FuNGI

A0A066XPJ2

Protein Details

Accession

A0A066XPJ2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
19-49	PPQPAQPGQPRPPPIKRKPRGDPLVARKRPG	Basic
212-235	KDPNVDKKPKPKEKEKDVQFHRQP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-60	PRPPPIKRKPRGDPLVARKRPGAPRPAAPRPPP
218-236	KKPKPKEKEKDVQFHRQPR
433-451	AEEERRKEGKKTQKALIKR
529-539	LKKGKSLKRPG
552-558	SRKKLKK
603-604	KK

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPGLPNGQNPNGQQPPQPAQPGQPRPPPIKRKPRGDPLVARKRPGAPRPAAPRPPPGSLQTAPGARPSPGASGHHGLQRTETEDDIKSRRAANGGWLDPAPPNVREFKIVTTKKALRDGVRHHIMKLSSAKADLEKRGIDPTNQEEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKQEQPEPQPLDEKEAERLAQLKADREAIRAIELAKSAPSLKDPNVDKKPKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTVCFVATRDGKFAAIPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDVGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPARIKTESSTFRAASREEKLDHDQIDMEGDEFQDDDENPGLEQDNDEEYKEANDRIRRDQLGANLFGEADERRVEKEMEELRRAEEERRKEGKKTQKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSEDDSDEEKQKEDNKDKEKEDENKDKDKDPDAKDKITSGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAAASVHQSRSSTPSAGLKNNLGKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGSGARGTPAGSRAGSPMPATSGSKPGSPLPEGSPAPRAGSPNGPIEAWEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGPDKILRRKPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.52
3	0.52
4	0.48
5	0.47
6	0.49
7	0.51
8	0.55
9	0.47
10	0.49
11	0.57
12	0.63
13	0.63
14	0.65
15	0.65
16	0.69
17	0.78
18	0.8
19	0.8
20	0.82
21	0.83
22	0.85
23	0.88
24	0.9
25	0.88
26	0.87
27	0.86
28	0.86
29	0.88
30	0.82
31	0.75
32	0.69
33	0.69
34	0.69
35	0.66
36	0.65
37	0.59
38	0.64
39	0.7
40	0.75
41	0.76
42	0.71
43	0.73
44	0.68
45	0.67
46	0.62
47	0.56
48	0.53
49	0.45
50	0.45
51	0.41
52	0.39
53	0.35
54	0.36
55	0.34
56	0.27
57	0.28
58	0.25
59	0.23
60	0.24
61	0.26
62	0.27
63	0.29
64	0.32
65	0.34
66	0.34
67	0.31
68	0.3
69	0.3
70	0.29
71	0.26
72	0.24
73	0.23
74	0.24
75	0.29
76	0.3
77	0.31
78	0.29
79	0.3
80	0.31
81	0.3
82	0.28
83	0.31
84	0.35
85	0.33
86	0.33
87	0.31
88	0.3
89	0.28
90	0.32
91	0.27
92	0.2
93	0.21
94	0.23
95	0.25
96	0.27
97	0.28
98	0.3
99	0.37
100	0.39
101	0.4
102	0.45
103	0.49
104	0.5
105	0.56
106	0.55
107	0.5
108	0.55
109	0.58
110	0.58
111	0.62
112	0.58
113	0.51
114	0.51
115	0.46
116	0.43
117	0.41
118	0.35
119	0.27
120	0.28
121	0.28
122	0.29
123	0.33
124	0.3
125	0.29
126	0.27
127	0.27
128	0.32
129	0.32
130	0.29
131	0.29
132	0.32
133	0.35
134	0.35
135	0.34
136	0.3
137	0.31
138	0.32
139	0.3
140	0.23
141	0.25
142	0.32
143	0.37
144	0.44
145	0.51
146	0.57
147	0.61
148	0.68
149	0.69
150	0.71
151	0.74
152	0.71
153	0.71
154	0.71
155	0.68
156	0.69
157	0.66
158	0.64
159	0.65
160	0.64
161	0.6
162	0.57
163	0.61
164	0.57
165	0.52
166	0.49
167	0.41
168	0.42
169	0.4
170	0.34
171	0.3
172	0.29
173	0.27
174	0.22
175	0.24
176	0.17
177	0.19
178	0.19
179	0.18
180	0.18
181	0.24
182	0.24
183	0.23
184	0.24
185	0.21
186	0.2
187	0.18
188	0.17
189	0.13
190	0.12
191	0.11
192	0.1
193	0.11
194	0.1
195	0.1
196	0.13
197	0.15
198	0.16
199	0.22
200	0.26
201	0.35
202	0.44
203	0.51
204	0.52
205	0.59
206	0.69
207	0.72
208	0.75
209	0.76
210	0.77
211	0.79
212	0.85
213	0.83
214	0.82
215	0.79
216	0.82
217	0.79
218	0.78
219	0.75
220	0.71
221	0.67
222	0.65
223	0.69
224	0.68
225	0.68
226	0.7
227	0.74
228	0.73
229	0.79
230	0.76
231	0.74
232	0.71
233	0.66
234	0.6
235	0.5
236	0.45
237	0.37
238	0.33
239	0.26
240	0.19
241	0.16
242	0.11
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.13
247	0.13
248	0.12
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.11
253	0.09
254	0.06
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.1
262	0.09
263	0.08
264	0.09
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.12
269	0.14
270	0.15
271	0.15
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.13
278	0.13
279	0.16
280	0.23
281	0.22
282	0.24
283	0.26
284	0.25
285	0.27
286	0.33
287	0.39
288	0.4
289	0.42
290	0.5
291	0.53
292	0.51
293	0.51
294	0.46
295	0.42
296	0.34
297	0.32
298	0.23
299	0.18
300	0.17
301	0.15
302	0.13
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.11
310	0.16
311	0.21
312	0.25
313	0.3
314	0.36
315	0.44
316	0.51
317	0.52
318	0.55
319	0.59
320	0.64
321	0.66
322	0.67
323	0.62
324	0.6
325	0.61
326	0.55
327	0.48
328	0.41
329	0.34
330	0.24
331	0.21
332	0.14
333	0.13
334	0.11
335	0.16
336	0.18
337	0.2
338	0.2
339	0.2
340	0.21
341	0.19
342	0.23
343	0.2
344	0.21
345	0.23
346	0.22
347	0.24
348	0.25
349	0.24
350	0.22
351	0.22
352	0.21
353	0.19
354	0.22
355	0.24
356	0.26
357	0.25
358	0.22
359	0.19
360	0.16
361	0.16
362	0.12
363	0.09
364	0.06
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.06
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.13
389	0.17
390	0.2
391	0.24
392	0.3
393	0.29
394	0.31
395	0.31
396	0.32
397	0.32
398	0.3
399	0.25
400	0.2
401	0.19
402	0.16
403	0.15
404	0.1
405	0.07
406	0.07
407	0.08
408	0.08
409	0.1
410	0.11
411	0.1
412	0.17
413	0.22
414	0.25
415	0.27
416	0.27
417	0.26
418	0.29
419	0.3
420	0.3
421	0.3
422	0.31
423	0.37
424	0.44
425	0.45
426	0.46
427	0.54
428	0.58
429	0.62
430	0.62
431	0.59
432	0.59
433	0.64
434	0.7
435	0.72
436	0.69
437	0.62
438	0.63
439	0.59
440	0.55
441	0.53
442	0.47
443	0.42
444	0.35
445	0.33
446	0.28
447	0.26
448	0.25
449	0.21
450	0.17
451	0.12
452	0.11
453	0.11
454	0.1
455	0.1
456	0.1
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.14
463	0.17
464	0.21
465	0.2
466	0.19
467	0.21
468	0.27
469	0.34
470	0.4
471	0.45
472	0.47
473	0.54
474	0.55
475	0.59
476	0.6
477	0.6
478	0.61
479	0.63
480	0.61
481	0.63
482	0.63
483	0.61
484	0.57
485	0.55
486	0.55
487	0.5
488	0.55
489	0.51
490	0.51
491	0.48
492	0.46
493	0.41
494	0.34
495	0.29
496	0.21
497	0.22
498	0.21
499	0.21
500	0.23
501	0.23
502	0.24
503	0.24
504	0.26
505	0.29
506	0.36
507	0.43
508	0.43
509	0.43
510	0.45
511	0.51
512	0.56
513	0.56
514	0.54
515	0.56
516	0.59
517	0.62
518	0.69
519	0.66
520	0.67
521	0.68
522	0.69
523	0.68
524	0.71
525	0.71
526	0.71
527	0.68
528	0.62
529	0.55
530	0.49
531	0.41
532	0.34
533	0.36
534	0.29
535	0.28
536	0.29
537	0.28
538	0.31
539	0.4
540	0.45
541	0.41
542	0.47
543	0.56
544	0.62
545	0.67
546	0.7
547	0.69
548	0.68
549	0.74
550	0.74
551	0.67
552	0.58
553	0.52
554	0.44
555	0.41
556	0.38
557	0.3
558	0.22
559	0.26
560	0.3
561	0.33
562	0.34
563	0.35
564	0.38
565	0.39
566	0.38
567	0.31
568	0.26
569	0.23
570	0.24
571	0.19
572	0.14
573	0.12
574	0.11
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.07
579	0.07
580	0.06
581	0.05
582	0.06
583	0.11
584	0.13
585	0.16
586	0.22
587	0.26
588	0.33
589	0.37
590	0.44
591	0.46
592	0.52
593	0.56
594	0.6
595	0.65
596	0.64
597	0.64
598	0.57
599	0.5
600	0.42
601	0.35
602	0.27
603	0.21
604	0.18
605	0.14
606	0.15
607	0.16
608	0.18
609	0.19
610	0.18
611	0.17
612	0.16
613	0.18
614	0.21
615	0.2
616	0.25
617	0.25
618	0.26
619	0.27
620	0.29
621	0.31
622	0.29
623	0.3
624	0.27
625	0.33
626	0.33
627	0.33
628	0.34
629	0.31
630	0.32
631	0.32
632	0.31
633	0.27
634	0.32
635	0.33
636	0.33
637	0.33
638	0.29
639	0.27
640	0.27
641	0.25
642	0.19
643	0.16
644	0.12
645	0.1
646	0.11
647	0.11
648	0.08
649	0.07
650	0.06
651	0.06
652	0.05
653	0.06
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.06
658	0.09
659	0.14
660	0.15
661	0.16
662	0.2
663	0.23
664	0.26
665	0.27
666	0.31
667	0.3
668	0.33
669	0.39
670	0.4
671	0.38
672	0.39
673	0.41
674	0.37
675	0.33
676	0.3
677	0.27
678	0.25
679	0.27
680	0.28
681	0.31
682	0.35
683	0.42
684	0.46
685	0.53
686	0.53
687	0.53
688	0.51
689	0.5
690	0.45
691	0.39
692	0.42
693	0.4
694	0.45
695	0.52

A0A066XPJ2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer