Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C136

Protein Details
Accession Q6C136    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-285VVYCWDGKQRRRLKQYPHMPTSVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 8, cyto 6.5, mito 5, cyto_nucl 5, cysk 3, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:1990298  C:bub1-bub3 complex  
GO:0000776  C:kinetochore  
GO:0033597  C:mitotic checkpoint complex  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:1990942  P:mitotic metaphase chromosome recapture  
GO:1990758  P:mitotic sister chromatid biorientation  
GO:0007094  P:mitotic spindle assembly checkpoint signaling  
GO:0140499  P:negative regulation of mitotic spindle assembly checkpoint signaling  
KEGG yli:YALI0F19558g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MSIIQIDALPDLISKVTWGPQKHLLVSSWDTKLRLYSVSHDNSRQVTEVSASSPILDCCWGDNGVAFTGGLAGVVEAIDLQAGELLSIGQQHADAISSVVCDAGNNLIVSGSWDKNLQFIDARGGFGNKDSSMMIPTAGKVYTMDKATNSNYVVCGLGNRQIHIYDIRNMGQVFQRRDSSLKFMTRKVRSMPDGKGYANTSIEGRVAVEWFDPSPEVQAQKYAFKCHRAKEPDAQGRIEVHPVNGVAFHPATPAFFTGGSDGVVYCWDGKQRRRLKQYPHMPTSVMGLDVDSTSGDMLAIACADDSFKENPNGALAKSSLHVRFLDGEGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.15
4 0.2
5 0.23
6 0.27
7 0.35
8 0.39
9 0.41
10 0.42
11 0.38
12 0.38
13 0.4
14 0.41
15 0.37
16 0.36
17 0.34
18 0.32
19 0.32
20 0.28
21 0.27
22 0.23
23 0.24
24 0.31
25 0.37
26 0.4
27 0.41
28 0.43
29 0.42
30 0.42
31 0.37
32 0.29
33 0.23
34 0.21
35 0.19
36 0.16
37 0.16
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.13
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.13
47 0.12
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.1
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.04
59 0.03
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.02
64 0.02
65 0.02
66 0.02
67 0.02
68 0.03
69 0.03
70 0.03
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.09
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.11
106 0.11
107 0.16
108 0.15
109 0.16
110 0.14
111 0.15
112 0.13
113 0.14
114 0.15
115 0.09
116 0.1
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.1
142 0.09
143 0.07
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.16
152 0.14
153 0.16
154 0.16
155 0.17
156 0.17
157 0.17
158 0.19
159 0.22
160 0.22
161 0.22
162 0.23
163 0.22
164 0.24
165 0.24
166 0.25
167 0.25
168 0.29
169 0.29
170 0.33
171 0.41
172 0.43
173 0.44
174 0.43
175 0.43
176 0.41
177 0.43
178 0.41
179 0.37
180 0.37
181 0.34
182 0.33
183 0.29
184 0.26
185 0.22
186 0.2
187 0.14
188 0.12
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.15
206 0.16
207 0.22
208 0.24
209 0.29
210 0.3
211 0.37
212 0.42
213 0.42
214 0.5
215 0.5
216 0.54
217 0.56
218 0.63
219 0.63
220 0.61
221 0.58
222 0.49
223 0.46
224 0.42
225 0.37
226 0.27
227 0.19
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.12
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.14
255 0.21
256 0.27
257 0.37
258 0.47
259 0.56
260 0.65
261 0.72
262 0.76
263 0.8
264 0.85
265 0.85
266 0.81
267 0.73
268 0.64
269 0.56
270 0.5
271 0.4
272 0.3
273 0.2
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.11
278 0.07
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.09
293 0.11
294 0.16
295 0.19
296 0.2
297 0.2
298 0.25
299 0.26
300 0.23
301 0.24
302 0.2
303 0.19
304 0.2
305 0.26
306 0.22
307 0.23
308 0.24
309 0.23
310 0.26