Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CFA9

Protein Details
Accession Q6CFA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MHSHRSSKKSQKPFKSKHASKGSIKALNHydrophilic
43-62KTMGKWDRRNQKDQIRAAKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-48SSKKSQKPFKSKHASKGSIKALNKGKIEKASAGNKAVKTMGKW
Subcellular Location(s) nucl 9.5cyto_nucl 9.5, cyto 8.5, mito 4, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012948  AARP2CN  
IPR039761  Bms1/Tsr1  
IPR007034  BMS1_TSR1_C  
IPR030387  G_Bms1/Tsr1_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0034511  F:U3 snoRNA binding  
GO:0000479  P:endonucleolytic cleavage of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000461  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG yli:YALI0B08756g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08142  AARP2CN  
PF04950  RIBIOP_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51714  G_BMS1  
Amino Acid Sequences MHSHRSSKKSQKPFKSKHASKGSIKALNKGKIEKASAGNKAVKTMGKWDRRNQKDQIRAAKMVELATDRKLFDGKSGAPKIVTVVGMSEDVDVNGLVCKMMGLESLQSKISTHEVERFKQKFTVITPSLDNFLEVLDAARIADFVILAFSPVAAFNDSEYILKCVAEQGVSNVISVVTETGMLTDKKRVERIDEIKTFSDYFFPQDKIFDIENATDCANLVRNIAQKFPKGVNWRDQRAFVLADNVQEVDGQVCVSGVVRGKGFNLLRTVHLPGYGDFKIAKAEVLKHGQAELVIPGEDVLAKNDGDDEDMDMEEDDVMEEEEEIQDQQLGVKVDGHHYFPDTAREAMQEKYAKRRVPKGTSEQQAKWLIDETLINSDDEFEDEQMEEDEVDMDAEDGAHVEFDMDEETRQLEEYKSLREELDFPDEVELKPGESAKERFAKYRGMKSLRNWDASQDDYPEEYKNCVTFNYNAMKNRVLKDSTDLQPGQYVKLYIEAPVSIVSEAQEHADSPFVVYGLHKYESDQAVCHVTMNPCFDQEETAPIKSKDELILQLGPRRLVVNPLYGTESTIAKFDRFLTRPCMATYIGPATFGNVPALWFRKSENGAMELVGTGSFDSTDPRKMLIKRAVLTGHPFKIHKKLVTIRYMFFNPEDINWFKAVPLFTKMGRSGFIKMSLGTHGYMKATFDQHLNGMDTVAMALYKRVWPKVARELE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.89
4 0.89
5 0.89
6 0.86
7 0.82
8 0.83
9 0.8
10 0.78
11 0.72
12 0.7
13 0.68
14 0.67
15 0.65
16 0.6
17 0.58
18 0.55
19 0.57
20 0.54
21 0.53
22 0.53
23 0.53
24 0.54
25 0.55
26 0.49
27 0.48
28 0.46
29 0.41
30 0.35
31 0.39
32 0.43
33 0.46
34 0.53
35 0.6
36 0.67
37 0.73
38 0.79
39 0.78
40 0.79
41 0.78
42 0.8
43 0.81
44 0.77
45 0.72
46 0.65
47 0.6
48 0.52
49 0.42
50 0.36
51 0.29
52 0.24
53 0.26
54 0.27
55 0.24
56 0.23
57 0.25
58 0.22
59 0.22
60 0.26
61 0.26
62 0.34
63 0.36
64 0.36
65 0.34
66 0.34
67 0.33
68 0.29
69 0.24
70 0.14
71 0.12
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.09
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.16
97 0.19
98 0.18
99 0.19
100 0.26
101 0.3
102 0.35
103 0.45
104 0.45
105 0.44
106 0.44
107 0.43
108 0.39
109 0.37
110 0.42
111 0.34
112 0.35
113 0.35
114 0.33
115 0.34
116 0.3
117 0.26
118 0.16
119 0.14
120 0.11
121 0.08
122 0.08
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.12
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.15
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.09
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.16
172 0.2
173 0.23
174 0.28
175 0.28
176 0.31
177 0.4
178 0.45
179 0.48
180 0.48
181 0.48
182 0.45
183 0.46
184 0.41
185 0.32
186 0.29
187 0.2
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.21
196 0.18
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.16
202 0.12
203 0.11
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.17
210 0.18
211 0.23
212 0.25
213 0.25
214 0.28
215 0.29
216 0.32
217 0.34
218 0.37
219 0.42
220 0.47
221 0.52
222 0.51
223 0.5
224 0.45
225 0.4
226 0.37
227 0.27
228 0.24
229 0.18
230 0.17
231 0.16
232 0.14
233 0.12
234 0.1
235 0.1
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.16
250 0.16
251 0.16
252 0.18
253 0.18
254 0.2
255 0.21
256 0.24
257 0.18
258 0.18
259 0.17
260 0.14
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.12
268 0.13
269 0.09
270 0.11
271 0.14
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.17
276 0.17
277 0.15
278 0.13
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.13
328 0.16
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.18
336 0.19
337 0.18
338 0.26
339 0.31
340 0.33
341 0.35
342 0.43
343 0.45
344 0.47
345 0.52
346 0.52
347 0.54
348 0.58
349 0.61
350 0.53
351 0.52
352 0.5
353 0.44
354 0.36
355 0.29
356 0.22
357 0.17
358 0.17
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.1
363 0.09
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.05
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.02
390 0.03
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.1
401 0.12
402 0.14
403 0.15
404 0.16
405 0.16
406 0.16
407 0.17
408 0.16
409 0.2
410 0.17
411 0.16
412 0.18
413 0.18
414 0.17
415 0.17
416 0.15
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.1
421 0.13
422 0.14
423 0.17
424 0.25
425 0.25
426 0.28
427 0.29
428 0.37
429 0.38
430 0.44
431 0.48
432 0.46
433 0.5
434 0.52
435 0.6
436 0.56
437 0.56
438 0.48
439 0.42
440 0.39
441 0.38
442 0.34
443 0.25
444 0.21
445 0.18
446 0.19
447 0.18
448 0.16
449 0.15
450 0.15
451 0.14
452 0.14
453 0.13
454 0.15
455 0.15
456 0.19
457 0.24
458 0.28
459 0.3
460 0.32
461 0.36
462 0.37
463 0.38
464 0.37
465 0.32
466 0.28
467 0.29
468 0.33
469 0.32
470 0.34
471 0.32
472 0.27
473 0.3
474 0.3
475 0.27
476 0.21
477 0.19
478 0.12
479 0.16
480 0.15
481 0.12
482 0.12
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.08
488 0.08
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.09
497 0.08
498 0.08
499 0.08
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.11
505 0.13
506 0.12
507 0.13
508 0.19
509 0.22
510 0.22
511 0.2
512 0.19
513 0.2
514 0.2
515 0.2
516 0.18
517 0.17
518 0.19
519 0.23
520 0.22
521 0.2
522 0.21
523 0.2
524 0.19
525 0.18
526 0.22
527 0.2
528 0.22
529 0.24
530 0.24
531 0.25
532 0.23
533 0.25
534 0.2
535 0.2
536 0.2
537 0.2
538 0.24
539 0.25
540 0.29
541 0.29
542 0.26
543 0.24
544 0.24
545 0.21
546 0.21
547 0.21
548 0.23
549 0.22
550 0.23
551 0.26
552 0.24
553 0.25
554 0.21
555 0.21
556 0.15
557 0.16
558 0.16
559 0.13
560 0.14
561 0.16
562 0.23
563 0.24
564 0.27
565 0.32
566 0.33
567 0.35
568 0.34
569 0.34
570 0.26
571 0.25
572 0.25
573 0.24
574 0.21
575 0.21
576 0.2
577 0.19
578 0.2
579 0.19
580 0.17
581 0.12
582 0.13
583 0.16
584 0.19
585 0.17
586 0.17
587 0.18
588 0.24
589 0.26
590 0.29
591 0.28
592 0.27
593 0.26
594 0.26
595 0.24
596 0.17
597 0.15
598 0.11
599 0.08
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.09
605 0.11
606 0.16
607 0.17
608 0.19
609 0.26
610 0.28
611 0.37
612 0.41
613 0.46
614 0.43
615 0.48
616 0.48
617 0.44
618 0.5
619 0.48
620 0.44
621 0.41
622 0.41
623 0.41
624 0.48
625 0.52
626 0.47
627 0.48
628 0.53
629 0.57
630 0.64
631 0.64
632 0.57
633 0.56
634 0.55
635 0.49
636 0.41
637 0.37
638 0.28
639 0.26
640 0.29
641 0.25
642 0.26
643 0.24
644 0.23
645 0.2
646 0.22
647 0.22
648 0.19
649 0.22
650 0.23
651 0.23
652 0.29
653 0.31
654 0.29
655 0.3
656 0.3
657 0.3
658 0.3
659 0.32
660 0.28
661 0.26
662 0.26
663 0.26
664 0.25
665 0.22
666 0.21
667 0.19
668 0.19
669 0.19
670 0.2
671 0.21
672 0.22
673 0.23
674 0.23
675 0.23
676 0.23
677 0.26
678 0.26
679 0.22
680 0.19
681 0.17
682 0.15
683 0.13
684 0.11
685 0.08
686 0.06
687 0.07
688 0.09
689 0.15
690 0.2
691 0.22
692 0.28
693 0.32
694 0.39