Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QIA1

Protein Details
Accession B6QIA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-311RIAQRRQPGWQERENRRRRKRREAIALDRSWGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-301RRQPGWQERENRRRRKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9, mito 4, cysk 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013921  Mediator_Med20  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG tmf:PMAA_096910  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08612  Med20  
Amino Acid Sequences MPHTGVFFIPSSPNAPNILGPLTERLRSVYGDEAIPIGRWGLEHKLMRDTPSCLPASAHAPNPAPRARYVQFLSMTNHPKLGFVYASEDDDNETQTNQPITGREKTESGMIMSTVPIASSSEIFRHFVRCCEPIWCHRHTVTVTGTVYDVGDFRVRLGEVRQTQPQARPRGTIMEVEWRGPSMIADALSPVSSSLGLDKTQDSGVLAMDVDGDIDSAMKTPYIPTESEIQLEYEQISHLIREFWTKIYSSNDATTNNKQLPTTIREAILIPDVGRELKQRIAQRRQPGWQERENRRRRKRREAIALDRSWGGVSEKQQQQQDEEEDDMDAGVDLARQYMELFRFNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.18
7 0.18
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.25
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.19
21 0.17
22 0.17
23 0.14
24 0.1
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.14
29 0.21
30 0.24
31 0.26
32 0.34
33 0.35
34 0.39
35 0.39
36 0.38
37 0.34
38 0.37
39 0.36
40 0.29
41 0.28
42 0.26
43 0.29
44 0.29
45 0.28
46 0.27
47 0.29
48 0.33
49 0.38
50 0.39
51 0.35
52 0.33
53 0.38
54 0.34
55 0.38
56 0.36
57 0.36
58 0.35
59 0.36
60 0.37
61 0.38
62 0.42
63 0.36
64 0.36
65 0.31
66 0.29
67 0.27
68 0.26
69 0.18
70 0.13
71 0.18
72 0.16
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.17
79 0.12
80 0.12
81 0.1
82 0.12
83 0.13
84 0.11
85 0.12
86 0.14
87 0.18
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.24
92 0.24
93 0.25
94 0.23
95 0.19
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.1
100 0.09
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.07
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.21
116 0.2
117 0.2
118 0.23
119 0.25
120 0.29
121 0.34
122 0.34
123 0.33
124 0.32
125 0.36
126 0.32
127 0.33
128 0.26
129 0.26
130 0.24
131 0.21
132 0.2
133 0.16
134 0.15
135 0.11
136 0.1
137 0.06
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.07
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.14
146 0.16
147 0.19
148 0.22
149 0.23
150 0.26
151 0.31
152 0.37
153 0.37
154 0.35
155 0.33
156 0.31
157 0.33
158 0.31
159 0.27
160 0.21
161 0.23
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.17
166 0.16
167 0.15
168 0.13
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.07
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.15
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.21
235 0.24
236 0.22
237 0.24
238 0.25
239 0.26
240 0.31
241 0.33
242 0.35
243 0.34
244 0.33
245 0.3
246 0.3
247 0.33
248 0.33
249 0.34
250 0.29
251 0.27
252 0.27
253 0.27
254 0.26
255 0.23
256 0.18
257 0.13
258 0.11
259 0.12
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.14
264 0.18
265 0.24
266 0.31
267 0.4
268 0.49
269 0.56
270 0.63
271 0.67
272 0.7
273 0.74
274 0.76
275 0.73
276 0.72
277 0.74
278 0.75
279 0.8
280 0.83
281 0.84
282 0.86
283 0.89
284 0.91
285 0.92
286 0.91
287 0.91
288 0.92
289 0.91
290 0.9
291 0.9
292 0.82
293 0.72
294 0.63
295 0.52
296 0.41
297 0.32
298 0.24
299 0.18
300 0.21
301 0.28
302 0.34
303 0.39
304 0.44
305 0.44
306 0.44
307 0.46
308 0.46
309 0.4
310 0.35
311 0.3
312 0.26
313 0.24
314 0.2
315 0.15
316 0.1
317 0.07
318 0.05
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.12
326 0.15