Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QJW3

Protein Details
Accession B6QJW3    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-39PPEEAPKPPARQKKLTLKFGGHydrophilic
50-79AVETTATKPKKKRPTKPKTDAGSSKKRPNDHydrophilic
113-132SVVKSIKIKNKRKVAIRPLGHydrophilic
266-290GITPPMKYVRKRRFRKRVSARTIEQHydrophilic
463-482MNKILKQKIGKRVQQLKQDLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-37AKKPEPPPEEAPKPPARQKKLTLKF
56-76TKPKKKRPTKPKTDAGSSKKR
121-124KNKR
275-282RKRRFRKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG tmf:PMAA_101080  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MSAPTKLKISFGAKKPEPPPEEAPKPPARQKKLTLKFGGTKPSEEPAPAAVETTATKPKKKRPTKPKTDAGSSKKRPNDAGSGDDSDATAPAPVQAKPTGIKRIKFLTTAKESVVKSIKIKNKRKVAIRPLGVGYDSEASDLETDPHIEEDFILRMVPGDDCEYIRQAINERHLDRSQIGIKPLTREGRRAIVRVRERQYAATLVDLPCIIEGMKSWDKRMFFKSVDITQMLLVLGPVQNEQEAMEYPLPKDVEVLDDKTYQYAHGITPPMKYVRKRRFRKRVSARTIEQAEKEVANLLAQDEVALRPPKFELVDATSLSRAEGVVDYEDEYDDEQDAYGEADYDMHDEDDGQADLFEDELAGELEAALAAGADETLDMPGTPAALAPEESATPSGAKPGDESSGDESEESDRDADGEADGEDDEDMDEGALERRREIQEQREFITELEGLIAQETAKYEMQMNKILKQKIGKRVQQLKQDLALKKASIGETEGEAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.69
4 0.65
5 0.62
6 0.63
7 0.62
8 0.66
9 0.62
10 0.65
11 0.64
12 0.68
13 0.71
14 0.73
15 0.71
16 0.72
17 0.77
18 0.8
19 0.81
20 0.83
21 0.79
22 0.76
23 0.77
24 0.73
25 0.73
26 0.64
27 0.57
28 0.51
29 0.48
30 0.42
31 0.35
32 0.31
33 0.23
34 0.25
35 0.21
36 0.19
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.19
41 0.26
42 0.26
43 0.33
44 0.4
45 0.5
46 0.6
47 0.7
48 0.76
49 0.78
50 0.86
51 0.9
52 0.92
53 0.92
54 0.89
55 0.88
56 0.87
57 0.85
58 0.85
59 0.81
60 0.8
61 0.76
62 0.72
63 0.66
64 0.61
65 0.6
66 0.53
67 0.5
68 0.45
69 0.44
70 0.4
71 0.36
72 0.31
73 0.23
74 0.19
75 0.14
76 0.09
77 0.06
78 0.08
79 0.1
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.2
85 0.26
86 0.33
87 0.37
88 0.39
89 0.39
90 0.44
91 0.45
92 0.46
93 0.44
94 0.42
95 0.43
96 0.43
97 0.41
98 0.41
99 0.38
100 0.4
101 0.42
102 0.36
103 0.33
104 0.4
105 0.47
106 0.51
107 0.61
108 0.63
109 0.68
110 0.73
111 0.77
112 0.79
113 0.81
114 0.8
115 0.73
116 0.68
117 0.59
118 0.53
119 0.45
120 0.34
121 0.26
122 0.18
123 0.15
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.07
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.09
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.18
156 0.23
157 0.29
158 0.29
159 0.33
160 0.33
161 0.34
162 0.31
163 0.31
164 0.3
165 0.25
166 0.26
167 0.24
168 0.25
169 0.26
170 0.31
171 0.33
172 0.3
173 0.3
174 0.31
175 0.36
176 0.36
177 0.36
178 0.36
179 0.38
180 0.44
181 0.49
182 0.51
183 0.47
184 0.47
185 0.45
186 0.42
187 0.35
188 0.28
189 0.21
190 0.2
191 0.15
192 0.14
193 0.13
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.07
198 0.04
199 0.04
200 0.11
201 0.17
202 0.17
203 0.19
204 0.22
205 0.24
206 0.27
207 0.31
208 0.28
209 0.23
210 0.27
211 0.29
212 0.27
213 0.28
214 0.25
215 0.22
216 0.17
217 0.17
218 0.13
219 0.09
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.09
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.18
258 0.22
259 0.27
260 0.34
261 0.42
262 0.52
263 0.61
264 0.7
265 0.77
266 0.81
267 0.87
268 0.88
269 0.89
270 0.87
271 0.85
272 0.76
273 0.73
274 0.69
275 0.6
276 0.49
277 0.4
278 0.32
279 0.24
280 0.22
281 0.15
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.07
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.09
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.15
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.15
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.13
308 0.09
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.06
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.04
346 0.03
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.03
363 0.03
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.1
381 0.09
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.17
388 0.16
389 0.19
390 0.2
391 0.21
392 0.21
393 0.19
394 0.18
395 0.17
396 0.17
397 0.15
398 0.11
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.08
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.09
418 0.13
419 0.14
420 0.15
421 0.21
422 0.24
423 0.3
424 0.36
425 0.42
426 0.47
427 0.51
428 0.52
429 0.5
430 0.47
431 0.42
432 0.39
433 0.29
434 0.19
435 0.16
436 0.14
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.07
441 0.08
442 0.09
443 0.11
444 0.11
445 0.12
446 0.17
447 0.22
448 0.26
449 0.33
450 0.35
451 0.38
452 0.45
453 0.47
454 0.47
455 0.51
456 0.55
457 0.58
458 0.65
459 0.66
460 0.69
461 0.77
462 0.8
463 0.81
464 0.79
465 0.74
466 0.71
467 0.72
468 0.65
469 0.59
470 0.56
471 0.46
472 0.41
473 0.41
474 0.35
475 0.28
476 0.26
477 0.24