Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6CFW4

Protein Details
Accession Q6CFW4    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
63-84KETEEWKEKKERKRERESQSGVBasic
139-159LTKGDKQRMKRRKQAGADDQHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-76KKERKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG yli:YALI0B03036g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MNDSSTSNRKALFEEDKDLKVNKRADALLERKQQEAEFELEKLQAEERGEDFDRKRAWDWTVKETEEWKEKKERKRERESQSGVHDMSSTAQRAYEKDLASFKPDLETYEKEKETGLHHTPSFNHKPTPEALDRLVNGLTKGDKQRMKRRKQAGADDQHATYISDKNKQFNEKLNRQYDKYTKEIRDNFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.43
3 0.43
4 0.45
5 0.46
6 0.43
7 0.42
8 0.42
9 0.37
10 0.37
11 0.35
12 0.37
13 0.43
14 0.44
15 0.46
16 0.5
17 0.49
18 0.46
19 0.47
20 0.43
21 0.36
22 0.32
23 0.27
24 0.2
25 0.19
26 0.19
27 0.18
28 0.18
29 0.16
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.17
36 0.18
37 0.23
38 0.23
39 0.26
40 0.27
41 0.28
42 0.29
43 0.28
44 0.3
45 0.33
46 0.35
47 0.37
48 0.4
49 0.38
50 0.37
51 0.37
52 0.38
53 0.39
54 0.37
55 0.33
56 0.39
57 0.45
58 0.52
59 0.6
60 0.66
61 0.67
62 0.76
63 0.82
64 0.8
65 0.83
66 0.78
67 0.73
68 0.66
69 0.6
70 0.5
71 0.4
72 0.32
73 0.22
74 0.19
75 0.15
76 0.12
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.15
82 0.18
83 0.16
84 0.17
85 0.2
86 0.2
87 0.22
88 0.22
89 0.17
90 0.14
91 0.14
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.2
96 0.26
97 0.26
98 0.25
99 0.25
100 0.25
101 0.23
102 0.27
103 0.25
104 0.22
105 0.22
106 0.24
107 0.25
108 0.32
109 0.36
110 0.32
111 0.31
112 0.28
113 0.3
114 0.3
115 0.36
116 0.3
117 0.26
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.25
122 0.24
123 0.17
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.15
128 0.19
129 0.25
130 0.29
131 0.37
132 0.48
133 0.57
134 0.65
135 0.7
136 0.75
137 0.77
138 0.8
139 0.82
140 0.81
141 0.8
142 0.75
143 0.69
144 0.6
145 0.51
146 0.43
147 0.33
148 0.25
149 0.22
150 0.21
151 0.26
152 0.28
153 0.33
154 0.39
155 0.45
156 0.47
157 0.51
158 0.58
159 0.6
160 0.67
161 0.71
162 0.7
163 0.67
164 0.72
165 0.7
166 0.65
167 0.63
168 0.63
169 0.59
170 0.63
171 0.67
172 0.66
173 0.67
174 0.65
175 0.6