FuNGI

A0A066VZ17

Protein Details

Accession

A0A066VZ17

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-30	LAERMPPAKRMRRHEPGKDAPPVG	Basic
32-51	RTSAEKTRRGHEEQRRDRAA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-57	PPAKRMRRHEPGKDAPPVGQRTSAEKTRRGHEEQRRDRAAASKKSR

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 8, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MSRGTHLAERMPPAKRMRRHEPGKDAPPVGQRTSAEKTRRGHEEQRRDRAAASKKSRGMNGDELSRGGRAFDVPSLPVDFDGVPVDGSQYLALVRHQAALHAPVYRVAFNPYEAAAAAAAGTKKEESKDQLRARHDADLDAVVSAAAACFRDSDSPETNLPPLPSLAWRQMFTCKFKAMRHRLSYPAANEAALHAVASESRMTPDDRNEGLWFQWIFGYGMRARRNQLKGHQQQQQAGSSTASALAAAAAEGDAEQELLWREPRTAALRALGHEHVLKLLEYMPEWFVHPAAQAPAAAESAPSSVIRSPSNTSKSTTAGAGLALGAGGTSASGPDAAALASVARLPDAVPPLLARWTFALLAALSPHLDGEEVSVLRTLARACVQAIVRNRWRFRVKAKNLLSSSSNASAGATPWTKEEERDVSAAVDMILDNDAEEQTGGQEHDDEDGIMHIGTPSRTRRGAAAVAEARGSRKGRSARLHDAEGADRLPAAGVASGLDEGAVGTHNAAMAHLLRQALAEEAQRAERSAWVIIAAVAGGWGQSDLWDEGMREVGKVAL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.69
5	0.74
6	0.8
7	0.83
8	0.83
9	0.84
10	0.83
11	0.82
12	0.73
13	0.68
14	0.67
15	0.62
16	0.54
17	0.49
18	0.43
19	0.42
20	0.47
21	0.5
22	0.48
23	0.5
24	0.52
25	0.54
26	0.61
27	0.62
28	0.65
29	0.67
30	0.73
31	0.76
32	0.81
33	0.79
34	0.72
35	0.67
36	0.65
37	0.64
38	0.64
39	0.62
40	0.6
41	0.62
42	0.65
43	0.66
44	0.61
45	0.58
46	0.56
47	0.52
48	0.47
49	0.42
50	0.39
51	0.36
52	0.33
53	0.26
54	0.18
55	0.15
56	0.12
57	0.13
58	0.14
59	0.15
60	0.14
61	0.17
62	0.18
63	0.17
64	0.15
65	0.16
66	0.13
67	0.12
68	0.12
69	0.11
70	0.09
71	0.09
72	0.1
73	0.08
74	0.09
75	0.08
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.1
81	0.11
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.16
86	0.18
87	0.19
88	0.18
89	0.18
90	0.17
91	0.19
92	0.19
93	0.18
94	0.19
95	0.18
96	0.17
97	0.18
98	0.15
99	0.14
100	0.13
101	0.12
102	0.09
103	0.07
104	0.06
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.08
109	0.08
110	0.1
111	0.12
112	0.16
113	0.2
114	0.27
115	0.37
116	0.43
117	0.49
118	0.52
119	0.55
120	0.53
121	0.53
122	0.46
123	0.37
124	0.32
125	0.25
126	0.21
127	0.16
128	0.14
129	0.08
130	0.07
131	0.06
132	0.04
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.05
137	0.06
138	0.09
139	0.11
140	0.17
141	0.19
142	0.22
143	0.23
144	0.24
145	0.25
146	0.24
147	0.23
148	0.18
149	0.15
150	0.14
151	0.15
152	0.17
153	0.22
154	0.22
155	0.22
156	0.23
157	0.31
158	0.34
159	0.37
160	0.37
161	0.35
162	0.37
163	0.41
164	0.51
165	0.52
166	0.57
167	0.58
168	0.59
169	0.58
170	0.59
171	0.58
172	0.49
173	0.44
174	0.35
175	0.29
176	0.24
177	0.2
178	0.17
179	0.12
180	0.1
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.06
185	0.06
186	0.05
187	0.06
188	0.08
189	0.1
190	0.12
191	0.15
192	0.19
193	0.19
194	0.2
195	0.2
196	0.2
197	0.18
198	0.21
199	0.18
200	0.13
201	0.13
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.14
206	0.12
207	0.19
208	0.22
209	0.23
210	0.25
211	0.33
212	0.36
213	0.37
214	0.42
215	0.47
216	0.51
217	0.57
218	0.62
219	0.57
220	0.57
221	0.55
222	0.51
223	0.42
224	0.35
225	0.27
226	0.2
227	0.17
228	0.13
229	0.09
230	0.06
231	0.04
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.02
240	0.02
241	0.02
242	0.02
243	0.03
244	0.04
245	0.05
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.11
251	0.14
252	0.15
253	0.15
254	0.17
255	0.17
256	0.18
257	0.2
258	0.18
259	0.15
260	0.14
261	0.13
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.06
266	0.08
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.07
292	0.09
293	0.09
294	0.11
295	0.14
296	0.2
297	0.25
298	0.25
299	0.26
300	0.26
301	0.27
302	0.26
303	0.23
304	0.17
305	0.13
306	0.11
307	0.09
308	0.07
309	0.05
310	0.04
311	0.03
312	0.02
313	0.02
314	0.02
315	0.02
316	0.02
317	0.02
318	0.02
319	0.02
320	0.02
321	0.03
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.03
326	0.03
327	0.03
328	0.04
329	0.04
330	0.03
331	0.04
332	0.04
333	0.06
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.09
338	0.1
339	0.13
340	0.12
341	0.1
342	0.09
343	0.11
344	0.11
345	0.1
346	0.1
347	0.07
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.04
357	0.05
358	0.08
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.08
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.09
368	0.1
369	0.1
370	0.14
371	0.15
372	0.19
373	0.24
374	0.31
375	0.38
376	0.45
377	0.46
378	0.49
379	0.53
380	0.53
381	0.57
382	0.6
383	0.59
384	0.62
385	0.65
386	0.67
387	0.63
388	0.61
389	0.54
390	0.45
391	0.42
392	0.33
393	0.28
394	0.19
395	0.18
396	0.16
397	0.14
398	0.17
399	0.14
400	0.12
401	0.13
402	0.18
403	0.17
404	0.18
405	0.22
406	0.22
407	0.23
408	0.24
409	0.23
410	0.19
411	0.19
412	0.18
413	0.13
414	0.09
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.07
427	0.07
428	0.06
429	0.07
430	0.07
431	0.09
432	0.09
433	0.08
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.07
441	0.08
442	0.14
443	0.17
444	0.22
445	0.24
446	0.25
447	0.26
448	0.3
449	0.33
450	0.29
451	0.34
452	0.31
453	0.3
454	0.31
455	0.29
456	0.26
457	0.27
458	0.27
459	0.2
460	0.25
461	0.31
462	0.38
463	0.47
464	0.53
465	0.58
466	0.61
467	0.63
468	0.58
469	0.55
470	0.48
471	0.41
472	0.34
473	0.23
474	0.18
475	0.15
476	0.12
477	0.09
478	0.07
479	0.05
480	0.05
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.05
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.08
497	0.08
498	0.1
499	0.12
500	0.12
501	0.11
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.13
506	0.14
507	0.14
508	0.16
509	0.19
510	0.19
511	0.2
512	0.19
513	0.2
514	0.2
515	0.19
516	0.17
517	0.14
518	0.14
519	0.13
520	0.12
521	0.09
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.08
531	0.08
532	0.1
533	0.12
534	0.12
535	0.13
536	0.19
537	0.19
538	0.16

A0A066VZ17

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer