Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6C344

Protein Details
Accession Q6C344    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-37MVKKLSFKGDKKTKKPKASSSKGSDKKRPRIDPVEDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-30FKGDKKTKKPKASSSKGSDKKRPR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010414  FRG1  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0051015  F:actin filament binding  
KEGG yli:YALI0F02761g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06229  FRG1  
Amino Acid Sequences MVKKLSFKGDKKTKKPKASSSKGSDKKRPRIDPVEDDQAAGWISAKSSEEFHGPTLLVTTSEGKPCCFVYENSGDAEDKTHSPTMAVSFDLDTVDKSLDTAEPTSTQQVLLLSPLEFDTNKRTIDIDETVARFALKVPSLGVFLGVDKAGVVSLDSVAIGTPQQFTFKREKGDAGVSWTIKTSYDAYIEIKNGKINLTEDGAKASKFTVRLQSSHRKKTTAEKQAVTYYAMSTKALEERAGRSLDPDEVVKLKKSNKEGNLNEALLDLRQKGKSDTYC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.9
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.89
7 0.87
8 0.88
9 0.86
10 0.86
11 0.86
12 0.85
13 0.86
14 0.86
15 0.84
16 0.82
17 0.82
18 0.81
19 0.79
20 0.75
21 0.74
22 0.64
23 0.57
24 0.47
25 0.39
26 0.31
27 0.23
28 0.17
29 0.07
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.11
35 0.13
36 0.15
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.14
48 0.19
49 0.2
50 0.19
51 0.2
52 0.2
53 0.22
54 0.2
55 0.19
56 0.21
57 0.24
58 0.25
59 0.24
60 0.25
61 0.22
62 0.2
63 0.21
64 0.16
65 0.12
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.14
73 0.13
74 0.1
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.1
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.12
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.09
97 0.09
98 0.08
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.12
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.15
116 0.15
117 0.14
118 0.13
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.06
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.09
151 0.1
152 0.14
153 0.21
154 0.24
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.27
159 0.3
160 0.27
161 0.25
162 0.26
163 0.23
164 0.22
165 0.21
166 0.19
167 0.16
168 0.17
169 0.13
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.16
175 0.17
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.15
181 0.15
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.15
187 0.18
188 0.18
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.17
195 0.23
196 0.25
197 0.28
198 0.36
199 0.46
200 0.52
201 0.61
202 0.61
203 0.54
204 0.54
205 0.62
206 0.65
207 0.64
208 0.62
209 0.55
210 0.55
211 0.56
212 0.55
213 0.46
214 0.37
215 0.28
216 0.23
217 0.21
218 0.18
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.17
225 0.2
226 0.24
227 0.25
228 0.22
229 0.21
230 0.22
231 0.22
232 0.21
233 0.19
234 0.18
235 0.21
236 0.23
237 0.24
238 0.28
239 0.33
240 0.38
241 0.45
242 0.52
243 0.56
244 0.64
245 0.64
246 0.67
247 0.66
248 0.59
249 0.51
250 0.43
251 0.35
252 0.26
253 0.25
254 0.19
255 0.18
256 0.2
257 0.22
258 0.25