Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QIN1

Protein Details
Accession B6QIN1    Localization Confidence High Confidence Score 22.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-118DAENLKLIGRHKRKRRDDEDGEPKRTREGRREKKKRAQKDSDVESGBasic
155-176MDAALKQKTRRRRKADGIDLEQHydrophilic
394-413EDRFRRMKARQLNAGKPSRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-132GRHKRKRRDDEDGEPKRTREGRREKKKRAQKDSDVESGDGKAVRRKAKPRRE
146-168RRRRALDRAMDAALKQKTRRRRK
399-413RMKARQLNAGKPSRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
KEGG tmf:PMAA_098140  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPEPQSDSPAADRDELQAELDDLNDDGGDAADDAGLSDDESVLSEVDEAQFEDFNPDDVDIEDRPALDVDAENLKLIGRHKRKRRDDEDGEPKRTREGRREKKKRAQKDSDVESGDGKAVRRKAKPRREATPEDDETLSPEERRRRALDRAMDAALKQKTRRRRKADGIDLEQMADAEIEDMRRRMTDAARLDAEARRQGQPAMHKLKMLPEVLNLLNRNQYTASLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGELPAYSIQRDLMDVLGKLPINKDSLVASGIGKVIVFYTKSKRPELKIKRQAERLLADWTRPILQRSDDYSKRVYEEVEFDPTRLVNRANIAQQTAEEARARELLPPRLANRARREMGHTSYSIVPRSTVVQDNKFARPVGASGEDRFRRMKARQLNAGKPSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.27
3 0.26
4 0.27
5 0.24
6 0.22
7 0.18
8 0.17
9 0.15
10 0.14
11 0.11
12 0.09
13 0.08
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.04
22 0.05
23 0.05
24 0.06
25 0.05
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.07
31 0.07
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.11
51 0.13
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.12
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.13
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.14
66 0.17
67 0.26
68 0.32
69 0.42
70 0.52
71 0.63
72 0.73
73 0.82
74 0.86
75 0.86
76 0.84
77 0.85
78 0.86
79 0.84
80 0.81
81 0.73
82 0.64
83 0.61
84 0.6
85 0.55
86 0.54
87 0.57
88 0.61
89 0.7
90 0.8
91 0.84
92 0.87
93 0.92
94 0.92
95 0.92
96 0.9
97 0.89
98 0.87
99 0.82
100 0.79
101 0.7
102 0.6
103 0.5
104 0.41
105 0.32
106 0.25
107 0.2
108 0.18
109 0.22
110 0.28
111 0.35
112 0.44
113 0.53
114 0.62
115 0.71
116 0.73
117 0.76
118 0.77
119 0.78
120 0.74
121 0.72
122 0.64
123 0.56
124 0.5
125 0.41
126 0.35
127 0.31
128 0.25
129 0.17
130 0.2
131 0.24
132 0.26
133 0.3
134 0.32
135 0.34
136 0.4
137 0.46
138 0.48
139 0.45
140 0.45
141 0.42
142 0.38
143 0.34
144 0.33
145 0.29
146 0.25
147 0.26
148 0.28
149 0.38
150 0.49
151 0.59
152 0.61
153 0.66
154 0.74
155 0.8
156 0.85
157 0.82
158 0.76
159 0.7
160 0.61
161 0.52
162 0.42
163 0.31
164 0.21
165 0.13
166 0.07
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.09
176 0.1
177 0.16
178 0.17
179 0.2
180 0.2
181 0.21
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.18
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.22
192 0.28
193 0.31
194 0.3
195 0.29
196 0.29
197 0.32
198 0.33
199 0.3
200 0.21
201 0.16
202 0.18
203 0.18
204 0.21
205 0.17
206 0.14
207 0.17
208 0.16
209 0.17
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.08
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.06
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.08
273 0.1
274 0.16
275 0.23
276 0.27
277 0.34
278 0.39
279 0.44
280 0.53
281 0.61
282 0.66
283 0.7
284 0.75
285 0.76
286 0.77
287 0.76
288 0.71
289 0.63
290 0.53
291 0.51
292 0.43
293 0.36
294 0.31
295 0.28
296 0.26
297 0.25
298 0.24
299 0.19
300 0.21
301 0.24
302 0.3
303 0.37
304 0.37
305 0.39
306 0.4
307 0.39
308 0.39
309 0.35
310 0.3
311 0.23
312 0.25
313 0.24
314 0.29
315 0.27
316 0.25
317 0.26
318 0.25
319 0.24
320 0.21
321 0.2
322 0.14
323 0.18
324 0.22
325 0.25
326 0.27
327 0.26
328 0.24
329 0.23
330 0.26
331 0.23
332 0.22
333 0.2
334 0.18
335 0.19
336 0.21
337 0.22
338 0.22
339 0.27
340 0.31
341 0.35
342 0.39
343 0.39
344 0.46
345 0.52
346 0.54
347 0.57
348 0.59
349 0.57
350 0.55
351 0.6
352 0.56
353 0.56
354 0.53
355 0.44
356 0.38
357 0.41
358 0.42
359 0.38
360 0.31
361 0.27
362 0.23
363 0.26
364 0.27
365 0.3
366 0.34
367 0.36
368 0.43
369 0.47
370 0.5
371 0.49
372 0.45
373 0.38
374 0.32
375 0.28
376 0.26
377 0.28
378 0.26
379 0.27
380 0.37
381 0.38
382 0.39
383 0.41
384 0.38
385 0.4
386 0.41
387 0.48
388 0.48
389 0.55
390 0.62
391 0.69
392 0.75
393 0.77