Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A067PPD1

Protein Details
Accession A0A067PPD1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
219-242KLNQDIDKKRKFSRKRANEDEGDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
106-114KKKARKARR
227-232KRKFSR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MTDTDDANVEGDENGKEGGKPTLEERRLKLEQLRTKMRSSAVANRQALIEESQKQKLGVREAARLDRQRKLAETLRLKADAEERGEDVERQKNWEYTIEENDEWEKKKARKARRADFQFHDDAHAARRKYKKDLDFLKPDLATYNKQKEMALGLAPGTLTASGSSSSSTEVSLTHSCDQLVPTSHQQQLAAENLYRDANSMLYADNTPSEEAIDRVVSKLNQDIDKKRKFSRKRANEDEGDITYINERNRVFNKKIARFYDKYTAEIRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.1
3 0.1
4 0.11
5 0.15
6 0.14
7 0.16
8 0.2
9 0.3
10 0.36
11 0.41
12 0.42
13 0.48
14 0.48
15 0.51
16 0.53
17 0.53
18 0.55
19 0.58
20 0.65
21 0.59
22 0.6
23 0.6
24 0.54
25 0.51
26 0.47
27 0.49
28 0.48
29 0.53
30 0.51
31 0.48
32 0.47
33 0.4
34 0.37
35 0.29
36 0.25
37 0.22
38 0.26
39 0.28
40 0.29
41 0.29
42 0.31
43 0.33
44 0.34
45 0.35
46 0.34
47 0.36
48 0.4
49 0.45
50 0.48
51 0.51
52 0.49
53 0.48
54 0.49
55 0.46
56 0.44
57 0.45
58 0.45
59 0.46
60 0.48
61 0.47
62 0.46
63 0.44
64 0.42
65 0.37
66 0.35
67 0.29
68 0.25
69 0.22
70 0.19
71 0.2
72 0.2
73 0.2
74 0.2
75 0.23
76 0.21
77 0.24
78 0.26
79 0.25
80 0.26
81 0.29
82 0.27
83 0.24
84 0.28
85 0.28
86 0.25
87 0.25
88 0.26
89 0.25
90 0.25
91 0.24
92 0.26
93 0.26
94 0.33
95 0.41
96 0.48
97 0.55
98 0.63
99 0.69
100 0.73
101 0.77
102 0.77
103 0.72
104 0.67
105 0.6
106 0.5
107 0.43
108 0.33
109 0.26
110 0.24
111 0.25
112 0.2
113 0.24
114 0.3
115 0.31
116 0.36
117 0.43
118 0.44
119 0.47
120 0.54
121 0.55
122 0.55
123 0.54
124 0.51
125 0.44
126 0.39
127 0.32
128 0.27
129 0.23
130 0.23
131 0.27
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.22
138 0.16
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.03
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.19
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.25
174 0.24
175 0.24
176 0.23
177 0.2
178 0.16
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.09
202 0.1
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.17
207 0.2
208 0.25
209 0.31
210 0.39
211 0.47
212 0.54
213 0.58
214 0.62
215 0.68
216 0.72
217 0.77
218 0.79
219 0.8
220 0.83
221 0.87
222 0.87
223 0.8
224 0.76
225 0.69
226 0.59
227 0.5
228 0.4
229 0.31
230 0.26
231 0.25
232 0.21
233 0.22
234 0.21
235 0.26
236 0.33
237 0.4
238 0.41
239 0.44
240 0.54
241 0.58
242 0.66
243 0.66
244 0.68
245 0.64
246 0.66
247 0.69
248 0.61
249 0.56
250 0.5
251 0.47
252 0.4
253 0.39
254 0.37
255 0.32
256 0.33
257 0.3