FuNGI

B6QD21

Protein Details

Accession

B6QD21

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-58	IIDSSRSRKKIRRHNEDDLKKELE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
562-599	GRGRGQANARGGPRGGGQARGGPQGGPGGRGRGQPANR

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_mito 9, nucl 7, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
KEGG	tmf:PMAA_086990 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MVDILSSKLSQLRLSSDKLDAANYDARLIEEEDGIIDSSRSRKKIRRHNEDDLKKELEDEFLTPSPRFSPDWLNRLQKRWDVSIDYQDIFDVAHTQTRTIIRFNREGLEGRVTGYHEMTVPASSATAKNSTSLLRRPAARADFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAEMESEMQASEQQRGMGKQGLDRIINFGTEGGLLEIPPGFTRGLNLKQAESKTAKEDDEEVEKTLDQEEAIKVERPEIDGNAEEYKEGEEEMVSEEEEEEEEEEDIDSLLPVEFPAFEPRSQLFAATAQKGGREWAHVVDVNKEISNFHDLVPNMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAVKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRNEFNDVGILTGDVQISPESSCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDMERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTSKRPVPLEHYLWSGKSMHKIVDSNKRFIEKGWKEADDILSGRDKQKAQKAAEAQAQSQAARGGQQGRGRGQANARGGPRGGGQARGGPQGGPGGRGRGQPANRGTGNIARTGRGGGRTTAAQDRNVWVHLVQHLRKENLLPACVFVFSKKRCEENANSLSNQDFCTATEKSAIHMIIEKSLARLKPEDRVLPQILRLRELLSRGVAVHHGGLLPIMKEIVEILFARTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGKGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGFVIIVASGKDEAPPAGALRRMMLGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLSKIKREPCAYCDVDLAVCHQASVEYEKLTRDLHLGLITSPVGKRLFMIKRLVVYRKDGIRTAGLIVREGISGGEPNIQVLEIGAVSDKRHPSDILPFLPSFRRFFRNLPTSSADMSLKVCRVALADVECVTNTFVKVTGPIWYLNIKKESLKFGDKELSKYCASWDSPFWDELDWDRVKELQIREILIKRQEQAAIAQGCHCLSCPDFLKHFEMQHDEWQVKENISQLRQLMSDQNLQLLPDYEQRVEVLKELGFVDAESRVMLKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTENEPTLTPRLEKGKEAIIRIADKVNDFQILHQVILSSEDSNDFTSKPRFGLMEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYLKMQQAQELIKRDVIFAASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.34
3	0.33
4	0.35
5	0.34
6	0.33
7	0.27
8	0.27
9	0.28
10	0.25
11	0.24
12	0.21
13	0.2
14	0.21
15	0.22
16	0.18
17	0.14
18	0.13
19	0.12
20	0.13
21	0.13
22	0.11
23	0.09
24	0.1
25	0.18
26	0.25
27	0.29
28	0.37
29	0.44
30	0.54
31	0.65
32	0.74
33	0.77
34	0.8
35	0.86
36	0.89
37	0.91
38	0.86
39	0.82
40	0.74
41	0.63
42	0.55
43	0.45
44	0.38
45	0.29
46	0.25
47	0.24
48	0.24
49	0.27
50	0.25
51	0.25
52	0.24
53	0.26
54	0.26
55	0.24
56	0.32
57	0.37
58	0.44
59	0.5
60	0.58
61	0.61
62	0.65
63	0.68
64	0.63
65	0.6
66	0.58
67	0.55
68	0.52
69	0.51
70	0.54
71	0.51
72	0.46
73	0.41
74	0.36
75	0.31
76	0.24
77	0.19
78	0.13
79	0.1
80	0.14
81	0.14
82	0.15
83	0.2
84	0.25
85	0.27
86	0.3
87	0.36
88	0.37
89	0.42
90	0.44
91	0.43
92	0.42
93	0.42
94	0.4
95	0.38
96	0.32
97	0.28
98	0.28
99	0.26
100	0.25
101	0.22
102	0.19
103	0.14
104	0.15
105	0.15
106	0.13
107	0.12
108	0.1
109	0.1
110	0.11
111	0.12
112	0.14
113	0.16
114	0.16
115	0.17
116	0.19
117	0.22
118	0.26
119	0.3
120	0.34
121	0.36
122	0.39
123	0.41
124	0.47
125	0.47
126	0.48
127	0.44
128	0.45
129	0.44
130	0.41
131	0.4
132	0.32
133	0.29
134	0.23
135	0.21
136	0.15
137	0.11
138	0.12
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.09
143	0.09
144	0.08
145	0.09
146	0.06
147	0.06
148	0.06
149	0.05
150	0.05
151	0.04
152	0.03
153	0.03
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.08
160	0.1
161	0.13
162	0.13
163	0.16
164	0.19
165	0.2
166	0.23
167	0.24
168	0.24
169	0.25
170	0.3
171	0.32
172	0.31
173	0.3
174	0.31
175	0.26
176	0.25
177	0.22
178	0.16
179	0.12
180	0.1
181	0.1
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.09
190	0.08
191	0.08
192	0.11
193	0.16
194	0.21
195	0.27
196	0.28
197	0.29
198	0.35
199	0.36
200	0.4
201	0.37
202	0.35
203	0.33
204	0.35
205	0.33
206	0.29
207	0.31
208	0.27
209	0.3
210	0.29
211	0.25
212	0.23
213	0.23
214	0.21
215	0.19
216	0.16
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.12
221	0.14
222	0.17
223	0.16
224	0.19
225	0.2
226	0.2
227	0.21
228	0.2
229	0.21
230	0.19
231	0.21
232	0.21
233	0.2
234	0.17
235	0.15
236	0.15
237	0.12
238	0.11
239	0.09
240	0.06
241	0.07
242	0.09
243	0.09
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.08
250	0.06
251	0.06
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.05
264	0.05
265	0.07
266	0.14
267	0.15
268	0.16
269	0.19
270	0.2
271	0.23
272	0.23
273	0.22
274	0.16
275	0.19
276	0.24
277	0.22
278	0.23
279	0.2
280	0.21
281	0.21
282	0.22
283	0.18
284	0.17
285	0.16
286	0.15
287	0.19
288	0.21
289	0.21
290	0.22
291	0.23
292	0.22
293	0.21
294	0.19
295	0.16
296	0.16
297	0.19
298	0.17
299	0.15
300	0.18
301	0.18
302	0.22
303	0.24
304	0.22
305	0.19
306	0.21
307	0.21
308	0.17
309	0.2
310	0.19
311	0.17
312	0.17
313	0.18
314	0.18
315	0.21
316	0.22
317	0.19
318	0.18
319	0.16
320	0.17
321	0.19
322	0.18
323	0.17
324	0.15
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.13
329	0.09
330	0.07
331	0.06
332	0.05
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.07
349	0.06
350	0.06
351	0.05
352	0.07
353	0.07
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.08
358	0.1
359	0.11
360	0.17
361	0.19
362	0.21
363	0.23
364	0.26
365	0.26
366	0.3
367	0.37
368	0.38
369	0.46
370	0.47
371	0.51
372	0.53
373	0.54
374	0.6
375	0.54
376	0.52
377	0.49
378	0.5
379	0.43
380	0.39
381	0.38
382	0.27
383	0.23
384	0.17
385	0.1
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.07
400	0.06
401	0.07
402	0.08
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.11
410	0.1
411	0.09
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.11
416	0.11
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.09
424	0.07
425	0.06
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.09
430	0.09
431	0.07
432	0.09
433	0.09
434	0.07
435	0.07
436	0.08
437	0.09
438	0.08
439	0.08
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.03
446	0.04
447	0.04
448	0.04
449	0.03
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.03
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.07
466	0.09
467	0.1
468	0.1
469	0.16
470	0.22
471	0.26
472	0.29
473	0.33
474	0.37
475	0.39
476	0.44
477	0.41
478	0.41
479	0.44
480	0.47
481	0.45
482	0.44
483	0.42
484	0.39
485	0.39
486	0.33
487	0.28
488	0.28
489	0.31
490	0.31
491	0.31
492	0.32
493	0.3
494	0.29
495	0.29
496	0.24
497	0.19
498	0.2
499	0.19
500	0.17
501	0.18
502	0.21
503	0.26
504	0.35
505	0.36
506	0.36
507	0.36
508	0.37
509	0.35
510	0.33
511	0.39
512	0.3
513	0.34
514	0.35
515	0.33
516	0.32
517	0.34
518	0.33
519	0.24
520	0.22
521	0.16
522	0.15
523	0.16
524	0.16
525	0.19
526	0.2
527	0.23
528	0.29
529	0.35
530	0.34
531	0.39
532	0.4
533	0.4
534	0.44
535	0.4
536	0.34
537	0.29
538	0.28
539	0.23
540	0.2
541	0.16
542	0.11
543	0.1
544	0.12
545	0.11
546	0.14
547	0.17
548	0.19
549	0.2
550	0.24
551	0.24
552	0.24
553	0.24
554	0.26
555	0.26
556	0.27
557	0.27
558	0.23
559	0.22
560	0.21
561	0.19
562	0.18
563	0.16
564	0.14
565	0.13
566	0.16
567	0.17
568	0.18
569	0.17
570	0.12
571	0.12
572	0.14
573	0.14
574	0.13
575	0.11
576	0.13
577	0.15
578	0.16
579	0.18
580	0.21
581	0.22
582	0.26
583	0.28
584	0.3
585	0.28
586	0.28
587	0.27
588	0.25
589	0.25
590	0.23
591	0.21
592	0.17
593	0.17
594	0.17
595	0.17
596	0.15
597	0.16
598	0.11
599	0.12
600	0.12
601	0.14
602	0.19
603	0.19
604	0.18
605	0.17
606	0.18
607	0.18
608	0.18
609	0.16
610	0.1
611	0.11
612	0.14
613	0.19
614	0.19
615	0.23
616	0.25
617	0.25
618	0.26
619	0.25
620	0.26
621	0.21
622	0.21
623	0.16
624	0.14
625	0.14
626	0.14
627	0.13
628	0.1
629	0.16
630	0.16
631	0.22
632	0.24
633	0.26
634	0.27
635	0.33
636	0.35
637	0.37
638	0.43
639	0.39
640	0.37
641	0.35
642	0.33
643	0.29
644	0.25
645	0.17
646	0.1
647	0.08
648	0.12
649	0.12
650	0.12
651	0.15
652	0.14
653	0.14
654	0.16
655	0.16
656	0.12
657	0.15
658	0.15
659	0.12
660	0.13
661	0.12
662	0.1
663	0.14
664	0.14
665	0.12
666	0.15
667	0.14
668	0.19
669	0.22
670	0.24
671	0.22
672	0.27
673	0.28
674	0.26
675	0.29
676	0.28
677	0.26
678	0.25
679	0.23
680	0.2
681	0.19
682	0.2
683	0.16
684	0.12
685	0.12
686	0.1
687	0.1
688	0.09
689	0.08
690	0.07
691	0.06
692	0.06
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.05
697	0.04
698	0.04
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.06
707	0.06
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.06
714	0.06
715	0.07
716	0.06
717	0.08
718	0.07
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.08
733	0.1
734	0.12
735	0.18
736	0.19
737	0.24
738	0.25
739	0.25
740	0.29
741	0.31
742	0.31
743	0.34
744	0.35
745	0.32
746	0.33
747	0.33
748	0.29
749	0.26
750	0.23
751	0.17
752	0.14
753	0.13
754	0.1
755	0.11
756	0.09
757	0.08
758	0.09
759	0.11
760	0.11
761	0.12
762	0.12
763	0.12
764	0.13
765	0.13
766	0.12
767	0.1
768	0.09
769	0.08
770	0.07
771	0.06
772	0.05
773	0.05
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.04
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.08
785	0.09
786	0.09
787	0.09
788	0.1
789	0.09
790	0.09
791	0.12
792	0.13
793	0.15
794	0.17
795	0.19
796	0.22
797	0.24
798	0.25
799	0.25
800	0.28
801	0.32
802	0.33
803	0.37
804	0.36
805	0.38
806	0.38
807	0.36
808	0.32
809	0.25
810	0.22
811	0.15
812	0.13
813	0.09
814	0.07
815	0.06
816	0.05
817	0.06
818	0.06
819	0.07
820	0.09
821	0.11
822	0.13
823	0.14
824	0.14
825	0.15
826	0.16
827	0.18
828	0.17
829	0.2
830	0.2
831	0.2
832	0.21
833	0.2
834	0.19
835	0.17
836	0.17
837	0.15
838	0.15
839	0.15
840	0.16
841	0.16
842	0.16
843	0.17
844	0.17
845	0.14
846	0.12
847	0.12
848	0.11
849	0.12
850	0.15
851	0.14
852	0.16
853	0.2
854	0.22
855	0.25
856	0.29
857	0.3
858	0.31
859	0.39
860	0.37
861	0.34
862	0.32
863	0.28
864	0.23
865	0.2
866	0.19
867	0.13
868	0.11
869	0.1
870	0.09
871	0.09
872	0.09
873	0.13
874	0.12
875	0.11
876	0.12
877	0.13
878	0.14
879	0.15
880	0.14
881	0.12
882	0.12
883	0.12
884	0.12
885	0.12
886	0.1
887	0.11
888	0.1
889	0.1
890	0.1
891	0.12
892	0.12
893	0.11
894	0.12
895	0.19
896	0.24
897	0.27
898	0.31
899	0.29
900	0.34
901	0.39
902	0.44
903	0.37
904	0.38
905	0.39
906	0.39
907	0.4
908	0.37
909	0.33
910	0.3
911	0.28
912	0.26
913	0.23
914	0.18
915	0.16
916	0.15
917	0.14
918	0.12
919	0.11
920	0.09
921	0.06
922	0.07
923	0.07
924	0.1
925	0.09
926	0.09
927	0.09
928	0.09
929	0.08
930	0.07
931	0.07
932	0.04
933	0.04
934	0.05
935	0.05
936	0.07
937	0.12
938	0.14
939	0.15
940	0.17
941	0.17
942	0.19
943	0.26
944	0.31
945	0.28
946	0.3
947	0.29
948	0.29
949	0.34
950	0.35
951	0.3
952	0.28
953	0.31
954	0.31
955	0.34
956	0.41
957	0.44
958	0.44
959	0.46
960	0.46
961	0.43
962	0.41
963	0.4
964	0.31
965	0.24
966	0.24
967	0.22
968	0.18
969	0.16
970	0.15
971	0.13
972	0.13
973	0.13
974	0.13
975	0.12
976	0.13
977	0.13
978	0.14
979	0.13
980	0.13
981	0.13
982	0.11
983	0.09
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.09
988	0.09
989	0.13
990	0.13
991	0.13
992	0.15
993	0.2
994	0.22
995	0.25
996	0.28
997	0.25
998	0.28
999	0.31
1000	0.35
1001	0.35
1002	0.39
1003	0.35
1004	0.37
1005	0.43
1006	0.41
1007	0.43
1008	0.4
1009	0.39
1010	0.33
1011	0.32
1012	0.3
1013	0.28
1014	0.28
1015	0.26
1016	0.26
1017	0.26
1018	0.27
1019	0.28
1020	0.26
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.19
1024	0.24
1025	0.2
1026	0.18
1027	0.19
1028	0.19
1029	0.21
1030	0.26
1031	0.25
1032	0.23
1033	0.25
1034	0.26
1035	0.31
1036	0.34
1037	0.37
1038	0.36
1039	0.37
1040	0.33
1041	0.34
1042	0.33
1043	0.29
1044	0.26
1045	0.29
1046	0.26
1047	0.24
1048	0.23
1049	0.22
1050	0.2
1051	0.2
1052	0.18
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.16
1056	0.19
1057	0.23
1058	0.25
1059	0.29
1060	0.34
1061	0.35
1062	0.37
1063	0.35
1064	0.36
1065	0.34
1066	0.38
1067	0.39
1068	0.35
1069	0.31
1070	0.34
1071	0.32
1072	0.27
1073	0.25
1074	0.24
1075	0.26
1076	0.27
1077	0.3
1078	0.26
1079	0.27
1080	0.26
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.24
1084	0.28
1085	0.25
1086	0.27
1087	0.25
1088	0.25
1089	0.24
1090	0.2
1091	0.19
1092	0.19
1093	0.22
1094	0.19
1095	0.19
1096	0.2
1097	0.22
1098	0.21
1099	0.2
1100	0.16
1101	0.14
1102	0.15
1103	0.15
1104	0.15
1105	0.12
1106	0.11
1107	0.11
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.08
1113	0.1
1114	0.1
1115	0.13
1116	0.17
1117	0.17
1118	0.24
1119	0.24
1120	0.25
1121	0.27
1122	0.29
1123	0.27
1124	0.24
1125	0.24
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.16
1129	0.13
1130	0.11
1131	0.09
1132	0.07
1133	0.07
1134	0.07
1135	0.06
1136	0.05
1137	0.04
1138	0.04
1139	0.05
1140	0.04
1141	0.04
1142	0.05
1143	0.06
1144	0.06
1145	0.06
1146	0.06
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.06
1150	0.06
1151	0.04
1152	0.04
1153	0.05
1154	0.05
1155	0.05
1156	0.06
1157	0.05
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.17
1161	0.21
1162	0.23
1163	0.24
1164	0.27
1165	0.31
1166	0.33
1167	0.35
1168	0.31
1169	0.32
1170	0.38
1171	0.39
1172	0.38
1173	0.37
1174	0.39
1175	0.41
1176	0.42
1177	0.41
1178	0.38
1179	0.38
1180	0.38
1181	0.39
1182	0.32
1183	0.29
1184	0.29
1185	0.27
1186	0.26
1187	0.24
1188	0.23
1189	0.27
1190	0.26
1191	0.24
1192	0.22
1193	0.2
1194	0.16
1195	0.19
1196	0.2
1197	0.12
1198	0.11
1199	0.13
1200	0.14
1201	0.16
1202	0.17
1203	0.15
1204	0.18
1205	0.23
1206	0.24
1207	0.23
1208	0.25
1209	0.23
1210	0.23
1211	0.3
1212	0.27
1213	0.27
1214	0.26
1215	0.28
1216	0.25
1217	0.24
1218	0.23
1219	0.15
1220	0.14
1221	0.1
1222	0.12
1223	0.18
1224	0.21
1225	0.22
1226	0.25
1227	0.26
1228	0.28
1229	0.28
1230	0.28
1231	0.2
1232	0.18
1233	0.17
1234	0.14
1235	0.14
1236	0.12
1237	0.11
1238	0.13
1239	0.11
1240	0.1
1241	0.11
1242	0.12
1243	0.13
1244	0.19
1245	0.2
1246	0.22
1247	0.28
1248	0.34
1249	0.4
1250	0.42
1251	0.42
1252	0.39
1253	0.42
1254	0.46
1255	0.46
1256	0.43
1257	0.37
1258	0.36
1259	0.37
1260	0.39
1261	0.34
1262	0.26
1263	0.23
1264	0.25
1265	0.24
1266	0.24
1267	0.24
1268	0.26
1269	0.28
1270	0.31
1271	0.31
1272	0.31
1273	0.38
1274	0.43
1275	0.42
1276	0.4
1277	0.38
1278	0.36
1279	0.33
1280	0.29
1281	0.23

B6QD21

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer