FuNGI

A0A066VFV8

Protein Details

Accession

A0A066VFV8

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
178-200	EQIRSGTRKEKRPRKLSIDTSRE	Hydrophilic
473-497	HPIAMRYTLRQKRIRRNESRRYGGM	Hydrophilic
505-529	EREPLEKEIKKRWRQRRLVDHLDAR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
185-191	RKEKRPR
485-492	RIRRNESR
505-520	EREPLEKEIKKRWRQR

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSASGRKSRDLIERVRYPNPIPLPPYPPKLTKVETPSSRYADGPETQGNVGGNAGLRFTSRLAQANSLPVVVDAEEGMPLDLNLFSGAWTGNLKAVAPHDLISAEALNLDPEDEFLLGAIARTTVGGSSPSQHVGSYATTGVNGAVRSSQAGLGPSVAPRASAAGVTWLRRTEYLGMEQIRSGTRKEKRPRKLSIDTSREAQIDRINRTFAKIKTQPLSELKHPTKGNLRAVQSWDLLPDAETWSTNFQIVRFQDWPGRVKDGKPIADPRVSSALLRPVHTDLNEQRISFYLITPEDEDSVTAAAAADAKAGDTGDGASAADQDGEDEELFGDDEETAAPKKRKRDDAVAKEASIEENITKSHQNVEQEIAERYEKKRRTGHVTPQPEQEGEEPSADDYTSFKFHRDYQPGEQDAAQASSQYVFVFDDSSGIPPQSDPERAWRAEQRAGLGGDDAAKAATKGKQSQRQIAYWHPIAMRYTLRQKRIRRNESRRYGGMWDRIRLAEREPLEKEIKKRWRQRRLVDHLDARLEAVLDESEGEMEDAEGEVEEGAATHDALHTDTHADTTVRDRHEPDGDASMEDAGVAAKDKVAGNKDSGSDRSDGDDGDDDDDDDDSESIDADEELKALAEEAEGQQDDTPVEGRRRRSAAAAAANSGPSDGDADADDDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.63
2	0.66
3	0.64
4	0.57
5	0.58
6	0.56
7	0.52
8	0.48
9	0.48
10	0.52
11	0.54
12	0.6
13	0.57
14	0.55
15	0.54
16	0.55
17	0.54
18	0.54
19	0.55
20	0.57
21	0.58
22	0.6
23	0.63
24	0.6
25	0.58
26	0.51
27	0.46
28	0.41
29	0.37
30	0.35
31	0.31
32	0.29
33	0.28
34	0.29
35	0.26
36	0.21
37	0.18
38	0.15
39	0.13
40	0.11
41	0.11
42	0.09
43	0.09
44	0.1
45	0.12
46	0.15
47	0.17
48	0.23
49	0.25
50	0.29
51	0.3
52	0.34
53	0.33
54	0.29
55	0.25
56	0.19
57	0.18
58	0.14
59	0.12
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.07
64	0.07
65	0.06
66	0.05
67	0.06
68	0.05
69	0.06
70	0.06
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.07
75	0.07
76	0.08
77	0.09
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.14
87	0.14
88	0.14
89	0.14
90	0.12
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.07
95	0.06
96	0.07
97	0.05
98	0.05
99	0.06
100	0.06
101	0.06
102	0.05
103	0.06
104	0.05
105	0.06
106	0.05
107	0.04
108	0.04
109	0.05
110	0.05
111	0.04
112	0.05
113	0.07
114	0.08
115	0.11
116	0.13
117	0.15
118	0.15
119	0.15
120	0.15
121	0.15
122	0.15
123	0.14
124	0.13
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.1
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.12
142	0.11
143	0.13
144	0.11
145	0.1
146	0.09
147	0.11
148	0.09
149	0.09
150	0.08
151	0.13
152	0.16
153	0.17
154	0.19
155	0.19
156	0.2
157	0.2
158	0.22
159	0.19
160	0.19
161	0.21
162	0.25
163	0.25
164	0.25
165	0.25
166	0.24
167	0.23
168	0.22
169	0.21
170	0.24
171	0.3
172	0.39
173	0.5
174	0.58
175	0.66
176	0.73
177	0.8
178	0.8
179	0.82
180	0.82
181	0.82
182	0.79
183	0.71
184	0.65
185	0.59
186	0.51
187	0.42
188	0.33
189	0.28
190	0.26
191	0.29
192	0.27
193	0.27
194	0.26
195	0.3
196	0.34
197	0.3
198	0.34
199	0.34
200	0.39
201	0.41
202	0.42
203	0.44
204	0.43
205	0.47
206	0.43
207	0.48
208	0.44
209	0.47
210	0.46
211	0.44
212	0.46
213	0.48
214	0.51
215	0.47
216	0.47
217	0.43
218	0.47
219	0.46
220	0.38
221	0.31
222	0.24
223	0.19
224	0.16
225	0.13
226	0.1
227	0.09
228	0.09
229	0.09
230	0.09
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.15
237	0.16
238	0.2
239	0.19
240	0.2
241	0.23
242	0.25
243	0.29
244	0.25
245	0.3
246	0.27
247	0.26
248	0.32
249	0.34
250	0.34
251	0.34
252	0.37
253	0.35
254	0.37
255	0.36
256	0.31
257	0.29
258	0.27
259	0.24
260	0.2
261	0.24
262	0.22
263	0.23
264	0.22
265	0.19
266	0.21
267	0.21
268	0.24
269	0.19
270	0.25
271	0.26
272	0.24
273	0.22
274	0.22
275	0.24
276	0.19
277	0.17
278	0.12
279	0.11
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.11
284	0.1
285	0.1
286	0.07
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.04
291	0.03
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.04
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.03
309	0.03
310	0.03
311	0.03
312	0.04
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.03
321	0.03
322	0.03
323	0.04
324	0.05
325	0.09
326	0.13
327	0.15
328	0.23
329	0.29
330	0.37
331	0.4
332	0.5
333	0.57
334	0.62
335	0.68
336	0.62
337	0.56
338	0.49
339	0.45
340	0.35
341	0.24
342	0.16
343	0.07
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.11
350	0.13
351	0.14
352	0.15
353	0.17
354	0.17
355	0.18
356	0.18
357	0.17
358	0.16
359	0.17
360	0.18
361	0.25
362	0.26
363	0.31
364	0.36
365	0.39
366	0.47
367	0.52
368	0.6
369	0.61
370	0.66
371	0.63
372	0.61
373	0.58
374	0.48
375	0.42
376	0.33
377	0.26
378	0.19
379	0.17
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.08
387	0.11
388	0.11
389	0.12
390	0.13
391	0.19
392	0.27
393	0.31
394	0.35
395	0.38
396	0.45
397	0.45
398	0.45
399	0.4
400	0.33
401	0.28
402	0.24
403	0.17
404	0.1
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.07
409	0.07
410	0.05
411	0.06
412	0.07
413	0.06
414	0.07
415	0.07
416	0.09
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.1
422	0.12
423	0.14
424	0.13
425	0.2
426	0.26
427	0.26
428	0.3
429	0.33
430	0.35
431	0.37
432	0.37
433	0.32
434	0.3
435	0.29
436	0.25
437	0.2
438	0.16
439	0.12
440	0.11
441	0.1
442	0.06
443	0.06
444	0.06
445	0.08
446	0.11
447	0.14
448	0.21
449	0.3
450	0.38
451	0.43
452	0.52
453	0.53
454	0.53
455	0.53
456	0.51
457	0.5
458	0.43
459	0.41
460	0.33
461	0.3
462	0.28
463	0.28
464	0.25
465	0.22
466	0.32
467	0.35
468	0.43
469	0.5
470	0.58
471	0.66
472	0.74
473	0.81
474	0.81
475	0.86
476	0.88
477	0.89
478	0.87
479	0.78
480	0.7
481	0.65
482	0.6
483	0.58
484	0.51
485	0.44
486	0.39
487	0.39
488	0.38
489	0.33
490	0.29
491	0.27
492	0.25
493	0.28
494	0.27
495	0.31
496	0.35
497	0.38
498	0.41
499	0.45
500	0.53
501	0.57
502	0.66
503	0.72
504	0.76
505	0.82
506	0.87
507	0.88
508	0.87
509	0.87
510	0.85
511	0.79
512	0.72
513	0.64
514	0.54
515	0.43
516	0.34
517	0.24
518	0.16
519	0.11
520	0.08
521	0.06
522	0.06
523	0.06
524	0.05
525	0.05
526	0.06
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.03
538	0.04
539	0.04
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.07
547	0.09
548	0.09
549	0.1
550	0.11
551	0.11
552	0.11
553	0.17
554	0.23
555	0.25
556	0.27
557	0.29
558	0.32
559	0.36
560	0.37
561	0.33
562	0.32
563	0.29
564	0.27
565	0.25
566	0.21
567	0.16
568	0.13
569	0.11
570	0.06
571	0.05
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.08
576	0.1
577	0.15
578	0.19
579	0.21
580	0.23
581	0.26
582	0.28
583	0.3
584	0.3
585	0.28
586	0.26
587	0.24
588	0.25
589	0.23
590	0.21
591	0.19
592	0.2
593	0.19
594	0.19
595	0.19
596	0.15
597	0.15
598	0.15
599	0.13
600	0.1
601	0.09
602	0.07
603	0.07
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.07
609	0.07
610	0.06
611	0.07
612	0.06
613	0.06
614	0.06
615	0.06
616	0.05
617	0.07
618	0.08
619	0.13
620	0.13
621	0.14
622	0.14
623	0.15
624	0.15
625	0.14
626	0.16
627	0.16
628	0.25
629	0.29
630	0.34
631	0.41
632	0.45
633	0.46
634	0.48
635	0.49
636	0.49
637	0.53
638	0.49
639	0.44
640	0.42
641	0.4
642	0.35
643	0.29
644	0.21
645	0.12
646	0.12
647	0.09
648	0.08
649	0.09
650	0.1

A0A066VFV8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer