Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CDH5

Protein Details
Accession Q6CDH5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-36NYVMIKSDKPKEHKQHVQRSPIKTADHydrophilic
95-118VSSSVERKARFKHHKKPTVSDSPRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
KEGG yli:YALI0C00473g  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MEEDPGICNGNYVMIKSDKPKEHKQHVQRSPIKTADSALSRALHKQPFSPPQEPQQPLPTQQTALADTTSPSVSPPSLPQSYLEPASHATAATSVSSSVERKARFKHHKKPTVSDSPRLVELCEEYISNKNIDALAKIARQRGLPPHLRQKAWPMLLAEHPYVIEPNVGLPEPRRRTNGGSKSSSSSSEQCKSETEIPIRRLKGDLSRLQRKLKSQKMNKLELQYKQLQSNPSSHVSTTLSARSTPLSISPVSAASEGSLTMDHLNQVVVSESHDAQRFDIYEDAIESFLTKYHVKYESGLVWVAAAVAECVDPLECDNWIQVYENFLLVLLHTPQRDIGINEIEDRFSGKNYYSDGVTSEPFCETPATSNENPVTNGAAAAAQAAAAEAEGQRPKTAPASTSPSTPSSQKIASHVLTDSISLFLSGFRRGLPELSAHFDEEDVLASIGGGDEWLIWWIKWMGAKTWNSSDRARVWDMYLGWKRVSDSQCQKNIAEEAAAAAANGVSAPASPSSDASESDIGMDPFWSPMKLDRVQEPNLPPRIQHLFICLAMIKAKKNTLLELEQSEIREYLSRLGKSKDIEGIVLEAGEIWRSWQWSELESEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.24
3 0.3
4 0.4
5 0.43
6 0.5
7 0.6
8 0.65
9 0.73
10 0.8
11 0.84
12 0.86
13 0.86
14 0.89
15 0.87
16 0.83
17 0.81
18 0.75
19 0.67
20 0.57
21 0.51
22 0.46
23 0.41
24 0.37
25 0.32
26 0.31
27 0.29
28 0.34
29 0.39
30 0.38
31 0.36
32 0.39
33 0.44
34 0.51
35 0.57
36 0.57
37 0.53
38 0.57
39 0.66
40 0.64
41 0.59
42 0.58
43 0.54
44 0.54
45 0.57
46 0.5
47 0.41
48 0.4
49 0.39
50 0.32
51 0.3
52 0.25
53 0.19
54 0.17
55 0.18
56 0.16
57 0.13
58 0.11
59 0.12
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.22
64 0.23
65 0.24
66 0.25
67 0.27
68 0.31
69 0.32
70 0.28
71 0.23
72 0.23
73 0.24
74 0.23
75 0.18
76 0.14
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.08
82 0.09
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.21
87 0.24
88 0.29
89 0.36
90 0.46
91 0.55
92 0.64
93 0.7
94 0.75
95 0.81
96 0.83
97 0.84
98 0.82
99 0.82
100 0.78
101 0.74
102 0.69
103 0.61
104 0.59
105 0.5
106 0.41
107 0.32
108 0.28
109 0.23
110 0.18
111 0.15
112 0.14
113 0.19
114 0.2
115 0.19
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.15
123 0.19
124 0.22
125 0.24
126 0.25
127 0.25
128 0.29
129 0.34
130 0.39
131 0.43
132 0.47
133 0.55
134 0.59
135 0.6
136 0.57
137 0.58
138 0.58
139 0.51
140 0.47
141 0.37
142 0.34
143 0.36
144 0.38
145 0.3
146 0.21
147 0.2
148 0.17
149 0.16
150 0.13
151 0.1
152 0.06
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.11
158 0.21
159 0.26
160 0.29
161 0.32
162 0.34
163 0.4
164 0.5
165 0.56
166 0.54
167 0.54
168 0.52
169 0.53
170 0.51
171 0.47
172 0.4
173 0.36
174 0.34
175 0.35
176 0.34
177 0.31
178 0.31
179 0.33
180 0.35
181 0.36
182 0.37
183 0.38
184 0.41
185 0.47
186 0.46
187 0.43
188 0.38
189 0.34
190 0.35
191 0.36
192 0.38
193 0.41
194 0.49
195 0.53
196 0.59
197 0.6
198 0.62
199 0.64
200 0.66
201 0.68
202 0.67
203 0.72
204 0.73
205 0.76
206 0.71
207 0.69
208 0.65
209 0.58
210 0.55
211 0.53
212 0.47
213 0.43
214 0.43
215 0.39
216 0.35
217 0.35
218 0.33
219 0.29
220 0.28
221 0.25
222 0.24
223 0.22
224 0.22
225 0.19
226 0.18
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.11
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.07
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.13
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.16
284 0.18
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.08
292 0.06
293 0.04
294 0.02
295 0.03
296 0.03
297 0.02
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.07
309 0.06
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.06
317 0.07
318 0.06
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.12
329 0.13
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.11
335 0.09
336 0.1
337 0.09
338 0.1
339 0.12
340 0.13
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.08
353 0.1
354 0.13
355 0.18
356 0.18
357 0.22
358 0.23
359 0.23
360 0.23
361 0.21
362 0.19
363 0.13
364 0.12
365 0.09
366 0.07
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.03
374 0.02
375 0.03
376 0.03
377 0.06
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.14
384 0.15
385 0.14
386 0.17
387 0.24
388 0.25
389 0.26
390 0.28
391 0.27
392 0.28
393 0.28
394 0.26
395 0.22
396 0.24
397 0.23
398 0.24
399 0.26
400 0.25
401 0.25
402 0.23
403 0.21
404 0.18
405 0.17
406 0.14
407 0.1
408 0.09
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.09
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.11
417 0.12
418 0.13
419 0.12
420 0.13
421 0.14
422 0.19
423 0.2
424 0.18
425 0.18
426 0.17
427 0.16
428 0.13
429 0.12
430 0.08
431 0.06
432 0.06
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.04
437 0.03
438 0.03
439 0.02
440 0.03
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.12
448 0.13
449 0.15
450 0.22
451 0.25
452 0.28
453 0.35
454 0.38
455 0.39
456 0.39
457 0.41
458 0.38
459 0.41
460 0.39
461 0.32
462 0.3
463 0.31
464 0.3
465 0.35
466 0.36
467 0.33
468 0.31
469 0.31
470 0.31
471 0.35
472 0.36
473 0.36
474 0.4
475 0.47
476 0.53
477 0.55
478 0.54
479 0.49
480 0.49
481 0.4
482 0.3
483 0.21
484 0.15
485 0.13
486 0.13
487 0.08
488 0.07
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.05
496 0.05
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.12
501 0.14
502 0.14
503 0.17
504 0.17
505 0.16
506 0.18
507 0.19
508 0.16
509 0.15
510 0.14
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.11
515 0.09
516 0.15
517 0.22
518 0.26
519 0.29
520 0.35
521 0.4
522 0.43
523 0.49
524 0.51
525 0.52
526 0.55
527 0.52
528 0.45
529 0.45
530 0.48
531 0.44
532 0.38
533 0.34
534 0.31
535 0.3
536 0.32
537 0.26
538 0.21
539 0.23
540 0.25
541 0.24
542 0.25
543 0.29
544 0.32
545 0.33
546 0.35
547 0.37
548 0.38
549 0.38
550 0.37
551 0.37
552 0.34
553 0.33
554 0.31
555 0.25
556 0.22
557 0.21
558 0.19
559 0.23
560 0.28
561 0.3
562 0.32
563 0.36
564 0.39
565 0.39
566 0.42
567 0.4
568 0.34
569 0.32
570 0.29
571 0.27
572 0.23
573 0.2
574 0.16
575 0.1
576 0.09
577 0.09
578 0.08
579 0.08
580 0.1
581 0.12
582 0.13
583 0.17
584 0.19
585 0.2