Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q2K0

Protein Details
Accession B6Q2K0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-110SGPAERNQAKKNKRTKAPLHNAGPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-109AKKNKRTKAPLHNAGP
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.333, cyto 5, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG tmf:PMAA_018650  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MSNPLVAWALPKLSNFLPLDEESLKQIITYSAGLSREESAEHLKNLLGDAPPVLEFISSFNSRRTDSGISTPQSGTSTPRTAREDSGPAERNQAKKNKRTKAPLHNAGPPRRPENYGNVSGGYKKSDLEQDYMTASSRPNSLQPDLGPGYGSSSANSRNPSPAPKSNNIKAPPSAAGPLISDYLPNVKSKTSKAHRPAGSGSGSGHSTPGKGSVTTTNIADLTSAIAALEVSTNPTSTKKRQKCDCNASIHPLFTPAPNCLSCGKIICSLEGLQPCSFCGAQLLSSQEIQSMIKELRAERGQEKMRAHNEGVHHAGGPGISDSGPPSKLDAAVAHRNKLLAFQAQNAQRTRVVDEAADFETPNIGSTQWMSPAQRALALKKQQKILREMEEKAKPEWEKKQTVLSLDIKSGRVVRSYHTAPSAAVTPDEEEKEIDEAAMIDTRNETGSTGAAFSKNPLLASGGLMRPIWKATTDGEAGGEKNKEVRRTWRRVQDDNDDNEQWILDGGAHGYSNDSGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.25
4 0.26
5 0.26
6 0.31
7 0.28
8 0.28
9 0.24
10 0.24
11 0.22
12 0.17
13 0.17
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.15
19 0.17
20 0.17
21 0.18
22 0.19
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.21
27 0.24
28 0.24
29 0.23
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.22
34 0.16
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.08
42 0.08
43 0.09
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.21
48 0.24
49 0.26
50 0.27
51 0.3
52 0.28
53 0.28
54 0.35
55 0.38
56 0.37
57 0.39
58 0.38
59 0.35
60 0.32
61 0.3
62 0.26
63 0.25
64 0.3
65 0.29
66 0.35
67 0.39
68 0.4
69 0.43
70 0.43
71 0.42
72 0.38
73 0.45
74 0.43
75 0.38
76 0.44
77 0.46
78 0.47
79 0.49
80 0.56
81 0.56
82 0.61
83 0.71
84 0.72
85 0.76
86 0.8
87 0.82
88 0.84
89 0.86
90 0.86
91 0.81
92 0.8
93 0.8
94 0.78
95 0.75
96 0.68
97 0.63
98 0.56
99 0.56
100 0.5
101 0.51
102 0.5
103 0.47
104 0.44
105 0.4
106 0.38
107 0.36
108 0.34
109 0.27
110 0.2
111 0.16
112 0.18
113 0.22
114 0.23
115 0.23
116 0.23
117 0.22
118 0.22
119 0.23
120 0.21
121 0.16
122 0.14
123 0.13
124 0.14
125 0.13
126 0.16
127 0.2
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.27
132 0.26
133 0.25
134 0.22
135 0.17
136 0.18
137 0.18
138 0.18
139 0.12
140 0.13
141 0.16
142 0.19
143 0.21
144 0.19
145 0.21
146 0.23
147 0.29
148 0.34
149 0.38
150 0.42
151 0.48
152 0.54
153 0.55
154 0.61
155 0.58
156 0.54
157 0.48
158 0.44
159 0.37
160 0.31
161 0.27
162 0.19
163 0.17
164 0.14
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.12
171 0.12
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.16
176 0.19
177 0.29
178 0.31
179 0.4
180 0.45
181 0.54
182 0.54
183 0.55
184 0.54
185 0.48
186 0.43
187 0.34
188 0.28
189 0.2
190 0.19
191 0.16
192 0.15
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.1
198 0.09
199 0.11
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.08
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.03
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.1
223 0.15
224 0.22
225 0.33
226 0.39
227 0.47
228 0.55
229 0.64
230 0.71
231 0.76
232 0.75
233 0.71
234 0.66
235 0.64
236 0.57
237 0.47
238 0.37
239 0.3
240 0.24
241 0.18
242 0.17
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.13
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.17
258 0.17
259 0.18
260 0.14
261 0.14
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.1
266 0.09
267 0.07
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.15
284 0.17
285 0.19
286 0.18
287 0.25
288 0.28
289 0.32
290 0.34
291 0.36
292 0.37
293 0.38
294 0.37
295 0.33
296 0.32
297 0.3
298 0.3
299 0.23
300 0.2
301 0.16
302 0.16
303 0.12
304 0.11
305 0.07
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.16
319 0.25
320 0.27
321 0.27
322 0.27
323 0.27
324 0.26
325 0.25
326 0.22
327 0.17
328 0.17
329 0.17
330 0.24
331 0.27
332 0.33
333 0.32
334 0.32
335 0.29
336 0.29
337 0.29
338 0.24
339 0.21
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.12
346 0.1
347 0.11
348 0.1
349 0.1
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.11
356 0.14
357 0.15
358 0.16
359 0.18
360 0.18
361 0.2
362 0.2
363 0.22
364 0.27
365 0.35
366 0.4
367 0.43
368 0.5
369 0.48
370 0.52
371 0.54
372 0.52
373 0.52
374 0.51
375 0.5
376 0.51
377 0.54
378 0.51
379 0.46
380 0.47
381 0.41
382 0.42
383 0.48
384 0.48
385 0.47
386 0.47
387 0.53
388 0.49
389 0.49
390 0.49
391 0.45
392 0.39
393 0.37
394 0.38
395 0.31
396 0.3
397 0.31
398 0.26
399 0.24
400 0.23
401 0.22
402 0.27
403 0.28
404 0.3
405 0.29
406 0.28
407 0.24
408 0.25
409 0.26
410 0.19
411 0.17
412 0.15
413 0.14
414 0.17
415 0.18
416 0.17
417 0.14
418 0.15
419 0.16
420 0.15
421 0.12
422 0.09
423 0.08
424 0.09
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.08
434 0.09
435 0.1
436 0.1
437 0.11
438 0.12
439 0.12
440 0.14
441 0.18
442 0.18
443 0.17
444 0.16
445 0.17
446 0.16
447 0.19
448 0.22
449 0.18
450 0.19
451 0.19
452 0.19
453 0.18
454 0.19
455 0.18
456 0.14
457 0.15
458 0.15
459 0.2
460 0.2
461 0.19
462 0.2
463 0.2
464 0.2
465 0.23
466 0.22
467 0.17
468 0.24
469 0.28
470 0.31
471 0.34
472 0.45
473 0.51
474 0.59
475 0.68
476 0.71
477 0.74
478 0.77
479 0.8
480 0.79
481 0.78
482 0.75
483 0.72
484 0.63
485 0.56
486 0.48
487 0.41
488 0.3
489 0.21
490 0.15
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.1