Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C6T6

Protein Details
Accession Q6C6T6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-64QDLKREIKKLQRLRDQIKTWHydrophilic
562-583AKELKSRSWRFHKRFLTWFQRHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11.333, cyto 7.5, cyto_mito 7.166, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR012270  CCR4-NOT_su3/5  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
IPR007207  Not_N  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000932  C:P-body  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG yli:YALI0E06435g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
PF04065  Not3  
Amino Acid Sequences MAARKLQQEMDRVFKRVAEGVATFDSIYDKVQQSTNQSQKEKLEQDLKREIKKLQRLRDQIKTWMGSNDIKDKKTLTDQRKLIETEMERFKACEREMKTKAFSKEGLSPGAGKQLDPREQQRQEACAFVQNTIDELSEQLETLEAEEEQLHGTVRKGRKDNSVKSERLSEIADASDRHKWHIGRLEVIARLLENGSLAPQQVMDLQEDIQYYVESNQDVDFAEDVEIYDELNLDQEEDEFTIDEQYLRDEPTSTLEDLAVESAKEREREAAKEKEEAAKAAQAQKEAAAQAAADAQNSSRRPAATNTPPPIGSNMKPAPLPTRNESLKYASAAAAAAGSSVGSSPSALPQGLAPLPAPKEEIRAAAPVPVAVSATPAPWAEGGGPAPGGANVSIPTGPAAASTPIAASSTPVAAPAIPTGPAASATIASTSSAGNTTSTAPSPPPLSTSTTLSDDSIIYTLPPGLQDLVSSLDVAKKRVGTPPPIGSIAKLLETSYFSCPDSGDAEKPQMYHPESPFPTLPFYPQDPLAVFEDGGIFAKMDIDTLFYIFYYRQGTYHQYLAAKELKSRSWRFHKRFLTWFQRHEEPKMINNEFEQGTYRYFDFEGVWLQRRKSNFQFEYHFLEDEI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.37
4 0.33
5 0.27
6 0.24
7 0.24
8 0.25
9 0.24
10 0.21
11 0.17
12 0.18
13 0.15
14 0.15
15 0.17
16 0.17
17 0.19
18 0.23
19 0.26
20 0.32
21 0.42
22 0.49
23 0.52
24 0.53
25 0.56
26 0.58
27 0.64
28 0.59
29 0.56
30 0.58
31 0.53
32 0.58
33 0.63
34 0.65
35 0.62
36 0.62
37 0.61
38 0.61
39 0.68
40 0.69
41 0.69
42 0.72
43 0.76
44 0.8
45 0.83
46 0.77
47 0.75
48 0.73
49 0.65
50 0.57
51 0.5
52 0.47
53 0.41
54 0.41
55 0.43
56 0.42
57 0.4
58 0.4
59 0.39
60 0.39
61 0.45
62 0.5
63 0.48
64 0.52
65 0.56
66 0.58
67 0.62
68 0.59
69 0.5
70 0.49
71 0.43
72 0.41
73 0.44
74 0.42
75 0.37
76 0.36
77 0.37
78 0.36
79 0.34
80 0.35
81 0.33
82 0.41
83 0.46
84 0.51
85 0.54
86 0.54
87 0.57
88 0.53
89 0.49
90 0.43
91 0.46
92 0.43
93 0.39
94 0.33
95 0.31
96 0.27
97 0.33
98 0.29
99 0.22
100 0.25
101 0.3
102 0.36
103 0.4
104 0.45
105 0.48
106 0.5
107 0.57
108 0.54
109 0.51
110 0.45
111 0.43
112 0.37
113 0.33
114 0.32
115 0.26
116 0.24
117 0.19
118 0.19
119 0.17
120 0.17
121 0.1
122 0.1
123 0.1
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.16
141 0.21
142 0.28
143 0.33
144 0.36
145 0.46
146 0.55
147 0.62
148 0.65
149 0.68
150 0.63
151 0.6
152 0.62
153 0.52
154 0.45
155 0.37
156 0.28
157 0.2
158 0.19
159 0.19
160 0.14
161 0.15
162 0.19
163 0.18
164 0.2
165 0.24
166 0.23
167 0.28
168 0.35
169 0.34
170 0.31
171 0.34
172 0.34
173 0.3
174 0.3
175 0.24
176 0.16
177 0.15
178 0.12
179 0.09
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.12
239 0.15
240 0.13
241 0.13
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.07
247 0.05
248 0.05
249 0.07
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.14
254 0.16
255 0.2
256 0.26
257 0.3
258 0.3
259 0.32
260 0.33
261 0.34
262 0.32
263 0.29
264 0.23
265 0.19
266 0.2
267 0.22
268 0.22
269 0.17
270 0.17
271 0.16
272 0.17
273 0.14
274 0.12
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.15
289 0.17
290 0.24
291 0.27
292 0.34
293 0.36
294 0.35
295 0.35
296 0.34
297 0.35
298 0.31
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.21
303 0.21
304 0.22
305 0.25
306 0.26
307 0.28
308 0.24
309 0.3
310 0.3
311 0.32
312 0.33
313 0.3
314 0.27
315 0.24
316 0.22
317 0.15
318 0.14
319 0.12
320 0.1
321 0.07
322 0.05
323 0.04
324 0.03
325 0.03
326 0.02
327 0.02
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.08
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.15
349 0.13
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.1
355 0.1
356 0.08
357 0.07
358 0.06
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.07
369 0.07
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.06
376 0.04
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.07
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.06
401 0.07
402 0.07
403 0.07
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.11
426 0.12
427 0.11
428 0.13
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.15
433 0.19
434 0.2
435 0.23
436 0.24
437 0.25
438 0.25
439 0.23
440 0.22
441 0.17
442 0.16
443 0.13
444 0.1
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.08
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.09
459 0.13
460 0.15
461 0.16
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.25
466 0.3
467 0.31
468 0.37
469 0.39
470 0.41
471 0.42
472 0.4
473 0.33
474 0.32
475 0.27
476 0.21
477 0.17
478 0.14
479 0.12
480 0.14
481 0.17
482 0.16
483 0.17
484 0.17
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.18
489 0.19
490 0.19
491 0.19
492 0.23
493 0.24
494 0.25
495 0.25
496 0.29
497 0.3
498 0.34
499 0.34
500 0.39
501 0.39
502 0.43
503 0.43
504 0.37
505 0.38
506 0.32
507 0.32
508 0.27
509 0.29
510 0.27
511 0.26
512 0.27
513 0.23
514 0.25
515 0.25
516 0.21
517 0.18
518 0.15
519 0.15
520 0.13
521 0.13
522 0.11
523 0.08
524 0.07
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.12
537 0.14
538 0.14
539 0.15
540 0.18
541 0.25
542 0.27
543 0.3
544 0.3
545 0.29
546 0.29
547 0.33
548 0.36
549 0.31
550 0.33
551 0.33
552 0.36
553 0.43
554 0.47
555 0.52
556 0.57
557 0.67
558 0.69
559 0.75
560 0.78
561 0.76
562 0.8
563 0.81
564 0.81
565 0.78
566 0.77
567 0.73
568 0.73
569 0.69
570 0.65
571 0.63
572 0.56
573 0.55
574 0.59
575 0.54
576 0.47
577 0.44
578 0.44
579 0.37
580 0.34
581 0.3
582 0.23
583 0.22
584 0.23
585 0.23
586 0.2
587 0.2
588 0.2
589 0.17
590 0.17
591 0.23
592 0.25
593 0.33
594 0.35
595 0.38
596 0.41
597 0.44
598 0.51
599 0.52
600 0.58
601 0.54
602 0.57
603 0.61
604 0.61
605 0.65
606 0.59