FuNGI

B6QTP3

Protein Details

Accession

B6QTP3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-49	RPRAADPLVRPKRRPPPGRPGTNPAA	Hydrophilic
134-154	QQFTRPVRLQRRDPRAKPPDP	Hydrophilic
521-541	GTDTSRKKPKHAQPHSIPSPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-55	KIRRPRAADPLVRPKRRPPPGRPGTNPAAAKGVPA
409-430	EKREKEARKVIGKKVRKALQRR
486-510	KASTPSGRPKHTDALKKASGIGRKR
526-532	RKKPKHA
547-552	GAKKRN

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	tmf:PMAA_005560 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTTPTDPKASRPPTESAPMMKIRRPRAADPLVRPKRRPPPGRPGTNPAAAKGVPAPKPISAGPSTIKNATEPTPLRSQRPNVREDMTVNGFSSPPLSTFQDYPLVTTKRALREGLKHHVAKFISKKAIDPRNEQQFTRPVRLQRRDPRAKPPDPDAVKREDEKPIPWAMRDMTEAERAEFEAKKAAREKEREENLAQIAPSAATAQKRTNLPKPKTQQVMKADMTAEEIAKARVKYEEALPWHMEDFDNKNTWMGNYEAALSETYAMFVLESTGKMRMVPIDKWYRFSARNAFKTLTIEEAEKFMSKKIKDPRWFMEKQQEAVRQKELDAYAKQRKVYRGKEVSVAGLDGNDMDFEEDRFADDEEVDAGLFEEDEDTKAAEQRIKQDQLKANVFNLKEEKDYDEEEMREKREKEARKVIGKKVRKALQRREKNFDYSSGSDVNPYSDEESSDEDSDAENEKEEDKKTEEEKALAKEKEKESGASTKASTPSGRPKHTDALKKASGIGRKRIGSPNLSDASGTDTSRKKPKHAQPHSIPSPSSGLAHGAKKRNRLGGPGSGSDIEGGALSGADLSDAGKPKKLKLNLSRAGTPLGSRSGSPAAPLRAGTPEGGSALKGPLRTSTPRPSIPGAATPAGTNTTFPTPAEIHAAIPASGIASRDLLKIFHPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.54
3	0.48
4	0.48
5	0.51
6	0.51
7	0.51
8	0.54
9	0.54
10	0.6
11	0.61
12	0.59
13	0.6
14	0.66
15	0.69
16	0.71
17	0.75
18	0.76
19	0.78
20	0.77
21	0.77
22	0.78
23	0.8
24	0.8
25	0.78
26	0.79
27	0.82
28	0.88
29	0.85
30	0.83
31	0.79
32	0.77
33	0.69
34	0.59
35	0.53
36	0.42
37	0.37
38	0.35
39	0.36
40	0.31
41	0.34
42	0.35
43	0.31
44	0.35
45	0.34
46	0.33
47	0.27
48	0.28
49	0.27
50	0.31
51	0.33
52	0.33
53	0.32
54	0.28
55	0.3
56	0.29
57	0.35
58	0.3
59	0.32
60	0.39
61	0.42
62	0.46
63	0.5
64	0.57
65	0.58
66	0.62
67	0.61
68	0.56
69	0.56
70	0.53
71	0.48
72	0.46
73	0.41
74	0.36
75	0.32
76	0.28
77	0.24
78	0.22
79	0.21
80	0.15
81	0.11
82	0.13
83	0.16
84	0.18
85	0.19
86	0.22
87	0.28
88	0.27
89	0.28
90	0.33
91	0.32
92	0.3
93	0.33
94	0.37
95	0.36
96	0.39
97	0.4
98	0.37
99	0.43
100	0.5
101	0.54
102	0.57
103	0.54
104	0.52
105	0.55
106	0.5
107	0.5
108	0.49
109	0.48
110	0.47
111	0.44
112	0.48
113	0.51
114	0.58
115	0.56
116	0.56
117	0.57
118	0.61
119	0.63
120	0.59
121	0.55
122	0.55
123	0.55
124	0.55
125	0.52
126	0.49
127	0.57
128	0.64
129	0.69
130	0.71
131	0.76
132	0.79
133	0.79
134	0.82
135	0.81
136	0.8
137	0.74
138	0.7
139	0.69
140	0.64
141	0.65
142	0.58
143	0.54
144	0.52
145	0.51
146	0.48
147	0.45
148	0.42
149	0.37
150	0.37
151	0.37
152	0.34
153	0.31
154	0.31
155	0.25
156	0.25
157	0.24
158	0.23
159	0.2
160	0.24
161	0.24
162	0.22
163	0.21
164	0.2
165	0.21
166	0.19
167	0.17
168	0.19
169	0.19
170	0.23
171	0.29
172	0.35
173	0.39
174	0.44
175	0.5
176	0.52
177	0.57
178	0.56
179	0.51
180	0.48
181	0.42
182	0.38
183	0.32
184	0.22
185	0.17
186	0.13
187	0.12
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.13
192	0.15
193	0.19
194	0.24
195	0.3
196	0.38
197	0.46
198	0.49
199	0.56
200	0.6
201	0.64
202	0.67
203	0.65
204	0.65
205	0.6
206	0.64
207	0.55
208	0.51
209	0.42
210	0.34
211	0.33
212	0.25
213	0.19
214	0.12
215	0.12
216	0.11
217	0.14
218	0.14
219	0.12
220	0.13
221	0.14
222	0.14
223	0.17
224	0.21
225	0.2
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.23
230	0.22
231	0.19
232	0.17
233	0.18
234	0.18
235	0.19
236	0.18
237	0.19
238	0.18
239	0.18
240	0.17
241	0.13
242	0.1
243	0.09
244	0.1
245	0.09
246	0.1
247	0.1
248	0.08
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.05
254	0.04
255	0.04
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.08
264	0.11
265	0.14
266	0.15
267	0.21
268	0.3
269	0.3
270	0.33
271	0.35
272	0.36
273	0.34
274	0.37
275	0.4
276	0.38
277	0.42
278	0.42
279	0.4
280	0.37
281	0.37
282	0.34
283	0.27
284	0.19
285	0.17
286	0.14
287	0.14
288	0.13
289	0.12
290	0.12
291	0.12
292	0.17
293	0.16
294	0.23
295	0.31
296	0.4
297	0.45
298	0.51
299	0.54
300	0.57
301	0.58
302	0.54
303	0.55
304	0.48
305	0.44
306	0.45
307	0.47
308	0.41
309	0.42
310	0.41
311	0.32
312	0.29
313	0.3
314	0.25
315	0.21
316	0.2
317	0.25
318	0.3
319	0.32
320	0.34
321	0.35
322	0.41
323	0.45
324	0.48
325	0.5
326	0.48
327	0.47
328	0.48
329	0.45
330	0.39
331	0.3
332	0.26
333	0.16
334	0.11
335	0.09
336	0.05
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.07
366	0.08
367	0.1
368	0.12
369	0.17
370	0.24
371	0.28
372	0.3
373	0.35
374	0.39
375	0.43
376	0.46
377	0.41
378	0.36
379	0.36
380	0.34
381	0.3
382	0.28
383	0.22
384	0.19
385	0.19
386	0.2
387	0.17
388	0.18
389	0.18
390	0.18
391	0.17
392	0.2
393	0.21
394	0.22
395	0.25
396	0.24
397	0.27
398	0.33
399	0.38
400	0.42
401	0.49
402	0.54
403	0.58
404	0.63
405	0.66
406	0.69
407	0.69
408	0.68
409	0.66
410	0.66
411	0.65
412	0.68
413	0.7
414	0.71
415	0.75
416	0.75
417	0.75
418	0.72
419	0.69
420	0.62
421	0.54
422	0.49
423	0.4
424	0.37
425	0.31
426	0.27
427	0.23
428	0.22
429	0.19
430	0.14
431	0.13
432	0.12
433	0.1
434	0.11
435	0.11
436	0.14
437	0.15
438	0.15
439	0.14
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.14
444	0.11
445	0.09
446	0.09
447	0.1
448	0.13
449	0.14
450	0.15
451	0.16
452	0.2
453	0.21
454	0.27
455	0.26
456	0.27
457	0.3
458	0.32
459	0.37
460	0.35
461	0.36
462	0.37
463	0.37
464	0.4
465	0.37
466	0.33
467	0.29
468	0.33
469	0.32
470	0.27
471	0.27
472	0.25
473	0.26
474	0.27
475	0.24
476	0.23
477	0.32
478	0.37
479	0.4
480	0.4
481	0.43
482	0.49
483	0.55
484	0.6
485	0.55
486	0.55
487	0.54
488	0.51
489	0.5
490	0.46
491	0.46
492	0.41
493	0.44
494	0.42
495	0.41
496	0.45
497	0.49
498	0.48
499	0.45
500	0.43
501	0.43
502	0.38
503	0.36
504	0.31
505	0.25
506	0.26
507	0.24
508	0.22
509	0.21
510	0.22
511	0.27
512	0.36
513	0.38
514	0.39
515	0.47
516	0.56
517	0.62
518	0.68
519	0.74
520	0.74
521	0.82
522	0.83
523	0.76
524	0.66
525	0.57
526	0.51
527	0.41
528	0.33
529	0.22
530	0.2
531	0.2
532	0.26
533	0.31
534	0.36
535	0.4
536	0.47
537	0.51
538	0.55
539	0.52
540	0.52
541	0.5
542	0.5
543	0.5
544	0.44
545	0.42
546	0.34
547	0.33
548	0.27
549	0.22
550	0.14
551	0.09
552	0.07
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.03
557	0.03
558	0.03
559	0.03
560	0.04
561	0.08
562	0.14
563	0.15
564	0.2
565	0.22
566	0.27
567	0.36
568	0.42
569	0.48
570	0.52
571	0.62
572	0.65
573	0.69
574	0.67
575	0.59
576	0.56
577	0.47
578	0.38
579	0.3
580	0.26
581	0.21
582	0.18
583	0.2
584	0.21
585	0.2
586	0.22
587	0.24
588	0.23
589	0.23
590	0.24
591	0.21
592	0.21
593	0.22
594	0.2
595	0.16
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.13
600	0.11
601	0.13
602	0.15
603	0.14
604	0.14
605	0.17
606	0.22
607	0.27
608	0.33
609	0.39
610	0.45
611	0.47
612	0.51
613	0.51
614	0.51
615	0.48
616	0.46
617	0.41
618	0.35
619	0.33
620	0.29
621	0.26
622	0.24
623	0.21
624	0.17
625	0.15
626	0.17
627	0.18
628	0.18
629	0.21
630	0.19
631	0.21
632	0.26
633	0.23
634	0.2
635	0.22
636	0.23
637	0.18
638	0.17
639	0.15
640	0.1
641	0.1
642	0.11
643	0.09
644	0.1
645	0.11
646	0.13
647	0.14
648	0.14
649	0.17
650	0.26
651	0.27
652	0.29
653	0.29
654	0.3
655	0.36
656	0.42
657	0.46
658	0.41
659	0.51
660	0.58
661	0.6
662	0.61
663	0.55
664	0.49
665	0.44
666	0.48
667	0.45
668	0.38
669	0.37
670	0.35
671	0.35
672	0.34
673	0.33
674	0.25
675	0.19
676	0.18
677	0.19
678	0.21
679	0.22
680	0.24
681	0.28
682	0.3
683	0.28

B6QTP3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer