FuNGI

A0A066WCE3

Protein Details

Accession

A0A066WCE3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
444-467	FSSGSSSFRRRPDKRRRLEPCASV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
457-457	K

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010684 RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A
Gene Ontology	GO:0070449 C:elongin complex GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF06881 Elongin_A

Amino Acid Sequences

MKDWRRSPEPPSMMGGGWTRQDEQPPDATVQLVDSDVPARPPDSGATEAPESASAIAIGEFLRAKKKTPPESLQSLCKRILFRNVANVVDLGTMPFRLAKDMLEQMKPMQLMDMEQKSPHFMPKTEYIWRRHVLQEFPKVRKAVEAGDFDKPDGWRALYFEKVADREEFLAEIGSRTKERYATLSAQKQAIRAVITDQLVGKIFARRQPNAPLTQTKGSKLINRARGMTIKAPKNASKRVVLSTSPTAPATFMEKWVAEAESASRTAARRKNGPIPGAYATIPSPPSSSSVPPSRPPTATPAHRPPQSNAKTMSSPPLAATGDSSPTSLIRSSVEGMTFRLRTQPGGGPINFFGGGSSLGGGSTFKRSSQPKSIASVVTVTKRRAPDVVKEGQPRSNPASPSPGTQGVTDAEWPSGAESPSPVNMSGAQSPRSVREKMQSIDLFSSGSSSFRRRPDKRRRLEPCASVVTLTNKRVLSVSEGVGTSGGQSKRMIVEEISPRADAVQGDYGSQEGSSMDQMRPSAPSATSVTSAPQLRSLGSLKARLIPVSNDSSSMAPTHGTSGGIPAAASTSDSLHRSPKVTSEPAIPTASPSLHQQHSKQASHGHTGHHRPARSIFMPSSSVTSQIPKELLRVKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.37
3	0.29
4	0.28
5	0.28
6	0.26
7	0.26
8	0.32
9	0.32
10	0.33
11	0.35
12	0.34
13	0.34
14	0.31
15	0.29
16	0.23
17	0.2
18	0.17
19	0.13
20	0.11
21	0.1
22	0.11
23	0.11
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.13
28	0.14
29	0.16
30	0.19
31	0.21
32	0.21
33	0.24
34	0.24
35	0.24
36	0.23
37	0.21
38	0.17
39	0.13
40	0.13
41	0.08
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.06
46	0.08
47	0.09
48	0.11
49	0.19
50	0.19
51	0.22
52	0.3
53	0.4
54	0.47
55	0.55
56	0.61
57	0.6
58	0.69
59	0.71
60	0.72
61	0.7
62	0.65
63	0.58
64	0.55
65	0.51
66	0.46
67	0.51
68	0.48
69	0.44
70	0.49
71	0.5
72	0.46
73	0.44
74	0.39
75	0.3
76	0.24
77	0.21
78	0.12
79	0.09
80	0.09
81	0.08
82	0.1
83	0.09
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.16
88	0.23
89	0.27
90	0.27
91	0.27
92	0.26
93	0.3
94	0.29
95	0.24
96	0.18
97	0.14
98	0.15
99	0.21
100	0.24
101	0.21
102	0.22
103	0.23
104	0.26
105	0.27
106	0.31
107	0.27
108	0.24
109	0.27
110	0.33
111	0.38
112	0.43
113	0.48
114	0.47
115	0.52
116	0.53
117	0.52
118	0.51
119	0.51
120	0.49
121	0.51
122	0.56
123	0.56
124	0.59
125	0.6
126	0.55
127	0.5
128	0.46
129	0.4
130	0.35
131	0.33
132	0.34
133	0.32
134	0.37
135	0.37
136	0.34
137	0.35
138	0.29
139	0.25
140	0.22
141	0.19
142	0.15
143	0.17
144	0.2
145	0.2
146	0.2
147	0.19
148	0.21
149	0.21
150	0.22
151	0.2
152	0.19
153	0.17
154	0.17
155	0.16
156	0.12
157	0.12
158	0.1
159	0.1
160	0.1
161	0.11
162	0.11
163	0.13
164	0.14
165	0.15
166	0.16
167	0.19
168	0.23
169	0.27
170	0.35
171	0.4
172	0.4
173	0.43
174	0.43
175	0.4
176	0.36
177	0.31
178	0.23
179	0.18
180	0.17
181	0.16
182	0.16
183	0.16
184	0.15
185	0.14
186	0.14
187	0.14
188	0.13
189	0.13
190	0.15
191	0.19
192	0.25
193	0.26
194	0.29
195	0.37
196	0.41
197	0.41
198	0.43
199	0.42
200	0.42
201	0.46
202	0.44
203	0.38
204	0.37
205	0.35
206	0.36
207	0.39
208	0.42
209	0.44
210	0.44
211	0.45
212	0.42
213	0.43
214	0.41
215	0.4
216	0.4
217	0.37
218	0.39
219	0.41
220	0.44
221	0.47
222	0.51
223	0.47
224	0.43
225	0.41
226	0.4
227	0.39
228	0.34
229	0.32
230	0.3
231	0.28
232	0.25
233	0.22
234	0.19
235	0.16
236	0.16
237	0.17
238	0.14
239	0.13
240	0.14
241	0.13
242	0.14
243	0.15
244	0.14
245	0.09
246	0.09
247	0.09
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.17
254	0.21
255	0.23
256	0.27
257	0.32
258	0.4
259	0.43
260	0.45
261	0.38
262	0.37
263	0.36
264	0.32
265	0.27
266	0.2
267	0.16
268	0.15
269	0.15
270	0.11
271	0.1
272	0.09
273	0.11
274	0.12
275	0.13
276	0.16
277	0.21
278	0.23
279	0.27
280	0.31
281	0.32
282	0.31
283	0.31
284	0.32
285	0.33
286	0.35
287	0.37
288	0.4
289	0.44
290	0.47
291	0.48
292	0.45
293	0.49
294	0.49
295	0.46
296	0.4
297	0.36
298	0.34
299	0.33
300	0.35
301	0.25
302	0.21
303	0.17
304	0.17
305	0.15
306	0.13
307	0.13
308	0.09
309	0.1
310	0.1
311	0.1
312	0.08
313	0.08
314	0.09
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.07
319	0.09
320	0.09
321	0.1
322	0.09
323	0.11
324	0.13
325	0.13
326	0.12
327	0.15
328	0.14
329	0.14
330	0.16
331	0.18
332	0.19
333	0.23
334	0.23
335	0.21
336	0.21
337	0.22
338	0.19
339	0.16
340	0.11
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.08
351	0.09
352	0.09
353	0.15
354	0.19
355	0.24
356	0.32
357	0.37
358	0.36
359	0.4
360	0.42
361	0.36
362	0.34
363	0.31
364	0.25
365	0.25
366	0.26
367	0.23
368	0.25
369	0.26
370	0.26
371	0.28
372	0.28
373	0.29
374	0.32
375	0.37
376	0.39
377	0.43
378	0.44
379	0.45
380	0.43
381	0.4
382	0.39
383	0.38
384	0.33
385	0.29
386	0.34
387	0.3
388	0.32
389	0.31
390	0.29
391	0.25
392	0.24
393	0.23
394	0.17
395	0.17
396	0.16
397	0.13
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.09
403	0.09
404	0.08
405	0.08
406	0.09
407	0.11
408	0.12
409	0.11
410	0.09
411	0.11
412	0.13
413	0.17
414	0.18
415	0.19
416	0.2
417	0.2
418	0.25
419	0.28
420	0.27
421	0.25
422	0.29
423	0.34
424	0.33
425	0.4
426	0.36
427	0.34
428	0.34
429	0.32
430	0.25
431	0.19
432	0.2
433	0.11
434	0.12
435	0.12
436	0.15
437	0.21
438	0.29
439	0.39
440	0.45
441	0.56
442	0.66
443	0.75
444	0.8
445	0.85
446	0.86
447	0.85
448	0.85
449	0.79
450	0.74
451	0.67
452	0.58
453	0.48
454	0.41
455	0.39
456	0.37
457	0.33
458	0.32
459	0.27
460	0.27
461	0.27
462	0.26
463	0.24
464	0.21
465	0.21
466	0.18
467	0.18
468	0.18
469	0.17
470	0.16
471	0.11
472	0.15
473	0.14
474	0.14
475	0.14
476	0.15
477	0.18
478	0.19
479	0.19
480	0.13
481	0.2
482	0.25
483	0.29
484	0.29
485	0.27
486	0.25
487	0.24
488	0.25
489	0.18
490	0.15
491	0.16
492	0.15
493	0.15
494	0.15
495	0.15
496	0.14
497	0.13
498	0.1
499	0.05
500	0.06
501	0.09
502	0.12
503	0.12
504	0.14
505	0.15
506	0.15
507	0.17
508	0.18
509	0.17
510	0.15
511	0.18
512	0.19
513	0.2
514	0.21
515	0.19
516	0.19
517	0.22
518	0.24
519	0.21
520	0.22
521	0.21
522	0.2
523	0.23
524	0.24
525	0.24
526	0.25
527	0.29
528	0.27
529	0.31
530	0.32
531	0.3
532	0.3
533	0.26
534	0.27
535	0.29
536	0.28
537	0.24
538	0.24
539	0.24
540	0.23
541	0.21
542	0.17
543	0.11
544	0.11
545	0.13
546	0.12
547	0.12
548	0.11
549	0.13
550	0.13
551	0.12
552	0.11
553	0.09
554	0.09
555	0.08
556	0.09
557	0.07
558	0.09
559	0.12
560	0.15
561	0.16
562	0.21
563	0.24
564	0.25
565	0.26
566	0.3
567	0.35
568	0.37
569	0.37
570	0.39
571	0.4
572	0.42
573	0.43
574	0.37
575	0.32
576	0.31
577	0.29
578	0.24
579	0.25
580	0.28
581	0.31
582	0.37
583	0.37
584	0.44
585	0.52
586	0.53
587	0.5
588	0.52
589	0.5
590	0.54
591	0.54
592	0.5
593	0.51
594	0.56
595	0.62
596	0.61
597	0.58
598	0.53
599	0.55
600	0.56
601	0.49
602	0.48
603	0.4
604	0.37
605	0.38
606	0.36
607	0.37
608	0.29
609	0.29
610	0.25
611	0.28
612	0.26
613	0.27
614	0.3
615	0.25
616	0.31

A0A066WCE3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer