FuNGI

Q6C1W7

Protein Details

Accession

Q6C1W7

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-37	RSKKYDSPLRRDRPSLRPQMRKGPINI	Hydrophilic
149-169	DGGARHAKKNQFNKKAKQVIH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005674 C:transcription factor TFIIF complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0016251 F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity GO:0001096 F:TFIIF-class transcription factor complex binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	yli:YALI0F12815g -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSKQPTNPLMRSKKYDSPLRRDRPSLRPQMRKGPINIPARPGHKFIQSTPGVKKEENEPKYKEYSLVAASKDELKDLRYHIMRLHSIKNVDPGADFTPPIKLHRKDPRNLQFQATQEEQAAESNADSGAEEGTEPVKREQADLSKIAPDGGARHAKKNQFNKKAKQVIHRDEDAKKLRYEEYYPWVMEDYSGKNTWVGNYEAAQSDSYCVFVFHGNGFKMVPVEKFYKFTPRNQYATLTLEEAEKRMADSVKAGTPRWLMKHMSPEMQQSRMRDQRPRKFQTVDSGGPVDDDDGLSRRRERDDEDLDFDHVFDDDEEAPIMDGDEEDQKEVERKMKNEHRSAAVLKDDNHDDMGDLFGEEEEEKMDKEGRKLKKYLRSLEKNAHYDSDDDENPYASSSEDDDDEEDGIKKEDPVKKEEDLAIKEEPMPLFVKKNITGLPRGMAVIQLPPHVLAKFTRGVWNPNAKRPREAGGESGDAKRPRTADADLPPPFGPNDTVLSDDIILNTLRSRPPMAVQDLLRILMPIMRKDADNKARLTACLKKHAKVQNGVLVLRE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.75
3	0.74
4	0.75
5	0.78
6	0.8
7	0.8
8	0.8
9	0.79
10	0.79
11	0.8
12	0.81
13	0.8
14	0.81
15	0.81
16	0.83
17	0.84
18	0.81
19	0.76
20	0.73
21	0.72
22	0.7
23	0.66
24	0.61
25	0.6
26	0.57
27	0.55
28	0.51
29	0.46
30	0.45
31	0.45
32	0.41
33	0.44
34	0.45
35	0.47
36	0.49
37	0.52
38	0.49
39	0.47
40	0.47
41	0.47
42	0.53
43	0.53
44	0.55
45	0.52
46	0.54
47	0.58
48	0.57
49	0.49
50	0.4
51	0.38
52	0.35
53	0.34
54	0.3
55	0.26
56	0.26
57	0.29
58	0.28
59	0.26
60	0.22
61	0.19
62	0.22
63	0.24
64	0.31
65	0.28
66	0.29
67	0.31
68	0.36
69	0.41
70	0.41
71	0.43
72	0.4
73	0.4
74	0.41
75	0.43
76	0.37
77	0.32
78	0.27
79	0.25
80	0.23
81	0.22
82	0.2
83	0.15
84	0.2
85	0.21
86	0.26
87	0.32
88	0.32
89	0.4
90	0.51
91	0.59
92	0.59
93	0.69
94	0.74
95	0.73
96	0.73
97	0.68
98	0.62
99	0.56
100	0.56
101	0.47
102	0.38
103	0.3
104	0.28
105	0.24
106	0.2
107	0.18
108	0.12
109	0.09
110	0.09
111	0.08
112	0.07
113	0.07
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.07
120	0.09
121	0.11
122	0.12
123	0.15
124	0.15
125	0.17
126	0.21
127	0.25
128	0.28
129	0.28
130	0.28
131	0.27
132	0.27
133	0.26
134	0.21
135	0.15
136	0.13
137	0.17
138	0.25
139	0.24
140	0.29
141	0.36
142	0.43
143	0.51
144	0.59
145	0.64
146	0.66
147	0.73
148	0.76
149	0.8
150	0.82
151	0.79
152	0.78
153	0.78
154	0.75
155	0.72
156	0.68
157	0.63
158	0.57
159	0.6
160	0.57
161	0.5
162	0.43
163	0.4
164	0.37
165	0.35
166	0.36
167	0.31
168	0.3
169	0.31
170	0.29
171	0.27
172	0.26
173	0.23
174	0.2
175	0.18
176	0.16
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.17
183	0.16
184	0.15
185	0.12
186	0.13
187	0.14
188	0.14
189	0.15
190	0.14
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.1
195	0.08
196	0.08
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.09
201	0.13
202	0.13
203	0.13
204	0.13
205	0.12
206	0.13
207	0.13
208	0.12
209	0.11
210	0.15
211	0.15
212	0.17
213	0.18
214	0.28
215	0.29
216	0.35
217	0.42
218	0.44
219	0.46
220	0.46
221	0.47
222	0.39
223	0.39
224	0.33
225	0.24
226	0.18
227	0.17
228	0.15
229	0.14
230	0.12
231	0.09
232	0.08
233	0.09
234	0.09
235	0.07
236	0.09
237	0.1
238	0.13
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.17
243	0.19
244	0.2
245	0.21
246	0.2
247	0.21
248	0.28
249	0.28
250	0.29
251	0.28
252	0.33
253	0.31
254	0.34
255	0.34
256	0.29
257	0.34
258	0.38
259	0.4
260	0.41
261	0.49
262	0.53
263	0.62
264	0.65
265	0.62
266	0.58
267	0.57
268	0.57
269	0.53
270	0.45
271	0.36
272	0.31
273	0.26
274	0.23
275	0.22
276	0.13
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.06
281	0.08
282	0.09
283	0.11
284	0.12
285	0.14
286	0.16
287	0.19
288	0.25
289	0.3
290	0.31
291	0.33
292	0.32
293	0.31
294	0.3
295	0.26
296	0.18
297	0.12
298	0.1
299	0.06
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.03
309	0.03
310	0.04
311	0.07
312	0.07
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.11
317	0.12
318	0.18
319	0.18
320	0.2
321	0.29
322	0.38
323	0.45
324	0.48
325	0.5
326	0.46
327	0.46
328	0.46
329	0.4
330	0.35
331	0.3
332	0.26
333	0.26
334	0.24
335	0.21
336	0.2
337	0.17
338	0.13
339	0.11
340	0.1
341	0.07
342	0.06
343	0.05
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.07
352	0.11
353	0.12
354	0.18
355	0.27
356	0.34
357	0.39
358	0.45
359	0.52
360	0.57
361	0.63
362	0.68
363	0.7
364	0.71
365	0.71
366	0.74
367	0.74
368	0.69
369	0.62
370	0.54
371	0.44
372	0.36
373	0.33
374	0.29
375	0.22
376	0.19
377	0.18
378	0.17
379	0.16
380	0.16
381	0.13
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.09
386	0.09
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.18
398	0.23
399	0.25
400	0.28
401	0.32
402	0.32
403	0.35
404	0.38
405	0.37
406	0.34
407	0.35
408	0.32
409	0.28
410	0.28
411	0.27
412	0.23
413	0.18
414	0.18
415	0.16
416	0.18
417	0.2
418	0.25
419	0.23
420	0.27
421	0.29
422	0.3
423	0.32
424	0.3
425	0.29
426	0.24
427	0.23
428	0.2
429	0.16
430	0.14
431	0.14
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.15
437	0.14
438	0.15
439	0.12
440	0.16
441	0.18
442	0.2
443	0.26
444	0.27
445	0.32
446	0.38
447	0.48
448	0.48
449	0.55
450	0.62
451	0.57
452	0.59
453	0.57
454	0.55
455	0.51
456	0.49
457	0.43
458	0.39
459	0.41
460	0.39
461	0.39
462	0.4
463	0.35
464	0.34
465	0.34
466	0.3
467	0.29
468	0.3
469	0.31
470	0.31
471	0.35
472	0.42
473	0.41
474	0.43
475	0.4
476	0.37
477	0.34
478	0.28
479	0.24
480	0.17
481	0.19
482	0.17
483	0.19
484	0.18
485	0.19
486	0.18
487	0.17
488	0.15
489	0.13
490	0.12
491	0.1
492	0.11
493	0.14
494	0.15
495	0.17
496	0.19
497	0.2
498	0.25
499	0.31
500	0.34
501	0.36
502	0.35
503	0.39
504	0.38
505	0.37
506	0.32
507	0.25
508	0.2
509	0.17
510	0.19
511	0.15
512	0.19
513	0.2
514	0.21
515	0.25
516	0.36
517	0.42
518	0.44
519	0.44
520	0.46
521	0.47
522	0.48
523	0.5
524	0.48
525	0.45
526	0.5
527	0.53
528	0.5
529	0.57
530	0.63
531	0.65
532	0.65
533	0.66
534	0.63
535	0.62

Q6C1W7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer