Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A074S558

Protein Details
Accession A0A074S558    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-168GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
458-461KRRK
963-979SRRGGGGRGRGGRGGPP
Subcellular Location(s) cyto 9, cyto_nucl 8, nucl 5, E.R. 5, mito 2, pero 2, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MTPSGPDLVIVGGLSRDQVELLTVLRLVQSTIVCSLVRLYLGVPALFRWLSKKYPKIVAQVVEEEPTRIEDADGNLVELPLDTSSPNPNGFELDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEVFNYTDRVVSMARPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKEEERKESIKMFEALGHPVSEETTRKPWDSNAITPGTPFMDLLAQSLRYWVVQKQNSDPGWKNLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFADSNKNCCRICGQEGHFAARCTGKPKEKDTSKPPEKKPFIFLDVAVLREYLAIELNVPNTPFPFDLERALDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKDELPRMGGYLAEHGQANKANVQIMLEGLAKREDEIFRKRREAEERQEQNAKRRKVEQQRAKEREQDAQLVEVTPAPASSGPHGLPSRPSFDVFTGSSLPNNPTFAGSNSDVVANRAALRLANLSAADAMRAELAGAAPLKPTSRATLTETEPTDPEPPAVTDAPTPEQIAEPQPEPEIAAPESAEPESSKDMDMTVDSESGNNETPDGPVDALIASAVNDAGADDGPRGVKRSAEAMEKDDSDTPADDEESGAKRALKVNPDGTVDQEDTVKLWEPGYKERYYRSKFGAELGDTELRKQITTSYMEGLCWVLQYYYQGAPSWTWFYPYHFAPFAADFEDVEHMDINFNLGQPFKPYEQLMGVFPAASRVHIPMPFQSLMTDEESPIIDFYPSEFEIDMNGKKMSWQGVALLPFIDEKRLLGAMAERYPRLNDDEVRRNKWGCNHIYVSDGNDLYDFFCGLYTKRKSEKPIPLDTRLSRGISGTVLYDPSCVPESSYPSPLTKVGLPDIVANRTLSAQFYYPRQITPHRSVLLPGVRLAPKALGQADAEHVMRGGESRRGGGGRGRGGRGGPPRDAGFVSSTGGYSDRPGAYDRNGSRFSQYDSYNGGYGSGYAGNGGSGGSGGYGGSGGGGGGSGGEYGGYGGGGYGGDGGYRGNDGYRGGGRGGGRGGYNGYDRGSAQRGAPRGGPPRGGNRGGYNGSGGYGGGGGYGGYGGRGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.09
9 0.1
10 0.09
11 0.09
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.14
24 0.14
25 0.12
26 0.11
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.18
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.21
37 0.29
38 0.38
39 0.45
40 0.47
41 0.56
42 0.62
43 0.65
44 0.67
45 0.64
46 0.59
47 0.56
48 0.51
49 0.45
50 0.39
51 0.32
52 0.26
53 0.23
54 0.2
55 0.15
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.21
60 0.21
61 0.19
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.14
66 0.13
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.09
71 0.15
72 0.18
73 0.2
74 0.2
75 0.2
76 0.22
77 0.22
78 0.23
79 0.2
80 0.19
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.14
85 0.14
86 0.11
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.09
93 0.12
94 0.16
95 0.19
96 0.19
97 0.25
98 0.31
99 0.34
100 0.39
101 0.38
102 0.38
103 0.37
104 0.4
105 0.34
106 0.31
107 0.27
108 0.23
109 0.21
110 0.16
111 0.14
112 0.1
113 0.09
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.1
121 0.14
122 0.24
123 0.32
124 0.35
125 0.38
126 0.39
127 0.41
128 0.42
129 0.41
130 0.33
131 0.27
132 0.27
133 0.24
134 0.24
135 0.2
136 0.2
137 0.16
138 0.15
139 0.12
140 0.13
141 0.19
142 0.26
143 0.36
144 0.44
145 0.54
146 0.65
147 0.72
148 0.78
149 0.8
150 0.77
151 0.73
152 0.74
153 0.74
154 0.72
155 0.75
156 0.7
157 0.66
158 0.68
159 0.64
160 0.6
161 0.58
162 0.53
163 0.49
164 0.49
165 0.48
166 0.45
167 0.46
168 0.43
169 0.36
170 0.33
171 0.31
172 0.27
173 0.28
174 0.25
175 0.22
176 0.17
177 0.16
178 0.17
179 0.15
180 0.16
181 0.17
182 0.23
183 0.26
184 0.27
185 0.28
186 0.29
187 0.36
188 0.39
189 0.39
190 0.38
191 0.38
192 0.36
193 0.35
194 0.34
195 0.26
196 0.21
197 0.16
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.14
209 0.16
210 0.24
211 0.27
212 0.31
213 0.35
214 0.43
215 0.44
216 0.49
217 0.48
218 0.45
219 0.47
220 0.45
221 0.42
222 0.35
223 0.36
224 0.29
225 0.27
226 0.23
227 0.17
228 0.15
229 0.14
230 0.12
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.15
242 0.19
243 0.26
244 0.35
245 0.38
246 0.39
247 0.47
248 0.54
249 0.56
250 0.59
251 0.62
252 0.6
253 0.62
254 0.66
255 0.6
256 0.61
257 0.54
258 0.45
259 0.36
260 0.29
261 0.25
262 0.23
263 0.19
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.06
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.04
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.11
279 0.13
280 0.13
281 0.17
282 0.19
283 0.21
284 0.21
285 0.22
286 0.2
287 0.21
288 0.21
289 0.2
290 0.19
291 0.23
292 0.23
293 0.26
294 0.24
295 0.23
296 0.26
297 0.27
298 0.31
299 0.34
300 0.35
301 0.4
302 0.41
303 0.45
304 0.43
305 0.38
306 0.36
307 0.3
308 0.27
309 0.24
310 0.3
311 0.33
312 0.36
313 0.41
314 0.5
315 0.53
316 0.6
317 0.64
318 0.68
319 0.71
320 0.76
321 0.78
322 0.79
323 0.78
324 0.73
325 0.7
326 0.63
327 0.57
328 0.49
329 0.41
330 0.37
331 0.32
332 0.3
333 0.24
334 0.19
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.09
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.14
353 0.16
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.18
358 0.16
359 0.12
360 0.11
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.07
387 0.05
388 0.08
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.13
394 0.16
395 0.18
396 0.18
397 0.2
398 0.2
399 0.21
400 0.2
401 0.17
402 0.14
403 0.15
404 0.13
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.12
416 0.1
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.11
426 0.12
427 0.15
428 0.25
429 0.31
430 0.34
431 0.39
432 0.41
433 0.45
434 0.51
435 0.54
436 0.53
437 0.57
438 0.58
439 0.58
440 0.64
441 0.6
442 0.61
443 0.61
444 0.56
445 0.48
446 0.49
447 0.54
448 0.57
449 0.66
450 0.66
451 0.69
452 0.77
453 0.79
454 0.76
455 0.74
456 0.65
457 0.6
458 0.53
459 0.45
460 0.35
461 0.3
462 0.27
463 0.2
464 0.18
465 0.13
466 0.11
467 0.07
468 0.06
469 0.05
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.17
479 0.19
480 0.21
481 0.2
482 0.21
483 0.18
484 0.18
485 0.2
486 0.17
487 0.17
488 0.15
489 0.14
490 0.14
491 0.14
492 0.15
493 0.13
494 0.13
495 0.12
496 0.1
497 0.11
498 0.11
499 0.14
500 0.14
501 0.14
502 0.13
503 0.14
504 0.13
505 0.13
506 0.12
507 0.08
508 0.08
509 0.07
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.05
532 0.05
533 0.06
534 0.07
535 0.08
536 0.09
537 0.1
538 0.12
539 0.15
540 0.19
541 0.21
542 0.24
543 0.24
544 0.23
545 0.21
546 0.21
547 0.19
548 0.15
549 0.14
550 0.1
551 0.09
552 0.11
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.09
561 0.09
562 0.1
563 0.11
564 0.12
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.08
573 0.08
574 0.07
575 0.07
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.06
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.08
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.07
600 0.08
601 0.08
602 0.07
603 0.06
604 0.06
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.03
610 0.03
611 0.03
612 0.03
613 0.03
614 0.03
615 0.03
616 0.03
617 0.03
618 0.03
619 0.04
620 0.05
621 0.06
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.09
626 0.13
627 0.15
628 0.18
629 0.2
630 0.2
631 0.22
632 0.22
633 0.22
634 0.2
635 0.18
636 0.14
637 0.13
638 0.11
639 0.09
640 0.09
641 0.08
642 0.07
643 0.09
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.12
649 0.17
650 0.2
651 0.21
652 0.23
653 0.24
654 0.25
655 0.28
656 0.27
657 0.24
658 0.23
659 0.2
660 0.17
661 0.15
662 0.13
663 0.1
664 0.11
665 0.1
666 0.08
667 0.08
668 0.1
669 0.11
670 0.18
671 0.23
672 0.24
673 0.25
674 0.3
675 0.4
676 0.42
677 0.44
678 0.41
679 0.4
680 0.38
681 0.4
682 0.38
683 0.29
684 0.26
685 0.25
686 0.26
687 0.22
688 0.22
689 0.22
690 0.18
691 0.17
692 0.16
693 0.14
694 0.13
695 0.16
696 0.17
697 0.17
698 0.17
699 0.17
700 0.18
701 0.17
702 0.13
703 0.1
704 0.09
705 0.05
706 0.05
707 0.07
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.1
712 0.11
713 0.11
714 0.13
715 0.16
716 0.13
717 0.16
718 0.16
719 0.19
720 0.22
721 0.22
722 0.24
723 0.21
724 0.21
725 0.19
726 0.19
727 0.17
728 0.15
729 0.14
730 0.1
731 0.1
732 0.12
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.08
739 0.08
740 0.07
741 0.08
742 0.08
743 0.08
744 0.08
745 0.11
746 0.14
747 0.14
748 0.16
749 0.16
750 0.16
751 0.18
752 0.19
753 0.17
754 0.15
755 0.14
756 0.12
757 0.11
758 0.13
759 0.12
760 0.11
761 0.11
762 0.11
763 0.14
764 0.15
765 0.17
766 0.15
767 0.2
768 0.2
769 0.19
770 0.17
771 0.16
772 0.17
773 0.19
774 0.17
775 0.12
776 0.13
777 0.13
778 0.13
779 0.12
780 0.1
781 0.07
782 0.06
783 0.07
784 0.1
785 0.1
786 0.11
787 0.11
788 0.1
789 0.12
790 0.16
791 0.16
792 0.14
793 0.14
794 0.13
795 0.13
796 0.16
797 0.16
798 0.14
799 0.13
800 0.13
801 0.16
802 0.18
803 0.17
804 0.15
805 0.13
806 0.13
807 0.13
808 0.12
809 0.09
810 0.08
811 0.09
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.11
816 0.14
817 0.18
818 0.2
819 0.19
820 0.2
821 0.21
822 0.22
823 0.23
824 0.23
825 0.23
826 0.29
827 0.39
828 0.45
829 0.49
830 0.52
831 0.5
832 0.49
833 0.51
834 0.52
835 0.46
836 0.45
837 0.44
838 0.4
839 0.41
840 0.39
841 0.35
842 0.3
843 0.26
844 0.19
845 0.16
846 0.16
847 0.13
848 0.13
849 0.1
850 0.06
851 0.06
852 0.07
853 0.08
854 0.17
855 0.21
856 0.28
857 0.34
858 0.39
859 0.46
860 0.55
861 0.64
862 0.62
863 0.68
864 0.68
865 0.68
866 0.71
867 0.65
868 0.6
869 0.54
870 0.48
871 0.37
872 0.31
873 0.26
874 0.19
875 0.18
876 0.14
877 0.11
878 0.11
879 0.11
880 0.11
881 0.1
882 0.12
883 0.14
884 0.12
885 0.14
886 0.16
887 0.23
888 0.25
889 0.3
890 0.29
891 0.28
892 0.3
893 0.29
894 0.28
895 0.23
896 0.22
897 0.21
898 0.2
899 0.19
900 0.22
901 0.24
902 0.24
903 0.22
904 0.2
905 0.18
906 0.18
907 0.18
908 0.14
909 0.13
910 0.14
911 0.15
912 0.18
913 0.24
914 0.24
915 0.25
916 0.29
917 0.34
918 0.4
919 0.45
920 0.49
921 0.44
922 0.43
923 0.43
924 0.46
925 0.44
926 0.37
927 0.31
928 0.3
929 0.29
930 0.29
931 0.29
932 0.23
933 0.19
934 0.21
935 0.21
936 0.16
937 0.16
938 0.17
939 0.18
940 0.2
941 0.18
942 0.15
943 0.14
944 0.12
945 0.11
946 0.12
947 0.12
948 0.14
949 0.15
950 0.16
951 0.19
952 0.19
953 0.21
954 0.24
955 0.28
956 0.31
957 0.36
958 0.36
959 0.35
960 0.36
961 0.41
962 0.45
963 0.43
964 0.37
965 0.36
966 0.36
967 0.37
968 0.36
969 0.31
970 0.25
971 0.21
972 0.2
973 0.16
974 0.15
975 0.13
976 0.14
977 0.12
978 0.12
979 0.16
980 0.15
981 0.15
982 0.18
983 0.2
984 0.23
985 0.32
986 0.33
987 0.36
988 0.39
989 0.38
990 0.4
991 0.39
992 0.41
993 0.38
994 0.36
995 0.32
996 0.33
997 0.34
998 0.31
999 0.28
1000 0.23
1001 0.17
1002 0.16
1003 0.15
1004 0.11
1005 0.09
1006 0.08
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.05
1012 0.04
1013 0.04
1014 0.03
1015 0.04
1016 0.04
1017 0.04
1018 0.04
1019 0.03
1020 0.03
1021 0.03
1022 0.03
1023 0.03
1024 0.03
1025 0.03
1026 0.03
1027 0.03
1028 0.03
1029 0.03
1030 0.03
1031 0.03
1032 0.03
1033 0.04
1034 0.04
1035 0.03
1036 0.03
1037 0.04
1038 0.04
1039 0.04
1040 0.04
1041 0.04
1042 0.04
1043 0.05
1044 0.05
1045 0.05
1046 0.06
1047 0.07
1048 0.07
1049 0.09
1050 0.09
1051 0.14
1052 0.16
1053 0.18
1054 0.17
1055 0.21
1056 0.21
1057 0.22
1058 0.23
1059 0.21
1060 0.19
1061 0.18
1062 0.19
1063 0.18
1064 0.2
1065 0.19
1066 0.19
1067 0.18
1068 0.19
1069 0.23
1070 0.25
1071 0.24
1072 0.26
1073 0.3
1074 0.32
1075 0.34
1076 0.37
1077 0.4
1078 0.44
1079 0.47
1080 0.49
1081 0.48
1082 0.54
1083 0.59
1084 0.58
1085 0.54
1086 0.5
1087 0.52
1088 0.48
1089 0.44
1090 0.37
1091 0.29
1092 0.26
1093 0.23
1094 0.18
1095 0.11
1096 0.09
1097 0.08
1098 0.06
1099 0.05
1100 0.04
1101 0.04
1102 0.05
1103 0.04