Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C4H0

Protein Details
Accession Q6C4H0    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
593-620AIITPVRGLKKIKKKQFRKDLLMHKDYDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-21GRKTPMPARKAPVASKR
585-610RRPSHSREAIITPVRGLKKIKKKQFR
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG yli:YALI0E26873g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MKKTGRKTPMPARKAPVASKRYGRKALYQPDLSVEEEDDNDEDLDSEDEAFETIIAAVNDEGSQDEASNGEDDDDTDSDDEDEDTDSSIDETSLPEAYRRRKFGAKSAKKSMLQNENESAIADSSEESDLSSLSDIETRLSSKDSTLVRRKSRRGSVVDHTLDEHVEFPRHKEEEGDSSDDSFEEDSLLKAIEADSSPNPDESDFDDEIGDLDEEEFENGDLGSPLSEGDNSYSSINDFSDEVDKDFDAINDNDIEREEEDAILQEMAENGDRLQTLSPTDDDESVASFGNYSRRNSHSQHHYTGYSSDEDDYSFEDNDPFFEPRDPNQVLITNGEIGVENNNTLNNTIRNNTTTDTPKGFTSDDDSYLFGYFFSDGSSSENEDKMNNSTKRRPSLSTPKKPPAAGSSSSIFKNNQNGYSDYTVDSGDSTDEDTTLPPRTQKKCNTATEILSSSNIASRPPMLGSWVMTKERPFGIIDGLTTRSLSGQKSPPTTNGKSNSNGGIRYSTAIESDDCSDISDLNDIVLDEFIYTSDLDEEAPKDVCQEAQPYSTSSNVPLSAFRNRGLISNPLYQQRFTGTPIPSRRRPSHSREAIITPVRGLKKIKKKQFRKDLLMHKDYDGNDYDSGMVAEYSDGFNGFYGGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.73
3 0.72
4 0.68
5 0.68
6 0.69
7 0.72
8 0.73
9 0.74
10 0.69
11 0.68
12 0.72
13 0.75
14 0.74
15 0.68
16 0.6
17 0.56
18 0.56
19 0.47
20 0.39
21 0.3
22 0.23
23 0.2
24 0.21
25 0.16
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.11
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.08
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.08
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.1
81 0.1
82 0.14
83 0.2
84 0.29
85 0.37
86 0.4
87 0.44
88 0.5
89 0.53
90 0.59
91 0.64
92 0.66
93 0.67
94 0.72
95 0.75
96 0.72
97 0.74
98 0.73
99 0.71
100 0.65
101 0.61
102 0.55
103 0.48
104 0.44
105 0.39
106 0.3
107 0.2
108 0.16
109 0.11
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.14
128 0.14
129 0.12
130 0.18
131 0.21
132 0.3
133 0.38
134 0.46
135 0.54
136 0.62
137 0.69
138 0.72
139 0.76
140 0.75
141 0.71
142 0.69
143 0.66
144 0.67
145 0.62
146 0.53
147 0.46
148 0.39
149 0.33
150 0.27
151 0.21
152 0.13
153 0.15
154 0.15
155 0.16
156 0.22
157 0.23
158 0.23
159 0.24
160 0.25
161 0.28
162 0.31
163 0.32
164 0.26
165 0.25
166 0.25
167 0.23
168 0.21
169 0.14
170 0.1
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.2
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.12
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.11
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.12
278 0.15
279 0.16
280 0.19
281 0.23
282 0.28
283 0.3
284 0.37
285 0.4
286 0.43
287 0.45
288 0.44
289 0.41
290 0.37
291 0.35
292 0.29
293 0.2
294 0.16
295 0.13
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.11
310 0.13
311 0.13
312 0.21
313 0.2
314 0.19
315 0.2
316 0.21
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.08
324 0.06
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.08
334 0.1
335 0.11
336 0.12
337 0.13
338 0.15
339 0.15
340 0.18
341 0.2
342 0.21
343 0.22
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.17
349 0.18
350 0.17
351 0.17
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.09
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.05
364 0.07
365 0.09
366 0.1
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.15
373 0.23
374 0.25
375 0.29
376 0.36
377 0.42
378 0.48
379 0.5
380 0.49
381 0.49
382 0.56
383 0.62
384 0.65
385 0.67
386 0.69
387 0.69
388 0.66
389 0.6
390 0.54
391 0.48
392 0.39
393 0.34
394 0.29
395 0.28
396 0.28
397 0.28
398 0.24
399 0.22
400 0.28
401 0.27
402 0.28
403 0.28
404 0.29
405 0.31
406 0.31
407 0.3
408 0.22
409 0.21
410 0.17
411 0.14
412 0.13
413 0.09
414 0.07
415 0.06
416 0.07
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.07
421 0.09
422 0.11
423 0.12
424 0.16
425 0.25
426 0.3
427 0.38
428 0.46
429 0.53
430 0.59
431 0.64
432 0.66
433 0.61
434 0.58
435 0.53
436 0.47
437 0.39
438 0.3
439 0.25
440 0.18
441 0.17
442 0.15
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.11
448 0.11
449 0.1
450 0.11
451 0.12
452 0.17
453 0.19
454 0.2
455 0.21
456 0.22
457 0.23
458 0.22
459 0.22
460 0.18
461 0.15
462 0.17
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.16
467 0.15
468 0.14
469 0.13
470 0.12
471 0.14
472 0.15
473 0.19
474 0.23
475 0.28
476 0.33
477 0.35
478 0.4
479 0.46
480 0.48
481 0.5
482 0.5
483 0.49
484 0.47
485 0.48
486 0.47
487 0.42
488 0.39
489 0.32
490 0.29
491 0.25
492 0.23
493 0.22
494 0.17
495 0.14
496 0.15
497 0.14
498 0.13
499 0.15
500 0.14
501 0.12
502 0.13
503 0.13
504 0.12
505 0.12
506 0.12
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.07
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.07
522 0.07
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.12
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.13
531 0.14
532 0.17
533 0.17
534 0.19
535 0.2
536 0.21
537 0.22
538 0.23
539 0.22
540 0.2
541 0.21
542 0.2
543 0.2
544 0.21
545 0.23
546 0.28
547 0.3
548 0.28
549 0.3
550 0.29
551 0.3
552 0.3
553 0.32
554 0.3
555 0.35
556 0.37
557 0.41
558 0.42
559 0.4
560 0.38
561 0.36
562 0.33
563 0.3
564 0.34
565 0.3
566 0.37
567 0.47
568 0.54
569 0.57
570 0.64
571 0.68
572 0.69
573 0.74
574 0.74
575 0.75
576 0.76
577 0.73
578 0.69
579 0.66
580 0.65
581 0.62
582 0.53
583 0.44
584 0.42
585 0.39
586 0.39
587 0.41
588 0.43
589 0.49
590 0.59
591 0.68
592 0.72
593 0.8
594 0.87
595 0.92
596 0.92
597 0.91
598 0.9
599 0.9
600 0.9
601 0.84
602 0.76
603 0.67
604 0.63
605 0.54
606 0.48
607 0.41
608 0.34
609 0.28
610 0.26
611 0.24
612 0.19
613 0.18
614 0.14
615 0.1
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.08
623 0.08