Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QTL2

Protein Details
Accession B6QTL2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
119-143NGSREVTRSKKYKPKPSRGKEIEVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-138REVTRSKKYKPKPSRGK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 11.5, mito 8.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045862  Trf4-like  
Gene Ontology GO:0031499  C:TRAMP complex  
GO:0043631  P:RNA polyadenylation  
KEGG tmf:PMAA_004990  -  
Amino Acid Sequences MRFGRQTCSLQCLALGDSRPILCDRPLSCLTKTTTPPAGPRRGYSSLKKVPLTTLGARYPVNKNSLKKTLEAQRTVNRERLVWKYYVRDKPDEGKTGDERTDNAAGVTPEPKNIKKVNNGSREVTRSKKYKPKPSRGKEIEVAHVRLPWVIPLEDGRAQRNPWLDSIQTPSKQNGDAKSILSNELLSLTAFLQPSSTEQAAVDYIIDDLSSKIQSIVPNPPQLIGSRYAELATNISAIDLMIHVNDERIPNFPKDKPPGISSQMKYKYLQIMTQTGNVLKDDLEYRDCRVIPDKSPSLVLFHRASGIPVRLFCRSYAPKIEEFIQDSISELPSLLPLYMTMRVFLESKHLFGWEAESLSSNGLVLLIMSFLKQQSEDFTSKCLAEQLLALLHTYGEQIDLTTTGISASPAEFFTGRSVRDRIRSLNKSGSNNSQLPDYLRGQRGLMAYKIHASHKGNKGMARHLCIQDPTNYLVDAGMRCFRTLELQQAFSGWYGGLKLALERWDEGHMDDGGILGQVLRADFGELVRRKKMLAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.19
4 0.22
5 0.22
6 0.23
7 0.23
8 0.23
9 0.21
10 0.26
11 0.25
12 0.29
13 0.35
14 0.37
15 0.37
16 0.4
17 0.43
18 0.44
19 0.46
20 0.45
21 0.46
22 0.46
23 0.53
24 0.56
25 0.61
26 0.56
27 0.56
28 0.57
29 0.57
30 0.6
31 0.6
32 0.61
33 0.61
34 0.65
35 0.64
36 0.57
37 0.53
38 0.53
39 0.51
40 0.45
41 0.43
42 0.38
43 0.39
44 0.39
45 0.4
46 0.4
47 0.39
48 0.42
49 0.42
50 0.45
51 0.5
52 0.57
53 0.54
54 0.5
55 0.53
56 0.56
57 0.58
58 0.58
59 0.56
60 0.55
61 0.62
62 0.64
63 0.62
64 0.53
65 0.46
66 0.47
67 0.47
68 0.43
69 0.39
70 0.39
71 0.41
72 0.5
73 0.55
74 0.56
75 0.54
76 0.55
77 0.59
78 0.63
79 0.6
80 0.52
81 0.5
82 0.49
83 0.48
84 0.46
85 0.39
86 0.33
87 0.31
88 0.32
89 0.25
90 0.22
91 0.2
92 0.18
93 0.18
94 0.21
95 0.16
96 0.19
97 0.24
98 0.25
99 0.29
100 0.34
101 0.39
102 0.44
103 0.54
104 0.59
105 0.63
106 0.66
107 0.63
108 0.63
109 0.62
110 0.58
111 0.55
112 0.53
113 0.49
114 0.54
115 0.61
116 0.65
117 0.7
118 0.75
119 0.8
120 0.84
121 0.86
122 0.89
123 0.85
124 0.83
125 0.79
126 0.71
127 0.69
128 0.63
129 0.57
130 0.47
131 0.41
132 0.35
133 0.28
134 0.24
135 0.17
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.15
141 0.19
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.23
146 0.26
147 0.29
148 0.26
149 0.23
150 0.24
151 0.22
152 0.21
153 0.27
154 0.3
155 0.29
156 0.29
157 0.29
158 0.29
159 0.32
160 0.33
161 0.29
162 0.28
163 0.27
164 0.26
165 0.27
166 0.26
167 0.23
168 0.2
169 0.17
170 0.12
171 0.11
172 0.1
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.13
183 0.13
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.09
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.09
201 0.1
202 0.13
203 0.21
204 0.23
205 0.26
206 0.26
207 0.25
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.18
212 0.16
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.09
236 0.12
237 0.14
238 0.18
239 0.2
240 0.26
241 0.3
242 0.33
243 0.33
244 0.33
245 0.35
246 0.36
247 0.41
248 0.35
249 0.39
250 0.4
251 0.4
252 0.38
253 0.36
254 0.36
255 0.29
256 0.3
257 0.23
258 0.23
259 0.22
260 0.23
261 0.22
262 0.17
263 0.17
264 0.15
265 0.13
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.09
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.16
274 0.16
275 0.17
276 0.2
277 0.21
278 0.21
279 0.27
280 0.27
281 0.24
282 0.26
283 0.25
284 0.23
285 0.21
286 0.23
287 0.17
288 0.16
289 0.17
290 0.15
291 0.16
292 0.15
293 0.17
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.22
301 0.23
302 0.26
303 0.3
304 0.31
305 0.31
306 0.32
307 0.34
308 0.28
309 0.28
310 0.25
311 0.2
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.13
316 0.1
317 0.08
318 0.07
319 0.06
320 0.07
321 0.06
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.1
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.12
330 0.12
331 0.12
332 0.17
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.15
337 0.15
338 0.14
339 0.18
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.07
348 0.06
349 0.05
350 0.05
351 0.04
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.04
356 0.05
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.1
362 0.16
363 0.17
364 0.17
365 0.19
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.18
370 0.13
371 0.11
372 0.11
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.07
396 0.07
397 0.09
398 0.08
399 0.09
400 0.14
401 0.17
402 0.17
403 0.21
404 0.24
405 0.27
406 0.33
407 0.36
408 0.39
409 0.46
410 0.5
411 0.52
412 0.57
413 0.59
414 0.59
415 0.59
416 0.59
417 0.56
418 0.53
419 0.48
420 0.41
421 0.36
422 0.33
423 0.34
424 0.3
425 0.31
426 0.31
427 0.32
428 0.3
429 0.33
430 0.33
431 0.31
432 0.29
433 0.24
434 0.22
435 0.25
436 0.27
437 0.26
438 0.3
439 0.32
440 0.39
441 0.45
442 0.52
443 0.51
444 0.52
445 0.53
446 0.55
447 0.56
448 0.52
449 0.51
450 0.45
451 0.46
452 0.45
453 0.44
454 0.39
455 0.37
456 0.35
457 0.29
458 0.26
459 0.23
460 0.2
461 0.21
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.19
466 0.19
467 0.19
468 0.19
469 0.23
470 0.24
471 0.31
472 0.3
473 0.31
474 0.31
475 0.31
476 0.31
477 0.25
478 0.23
479 0.13
480 0.1
481 0.08
482 0.09
483 0.09
484 0.08
485 0.09
486 0.11
487 0.15
488 0.16
489 0.17
490 0.18
491 0.2
492 0.21
493 0.2
494 0.21
495 0.17
496 0.16
497 0.14
498 0.13
499 0.1
500 0.09
501 0.08
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.09
510 0.11
511 0.2
512 0.24
513 0.3
514 0.33
515 0.34