Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QVD3

Protein Details
Accession B6QVD3    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
285-306LQEHKKKEKQLIKEGKKSQPYFHydrophilic
325-354GSKERAKALERRRKKVASKEKKDLPWARRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
110-115KKRKRG
278-353RKREREVLQEHKKKEKQLIKEGKKSQPYFLKKSELKREVLKKKYESMGSKERAKALERRRKKVASKEKKDLPWARR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 15, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG tmf:PMAA_012100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MAISDALNKRLRARRDEEEEEDDFEDELLSDEMEGSEEDGRSNSDEEQEDSNSDAAESEEDDDQDDEQDGDEDLSDAQSIQSANDREAIQSEFRQISFGALAKAQNSIGKKRKRGAEDKSDTRTDDKKPSSTLDDIRERLRKAREQKLGLTNNNNNNNNQNNNNGYHSKPKPPPRSSKHAPAVQSSKVAVSRKRTIIEPTTVKSRDPRFDPTVVKSSSSVRRNNSSAENAYSFLDEYRASEIKQLKEQLSKTKDATQKEELKRAITSATDRQRALDNRKREREVLQEHKKKEKQLIKEGKKSQPYFLKKSELKREVLKKKYESMGSKERAKALERRRKKVASKEKKDLPWARRGMEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.7
4 0.67
5 0.65
6 0.6
7 0.55
8 0.49
9 0.4
10 0.31
11 0.24
12 0.18
13 0.11
14 0.11
15 0.08
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.12
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.17
33 0.19
34 0.22
35 0.22
36 0.21
37 0.21
38 0.2
39 0.16
40 0.14
41 0.12
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.12
69 0.13
70 0.14
71 0.17
72 0.18
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.17
77 0.17
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.19
82 0.17
83 0.16
84 0.15
85 0.15
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.16
94 0.24
95 0.32
96 0.39
97 0.44
98 0.5
99 0.56
100 0.61
101 0.67
102 0.66
103 0.68
104 0.69
105 0.7
106 0.69
107 0.64
108 0.58
109 0.53
110 0.49
111 0.43
112 0.43
113 0.4
114 0.37
115 0.37
116 0.39
117 0.39
118 0.38
119 0.38
120 0.35
121 0.38
122 0.37
123 0.4
124 0.42
125 0.39
126 0.4
127 0.41
128 0.42
129 0.44
130 0.52
131 0.54
132 0.53
133 0.58
134 0.61
135 0.62
136 0.59
137 0.58
138 0.54
139 0.54
140 0.59
141 0.55
142 0.46
143 0.45
144 0.44
145 0.41
146 0.36
147 0.32
148 0.26
149 0.26
150 0.29
151 0.26
152 0.24
153 0.3
154 0.31
155 0.35
156 0.4
157 0.48
158 0.55
159 0.6
160 0.68
161 0.66
162 0.73
163 0.7
164 0.72
165 0.7
166 0.64
167 0.58
168 0.53
169 0.51
170 0.42
171 0.38
172 0.29
173 0.23
174 0.22
175 0.24
176 0.22
177 0.24
178 0.29
179 0.3
180 0.31
181 0.32
182 0.32
183 0.33
184 0.36
185 0.33
186 0.29
187 0.34
188 0.33
189 0.32
190 0.34
191 0.36
192 0.34
193 0.35
194 0.4
195 0.36
196 0.41
197 0.43
198 0.41
199 0.43
200 0.39
201 0.36
202 0.3
203 0.32
204 0.35
205 0.39
206 0.4
207 0.36
208 0.41
209 0.41
210 0.43
211 0.41
212 0.38
213 0.33
214 0.31
215 0.28
216 0.24
217 0.23
218 0.2
219 0.17
220 0.12
221 0.11
222 0.08
223 0.09
224 0.12
225 0.13
226 0.12
227 0.18
228 0.23
229 0.24
230 0.29
231 0.32
232 0.31
233 0.36
234 0.38
235 0.42
236 0.42
237 0.43
238 0.41
239 0.45
240 0.47
241 0.45
242 0.49
243 0.48
244 0.53
245 0.54
246 0.59
247 0.52
248 0.49
249 0.45
250 0.4
251 0.33
252 0.25
253 0.25
254 0.26
255 0.33
256 0.35
257 0.35
258 0.35
259 0.42
260 0.47
261 0.52
262 0.52
263 0.54
264 0.6
265 0.68
266 0.71
267 0.66
268 0.63
269 0.63
270 0.64
271 0.65
272 0.66
273 0.67
274 0.68
275 0.76
276 0.76
277 0.71
278 0.71
279 0.68
280 0.66
281 0.69
282 0.75
283 0.74
284 0.79
285 0.83
286 0.81
287 0.83
288 0.76
289 0.73
290 0.72
291 0.71
292 0.68
293 0.65
294 0.67
295 0.63
296 0.7
297 0.73
298 0.69
299 0.65
300 0.67
301 0.72
302 0.72
303 0.75
304 0.74
305 0.67
306 0.69
307 0.71
308 0.7
309 0.65
310 0.63
311 0.65
312 0.63
313 0.66
314 0.63
315 0.61
316 0.57
317 0.55
318 0.56
319 0.57
320 0.62
321 0.64
322 0.68
323 0.73
324 0.78
325 0.82
326 0.84
327 0.84
328 0.84
329 0.84
330 0.87
331 0.87
332 0.85
333 0.87
334 0.85
335 0.8
336 0.79
337 0.75