Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CG42

Protein Details
Accession Q6CG42    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
52-72SELSRRRIRSIQKHIKVGKNEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 14, cyto_nucl 11.5, nucl 7, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR022967  S1_dom  
IPR003029  S1_domain  
IPR044126  S1_IF2_alpha  
IPR024055  TIF2_asu_C  
IPR024054  TIF2_asu_middle_sf  
IPR011488  TIF_2_asu  
Gene Ontology GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005850  C:eukaryotic translation initiation factor 2 complex  
GO:0005851  C:eukaryotic translation initiation factor 2B complex  
GO:0043614  C:multi-eIF complex  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
KEGG yli:YALI0B01034g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07541  EIF_2_alpha  
PF00575  S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd04452  S1_IF2_alpha  
Amino Acid Sequences MDEVNTTTCRFYANKYPEVDDLVMVNVKEIADMGAYVKLLEYDDIEGMILLSELSRRRIRSIQKHIKVGKNEIVVVLRVDKDKGYIDLSKRRVSAEDVEKCEEKYTKSKTVHSILRHVAEKHKYSLEKLYEQVGWPLSTKYGHAYDGFKLSITNPDQVFGDLEDPASPAIMEDLKAQIGRRLTPNPVKVRADIDITCFAYEGIEAIKKALAAGETLNSELVPVKVKLVAAPLFVLTSTCLDKQKAIDTLGEAIEKIRESIEASGGSLTVKMEPKAVTETDDAELAKLMEKTEQQNKLVDGDDDDADEEAGDFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.43
3 0.46
4 0.44
5 0.48
6 0.43
7 0.33
8 0.27
9 0.22
10 0.21
11 0.18
12 0.16
13 0.12
14 0.11
15 0.11
16 0.1
17 0.08
18 0.06
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.08
34 0.07
35 0.07
36 0.05
37 0.04
38 0.04
39 0.07
40 0.09
41 0.15
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.33
46 0.44
47 0.51
48 0.61
49 0.67
50 0.69
51 0.77
52 0.8
53 0.8
54 0.75
55 0.71
56 0.65
57 0.56
58 0.5
59 0.42
60 0.35
61 0.29
62 0.24
63 0.2
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.13
68 0.14
69 0.14
70 0.15
71 0.16
72 0.2
73 0.25
74 0.33
75 0.37
76 0.39
77 0.39
78 0.38
79 0.36
80 0.34
81 0.36
82 0.37
83 0.4
84 0.4
85 0.42
86 0.42
87 0.41
88 0.4
89 0.34
90 0.27
91 0.28
92 0.31
93 0.36
94 0.39
95 0.43
96 0.46
97 0.51
98 0.54
99 0.49
100 0.49
101 0.44
102 0.45
103 0.43
104 0.38
105 0.38
106 0.38
107 0.37
108 0.34
109 0.35
110 0.32
111 0.31
112 0.36
113 0.33
114 0.3
115 0.28
116 0.28
117 0.24
118 0.24
119 0.23
120 0.18
121 0.14
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.16
134 0.16
135 0.13
136 0.12
137 0.11
138 0.16
139 0.15
140 0.18
141 0.16
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.11
147 0.1
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.06
161 0.06
162 0.07
163 0.08
164 0.1
165 0.1
166 0.12
167 0.15
168 0.17
169 0.22
170 0.28
171 0.35
172 0.38
173 0.42
174 0.42
175 0.4
176 0.4
177 0.35
178 0.32
179 0.25
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.19
184 0.16
185 0.15
186 0.11
187 0.11
188 0.08
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.15
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.07
223 0.08
224 0.1
225 0.12
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.2
230 0.24
231 0.25
232 0.24
233 0.23
234 0.21
235 0.23
236 0.22
237 0.2
238 0.15
239 0.12
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.11
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.17
260 0.19
261 0.22
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.22
266 0.2
267 0.22
268 0.19
269 0.16
270 0.16
271 0.13
272 0.14
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.18
277 0.25
278 0.33
279 0.39
280 0.38
281 0.41
282 0.42
283 0.41
284 0.39
285 0.32
286 0.26
287 0.23
288 0.22
289 0.18
290 0.18
291 0.15
292 0.13
293 0.12