Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A066W5E7

Protein Details
Accession A0A066W5E7    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-31SIYNQQRTNRQVLKRHRKDPPSLVMHHydrophilic
408-433SSKPAAKGKKTTKKKSSQPQQQQDTDHydrophilic
447-466ASAAKPKKMSKKAKAAEEKAHydrophilic
486-511AEQASKAKSKKKCSVKKKGAAKTATAHydrophilic
539-560ADSATKGKKKSAVKKVPAKGSAHydrophilic
581-616QGKQQCKCSRINCRCSYNRQHRRKRRRLKCKLPHRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-422PAAKGKKTTKKK
450-506AKPKKMSKKAKAAEEKAAKVAAENAAAEKAEKERKEAEQASKAKSKKKCSVKKKGAA
544-558KGKKKSAVKKVPAKG
601-613HRRKRRRLKCKLP
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATSASIYNQQRTNRQVLKRHRKDPPSLVMHLNNGHFRFERQSGIFTFDSPARAFLDCIRQQRVPVDLLDILVQSNVAFYEGCLIIEVHDHRPPSLGSSSSDPLPSSTLQRLSLGTASSSLLDRSRHPLYGNSSARRRAQAEARGSSISTGPEIYRVVLHATGETVWQDIKDLDAELGPGGVPVWTDEEALRVEAKVLALTSPPLCLTPDPHASKIANIMLAATAPSIAYNPPAHLTPPFYRDRDSRGVKRGLMNSVEAEEQAFKRRRRDLIMRLMEKGTAGQSEITRPLPGVISSAGIAASAIAAQRANGEDGNVPGLTATASSIFAPTFSRLGFIEHFREAKAANDKAGVPRPGGIGFGGANVGIAGGAGGAGSVVAPNNSTARSTSTAAANDSTTSVAVTAADASSKPAAKGKKTTKKKSSQPQQQQDTDASTTAGSPLAEEPASAAKPKKMSKKAKAAEEKAAKVAAENAAAEKAEKERKEAEQASKAKSKKKCSVKKKGAAKTATASSPADTSLGGADEVPATPVSEAASLAPADSATKGKKKSAVKKVPAKGSAGRNNAQHMLAESPSQIKAQVQGKQQCKCSRINCRCSYNRQHRRKRRRLKCKLPHRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.63
3 0.67
4 0.73
5 0.79
6 0.82
7 0.85
8 0.85
9 0.85
10 0.86
11 0.85
12 0.84
13 0.79
14 0.74
15 0.71
16 0.64
17 0.6
18 0.56
19 0.51
20 0.48
21 0.42
22 0.42
23 0.36
24 0.35
25 0.37
26 0.34
27 0.37
28 0.31
29 0.35
30 0.32
31 0.37
32 0.35
33 0.29
34 0.3
35 0.25
36 0.27
37 0.23
38 0.23
39 0.2
40 0.2
41 0.2
42 0.21
43 0.29
44 0.32
45 0.37
46 0.41
47 0.4
48 0.42
49 0.44
50 0.43
51 0.35
52 0.3
53 0.28
54 0.23
55 0.22
56 0.21
57 0.17
58 0.14
59 0.11
60 0.11
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.1
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.15
74 0.19
75 0.18
76 0.21
77 0.22
78 0.21
79 0.23
80 0.23
81 0.23
82 0.23
83 0.2
84 0.2
85 0.24
86 0.26
87 0.26
88 0.27
89 0.22
90 0.2
91 0.21
92 0.2
93 0.19
94 0.22
95 0.23
96 0.23
97 0.24
98 0.24
99 0.23
100 0.24
101 0.2
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.14
110 0.16
111 0.21
112 0.23
113 0.24
114 0.25
115 0.29
116 0.32
117 0.41
118 0.46
119 0.47
120 0.49
121 0.53
122 0.56
123 0.55
124 0.51
125 0.46
126 0.47
127 0.48
128 0.5
129 0.47
130 0.46
131 0.42
132 0.39
133 0.35
134 0.28
135 0.21
136 0.14
137 0.13
138 0.1
139 0.11
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.09
148 0.1
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.12
195 0.15
196 0.24
197 0.26
198 0.27
199 0.3
200 0.29
201 0.29
202 0.3
203 0.26
204 0.18
205 0.14
206 0.13
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.05
211 0.04
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.11
223 0.16
224 0.16
225 0.21
226 0.25
227 0.25
228 0.28
229 0.29
230 0.34
231 0.38
232 0.42
233 0.43
234 0.46
235 0.48
236 0.47
237 0.5
238 0.47
239 0.41
240 0.35
241 0.3
242 0.24
243 0.21
244 0.19
245 0.14
246 0.12
247 0.1
248 0.09
249 0.17
250 0.23
251 0.24
252 0.3
253 0.36
254 0.39
255 0.44
256 0.51
257 0.51
258 0.55
259 0.61
260 0.57
261 0.54
262 0.51
263 0.44
264 0.36
265 0.28
266 0.18
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.04
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.14
330 0.16
331 0.2
332 0.18
333 0.17
334 0.18
335 0.19
336 0.21
337 0.26
338 0.23
339 0.17
340 0.17
341 0.18
342 0.17
343 0.16
344 0.13
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.01
360 0.01
361 0.01
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.02
366 0.03
367 0.04
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.1
373 0.13
374 0.15
375 0.16
376 0.18
377 0.18
378 0.19
379 0.19
380 0.16
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.1
398 0.14
399 0.18
400 0.22
401 0.31
402 0.4
403 0.49
404 0.59
405 0.69
406 0.74
407 0.8
408 0.86
409 0.87
410 0.87
411 0.88
412 0.88
413 0.88
414 0.86
415 0.79
416 0.72
417 0.63
418 0.55
419 0.45
420 0.35
421 0.25
422 0.17
423 0.14
424 0.12
425 0.11
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.09
430 0.08
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.12
435 0.14
436 0.15
437 0.17
438 0.23
439 0.3
440 0.39
441 0.46
442 0.56
443 0.63
444 0.72
445 0.76
446 0.8
447 0.83
448 0.77
449 0.77
450 0.73
451 0.65
452 0.56
453 0.5
454 0.4
455 0.3
456 0.28
457 0.2
458 0.14
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.1
465 0.14
466 0.21
467 0.21
468 0.24
469 0.27
470 0.31
471 0.39
472 0.44
473 0.45
474 0.48
475 0.52
476 0.55
477 0.58
478 0.59
479 0.59
480 0.6
481 0.63
482 0.63
483 0.69
484 0.73
485 0.77
486 0.84
487 0.87
488 0.89
489 0.9
490 0.89
491 0.87
492 0.8
493 0.73
494 0.66
495 0.6
496 0.52
497 0.44
498 0.36
499 0.27
500 0.25
501 0.21
502 0.16
503 0.12
504 0.11
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.07
509 0.07
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.07
521 0.09
522 0.08
523 0.09
524 0.08
525 0.07
526 0.08
527 0.09
528 0.13
529 0.17
530 0.24
531 0.27
532 0.32
533 0.4
534 0.49
535 0.58
536 0.65
537 0.7
538 0.73
539 0.81
540 0.85
541 0.86
542 0.8
543 0.74
544 0.7
545 0.7
546 0.69
547 0.65
548 0.61
549 0.55
550 0.56
551 0.54
552 0.47
553 0.37
554 0.3
555 0.26
556 0.23
557 0.21
558 0.18
559 0.18
560 0.18
561 0.18
562 0.17
563 0.15
564 0.21
565 0.27
566 0.32
567 0.38
568 0.46
569 0.54
570 0.59
571 0.67
572 0.67
573 0.65
574 0.67
575 0.68
576 0.7
577 0.73
578 0.77
579 0.77
580 0.79
581 0.83
582 0.84
583 0.86
584 0.86
585 0.86
586 0.87
587 0.9
588 0.91
589 0.95
590 0.96
591 0.96
592 0.96
593 0.97
594 0.97
595 0.97
596 0.96