Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QHZ5

Protein Details
Accession B6QHZ5    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-262EEEEAPKSRRNKRKAPARQQDNEPSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-252KSRRNKRKAP
357-361RRGKG
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010585  DNA_repair_prot_XRCC4  
IPR014751  XRCC4-like_C  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG tmf:PMAA_095940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06632  XRCC4  
Amino Acid Sequences MPAGSKDWVIRIPRSDNANEFVLVYIAPSGKTALDLKFIATEGENPYVGSLRQSRLKDIRAKNFQGTDQELEQILKSVLRIQIDTSQLGPKQDSEIEATALIKAKDEVNELVINVRKKIDSITQRVATLTLSQNDDQTIELFEWMGLMLSRTDVYEHQISTLTTQLQAAEKSIKDLKTSLDDLVQSKREHENMLLGSFAQVLNEKKLKIRNQQRLLASANVDSEKARELESTMDQEEEEEAPKSRRNKRKAPARQQDNEPSDSDDEFEKMDIDKPTPSRRGVAAAKAQAEEEEEEEGVEEDERPETPQPLEEETESEAEEERMASPPDEQPQKSSRPNLTRAADPPPPPRRDLPFLRRGKGADTAKRETEKVRKPDETGEATGGETDDDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.48
3 0.46
4 0.45
5 0.42
6 0.36
7 0.32
8 0.27
9 0.21
10 0.16
11 0.13
12 0.11
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.13
19 0.16
20 0.14
21 0.18
22 0.18
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.15
28 0.18
29 0.17
30 0.2
31 0.19
32 0.17
33 0.18
34 0.18
35 0.17
36 0.18
37 0.19
38 0.21
39 0.28
40 0.3
41 0.38
42 0.43
43 0.5
44 0.55
45 0.6
46 0.66
47 0.68
48 0.71
49 0.69
50 0.65
51 0.61
52 0.56
53 0.52
54 0.45
55 0.36
56 0.34
57 0.28
58 0.26
59 0.23
60 0.19
61 0.15
62 0.11
63 0.11
64 0.13
65 0.15
66 0.16
67 0.16
68 0.17
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.22
73 0.24
74 0.24
75 0.25
76 0.24
77 0.19
78 0.19
79 0.2
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.11
90 0.11
91 0.12
92 0.13
93 0.15
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.17
99 0.2
100 0.2
101 0.18
102 0.19
103 0.16
104 0.16
105 0.19
106 0.23
107 0.27
108 0.33
109 0.39
110 0.39
111 0.4
112 0.39
113 0.37
114 0.3
115 0.26
116 0.22
117 0.17
118 0.18
119 0.18
120 0.19
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.12
125 0.1
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.06
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.11
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.14
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.17
163 0.17
164 0.18
165 0.2
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.19
171 0.21
172 0.18
173 0.19
174 0.21
175 0.2
176 0.2
177 0.18
178 0.18
179 0.15
180 0.15
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.08
186 0.05
187 0.07
188 0.07
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.16
193 0.23
194 0.29
195 0.36
196 0.45
197 0.52
198 0.56
199 0.62
200 0.6
201 0.57
202 0.53
203 0.45
204 0.36
205 0.26
206 0.22
207 0.16
208 0.15
209 0.12
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.12
218 0.14
219 0.13
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.1
225 0.1
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.16
230 0.23
231 0.32
232 0.41
233 0.48
234 0.57
235 0.65
236 0.74
237 0.81
238 0.85
239 0.85
240 0.85
241 0.84
242 0.81
243 0.81
244 0.74
245 0.65
246 0.55
247 0.47
248 0.39
249 0.33
250 0.27
251 0.18
252 0.14
253 0.12
254 0.11
255 0.09
256 0.09
257 0.13
258 0.13
259 0.14
260 0.17
261 0.21
262 0.28
263 0.32
264 0.32
265 0.3
266 0.3
267 0.36
268 0.35
269 0.37
270 0.36
271 0.36
272 0.36
273 0.34
274 0.33
275 0.26
276 0.25
277 0.19
278 0.14
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.13
293 0.13
294 0.16
295 0.18
296 0.21
297 0.23
298 0.21
299 0.21
300 0.21
301 0.21
302 0.18
303 0.16
304 0.13
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.11
310 0.12
311 0.11
312 0.13
313 0.17
314 0.24
315 0.31
316 0.31
317 0.34
318 0.38
319 0.46
320 0.51
321 0.55
322 0.56
323 0.57
324 0.62
325 0.65
326 0.63
327 0.6
328 0.56
329 0.56
330 0.53
331 0.51
332 0.56
333 0.57
334 0.57
335 0.55
336 0.58
337 0.59
338 0.6
339 0.65
340 0.64
341 0.65
342 0.7
343 0.69
344 0.67
345 0.61
346 0.56
347 0.55
348 0.54
349 0.53
350 0.53
351 0.55
352 0.58
353 0.6
354 0.59
355 0.57
356 0.59
357 0.6
358 0.61
359 0.64
360 0.62
361 0.63
362 0.67
363 0.67
364 0.63
365 0.56
366 0.49
367 0.41
368 0.37
369 0.34
370 0.26
371 0.18