Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QH05

Protein Details
Accession B6QH05    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-57EKYGRGKAVQVKKIRDKKLRGNLKAVEHydrophilic
473-504KLKNRGRGRNSALRKYLRKRGKTNVIDEKRLKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
33-51YGRGKAVQVKKIRDKKLRG
455-495KKRREEREEDNKPKDAIEKLKNRGRGRNSALRKYLRKRGKT
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11, nucl 8.5, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012952  BING4_C_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR040315  WDR46/Utp7  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG tmf:PMAA_092820  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08149  BING4CT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MAAVAGPVAKRSPQDLVEAREAKRRITEATEKYGRGKAVQVKKIRDKKLRGNLKAVEDRYKTAALRAKDAEILLENESGFLEPEAELERTYKVRQDEIRENVGIEVAKKGFELKLEELGPYRADYTRSGKNLLLAGRKGHVATMDWRAGKLGCELQLGETVRDAKWLHNNQFFAVAQKKNVYIYDHAGVELHCLNKHVEAKYLEFLPYHFLLASAANSGFLKYTDTSTGQLVAELPTRLGSPTALCQNPWNAILHVGHQNGTVTLWSPNSQTALVKALVHRGPVRSMAIDRLGRYMVSTGQDMRMNVWDIRMFKPVHSYSCYQPGSSVAISDRNLTAVGWGTQVSVWKGLFDAAASDAGKVQSPYMAWGGDGQRIETVRWCPYEDILGVTHDKGFASIIVPGAGEANFDATEVNPYETTKQRQEAEVKALLNKLQPEMISLDPNLIGKIDLISDKKRREEREEDNKPKDAIEKLKNRGRGRNSALRKYLRKRGKTNVIDEKRLKAEAIQRERSAHQNETLQKQREELGPALARFASKKDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.35
3 0.39
4 0.47
5 0.51
6 0.49
7 0.53
8 0.52
9 0.46
10 0.45
11 0.42
12 0.36
13 0.38
14 0.46
15 0.44
16 0.53
17 0.57
18 0.53
19 0.55
20 0.56
21 0.49
22 0.41
23 0.43
24 0.43
25 0.46
26 0.53
27 0.57
28 0.62
29 0.72
30 0.79
31 0.82
32 0.82
33 0.81
34 0.83
35 0.86
36 0.87
37 0.82
38 0.81
39 0.77
40 0.76
41 0.76
42 0.69
43 0.67
44 0.59
45 0.56
46 0.51
47 0.48
48 0.39
49 0.38
50 0.4
51 0.33
52 0.37
53 0.36
54 0.34
55 0.33
56 0.33
57 0.27
58 0.23
59 0.23
60 0.19
61 0.18
62 0.15
63 0.13
64 0.14
65 0.12
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.06
70 0.08
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.14
76 0.16
77 0.18
78 0.21
79 0.21
80 0.27
81 0.32
82 0.39
83 0.45
84 0.48
85 0.52
86 0.48
87 0.46
88 0.39
89 0.36
90 0.28
91 0.2
92 0.18
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.17
101 0.22
102 0.22
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.22
107 0.18
108 0.18
109 0.14
110 0.15
111 0.18
112 0.22
113 0.28
114 0.29
115 0.31
116 0.3
117 0.31
118 0.33
119 0.33
120 0.34
121 0.28
122 0.28
123 0.26
124 0.27
125 0.24
126 0.21
127 0.18
128 0.14
129 0.16
130 0.2
131 0.24
132 0.23
133 0.23
134 0.23
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.17
139 0.14
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.19
144 0.19
145 0.17
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.18
150 0.18
151 0.16
152 0.25
153 0.32
154 0.37
155 0.4
156 0.41
157 0.38
158 0.41
159 0.38
160 0.33
161 0.33
162 0.27
163 0.24
164 0.25
165 0.26
166 0.23
167 0.25
168 0.23
169 0.19
170 0.21
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.12
179 0.1
180 0.11
181 0.12
182 0.15
183 0.2
184 0.18
185 0.22
186 0.22
187 0.24
188 0.25
189 0.25
190 0.22
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.13
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.08
209 0.07
210 0.09
211 0.1
212 0.12
213 0.12
214 0.13
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.08
225 0.08
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.08
230 0.14
231 0.13
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.17
236 0.17
237 0.16
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.17
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.1
264 0.14
265 0.14
266 0.16
267 0.17
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.15
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.13
282 0.12
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.09
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.17
298 0.21
299 0.2
300 0.18
301 0.25
302 0.26
303 0.26
304 0.27
305 0.28
306 0.25
307 0.34
308 0.34
309 0.27
310 0.25
311 0.24
312 0.23
313 0.21
314 0.19
315 0.11
316 0.14
317 0.15
318 0.16
319 0.14
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.09
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.12
356 0.13
357 0.16
358 0.16
359 0.14
360 0.15
361 0.16
362 0.16
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.2
367 0.21
368 0.2
369 0.2
370 0.22
371 0.19
372 0.18
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.14
378 0.11
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.08
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.09
399 0.1
400 0.12
401 0.11
402 0.12
403 0.17
404 0.22
405 0.28
406 0.3
407 0.34
408 0.35
409 0.4
410 0.44
411 0.44
412 0.45
413 0.43
414 0.39
415 0.36
416 0.36
417 0.32
418 0.3
419 0.27
420 0.22
421 0.19
422 0.18
423 0.17
424 0.19
425 0.19
426 0.18
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.11
433 0.1
434 0.08
435 0.08
436 0.08
437 0.12
438 0.15
439 0.23
440 0.3
441 0.35
442 0.43
443 0.5
444 0.55
445 0.59
446 0.65
447 0.68
448 0.71
449 0.77
450 0.79
451 0.77
452 0.76
453 0.68
454 0.6
455 0.54
456 0.5
457 0.48
458 0.48
459 0.51
460 0.56
461 0.62
462 0.7
463 0.71
464 0.73
465 0.71
466 0.71
467 0.7
468 0.72
469 0.74
470 0.74
471 0.78
472 0.77
473 0.8
474 0.79
475 0.81
476 0.8
477 0.81
478 0.8
479 0.81
480 0.83
481 0.81
482 0.83
483 0.84
484 0.81
485 0.81
486 0.77
487 0.72
488 0.65
489 0.58
490 0.49
491 0.43
492 0.44
493 0.45
494 0.51
495 0.52
496 0.51
497 0.54
498 0.56
499 0.59
500 0.57
501 0.5
502 0.45
503 0.46
504 0.5
505 0.56
506 0.62
507 0.6
508 0.55
509 0.53
510 0.52
511 0.48
512 0.47
513 0.39
514 0.38
515 0.38
516 0.37
517 0.37
518 0.34
519 0.31
520 0.27