Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A066VGD6

Protein Details
Accession A0A066VGD6    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24GSDAKVSKKEKKAAQFKAQKSGGHydrophilic
66-87SVVSSIKKGKRKEKSAPASAEKHydrophilic
95-119EVQEAEKAKKPKKSKKGNNEASEETHydrophilic
309-333GKTAQRTEKIQKKNERLDKERQKLHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-29SKKEKKAAQFKAQKSGGKRGSK
72-80KKGKRKEKS
101-111KAKKPKKSKKG
140-143KKRK
318-362IQKKNERLDKERQKLHDKYIAPAAKEAKAKKASAAAGPPPSKKAR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MGSDAKVSKKEKKAAQFKAQKSGGKRGSKGSATAVSDLPENDLLDDNGQPVHGQGVGEDGEREEESVVSSIKKGKRKEKSAPASAEKEDAAVADEVQEAEKAKKPKKSKKGNNEASEETLQAIDAISASKSAVTGEKQSKKRKRTEEDATDKKALTAKRTTFGDDGEAEAVEEVKRRSALEAQGDGKKATSEKGKEDAVRKYIVFVGNMSYKTKSEEIAAHFASHCGEKPTVRLLTTKADPNALANLSKSKQKSLAKGKASHAAQGGVSKGCAFVEFTSTAALQKALSFHHTAFAGRQINVELTAGGGGKTAQRTEKIQKKNERLDKERQKLHDKYIAPAAKEAKAKKASAAAGPPPSKKARMGADEAAAEGTAQWGRRSSGAGSRTGAKPMPKWMASGANAVRLQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.83
3 0.84
4 0.8
5 0.82
6 0.8
7 0.75
8 0.7
9 0.71
10 0.69
11 0.67
12 0.65
13 0.62
14 0.63
15 0.6
16 0.56
17 0.51
18 0.48
19 0.42
20 0.42
21 0.36
22 0.29
23 0.28
24 0.26
25 0.23
26 0.19
27 0.16
28 0.15
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.11
35 0.11
36 0.1
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.09
43 0.1
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.09
51 0.09
52 0.1
53 0.11
54 0.11
55 0.1
56 0.12
57 0.19
58 0.25
59 0.32
60 0.39
61 0.48
62 0.57
63 0.66
64 0.74
65 0.77
66 0.81
67 0.83
68 0.82
69 0.79
70 0.74
71 0.66
72 0.58
73 0.46
74 0.37
75 0.28
76 0.2
77 0.15
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.08
86 0.11
87 0.16
88 0.23
89 0.28
90 0.36
91 0.47
92 0.57
93 0.66
94 0.75
95 0.8
96 0.84
97 0.9
98 0.92
99 0.88
100 0.83
101 0.75
102 0.68
103 0.59
104 0.48
105 0.37
106 0.26
107 0.19
108 0.13
109 0.11
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.08
120 0.08
121 0.16
122 0.24
123 0.33
124 0.42
125 0.52
126 0.61
127 0.67
128 0.75
129 0.78
130 0.77
131 0.77
132 0.79
133 0.79
134 0.8
135 0.79
136 0.75
137 0.67
138 0.59
139 0.51
140 0.45
141 0.36
142 0.31
143 0.32
144 0.28
145 0.31
146 0.32
147 0.34
148 0.3
149 0.29
150 0.27
151 0.19
152 0.18
153 0.14
154 0.12
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.13
166 0.16
167 0.18
168 0.22
169 0.24
170 0.26
171 0.27
172 0.25
173 0.21
174 0.19
175 0.15
176 0.14
177 0.17
178 0.17
179 0.19
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.32
184 0.33
185 0.29
186 0.29
187 0.26
188 0.24
189 0.24
190 0.22
191 0.17
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.16
197 0.14
198 0.13
199 0.15
200 0.16
201 0.14
202 0.13
203 0.16
204 0.17
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.18
209 0.18
210 0.17
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.18
221 0.17
222 0.21
223 0.24
224 0.26
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.2
229 0.2
230 0.16
231 0.14
232 0.11
233 0.14
234 0.14
235 0.2
236 0.2
237 0.19
238 0.27
239 0.3
240 0.39
241 0.45
242 0.53
243 0.54
244 0.59
245 0.59
246 0.59
247 0.56
248 0.5
249 0.4
250 0.32
251 0.26
252 0.22
253 0.21
254 0.14
255 0.13
256 0.1
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.06
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.11
269 0.11
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.12
275 0.13
276 0.13
277 0.15
278 0.16
279 0.15
280 0.15
281 0.21
282 0.22
283 0.2
284 0.2
285 0.19
286 0.19
287 0.19
288 0.18
289 0.1
290 0.07
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.08
297 0.1
298 0.12
299 0.13
300 0.16
301 0.22
302 0.32
303 0.41
304 0.48
305 0.56
306 0.64
307 0.71
308 0.79
309 0.82
310 0.82
311 0.79
312 0.81
313 0.82
314 0.82
315 0.79
316 0.76
317 0.76
318 0.72
319 0.72
320 0.69
321 0.59
322 0.54
323 0.56
324 0.53
325 0.44
326 0.44
327 0.41
328 0.38
329 0.43
330 0.42
331 0.41
332 0.43
333 0.42
334 0.4
335 0.43
336 0.4
337 0.39
338 0.42
339 0.39
340 0.42
341 0.47
342 0.46
343 0.46
344 0.48
345 0.46
346 0.43
347 0.44
348 0.43
349 0.44
350 0.48
351 0.45
352 0.44
353 0.41
354 0.39
355 0.32
356 0.24
357 0.18
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.13
364 0.15
365 0.16
366 0.19
367 0.2
368 0.26
369 0.28
370 0.3
371 0.31
372 0.35
373 0.36
374 0.38
375 0.38
376 0.36
377 0.36
378 0.41
379 0.47
380 0.42
381 0.42
382 0.41
383 0.45
384 0.42
385 0.47
386 0.4
387 0.4