.12
56	0.11
57	0.1
58	0.09
59	0.07
60	0.07
61	0.07
62	0.05
63	0.05
64	0.06
65	0.05
66	0.06
67	0.09
68	0.09
69	0.11
70	0.13
71	0.16
72	0.17
73	0.18
74	0.19
75	0.18
76	0.19
77	0.18
78	0.16
79	0.14
80	0.13
81	0.12
82	0.12
83	0.1
84	0.08
85	0.07
86	0.07
87	0.07
88	0.09
89	0.11
90	0.12
91	0.13
92	0.15
93	0.21
94	0.28
95	0.34
96	0.4
97	0.45
98	0.5
99	0.52
100	0.53
101	0.55
102	0.53
103	0.47
104	0.39
105	0.34
106	0.3
107	0.26
108	0.23
109	0.16
110	0.11
111	0.12
112	0.15
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.13
117	0.13
118	0.16
119	0.14
120	0.11
121	0.12
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.17
126	0.16
127	0.15
128	0.15
129	0.15
130	0.13
131	0.14
132	0.13
133	0.1
134	0.09
135	0.1
136	0.09
137	0.09
138	0.08
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.06
143	0.06
144	0.09
145	0.12
146	0.2
147	0.24
148	0.24
149	0.26
150	0.32
151	0.36
152	0.37
153	0.41
154	0.41
155	0.42
156	0.43
157	0.43
158	0.38
159	0.33
160	0.3
161	0.23
162	0.16
163	0.11
164	0.1
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.11
169	0.11
170	0.1
171	0.13
172	0.11
173	0.11
174	0.11
175	0.11
176	0.1
177	0.1
178	0.11
179	0.13
180	0.15
181	0.15
182	0.17
183	0.18
184	0.19
185	0.18
186	0.19
187	0.14
188	0.18
189	0.19
190	0.16
191	0.15
192	0.14
193	0.14
194	0.14
195	0.12
196	0.06
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.06
223	0.08
224	0.09
225	0.12
226	0.13
227	0.13
228	0.15
229	0.17
230	0.19
231	0.24
232	0.3
233	0.31
234	0.36
235	0.35
236	0.34
237	0.33
238	0.29
239	0.23
240	0.16
241	0.16
242	0.13
243	0.15
244	0.14
245	0.13
246	0.14
247	0.13
248	0.14
249	0.13
250	0.12
251	0.1
252	0.11
253	0.13
254	0.13
255	0.13
256	0.11
257	0.08
258	0.07
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.09
264	0.1
265	0.1
266	0.11
267	0.1
268	0.12
269	0.11
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.1
274	0.09
275	0.09
276	0.07
277	0.06
278	0.07
279	0.09
280	0.13
281	0.14
282	0.21
283	0.22
284	0.25
285	0.28
286	0.29
287	0.28
288	0.3
289	0.32
290	0.25
291	0.24
292	0.22
293	0.19
294	0.18
295	0.17
296	0.11
297	0.09
298	0.08
299	0.07
300	0.08
301	0.08
302	0.09
303	0.09
304	0.11
305	0.1
306	0.12
307	0.17
308	0.17
309	0.2
310	0.23
311	0.3
312	0.29
313	0.31
314	0.3
315	0.25
316	0.23
317	0.2
318	0.16
319	0.09
320	0.09
321	0.07
322	0.06
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.08
336	0.09
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.07
346	0.08
347	0.1
348	0.14
349	0.19
350	0.21
351	0.27
352	0.33
353	0.38
354	0.46
355	0.54
356	0.59
357	0.63
358	0.69
359	0.75
360	0.74
361	0.72
362	0.69
363	0.68
364	0.65
365	0.6
366	0.58
367	0.54
368	0.5
369	0.46
370	0.41
371	0.34
372	0.28
373	0.26
374	0.28
375	0.29
376	0.3
377	0.34
378	0.37
379	0.39
380	0.4
381	0.39
382	0.32
383	0.25
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.2
388	0.19
389	0.16
390	0.14
391	0.17
392	0.16
393	0.12
394	0.08
395	0.08
396	0.09
397	0.08
398	0.09
399	0.07
400	0.1
401	0.1
402	0.1
403	0.11
404	0.13
405	0.15
406	0.21
407	0.23
408	0.28
409	0.33
410	0.37
411	0.42
412	0.45
413	0.51
414	0.53
415	0.57
416	0.57
417	0.58
418	0.61
419	0.6
420	0.58
421	0.5
422	0.44
423	0.37
424	0.31
425	0.25
426	0.21
427	0.18
428	0.15
429	0.15
430	0.13
431	0.12
432	0.1
433	0.09
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.07
438	0.08
439	0.08
440	0.09
441	0.12
442	0.15
443	0.14
444	0.15
445	0.16
446	0.19
447	0.26
448	0.25
449	0.25
450	0.25
451	0.24
452	0.23
453	0.22
454	0.19
455	0.12
456	0.12
457	0.09
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.07
464	0.09
465	0.18
466	0.25
467	0.35
468	0.43
469	0.45
470	0.5
471	0.59
472	0.61
473	0.58
474	0.54
475	0.46
476	0.4
477	0.39
478	0.34
479	0.24
480	0.21
481	0.15
482	0.13
483	0.1
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.05
488	0.05
489	0.05
490	0.08
491	0.09
492	0.1
493	0.11
494	0.11
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.11
499	0.12
500	0.15
501	0.17
502	0.17
503	0.16
504	0.16
505	0.16
506	0.13
507	0.12
508	0.08
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.06
513	0.07
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.09
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.1
528	0.1
529	0.09
530	0.12
531	0.13
532	0.18
533	0.19
534	0.19
535	0.19
536	0.25
537	0.3
538	0.33
539	0.36
540	0.37
541	0.38
542	0.44
543	0.49
544	0.48
545	0.5
546	0.52
547	0.57
548	0.59
549	0.61
550	0.59
551	0.61
552	0.58
553	0.52
554	0.52
555	0.45
556	0.4
557	0.36
558	0.34
559	0.27
560	0.28
561	0.26
562	0.2
563	0.23
564	0.2
565	0.2
566	0.22
567	0.31
568	0.35
569	0.4
570	0.43
571	0.44
572	0.52
573	0.55
574	0.55
575	0.48
576	0.42
577	0.4
578	0.37
579	0.34
580	0.3
581	0.32
582	0.35
583	0.4
584	0.44
585	0.5
586	0.56
587	0.57
588	0.6
589	0.59
590	0.56
591	0.52
592	0.57
593	0.52
594	0.55
595	0.59
596	0.57
597	0.59
598	0.65
599	0.69
600	0.7
601	0.75
602	0.75
603	0.77
604	0.79
605	0.78
606	0.76
607	0.72
608	0.66
609	0.63
610	0.58
611	0.52
612	0.48
613	0.45
614	0.42
615	0.39
616	0.38
617	0.37
618	0.37
619	0.38
620	0.42
621	0.47
622	0.46
623	0.54
624	0.54
625	0.51
626	0.47
627	0.48
628	0.44
629	0.38
630	0.37
631	0.32
632	0.35
633	0.38
634	0.44
635	0.48
636	0.48
637	0.48
638	0.45
639	0.44
640	0.45
641	0.4
642	0.36
643	0.26
644	0.25
645	0.24
646	0.24
647	0.22
648	0.15
649	0.12
650	0.09
651	0.09
652	0.05
653	0.04
654	0.03
655	0.03
656	0.03
657	0.03
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.07
662	0.08
663	0.12
664	0.2
665	0.3
666	0.4
667	0.49
668	0.56
669	0.62
670	0.67
671	0.67
672	0.69
673	0.62
674	0.55
675	0.47
676	0.44
677	0.39
678	0.34
679	0.31
680	0.22
681	0.21
682	0.22
683	0.22
684	0.21
685	0.18
686	0.19
687	0.18
688	0.19
689	0.16
690	0.13
691	0.13
692	0.1
693	0.09
694	0.07
695	0.07
696	0.05
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.07
701	0.07
702	0.08
703	0.09
704	0.19
705	0.29
706	0.35
707	0.42
708	0.45
709	0.56
710	0.62
711	0.7
712	0.7
713	0.71
714	0.75
715	0.79
716	0.82
717	0.75
718	0.7
719	0.63
720	0.55
721	0.5
722	0.43
723	0.39
724	0.33
725	0.29
726	0.28
727	0.27
728	0.24
729	0.19
730	0.18
731	0.13
732	0.12
733	0.11
734	0.1
735	0.1
736	0.1
737	0.08
738	0.07
739	0.06
740	0.05
741	0.05
742	0.06
743	0.06
744	0.08
745	0.09
746	0.12
747	0.12
748	0.14
749	0.16
750	0.2
751	0.21
752	0.19
753	0.19
754	0.16
755	0.17
756	0.18
757	0.17
758	0.17
759	0.18
760	0.24
761	0.3
762	0.32
763	0.32
764	0.3
765	0.32
766	0.27
767	0.29
768	0.25
769	0.2
770	0.18
771	0.18
772	0.19
773	0.17
774	0.17
775	0.17
776	0.23
777	0.3
778	0.39
779	0.46
780	0.52
781	0.57
782	0.59
783	0.58
784	0.54
785	0.47
786	0.43
787	0.36
788	0.3
789	0.24
790	0.21
791	0.19
792	0.14
793	0.13
794	0.09
795	0.08
796	0.08
797	0.11
798	0.13
799	0.15
800	0.15
801	0.18

A0A074RU11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer