FuNGI

B6QN52

Protein Details

Accession

B6QN52

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
156-175	NSWTSRKERKADANRWHARL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 9.5, pero 9, cyto_mito 6.5, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
KEGG	tmf:PMAA_061350 -
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MEKDLAALSINKYPLKHSALLDSGSSIHVFNEFERFVNIRKAQVGDVLWAGSNQVPILGYGEVDIQVHGLGGKLQFLRLYNVAYCKDFVANLVSFYQLRKQGIWWDTRRGYNCLRGKTDQVLAYLKEKEGQFVLEYIKHDHPLVKTGFAIRRHRFNSWTSRKERKADANRWHARLGHPGPEVLKHLAGAAKGVRLTGISKGPTTVECESCGTSKAQRIIRREERTPPHAPGEHLAIDFHDFAESTMHGEKTLMLITDRFSGFMWDYYMTSHRGDEILETLKWFLDYLEKAYMISPVKIEMDNEIAKRPEVKHYLEHEKRIILQPSPAHTQALNGGAERSGAIIKTKGRSMRKGARLPFDLWPEIVRAAVYLYNRTPRYASNWKTPYDRFTTHAAWKSGIVIENQKPQLAHLKVYGCKAYALTTEYMKKENRLQRFNPRAWIGYLVGYDSTNVYRIWNPTTGRIIRTRDVIFNEDEVFSGNIEHLKDDLLHVSTQEITRLLTKLDLGTDADFDDEYADLIDHITDVVFDGDKVNIEPDRLTRSATGLGSQESSQLDSRNPSGPTLTIGEGLLDGIDKYTYPTPPETPPSALLAASITIVSNNDFDLHQSSALAAGMSTDGECTGGTLVQEATARERIGGAPSGVGTDRTGGSRADFEERTGGALDLHETIQAAIPGDRTTLLLDYATRRAQSWRFAFLAGTRHRQYEVNTVKFDYASLQRRLRSGRRLQSLLVRDLPPAPKSHREVETHPLGWLFEEAEKAHLKSHDPYGSWTTVPIGKAKGKQILDCMWIYVYKQDKKGRLVKCKARLVVRGDQEKRDDMRDTYAATLAARSFRTFMAIAARFDLELKQYDAVNAFVNAKLDEEIFMRMAPGYRESGKIYQLNKALYGLRRSPLLWQKELTSTLIKLGFRAVPHEPCCMLKSGVMLFFYVDDIVVAYKKSRQLEANSILNQLRAKYNISGGEDLEWFLGMRIIRDRSNKMIWLSQATYIDKIAKLADTQQADDTPMSREELLPYEGTATYKSQHQYQRKVGSIMYAAVSTRPDVAFAVSRLARFLSNPGPEHHKAADKVLCYLKRHRAYALRLGGGDDFSVSTDASFADNTLDRKSSQAYVMTLFGGTIGWQANKQDTVTTSTTEAELLALAQGVKEGKYVLRLLLELDIRFQTPTLHVYCDNQQTLGLLEKDAPRLRTKLRHVDIHNHWVRQEVQNGDVQVHYMPTKDMIANGLTKALSRQEHHNFLKQIGVDDIGERLAPQQKDIENPDIEELLSLNDMPDNI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.37
3	0.39
4	0.35
5	0.38
6	0.39
7	0.4
8	0.37
9	0.31
10	0.26
11	0.22
12	0.21
13	0.15
14	0.12
15	0.12
16	0.13
17	0.12
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.21
22	0.23
23	0.24
24	0.33
25	0.34
26	0.32
27	0.35
28	0.36
29	0.34
30	0.36
31	0.34
32	0.27
33	0.25
34	0.22
35	0.19
36	0.16
37	0.17
38	0.13
39	0.13
40	0.1
41	0.1
42	0.09
43	0.09
44	0.12
45	0.1
46	0.09
47	0.09
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.09
52	0.07
53	0.07
54	0.07
55	0.07
56	0.06
57	0.08
58	0.08
59	0.12
60	0.13
61	0.14
62	0.16
63	0.17
64	0.22
65	0.21
66	0.24
67	0.23
68	0.28
69	0.3
70	0.3
71	0.29
72	0.26
73	0.26
74	0.23
75	0.2
76	0.21
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.19
81	0.18
82	0.2
83	0.25
84	0.25
85	0.26
86	0.26
87	0.27
88	0.34
89	0.39
90	0.47
91	0.45
92	0.49
93	0.52
94	0.59
95	0.6
96	0.57
97	0.57
98	0.57
99	0.6
100	0.57
101	0.59
102	0.55
103	0.56
104	0.55
105	0.55
106	0.48
107	0.44
108	0.41
109	0.37
110	0.38
111	0.35
112	0.31
113	0.3
114	0.28
115	0.26
116	0.24
117	0.23
118	0.19
119	0.19
120	0.22
121	0.2
122	0.22
123	0.25
124	0.27
125	0.27
126	0.27
127	0.29
128	0.27
129	0.31
130	0.31
131	0.27
132	0.26
133	0.32
134	0.37
135	0.41
136	0.5
137	0.47
138	0.55
139	0.57
140	0.6
141	0.57
142	0.58
143	0.61
144	0.61
145	0.66
146	0.65
147	0.71
148	0.74
149	0.76
150	0.77
151	0.77
152	0.77
153	0.77
154	0.79
155	0.8
156	0.81
157	0.78
158	0.72
159	0.64
160	0.56
161	0.56
162	0.5
163	0.46
164	0.39
165	0.38
166	0.36
167	0.36
168	0.37
169	0.3
170	0.26
171	0.18
172	0.19
173	0.19
174	0.17
175	0.18
176	0.15
177	0.15
178	0.15
179	0.14
180	0.13
181	0.12
182	0.13
183	0.15
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.19
188	0.2
189	0.2
190	0.25
191	0.25
192	0.21
193	0.22
194	0.23
195	0.24
196	0.24
197	0.25
198	0.21
199	0.22
200	0.26
201	0.31
202	0.36
203	0.4
204	0.45
205	0.54
206	0.62
207	0.64
208	0.63
209	0.65
210	0.67
211	0.67
212	0.67
213	0.6
214	0.57
215	0.53
216	0.5
217	0.43
218	0.4
219	0.35
220	0.3
221	0.26
222	0.2
223	0.2
224	0.18
225	0.16
226	0.11
227	0.09
228	0.09
229	0.1
230	0.1
231	0.1
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.14
239	0.11
240	0.09
241	0.1
242	0.11
243	0.16
244	0.16
245	0.15
246	0.14
247	0.16
248	0.16
249	0.16
250	0.16
251	0.12
252	0.13
253	0.14
254	0.16
255	0.16
256	0.16
257	0.15
258	0.14
259	0.13
260	0.13
261	0.12
262	0.13
263	0.15
264	0.14
265	0.14
266	0.14
267	0.14
268	0.13
269	0.12
270	0.09
271	0.12
272	0.13
273	0.15
274	0.17
275	0.17
276	0.18
277	0.18
278	0.22
279	0.18
280	0.18
281	0.15
282	0.14
283	0.16
284	0.16
285	0.16
286	0.13
287	0.16
288	0.19
289	0.2
290	0.21
291	0.2
292	0.2
293	0.24
294	0.24
295	0.27
296	0.29
297	0.31
298	0.35
299	0.42
300	0.52
301	0.53
302	0.56
303	0.5
304	0.47
305	0.47
306	0.46
307	0.42
308	0.32
309	0.32
310	0.31
311	0.33
312	0.36
313	0.34
314	0.29
315	0.25
316	0.25
317	0.23
318	0.23
319	0.19
320	0.14
321	0.14
322	0.13
323	0.13
324	0.12
325	0.1
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.11
330	0.14
331	0.16
332	0.21
333	0.27
334	0.32
335	0.38
336	0.46
337	0.52
338	0.58
339	0.64
340	0.65
341	0.65
342	0.63
343	0.6
344	0.56
345	0.5
346	0.42
347	0.35
348	0.3
349	0.24
350	0.2
351	0.17
352	0.12
353	0.08
354	0.08
355	0.1
356	0.1
357	0.12
358	0.14
359	0.21
360	0.22
361	0.23
362	0.23
363	0.22
364	0.3
365	0.37
366	0.39
367	0.42
368	0.46
369	0.47
370	0.51
371	0.52
372	0.48
373	0.45
374	0.42
375	0.35
376	0.36
377	0.38
378	0.4
379	0.44
380	0.4
381	0.35
382	0.33
383	0.31
384	0.28
385	0.25
386	0.19
387	0.2
388	0.22
389	0.29
390	0.29
391	0.29
392	0.26
393	0.26
394	0.34
395	0.28
396	0.26
397	0.23
398	0.28
399	0.29
400	0.32
401	0.31
402	0.23
403	0.22
404	0.21
405	0.18
406	0.15
407	0.15
408	0.13
409	0.15
410	0.19
411	0.2
412	0.25
413	0.24
414	0.25
415	0.32
416	0.38
417	0.43
418	0.46
419	0.5
420	0.57
421	0.64
422	0.64
423	0.61
424	0.56
425	0.49
426	0.43
427	0.4
428	0.3
429	0.23
430	0.21
431	0.15
432	0.13
433	0.11
434	0.11
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.11
441	0.13
442	0.16
443	0.19
444	0.2
445	0.22
446	0.29
447	0.29
448	0.3
449	0.33
450	0.35
451	0.32
452	0.36
453	0.34
454	0.31
455	0.31
456	0.31
457	0.26
458	0.23
459	0.23
460	0.18
461	0.16
462	0.14
463	0.12
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.08
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.08
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.07
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.05
501	0.04
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.08
523	0.09
524	0.14
525	0.14
526	0.15
527	0.14
528	0.15
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.12
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.13
537	0.1
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.12
543	0.14
544	0.17
545	0.17
546	0.15
547	0.15
548	0.14
549	0.15
550	0.16
551	0.14
552	0.1
553	0.1
554	0.09
555	0.08
556	0.08
557	0.06
558	0.04
559	0.03
560	0.03
561	0.03
562	0.03
563	0.05
564	0.07
565	0.08
566	0.09
567	0.12
568	0.14
569	0.17
570	0.21
571	0.21
572	0.21
573	0.21
574	0.21
575	0.2
576	0.17
577	0.14
578	0.11
579	0.09
580	0.07
581	0.06
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.08
592	0.08
593	0.08
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.04
600	0.03
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.03
605	0.03
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.04
611	0.04
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.06
616	0.06
617	0.08
618	0.09
619	0.09
620	0.09
621	0.1
622	0.09
623	0.09
624	0.1
625	0.08
626	0.06
627	0.06
628	0.07
629	0.06
630	0.07
631	0.05
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.08
636	0.07
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.12
641	0.12
642	0.12
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.12
647	0.11
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.05
655	0.05
656	0.06
657	0.06
658	0.06
659	0.05
660	0.05
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.05
669	0.06
670	0.08
671	0.11
672	0.12
673	0.11
674	0.12
675	0.15
676	0.18
677	0.24
678	0.24
679	0.25
680	0.24
681	0.24
682	0.24
683	0.22
684	0.28
685	0.24
686	0.28
687	0.26
688	0.26
689	0.27
690	0.28
691	0.28
692	0.3
693	0.35
694	0.33
695	0.32
696	0.32
697	0.31
698	0.3
699	0.28
700	0.2
701	0.19
702	0.22
703	0.27
704	0.29
705	0.3
706	0.33
707	0.38
708	0.41
709	0.43
710	0.46
711	0.48
712	0.5
713	0.51
714	0.49
715	0.51
716	0.49
717	0.43
718	0.38
719	0.31
720	0.26
721	0.27
722	0.28
723	0.23
724	0.22
725	0.23
726	0.25
727	0.28
728	0.32
729	0.34
730	0.35
731	0.37
732	0.4
733	0.42
734	0.36
735	0.33
736	0.28
737	0.23
738	0.2
739	0.17
740	0.11
741	0.07
742	0.08
743	0.07
744	0.1
745	0.11
746	0.11
747	0.13
748	0.13
749	0.15
750	0.16
751	0.21
752	0.22
753	0.21
754	0.24
755	0.26
756	0.26
757	0.24
758	0.22
759	0.18
760	0.17
761	0.17
762	0.16
763	0.16
764	0.18
765	0.22
766	0.25
767	0.3
768	0.29
769	0.29
770	0.31
771	0.3
772	0.29
773	0.26
774	0.23
775	0.16
776	0.16
777	0.15
778	0.16
779	0.21
780	0.22
781	0.3
782	0.35
783	0.39
784	0.46
785	0.54
786	0.57
787	0.6
788	0.65
789	0.67
790	0.7
791	0.72
792	0.7
793	0.66
794	0.64
795	0.59
796	0.57
797	0.55
798	0.56
799	0.52
800	0.51
801	0.48
802	0.47
803	0.42
804	0.38
805	0.33
806	0.25
807	0.26
808	0.24
809	0.23
810	0.19
811	0.19
812	0.16
813	0.14
814	0.14
815	0.1
816	0.12
817	0.11
818	0.11
819	0.11
820	0.11
821	0.13
822	0.12
823	0.12
824	0.18
825	0.19
826	0.19
827	0.19
828	0.19
829	0.17
830	0.17
831	0.17
832	0.11
833	0.1
834	0.11
835	0.11
836	0.11
837	0.12
838	0.12
839	0.12
840	0.11
841	0.11
842	0.11
843	0.1
844	0.11
845	0.1
846	0.1
847	0.09
848	0.09
849	0.09
850	0.08
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.08
855	0.08
856	0.09
857	0.09
858	0.1
859	0.11
860	0.13
861	0.15
862	0.18
863	0.2
864	0.23
865	0.28
866	0.27
867	0.3
868	0.32
869	0.31
870	0.28
871	0.28
872	0.27
873	0.26
874	0.29
875	0.26
876	0.24
877	0.24
878	0.24
879	0.3
880	0.34
881	0.36
882	0.33
883	0.32
884	0.33
885	0.35
886	0.36
887	0.3
888	0.25
889	0.19
890	0.2
891	0.23
892	0.21
893	0.18
894	0.19
895	0.18
896	0.16
897	0.2
898	0.21
899	0.24
900	0.26
901	0.28
902	0.27
903	0.26
904	0.28
905	0.26
906	0.23
907	0.17
908	0.17
909	0.17
910	0.18
911	0.17
912	0.16
913	0.13
914	0.12
915	0.12
916	0.1
917	0.07
918	0.05
919	0.05
920	0.05
921	0.06
922	0.06
923	0.06
924	0.1
925	0.15
926	0.17
927	0.2
928	0.24
929	0.29
930	0.37
931	0.42
932	0.45
933	0.41
934	0.43
935	0.4
936	0.37
937	0.33
938	0.26
939	0.23
940	0.18
941	0.2
942	0.17
943	0.2
944	0.22
945	0.24
946	0.23
947	0.21
948	0.21
949	0.19
950	0.18
951	0.15
952	0.11
953	0.08
954	0.07
955	0.09
956	0.07
957	0.09
958	0.13
959	0.16
960	0.2
961	0.26
962	0.29
963	0.33
964	0.36
965	0.38
966	0.36
967	0.37
968	0.34
969	0.34
970	0.32
971	0.3
972	0.31
973	0.28
974	0.27
975	0.24
976	0.25
977	0.2
978	0.19
979	0.16
980	0.13
981	0.12
982	0.15
983	0.2
984	0.19
985	0.2
986	0.21
987	0.21
988	0.22
989	0.21
990	0.18
991	0.15
992	0.14
993	0.15
994	0.14
995	0.14
996	0.14
997	0.16
998	0.17
999	0.15
1000	0.14
1001	0.15
1002	0.15
1003	0.15
1004	0.15
1005	0.13
1006	0.13
1007	0.18
1008	0.2
1009	0.25
1010	0.34
1011	0.42
1012	0.49
1013	0.57
1014	0.63
1015	0.61
1016	0.61
1017	0.54
1018	0.48
1019	0.41
1020	0.33
1021	0.25
1022	0.18
1023	0.14
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.11
1027	0.12
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.1
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.14
1034	0.19
1035	0.18
1036	0.18
1037	0.19
1038	0.19
1039	0.18
1040	0.16
1041	0.2
1042	0.21
1043	0.25
1044	0.27
1045	0.29
1046	0.36
1047	0.37
1048	0.41
1049	0.39
1050	0.38
1051	0.34
1052	0.39
1053	0.4
1054	0.33
1055	0.37
1056	0.4
1057	0.42
1058	0.4
1059	0.47
1060	0.51
1061	0.53
1062	0.54
1063	0.55
1064	0.56
1065	0.57
1066	0.62
1067	0.6
1068	0.51
1069	0.45
1070	0.45
1071	0.39
1072	0.31
1073	0.25
1074	0.16
1075	0.1
1076	0.09
1077	0.09
1078	0.07
1079	0.07
1080	0.06
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.09
1086	0.12
1087	0.14
1088	0.17
1089	0.18
1090	0.17
1091	0.2
1092	0.22
1093	0.22
1094	0.22
1095	0.23
1096	0.22
1097	0.23
1098	0.23
1099	0.22
1100	0.18
1101	0.15
1102	0.13
1103	0.09
1104	0.08
1105	0.08
1106	0.09
1107	0.09
1108	0.11
1109	0.13
1110	0.16
1111	0.18
1112	0.18
1113	0.18
1114	0.18
1115	0.23
1116	0.24
1117	0.24
1118	0.22
1119	0.21
1120	0.21
1121	0.19
1122	0.17
1123	0.11
1124	0.09
1125	0.08
1126	0.06
1127	0.06
1128	0.05
1129	0.05
1130	0.07
1131	0.08
1132	0.08
1133	0.08
1134	0.09
1135	0.1
1136	0.14
1137	0.15
1138	0.15
1139	0.16
1140	0.16
1141	0.17
1142	0.2
1143	0.22
1144	0.18
1145	0.2
1146	0.2
1147	0.19
1148	0.19
1149	0.18
1150	0.15
1151	0.15
1152	0.2
1153	0.19
1154	0.21
1155	0.22
1156	0.25
1157	0.32
1158	0.38
1159	0.36
1160	0.32
1161	0.3
1162	0.27
1163	0.27
1164	0.29
1165	0.22
1166	0.15
1167	0.18
1168	0.21
1169	0.28
1170	0.32
1171	0.33
1172	0.33
1173	0.37
1174	0.44
1175	0.5
1176	0.56
1177	0.59
1178	0.61
1179	0.67
1180	0.68
1181	0.73
1182	0.73
1183	0.74
1184	0.71
1185	0.62
1186	0.56
1187	0.52
1188	0.51
1189	0.46
1190	0.45
1191	0.37
1192	0.33
1193	0.35
1194	0.36
1195	0.32
1196	0.28
1197	0.24
1198	0.18
1199	0.17
1200	0.15
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.13
1204	0.16
1205	0.16
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.18
1209	0.19
1210	0.19
1211	0.2
1212	0.17
1213	0.16
1214	0.18
1215	0.22
1216	0.24
1217	0.25
1218	0.34
1219	0.4
1220	0.5
1221	0.55
1222	0.61
1223	0.57
1224	0.53
1225	0.55
1226	0.46
1227	0.4
1228	0.32
1229	0.29
1230	0.21
1231	0.19
1232	0.19
1233	0.14
1234	0.13
1235	0.11
1236	0.14
1237	0.2
1238	0.2
1239	0.21
1240	0.27
1241	0.28
1242	0.35
1243	0.41
1244	0.43
1245	0.37
1246	0.39
1247	0.39
1248	0.33
1249	0.31
1250	0.24
1251	0.19
1252	0.13
1253	0.12
1254	0.1
1255	0.09

B6QN52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer