Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A067QPF7

Protein Details
Accession A0A067QPF7    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
146-168ENKGANSGRKKPARKTRQVYLVPHydrophilic
576-602TSPSAPSSVPKPKKRKPIPPAVPSATGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
152-160SGRKKPARK
505-506KP
585-592PKPKKRKP
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF05793  TFIIF_alpha  
Amino Acid Sequences MPKKPKKDANDKAPVPQPSPKRLNSSTPRPKPTPPVDDDLNPPPPEGEYQEYRLMSSALNGWKYDVMKFHSTRPVDVSTWAQPVKLNRKDVTVSVAAPAQKPVGPMLGADGKPVIGADGKVVMVDADGRPIHNLGETSATGSGKDENKGANSGRKKPARKTRQVYLVPDEVRKLRKEERYPWVMEDGTGNEVWTGSMEEASKAENYAFFMPAENNIFKFVPSHRWYKFEKKRNLGVRSLDEAEQIMAKIAKNKEPERWLFHRTGRGASSSTSAMFKGEPDSNLPGSSSLVYNVGHSLGPNGRALRTVDTGMGHLFGDDDEEGMDTKRRKEREYGGEGDMDEVEFEEEFADDEEKMEPEDNDDEEAKEMEERIKREYRKANKLEGGEEEEDDEDESKLTTAGKAMKKIIKNLEKNNAYDSDDEENPYASEEEEEEEEPQEVPTGPAVQQQQQRPPSRSQTPSHATSTPSNKPPPSAPSSRATSPVPPGHGGHSVVALRATSPKAPKPKTGGKSPTVSRAGSPLAPSPPAGGGGGSRATSPVGSLAGSPPVQSPTIPGVSKPSAKRKATDELGPASPTSPSAPSSVPKPKKRKPIPPAVPSATGGILDDRMVIEWLRNTPHATTRDCIQHFTPYLTDETKKAKFTGLVKEVAQLRSGVLVLRNQYRSDGGVSPGATTSGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.65
3 0.63
4 0.6
5 0.59
6 0.65
7 0.62
8 0.63
9 0.63
10 0.69
11 0.7
12 0.74
13 0.75
14 0.77
15 0.8
16 0.76
17 0.78
18 0.77
19 0.77
20 0.75
21 0.69
22 0.66
23 0.62
24 0.61
25 0.61
26 0.58
27 0.56
28 0.47
29 0.41
30 0.35
31 0.32
32 0.31
33 0.3
34 0.29
35 0.26
36 0.3
37 0.36
38 0.36
39 0.35
40 0.33
41 0.29
42 0.22
43 0.2
44 0.22
45 0.21
46 0.23
47 0.22
48 0.23
49 0.26
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.27
54 0.34
55 0.35
56 0.4
57 0.45
58 0.45
59 0.45
60 0.45
61 0.44
62 0.36
63 0.38
64 0.35
65 0.31
66 0.36
67 0.34
68 0.3
69 0.28
70 0.36
71 0.44
72 0.47
73 0.49
74 0.44
75 0.48
76 0.5
77 0.48
78 0.45
79 0.37
80 0.3
81 0.25
82 0.27
83 0.24
84 0.23
85 0.23
86 0.19
87 0.17
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.14
92 0.13
93 0.16
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.19
98 0.17
99 0.16
100 0.16
101 0.13
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.08
112 0.07
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.14
129 0.18
130 0.17
131 0.19
132 0.19
133 0.18
134 0.2
135 0.24
136 0.26
137 0.3
138 0.34
139 0.41
140 0.49
141 0.56
142 0.61
143 0.67
144 0.75
145 0.77
146 0.81
147 0.79
148 0.79
149 0.8
150 0.8
151 0.75
152 0.7
153 0.66
154 0.58
155 0.53
156 0.47
157 0.42
158 0.4
159 0.37
160 0.37
161 0.37
162 0.44
163 0.5
164 0.56
165 0.6
166 0.61
167 0.61
168 0.58
169 0.53
170 0.44
171 0.36
172 0.3
173 0.22
174 0.18
175 0.16
176 0.14
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.05
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.16
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.16
207 0.22
208 0.25
209 0.32
210 0.31
211 0.36
212 0.42
213 0.51
214 0.59
215 0.6
216 0.66
217 0.65
218 0.72
219 0.76
220 0.75
221 0.69
222 0.64
223 0.58
224 0.53
225 0.48
226 0.39
227 0.3
228 0.26
229 0.21
230 0.16
231 0.12
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.14
236 0.15
237 0.2
238 0.26
239 0.28
240 0.33
241 0.39
242 0.42
243 0.44
244 0.46
245 0.46
246 0.45
247 0.46
248 0.47
249 0.42
250 0.41
251 0.34
252 0.32
253 0.28
254 0.24
255 0.22
256 0.16
257 0.15
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.12
266 0.13
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.1
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.12
290 0.14
291 0.14
292 0.14
293 0.13
294 0.13
295 0.12
296 0.13
297 0.11
298 0.11
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.09
311 0.09
312 0.14
313 0.19
314 0.22
315 0.23
316 0.29
317 0.36
318 0.41
319 0.46
320 0.45
321 0.41
322 0.39
323 0.37
324 0.32
325 0.24
326 0.15
327 0.09
328 0.06
329 0.05
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.07
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.08
353 0.07
354 0.07
355 0.1
356 0.13
357 0.14
358 0.19
359 0.25
360 0.27
361 0.34
362 0.43
363 0.48
364 0.55
365 0.58
366 0.59
367 0.57
368 0.57
369 0.51
370 0.44
371 0.39
372 0.3
373 0.25
374 0.2
375 0.15
376 0.14
377 0.12
378 0.11
379 0.06
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.07
387 0.14
388 0.17
389 0.19
390 0.24
391 0.29
392 0.31
393 0.36
394 0.43
395 0.45
396 0.49
397 0.52
398 0.58
399 0.55
400 0.54
401 0.52
402 0.45
403 0.37
404 0.31
405 0.28
406 0.23
407 0.2
408 0.2
409 0.18
410 0.16
411 0.14
412 0.14
413 0.11
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.09
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.12
432 0.14
433 0.19
434 0.25
435 0.29
436 0.37
437 0.43
438 0.49
439 0.49
440 0.52
441 0.54
442 0.56
443 0.58
444 0.53
445 0.53
446 0.53
447 0.53
448 0.51
449 0.45
450 0.41
451 0.41
452 0.45
453 0.42
454 0.43
455 0.45
456 0.41
457 0.42
458 0.42
459 0.42
460 0.42
461 0.4
462 0.38
463 0.38
464 0.42
465 0.41
466 0.42
467 0.37
468 0.34
469 0.35
470 0.35
471 0.32
472 0.29
473 0.29
474 0.28
475 0.29
476 0.27
477 0.21
478 0.2
479 0.18
480 0.16
481 0.15
482 0.12
483 0.1
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.19
488 0.26
489 0.35
490 0.39
491 0.44
492 0.49
493 0.57
494 0.58
495 0.64
496 0.64
497 0.59
498 0.63
499 0.6
500 0.61
501 0.55
502 0.5
503 0.4
504 0.36
505 0.34
506 0.28
507 0.27
508 0.22
509 0.21
510 0.21
511 0.21
512 0.18
513 0.16
514 0.16
515 0.14
516 0.1
517 0.08
518 0.1
519 0.11
520 0.1
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.12
532 0.12
533 0.13
534 0.13
535 0.14
536 0.15
537 0.14
538 0.16
539 0.17
540 0.22
541 0.21
542 0.2
543 0.25
544 0.29
545 0.36
546 0.4
547 0.46
548 0.51
549 0.53
550 0.56
551 0.55
552 0.59
553 0.57
554 0.56
555 0.5
556 0.45
557 0.45
558 0.42
559 0.37
560 0.29
561 0.25
562 0.2
563 0.17
564 0.14
565 0.13
566 0.15
567 0.17
568 0.18
569 0.26
570 0.36
571 0.44
572 0.52
573 0.61
574 0.67
575 0.76
576 0.84
577 0.87
578 0.86
579 0.88
580 0.88
581 0.86
582 0.87
583 0.8
584 0.73
585 0.63
586 0.55
587 0.44
588 0.34
589 0.26
590 0.18
591 0.13
592 0.1
593 0.1
594 0.08
595 0.08
596 0.09
597 0.09
598 0.1
599 0.12
600 0.15
601 0.18
602 0.2
603 0.21
604 0.23
605 0.31
606 0.34
607 0.35
608 0.34
609 0.37
610 0.44
611 0.43
612 0.45
613 0.39
614 0.42
615 0.4
616 0.41
617 0.37
618 0.29
619 0.32
620 0.32
621 0.32
622 0.29
623 0.35
624 0.37
625 0.38
626 0.37
627 0.36
628 0.38
629 0.41
630 0.47
631 0.44
632 0.44
633 0.41
634 0.46
635 0.48
636 0.43
637 0.39
638 0.28
639 0.24
640 0.21
641 0.21
642 0.17
643 0.15
644 0.18
645 0.22
646 0.3
647 0.32
648 0.31
649 0.33
650 0.33
651 0.32
652 0.32
653 0.29
654 0.24
655 0.26
656 0.26
657 0.24
658 0.23