Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C456

Protein Details
Accession Q6C456    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-306AQGPSGPPEKKRKKSAPAKEEKAPKNNKRLTAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-302QGPSGPPEKKRKKSAPAKEEKAPKNNKR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 12.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040456  RNase_H2_suB  
IPR019024  RNase_H2_suB_wHTH  
IPR041195  Rnh202_N  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0032299  C:ribonuclease H2 complex  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG yli:YALI0E29535g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09468  RNase_H2-Ydr279  
PF17745  Ydr279_N  
CDD cd09270  RNase_H2-B  
Amino Acid Sequences MMHEQCDEAKSKRNLIPKQSTLQYITMTSTLSTTKNHLVILPPTTKPTIVSLTHPRTRNLARFVVDSSDPKHTKVYEITQINGSNAHFEGTPDPRSIILQVEGDKGSVIQDPSVFMTTPFSPLWLILPTLVRHKDKLMTLDDLHEASCHGVDRMDLITQDTFDKYIPDVCEVMDEGEKFYKLSNEKLLAHLKAIVASIKKSLPNDIYVRHVQNLLDSDASDEIKDLAKEHISMNMLGSNLPPDVTEILLKSVDFEPYNKHKAEYKAKRDAESAAQGPSGPPEKKRKKSAPAKEEKAPKNNKRLTAFFSVVPKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.63
3 0.7
4 0.66
5 0.69
6 0.66
7 0.65
8 0.59
9 0.54
10 0.45
11 0.37
12 0.33
13 0.26
14 0.22
15 0.18
16 0.15
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.22
22 0.23
23 0.23
24 0.23
25 0.25
26 0.27
27 0.32
28 0.32
29 0.28
30 0.3
31 0.31
32 0.3
33 0.27
34 0.26
35 0.26
36 0.23
37 0.28
38 0.35
39 0.42
40 0.48
41 0.5
42 0.48
43 0.49
44 0.54
45 0.55
46 0.5
47 0.47
48 0.42
49 0.42
50 0.42
51 0.39
52 0.34
53 0.29
54 0.27
55 0.31
56 0.3
57 0.3
58 0.32
59 0.28
60 0.3
61 0.32
62 0.34
63 0.33
64 0.34
65 0.34
66 0.35
67 0.35
68 0.32
69 0.29
70 0.24
71 0.17
72 0.15
73 0.15
74 0.1
75 0.11
76 0.14
77 0.16
78 0.18
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.15
85 0.13
86 0.12
87 0.13
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.13
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.09
99 0.1
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.11
104 0.11
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.1
112 0.1
113 0.08
114 0.1
115 0.1
116 0.16
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.22
121 0.24
122 0.24
123 0.26
124 0.23
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.21
129 0.18
130 0.16
131 0.13
132 0.1
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.09
167 0.12
168 0.12
169 0.15
170 0.18
171 0.21
172 0.21
173 0.26
174 0.29
175 0.25
176 0.24
177 0.23
178 0.19
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.13
186 0.15
187 0.15
188 0.18
189 0.18
190 0.22
191 0.23
192 0.23
193 0.26
194 0.29
195 0.3
196 0.27
197 0.27
198 0.22
199 0.22
200 0.23
201 0.19
202 0.14
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.11
215 0.12
216 0.13
217 0.16
218 0.15
219 0.15
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.1
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.12
238 0.12
239 0.15
240 0.14
241 0.15
242 0.21
243 0.28
244 0.34
245 0.32
246 0.33
247 0.37
248 0.45
249 0.55
250 0.58
251 0.6
252 0.65
253 0.68
254 0.68
255 0.64
256 0.58
257 0.53
258 0.49
259 0.42
260 0.33
261 0.29
262 0.27
263 0.25
264 0.26
265 0.28
266 0.23
267 0.29
268 0.39
269 0.49
270 0.58
271 0.69
272 0.74
273 0.77
274 0.86
275 0.9
276 0.89
277 0.9
278 0.87
279 0.85
280 0.86
281 0.84
282 0.83
283 0.83
284 0.81
285 0.81
286 0.82
287 0.81
288 0.78
289 0.74
290 0.7
291 0.68
292 0.61
293 0.54