Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CB24

Protein Details
Accession Q6CB24    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
500-531PAPKKDVKESRDKKDKKEKPRLPPSRKKLLDMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
459-527PPSRASSKGPPVPPPSRGKSPMPQISRVKSPAPPPPPSRNSPAPKKDVKESRDKKDKKEKPRLPPSRKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 13.5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030125  SPIN90/Ldb17  
IPR018556  SPIN90/Ldb17_LRD  
Gene Ontology GO:0030479  C:actin cortical patch  
GO:0071933  F:Arp2/3 complex binding  
GO:0000147  P:actin cortical patch assembly  
GO:0051666  P:actin cortical patch localization  
GO:0006897  P:endocytosis  
KEGG yli:YALI0C22462g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09431  SPIN90_LRD  
Amino Acid Sequences METLLESLMSSVSDEPLLAPDISIPPEEDGDMSDSDFWTKLLDIVSVKTHSYPVVESALKDYLLFATKHLSDFLVSDNDLFRAGYKLTTSPIFTLHKAFTRRKLIAMLTLAEEYTDLAAVVSLILLIDSDSHPATLEMMQEENACHALTRLLLTFQKTSALRLRRVLLELTFEMCKIQRISTSDLENISDKFIDSLLRTVVNADRDDTSLYDASVMKVLLCLNEQYMIAAYDEDEESGIYSSKVLDLISLDIDGYVEFGAKLVLLLNRAIDTCLQIMGLKLLYLLFTNEPTYEYFYTNDLLVLIDVFIRELHDLPNDEEQLINTYLRVLHPLMVNSQIRHEPYKIEGLTDVLEMLSGHKGSSTFLPVSETTLRLAVRCLGVPWLEYTFPSPMSTVPPSPSSSIGSFNEEESPSKIRVPSIGMTDFSGTRRLSQSSLGTNSAMSSTTSLISSLKLAPPPPPSRASSKGPPVPPPSRGKSPMPQISRVKSPAPPPPPSRNSPAPKKDVKESRDKKDKKEKPRLPPSRKKLLDMSIRNTSVGDLSVAERE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.1
4 0.13
5 0.11
6 0.11
7 0.12
8 0.14
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.16
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.13
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.12
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.11
29 0.14
30 0.13
31 0.16
32 0.2
33 0.2
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.19
39 0.18
40 0.16
41 0.2
42 0.21
43 0.2
44 0.23
45 0.24
46 0.22
47 0.21
48 0.18
49 0.15
50 0.18
51 0.18
52 0.14
53 0.18
54 0.19
55 0.2
56 0.2
57 0.18
58 0.15
59 0.16
60 0.18
61 0.16
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.15
75 0.18
76 0.19
77 0.17
78 0.22
79 0.24
80 0.24
81 0.26
82 0.27
83 0.31
84 0.37
85 0.42
86 0.45
87 0.51
88 0.51
89 0.49
90 0.5
91 0.45
92 0.43
93 0.4
94 0.33
95 0.25
96 0.24
97 0.22
98 0.17
99 0.16
100 0.1
101 0.08
102 0.06
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.02
112 0.02
113 0.03
114 0.04
115 0.05
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.08
138 0.1
139 0.12
140 0.15
141 0.16
142 0.15
143 0.2
144 0.19
145 0.23
146 0.28
147 0.31
148 0.32
149 0.35
150 0.37
151 0.34
152 0.35
153 0.33
154 0.26
155 0.24
156 0.22
157 0.2
158 0.18
159 0.15
160 0.15
161 0.13
162 0.16
163 0.13
164 0.13
165 0.15
166 0.18
167 0.23
168 0.26
169 0.28
170 0.27
171 0.26
172 0.27
173 0.24
174 0.21
175 0.17
176 0.13
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.11
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.14
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.04
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.13
285 0.12
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.03
293 0.04
294 0.03
295 0.04
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.08
300 0.09
301 0.11
302 0.14
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.09
314 0.11
315 0.08
316 0.1
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.18
321 0.19
322 0.17
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.22
327 0.22
328 0.17
329 0.18
330 0.25
331 0.22
332 0.2
333 0.18
334 0.17
335 0.17
336 0.15
337 0.13
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.14
353 0.14
354 0.18
355 0.18
356 0.18
357 0.15
358 0.17
359 0.17
360 0.14
361 0.15
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.11
367 0.11
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.13
377 0.12
378 0.11
379 0.15
380 0.18
381 0.18
382 0.19
383 0.21
384 0.22
385 0.23
386 0.24
387 0.23
388 0.21
389 0.24
390 0.23
391 0.25
392 0.23
393 0.23
394 0.24
395 0.22
396 0.22
397 0.21
398 0.22
399 0.19
400 0.21
401 0.21
402 0.18
403 0.19
404 0.22
405 0.21
406 0.23
407 0.24
408 0.22
409 0.22
410 0.23
411 0.22
412 0.19
413 0.22
414 0.17
415 0.19
416 0.21
417 0.22
418 0.21
419 0.24
420 0.27
421 0.28
422 0.31
423 0.29
424 0.27
425 0.25
426 0.24
427 0.2
428 0.17
429 0.11
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.13
439 0.15
440 0.17
441 0.18
442 0.22
443 0.31
444 0.35
445 0.37
446 0.38
447 0.39
448 0.43
449 0.48
450 0.51
451 0.5
452 0.55
453 0.59
454 0.58
455 0.62
456 0.64
457 0.63
458 0.64
459 0.64
460 0.61
461 0.62
462 0.63
463 0.62
464 0.62
465 0.66
466 0.68
467 0.65
468 0.67
469 0.66
470 0.66
471 0.67
472 0.63
473 0.57
474 0.52
475 0.54
476 0.55
477 0.54
478 0.58
479 0.58
480 0.64
481 0.67
482 0.68
483 0.69
484 0.7
485 0.72
486 0.74
487 0.76
488 0.74
489 0.76
490 0.75
491 0.77
492 0.77
493 0.73
494 0.74
495 0.73
496 0.75
497 0.78
498 0.79
499 0.8
500 0.82
501 0.85
502 0.85
503 0.88
504 0.87
505 0.87
506 0.92
507 0.93
508 0.92
509 0.94
510 0.91
511 0.91
512 0.85
513 0.79
514 0.76
515 0.74
516 0.73
517 0.7
518 0.68
519 0.66
520 0.64
521 0.58
522 0.51
523 0.42
524 0.33
525 0.26
526 0.2
527 0.12