FuNGI

A0A066VSK6

Protein Details

Accession

A0A066VSK6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
135-160	AGKRREARLTWKRSARWKKLHSGSIS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
131-153	SGAAAGKRREARLTWKRSARWKK

Subcellular Location(s)

extr 11, plas 9, nucl 2, cyto 2, cyto_nucl 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004821 Cyt_trans-like IPR037289 Elp2 IPR014729 Rossmann-like_a/b/a_fold IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0033588 C:elongator holoenzyme complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003824 F:catalytic activity GO:0009058 P:biosynthetic process GO:0002098 P:tRNA wobble uridine modification
Pfam	View protein in Pfam PF01467 CTP_transf_like PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MTRLIYASTGANRASNIADSGVVLLSGSSASSQHRSSASISTAEDQKTVLTVPVLAYATHKSVVFWEDPQGSASEGITSILHAGDAPITALRFLLQTAPQGSSAVYAGVISALAIGCTDGTVSVFRPHRASGAAAGKRREARLTWKRSARWKKLHSGSISTIGTVKPTPGFQVSPFLSEQLLVTGGSDGKLRICRMQAGEMDDATIEEPAVLDLAGAFPLSAALCVIPGSGRLILAVGITKAKVMIFAQTHNATTFERVAMLDGHDDWVRSLDMCSTAPDQSSDVRVEIMIATASQDSCIRLWRVKEQQQRTWTAPKDAFETLASKLEEDKADDRGVSTKAHPFSLSELHGTDKHFSIAFDALLVGHDGWVNDVRWAMPTLHAQPAALLSAGADGSSILWAPSPSGNATMKSLSDKKSHHDRQLRTFAHPDTLADSALWLPSARFGEVGGVATGGFYGSCWLPRSGDGDSALSMMAHAWNGATHLFRSESADAKWTAMPSIGGHLGAVKGVAWEPQGTWFLSAGLDRTTRLHGQSKRGKFRSCWYELARPQTHGYSLSSVAWLDRLSFASAADEKIVRIFEAPRGFVETVKNLGADQPDAGSDPAEIAVVLQLPGLQELLHPDALQKPLHEVAQVLQSRQRLTVLVVSSLFDSFTEKTGPAPELGFKTIERFLKWTYAQVWSVAVKRDVLDVDIDVLPLPATNAEQIGKLLGSARQIFSVADYEFEVGAQTAVEVTLLKPGPKPQAQERHISPDDGFPRHHAIALGGTFDHLHVGHKILLSMACLICTKRIVVGVTTDVMLKKKSNAHLLEGLPERIDRVDTFIRRFRSCFFPIKQDVVELADVCGPAGTDADLNALLVTDETIAGANMVADERKKNGLQPLERYVIGVIGAAGETVVHGKDAAEFAASKVGSTAIRKWLTSKGQQAGAHPLSASERPIGASVPPLGLSNRAVYEGRNIEEQPSQSGQPLGKASNSVATAQIRPPTEAELVVTTLWPELDKLYGHGYEMLSVAASPDGRFCASSCKSTSPEHAVIRLHDRNKGWKEVSVLAGHTLSITRIRFSPSGQYLLSVSRDRSWRLYQWSTSSDQYEPAAVLEKAHARILWDCAWLPGGDAFVTASRDKSVKIWAIKASTSGPVQVSLEATQTMLGPATAIAVATDNTIATGLENGQVHLLVKGADGTWRTKTSFSAHTEAVSEMCFRPGHPTQLLSAGEDGLVQLIELDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.18
3	0.16
4	0.14
5	0.13
6	0.12
7	0.13
8	0.11
9	0.09
10	0.08
11	0.06
12	0.06
13	0.05
14	0.05
15	0.05
16	0.06
17	0.1
18	0.15
19	0.16
20	0.19
21	0.2
22	0.23
23	0.25
24	0.28
25	0.27
26	0.26
27	0.27
28	0.28
29	0.33
30	0.31
31	0.29
32	0.24
33	0.22
34	0.2
35	0.19
36	0.16
37	0.1
38	0.1
39	0.11
40	0.15
41	0.15
42	0.14
43	0.16
44	0.18
45	0.19
46	0.2
47	0.2
48	0.16
49	0.18
50	0.22
51	0.22
52	0.2
53	0.25
54	0.24
55	0.25
56	0.26
57	0.24
58	0.21
59	0.19
60	0.18
61	0.12
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.06
70	0.07
71	0.06
72	0.06
73	0.07
74	0.08
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.09
81	0.12
82	0.12
83	0.16
84	0.18
85	0.2
86	0.2
87	0.2
88	0.2
89	0.17
90	0.16
91	0.11
92	0.09
93	0.07
94	0.06
95	0.06
96	0.06
97	0.04
98	0.05
99	0.04
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.04
104	0.04
105	0.05
106	0.04
107	0.05
108	0.06
109	0.08
110	0.16
111	0.19
112	0.21
113	0.24
114	0.25
115	0.26
116	0.27
117	0.27
118	0.27
119	0.34
120	0.38
121	0.4
122	0.42
123	0.46
124	0.48
125	0.49
126	0.45
127	0.39
128	0.43
129	0.49
130	0.55
131	0.59
132	0.62
133	0.67
134	0.74
135	0.82
136	0.81
137	0.82
138	0.8
139	0.81
140	0.82
141	0.83
142	0.77
143	0.72
144	0.65
145	0.62
146	0.54
147	0.44
148	0.38
149	0.3
150	0.28
151	0.21
152	0.2
153	0.14
154	0.14
155	0.17
156	0.18
157	0.2
158	0.19
159	0.27
160	0.26
161	0.27
162	0.27
163	0.25
164	0.21
165	0.2
166	0.19
167	0.12
168	0.11
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.08
173	0.09
174	0.09
175	0.09
176	0.12
177	0.16
178	0.18
179	0.2
180	0.22
181	0.26
182	0.28
183	0.33
184	0.32
185	0.33
186	0.33
187	0.29
188	0.27
189	0.22
190	0.2
191	0.15
192	0.12
193	0.07
194	0.05
195	0.05
196	0.04
197	0.05
198	0.04
199	0.03
200	0.03
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.03
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.05
213	0.05
214	0.04
215	0.05
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.08
232	0.13
233	0.14
234	0.16
235	0.21
236	0.22
237	0.23
238	0.22
239	0.24
240	0.19
241	0.2
242	0.19
243	0.14
244	0.13
245	0.12
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.11
250	0.1
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.1
259	0.09
260	0.11
261	0.11
262	0.14
263	0.14
264	0.15
265	0.15
266	0.16
267	0.16
268	0.15
269	0.18
270	0.16
271	0.14
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.1
277	0.07
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.14
287	0.15
288	0.18
289	0.21
290	0.29
291	0.38
292	0.46
293	0.55
294	0.58
295	0.64
296	0.67
297	0.69
298	0.65
299	0.65
300	0.58
301	0.56
302	0.51
303	0.44
304	0.42
305	0.37
306	0.34
307	0.26
308	0.25
309	0.19
310	0.22
311	0.2
312	0.16
313	0.17
314	0.19
315	0.18
316	0.19
317	0.2
318	0.17
319	0.18
320	0.18
321	0.17
322	0.17
323	0.18
324	0.16
325	0.17
326	0.21
327	0.22
328	0.23
329	0.22
330	0.2
331	0.22
332	0.24
333	0.23
334	0.18
335	0.17
336	0.19
337	0.21
338	0.22
339	0.21
340	0.17
341	0.17
342	0.16
343	0.15
344	0.15
345	0.14
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.06
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.07
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.12
364	0.11
365	0.11
366	0.14
367	0.17
368	0.2
369	0.2
370	0.19
371	0.17
372	0.17
373	0.15
374	0.11
375	0.08
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.03
382	0.03
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.04
387	0.04
388	0.05
389	0.06
390	0.07
391	0.08
392	0.12
393	0.13
394	0.14
395	0.15
396	0.15
397	0.15
398	0.19
399	0.23
400	0.22
401	0.27
402	0.28
403	0.32
404	0.42
405	0.48
406	0.53
407	0.57
408	0.59
409	0.62
410	0.71
411	0.67
412	0.59
413	0.57
414	0.48
415	0.43
416	0.38
417	0.29
418	0.21
419	0.2
420	0.16
421	0.12
422	0.11
423	0.08
424	0.08
425	0.08
426	0.05
427	0.05
428	0.08
429	0.09
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.09
434	0.1
435	0.1
436	0.07
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.03
443	0.02
444	0.04
445	0.04
446	0.06
447	0.08
448	0.09
449	0.1
450	0.11
451	0.14
452	0.14
453	0.16
454	0.15
455	0.14
456	0.13
457	0.13
458	0.12
459	0.09
460	0.07
461	0.06
462	0.05
463	0.04
464	0.04
465	0.03
466	0.03
467	0.04
468	0.05
469	0.06
470	0.05
471	0.07
472	0.08
473	0.08
474	0.12
475	0.13
476	0.14
477	0.14
478	0.17
479	0.16
480	0.17
481	0.17
482	0.14
483	0.12
484	0.11
485	0.1
486	0.08
487	0.09
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.07
492	0.07
493	0.06
494	0.06
495	0.04
496	0.04
497	0.04
498	0.05
499	0.05
500	0.05
501	0.06
502	0.08
503	0.09
504	0.09
505	0.1
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.07
511	0.08
512	0.08
513	0.08
514	0.09
515	0.11
516	0.12
517	0.15
518	0.23
519	0.25
520	0.34
521	0.42
522	0.5
523	0.57
524	0.6
525	0.6
526	0.54
527	0.59
528	0.58
529	0.53
530	0.51
531	0.46
532	0.5
533	0.5
534	0.57
535	0.5
536	0.43
537	0.4
538	0.35
539	0.31
540	0.24
541	0.21
542	0.14
543	0.14
544	0.12
545	0.11
546	0.1
547	0.09
548	0.09
549	0.08
550	0.06
551	0.06
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.09
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.07
562	0.08
563	0.08
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.11
568	0.13
569	0.13
570	0.12
571	0.16
572	0.16
573	0.17
574	0.17
575	0.14
576	0.14
577	0.14
578	0.14
579	0.1
580	0.11
581	0.1
582	0.09
583	0.08
584	0.06
585	0.06
586	0.07
587	0.07
588	0.05
589	0.05
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.04
594	0.03
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.03
599	0.03
600	0.03
601	0.04
602	0.04
603	0.03
604	0.03
605	0.05
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.1
611	0.12
612	0.13
613	0.11
614	0.11
615	0.12
616	0.13
617	0.12
618	0.1
619	0.09
620	0.16
621	0.17
622	0.15
623	0.17
624	0.18
625	0.19
626	0.19
627	0.18
628	0.11
629	0.11
630	0.15
631	0.12
632	0.12
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.1
638	0.06
639	0.07
640	0.07
641	0.08
642	0.09
643	0.08
644	0.09
645	0.11
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.11
650	0.11
651	0.12
652	0.13
653	0.11
654	0.13
655	0.17
656	0.18
657	0.16
658	0.17
659	0.17
660	0.21
661	0.21
662	0.21
663	0.19
664	0.21
665	0.2
666	0.18
667	0.19
668	0.16
669	0.17
670	0.16
671	0.15
672	0.12
673	0.12
674	0.13
675	0.12
676	0.1
677	0.09
678	0.07
679	0.09
680	0.08
681	0.08
682	0.07
683	0.07
684	0.06
685	0.05
686	0.05
687	0.03
688	0.04
689	0.04
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.06
696	0.05
697	0.06
698	0.07
699	0.09
700	0.1
701	0.1
702	0.1
703	0.11
704	0.11
705	0.11
706	0.12
707	0.09
708	0.08
709	0.08
710	0.09
711	0.08
712	0.08
713	0.07
714	0.05
715	0.05
716	0.04
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.08
724	0.09
725	0.1
726	0.11
727	0.15
728	0.21
729	0.23
730	0.27
731	0.3
732	0.41
733	0.42
734	0.48
735	0.46
736	0.49
737	0.47
738	0.44
739	0.37
740	0.33
741	0.35
742	0.3
743	0.29
744	0.22
745	0.27
746	0.26
747	0.25
748	0.19
749	0.15
750	0.16
751	0.15
752	0.13
753	0.08
754	0.08
755	0.08
756	0.07
757	0.08
758	0.05
759	0.06
760	0.07
761	0.08
762	0.1
763	0.1
764	0.1
765	0.1
766	0.1
767	0.09
768	0.11
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.09
773	0.1
774	0.11
775	0.1
776	0.09
777	0.11
778	0.11
779	0.1
780	0.12
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.12
785	0.11
786	0.11
787	0.12
788	0.11
789	0.14
790	0.19
791	0.23
792	0.3
793	0.3
794	0.33
795	0.37
796	0.37
797	0.38
798	0.35
799	0.31
800	0.23
801	0.22
802	0.18
803	0.13
804	0.14
805	0.09
806	0.12
807	0.18
808	0.21
809	0.25
810	0.3
811	0.35
812	0.35
813	0.36
814	0.34
815	0.35
816	0.37
817	0.41
818	0.39
819	0.42
820	0.44
821	0.46
822	0.43
823	0.36
824	0.32
825	0.26
826	0.24
827	0.16
828	0.13
829	0.11
830	0.1
831	0.09
832	0.08
833	0.06
834	0.05
835	0.05
836	0.05
837	0.04
838	0.04
839	0.05
840	0.05
841	0.05
842	0.05
843	0.05
844	0.04
845	0.04
846	0.04
847	0.03
848	0.03
849	0.04
850	0.04
851	0.04
852	0.04
853	0.04
854	0.03
855	0.03
856	0.04
857	0.05
858	0.06
859	0.07
860	0.1
861	0.14
862	0.14
863	0.17
864	0.24
865	0.31
866	0.34
867	0.39
868	0.42
869	0.42
870	0.41
871	0.38
872	0.32
873	0.24
874	0.19
875	0.14
876	0.07
877	0.05
878	0.04
879	0.04
880	0.03
881	0.03
882	0.03
883	0.04
884	0.04
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.06
889	0.06
890	0.06
891	0.07
892	0.07
893	0.07
894	0.12
895	0.12
896	0.1
897	0.1
898	0.12
899	0.13
900	0.15
901	0.18
902	0.22
903	0.23
904	0.24
905	0.26
906	0.32
907	0.36
908	0.4
909	0.45
910	0.4
911	0.45
912	0.47
913	0.46
914	0.48
915	0.43
916	0.37
917	0.29
918	0.25
919	0.22
920	0.22
921	0.21
922	0.13
923	0.12
924	0.12
925	0.13
926	0.13
927	0.1
928	0.12
929	0.11
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.11
934	0.13
935	0.13
936	0.13
937	0.12
938	0.14
939	0.14
940	0.14
941	0.2
942	0.21
943	0.21
944	0.22
945	0.22
946	0.22
947	0.25
948	0.26
949	0.23
950	0.22
951	0.22
952	0.2
953	0.23
954	0.2
955	0.21
956	0.23
957	0.2
958	0.18
959	0.19
960	0.18
961	0.19
962	0.2
963	0.17
964	0.18
965	0.19
966	0.21
967	0.22
968	0.27
969	0.23
970	0.24
971	0.24
972	0.24
973	0.23
974	0.2
975	0.19
976	0.15
977	0.15
978	0.14
979	0.13
980	0.1
981	0.09
982	0.08
983	0.07
984	0.06
985	0.06
986	0.08
987	0.08
988	0.1
989	0.13
990	0.13
991	0.14
992	0.16
993	0.16
994	0.15
995	0.15
996	0.13
997	0.09
998	0.09
999	0.08
1000	0.07
1001	0.08
1002	0.07
1003	0.08
1004	0.09
1005	0.1
1006	0.11
1007	0.11
1008	0.19
1009	0.21
1010	0.26
1011	0.28
1012	0.31
1013	0.34
1014	0.37
1015	0.42
1016	0.4
1017	0.45
1018	0.42
1019	0.43
1020	0.4
1021	0.4
1022	0.46
1023	0.47
1024	0.42
1025	0.41
1026	0.42
1027	0.48
1028	0.51
1029	0.55
1030	0.48
1031	0.44
1032	0.46
1033	0.44
1034	0.44
1035	0.36
1036	0.32
1037	0.26
1038	0.25
1039	0.21
1040	0.17
1041	0.14
1042	0.11
1043	0.14
1044	0.14
1045	0.14
1046	0.16
1047	0.21
1048	0.22
1049	0.23
1050	0.31
1051	0.3
1052	0.33
1053	0.31
1054	0.31
1055	0.27
1056	0.29
1057	0.32
1058	0.25
1059	0.24
1060	0.25
1061	0.29
1062	0.31
1063	0.35
1064	0.38
1065	0.4
1066	0.46
1067	0.5
1068	0.48
1069	0.5
1070	0.51
1071	0.49
1072	0.46
1073	0.43
1074	0.36
1075	0.32
1076	0.28
1077	0.24
1078	0.2
1079	0.17
1080	0.18
1081	0.14
1082	0.14
1083	0.16
1084	0.19
1085	0.2
1086	0.21
1087	0.21
1088	0.19
1089	0.21
1090	0.25
1091	0.24
1092	0.22
1093	0.21
1094	0.21
1095	0.22
1096	0.19
1097	0.18
1098	0.14
1099	0.13
1100	0.1
1101	0.1
1102	0.1
1103	0.1
1104	0.14
1105	0.13
1106	0.13
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.17
1110	0.18
1111	0.24
1112	0.28
1113	0.32
1114	0.36
1115	0.39
1116	0.41
1117	0.41
1118	0.41
1119	0.36
1120	0.32
1121	0.29
1122	0.27
1123	0.22
1124	0.21
1125	0.21
1126	0.2
1127	0.2
1128	0.16
1129	0.17
1130	0.14
1131	0.13
1132	0.12
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.09
1136	0.07
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.07
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.05
1143	0.06
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.08
1147	0.06
1148	0.07
1149	0.07
1150	0.07
1151	0.06
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.11
1155	0.12
1156	0.12
1157	0.13
1158	0.13
1159	0.13
1160	0.12
1161	0.12
1162	0.08
1163	0.08
1164	0.09
1165	0.08
1166	0.12
1167	0.14
1168	0.17
1169	0.22
1170	0.25
1171	0.27
1172	0.27
1173	0.3
1174	0.32
1175	0.37
1176	0.4
1177	0.39
1178	0.37
1179	0.36
1180	0.37
1181	0.34
1182	0.3
1183	0.23
1184	0.2
1185	0.15
1186	0.18
1187	0.17
1188	0.16
1189	0.23
1190	0.27
1191	0.33
1192	0.33
1193	0.34
1194	0.32
1195	0.39
1196	0.4
1197	0.33
1198	0.3
1199	0.23
1200	0.2
1201	0.18
1202	0.16
1203	0.09
1204	0.08
1205	0.06

A0A066VSK6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer