FuNGI

Q6CDK0

Protein Details

Accession

Q6CDK0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
36-63	LCIFKGIYPREPRSKKKANKGSTAPVTF	Hydrophilic
518-543	ADPAAAPKKAKRKADKMTKAEKQEEE	Hydrophilic
550-590	IMMSNKQKKLYKKMQYSNDKKSDREAELKKRRKLNEKKEKR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
48-53	RSKKKA
517-590	KADPAAAPKKAKRKADKMTKAEKQEEEDKKLRMIMMSNKQKKLYKKMQYSNDKKSDREAELKKRRKLNEKKEKR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto_mito 7.333, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001357 BRCT_dom IPR036420 BRCT_dom_sf IPR010613 PES
Gene Ontology	GO:0005654 C:nucleoplasm GO:0070545 C:PeBoW complex GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0043021 F:ribonucleoprotein complex binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	yli:YALI0B23342g -
Pfam	View protein in Pfam PF16589 BRCT_2 PF06732 Pescadillo_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50172 BRCT
CDD	cd17709 BRCT_pescadillo_like

Amino Acid Sequences

MGQIKKKHTAGAARNFITRTQAIRKLQVSLADFRRLCIFKGIYPREPRSKKKANKGSTAPVTFYYAKDIQYLLHEPVLDKFREHKTFAKKLTRALGRGDLHDAKRIDENRPRYHLDHIIKERYPTFMDALRDIDDALSMLFLFAALPASDDVSARLVSEAEAICTQWMAFVARERLVRKVFVSIKGVYYSANIRGVEVMWLVPFRFPQNIPADIDFRVMLTFLEFYTTLLHFVLYKLYNENGLVFPPIINSTKLSGVGGINAYVLESRQNAGVVPQIEGNSEAKVENVSAAVLSKAAKADAGEEEEVEEEEEVEDDGLDSFSAEKGDALAQPTFNSTAGQLFSNFTIFIGREVPLDIIEFLIIAFGGKVISESAMDELIDNEDETRGNVIDEKTLKQKFNLASVTHQITDRPTLREKVPGRTYVQPQWVFDSINEGKLLPVSEYAPGERLPAHLSPWGDAGTYDPTADVSDASDDDEDDEDIEVAPEDYDKDDEEEEAEAEAKQHQRELEAEAKGTKADPAAAPKKAKRKADKMTKAEKQEEEDKKLRMIMMSNKQKKLYKKMQYSNDKKSDREAELKKRRKLNEKKEKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.58
3	0.53
4	0.49
5	0.42
6	0.38
7	0.37
8	0.44
9	0.44
10	0.51
11	0.52
12	0.5
13	0.49
14	0.49
15	0.45
16	0.44
17	0.45
18	0.46
19	0.44
20	0.41
21	0.47
22	0.42
23	0.4
24	0.39
25	0.37
26	0.33
27	0.44
28	0.49
29	0.5
30	0.58
31	0.64
32	0.67
33	0.73
34	0.77
35	0.76
36	0.8
37	0.81
38	0.84
39	0.86
40	0.84
41	0.85
42	0.84
43	0.83
44	0.82
45	0.75
46	0.66
47	0.57
48	0.54
49	0.46
50	0.39
51	0.36
52	0.29
53	0.27
54	0.26
55	0.25
56	0.2
57	0.24
58	0.26
59	0.21
60	0.21
61	0.21
62	0.2
63	0.25
64	0.29
65	0.24
66	0.22
67	0.26
68	0.33
69	0.38
70	0.41
71	0.44
72	0.49
73	0.57
74	0.65
75	0.69
76	0.63
77	0.63
78	0.69
79	0.67
80	0.6
81	0.56
82	0.55
83	0.47
84	0.47
85	0.48
86	0.45
87	0.4
88	0.44
89	0.4
90	0.33
91	0.39
92	0.39
93	0.4
94	0.42
95	0.5
96	0.5
97	0.55
98	0.58
99	0.53
100	0.56
101	0.57
102	0.55
103	0.56
104	0.55
105	0.57
106	0.54
107	0.55
108	0.5
109	0.43
110	0.39
111	0.32
112	0.27
113	0.24
114	0.25
115	0.23
116	0.24
117	0.23
118	0.21
119	0.19
120	0.16
121	0.12
122	0.1
123	0.08
124	0.06
125	0.04
126	0.04
127	0.03
128	0.03
129	0.03
130	0.03
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.07
137	0.07
138	0.08
139	0.08
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.07
145	0.1
146	0.1
147	0.1
148	0.1
149	0.1
150	0.09
151	0.09
152	0.09
153	0.06
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.11
158	0.14
159	0.17
160	0.21
161	0.22
162	0.26
163	0.27
164	0.28
165	0.25
166	0.3
167	0.31
168	0.31
169	0.33
170	0.29
171	0.29
172	0.28
173	0.28
174	0.2
175	0.18
176	0.17
177	0.15
178	0.18
179	0.16
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.14
184	0.12
185	0.1
186	0.06
187	0.07
188	0.07
189	0.07
190	0.08
191	0.09
192	0.12
193	0.12
194	0.18
195	0.22
196	0.24
197	0.25
198	0.26
199	0.27
200	0.24
201	0.25
202	0.18
203	0.14
204	0.11
205	0.09
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.07
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.09
217	0.09
218	0.08
219	0.08
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.12
227	0.13
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.07
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.12
240	0.12
241	0.11
242	0.1
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.06
250	0.04
251	0.05
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.06
259	0.09
260	0.09
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.1
265	0.11
266	0.11
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.05
284	0.05
285	0.05
286	0.06
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.07
295	0.06
296	0.04
297	0.03
298	0.04
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.03
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.06
314	0.07
315	0.08
316	0.09
317	0.09
318	0.09
319	0.1
320	0.11
321	0.1
322	0.09
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.04
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.02
352	0.02
353	0.02
354	0.02
355	0.03
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.05
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.06
374	0.06
375	0.09
376	0.09
377	0.13
378	0.15
379	0.17
380	0.24
381	0.28
382	0.29
383	0.27
384	0.33
385	0.3
386	0.34
387	0.36
388	0.3
389	0.29
390	0.33
391	0.34
392	0.29
393	0.28
394	0.23
395	0.2
396	0.26
397	0.25
398	0.25
399	0.26
400	0.28
401	0.29
402	0.37
403	0.39
404	0.41
405	0.43
406	0.43
407	0.44
408	0.47
409	0.52
410	0.49
411	0.55
412	0.48
413	0.44
414	0.44
415	0.41
416	0.35
417	0.29
418	0.31
419	0.23
420	0.23
421	0.23
422	0.18
423	0.17
424	0.17
425	0.18
426	0.1
427	0.1
428	0.09
429	0.11
430	0.12
431	0.12
432	0.13
433	0.13
434	0.13
435	0.12
436	0.13
437	0.14
438	0.13
439	0.15
440	0.16
441	0.17
442	0.17
443	0.18
444	0.17
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.13
450	0.12
451	0.11
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.09
456	0.06
457	0.07
458	0.07
459	0.09
460	0.08
461	0.08
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.12
483	0.11
484	0.1
485	0.1
486	0.08
487	0.09
488	0.13
489	0.16
490	0.16
491	0.19
492	0.19
493	0.2
494	0.22
495	0.27
496	0.29
497	0.27
498	0.28
499	0.26
500	0.26
501	0.25
502	0.23
503	0.19
504	0.13
505	0.14
506	0.15
507	0.23
508	0.29
509	0.35
510	0.42
511	0.48
512	0.57
513	0.63
514	0.7
515	0.7
516	0.74
517	0.78
518	0.82
519	0.86
520	0.86
521	0.88
522	0.86
523	0.85
524	0.82
525	0.74
526	0.69
527	0.69
528	0.67
529	0.65
530	0.63
531	0.57
532	0.52
533	0.51
534	0.46
535	0.38
536	0.36
537	0.37
538	0.42
539	0.51
540	0.58
541	0.6
542	0.66
543	0.7
544	0.72
545	0.73
546	0.73
547	0.73
548	0.74
549	0.79
550	0.83
551	0.88
552	0.89
553	0.89
554	0.89
555	0.83
556	0.73
557	0.72
558	0.7
559	0.65
560	0.65
561	0.64
562	0.65
563	0.72
564	0.81
565	0.8
566	0.81
567	0.84
568	0.85
569	0.86
570	0.86

Q6CDK0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer