FuNGI

B6QG92

Protein Details

Accession

B6QG92

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MASDKVEKKRKRDSDRHERPSKRPATQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-23	KKRKRDSDRHERPSKR

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11.333, mito_nucl 11.333, mito 5.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	tmf:PMAA_084790 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MASDKVEKKRKRDSDRHERPSKRPATQAQNLPPLTASVLKDDNELAPVLINAPGLQFPKKIHGFKPYTKESTKKEASSGRNKGIISTDLLLQSSEHPVLDFVGTEATEDADSQLKHYVAIVDPDQKTMQFVEVRRMTLRSSLKARNKEVEEEETSDYEAAAYRDQRKALTDAFGTKASRKAAQSEAENSMLAPAGASGAIESAILSSMPSQGIATANLKAQELQAQVQANKPIPTANLAATHPSEVYTLETLVAGGVSTLNQMPIQEWQDAVNAGEAITSTSRYVAHRVDAVVKSTNVTHLQVLRYILALIELTKNIKRGKGSDPPGSKRVPLRADLKKVLSGGSSAQALLPDPVVEAIRRKYAPGGVMVAHNITLLYTTLCALSLHIPPAPAKDGGTSSLGGNTPTELATDPSDLRDDLRLDTPTVTQYFRELGCRSEKPRETEFAKFGIKSKAEAANKRVCRLRLPLDFPKVSRGGGPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.91
3	0.93
4	0.93
5	0.9
6	0.87
7	0.87
8	0.85
9	0.79
10	0.77
11	0.76
12	0.75
13	0.76
14	0.78
15	0.75
16	0.76
17	0.7
18	0.61
19	0.52
20	0.43
21	0.37
22	0.32
23	0.25
24	0.2
25	0.23
26	0.23
27	0.24
28	0.24
29	0.23
30	0.19
31	0.18
32	0.14
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.1
37	0.09
38	0.07
39	0.08
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.17
44	0.18
45	0.27
46	0.34
47	0.38
48	0.39
49	0.47
50	0.53
51	0.58
52	0.65
53	0.64
54	0.64
55	0.65
56	0.68
57	0.64
58	0.67
59	0.66
60	0.59
61	0.57
62	0.58
63	0.62
64	0.65
65	0.66
66	0.61
67	0.59
68	0.57
69	0.52
70	0.47
71	0.39
72	0.32
73	0.26
74	0.23
75	0.19
76	0.2
77	0.18
78	0.15
79	0.15
80	0.16
81	0.15
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.1
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.08
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.15
101	0.14
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.12
106	0.16
107	0.17
108	0.21
109	0.22
110	0.24
111	0.24
112	0.22
113	0.22
114	0.19
115	0.21
116	0.18
117	0.18
118	0.25
119	0.27
120	0.29
121	0.3
122	0.3
123	0.27
124	0.3
125	0.33
126	0.29
127	0.33
128	0.41
129	0.48
130	0.54
131	0.58
132	0.57
133	0.56
134	0.56
135	0.52
136	0.48
137	0.43
138	0.39
139	0.36
140	0.29
141	0.27
142	0.22
143	0.18
144	0.13
145	0.11
146	0.08
147	0.09
148	0.13
149	0.17
150	0.2
151	0.21
152	0.21
153	0.22
154	0.24
155	0.23
156	0.22
157	0.19
158	0.19
159	0.2
160	0.22
161	0.21
162	0.2
163	0.22
164	0.21
165	0.24
166	0.22
167	0.23
168	0.25
169	0.27
170	0.28
171	0.28
172	0.29
173	0.26
174	0.25
175	0.21
176	0.18
177	0.14
178	0.11
179	0.07
180	0.04
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.04
195	0.04
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.06
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.09
204	0.1
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.12
209	0.12
210	0.11
211	0.14
212	0.14
213	0.15
214	0.17
215	0.19
216	0.17
217	0.17
218	0.16
219	0.14
220	0.12
221	0.14
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.14
227	0.13
228	0.13
229	0.11
230	0.1
231	0.09
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.06
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.02
245	0.03
246	0.03
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.08
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.12
272	0.12
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.19
277	0.18
278	0.2
279	0.18
280	0.18
281	0.17
282	0.16
283	0.18
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.1
302	0.15
303	0.16
304	0.19
305	0.2
306	0.23
307	0.29
308	0.36
309	0.4
310	0.45
311	0.51
312	0.53
313	0.56
314	0.54
315	0.51
316	0.46
317	0.47
318	0.41
319	0.39
320	0.43
321	0.45
322	0.51
323	0.52
324	0.5
325	0.44
326	0.42
327	0.37
328	0.29
329	0.22
330	0.16
331	0.14
332	0.12
333	0.1
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.06
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.08
344	0.11
345	0.13
346	0.19
347	0.19
348	0.2
349	0.21
350	0.23
351	0.24
352	0.22
353	0.22
354	0.17
355	0.18
356	0.18
357	0.16
358	0.13
359	0.12
360	0.09
361	0.07
362	0.06
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.06
367	0.06
368	0.07
369	0.07
370	0.07
371	0.1
372	0.12
373	0.14
374	0.14
375	0.15
376	0.15
377	0.18
378	0.2
379	0.17
380	0.16
381	0.16
382	0.17
383	0.18
384	0.19
385	0.17
386	0.14
387	0.17
388	0.17
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.09
396	0.1
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.16
404	0.19
405	0.18
406	0.18
407	0.22
408	0.22
409	0.22
410	0.23
411	0.23
412	0.23
413	0.24
414	0.23
415	0.19
416	0.2
417	0.22
418	0.22
419	0.27
420	0.23
421	0.25
422	0.32
423	0.38
424	0.42
425	0.48
426	0.53
427	0.54
428	0.58
429	0.61
430	0.58
431	0.58
432	0.56
433	0.51
434	0.5
435	0.45
436	0.44
437	0.45
438	0.42
439	0.36
440	0.39
441	0.42
442	0.45
443	0.51
444	0.54
445	0.56
446	0.59
447	0.63
448	0.65
449	0.58
450	0.56
451	0.57
452	0.59
453	0.58
454	0.62
455	0.65
456	0.68
457	0.7
458	0.65
459	0.65
460	0.57
461	0.48
462	0.46

B6QG92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer