FuNGI

A0A066X2V3

Protein Details

Accession

A0A066X2V3

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
592-617	IDEPTPKSAKKDKKRSKAAQDPVQDS	Hydrophilic
624-651	VPNSQPLTSKKDKKSKKRRDSIESISSV	Hydrophilic
751-775	PQISTPQPKSKSKSSKKSKGDDLVI	Hydrophilic
804-835	SSPAAEQTPKKEKSKRRKSEKTEEPKSAKKET	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
598-608	KSAKKDKKRSK
633-642	KKDKKSKKRR
701-708	KKAKKAKR
812-836	PKKEKSKRRKSEKTEEPKSAKKETP

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MSGRSDGGRRRSGSVRGEMHTPKNDGGKSFMRARAPTPSLMRPSTPSVAAPPTTPATLGTLRVAVSSAATPPMVRANLASSAGSRRDPRKFPVAPNSTITTPSAHATPVSRLSPQTLTDTMSSRKLDGVHSLSAILDKKSQEAALSQSKSKFARGAQSKAKIEKKFDPRAADTDEEDDTSSSDDDSDDDAPTVPNFVNKLNGQTSSSKPAATPLKKAKRAKEDEVADSDVERKTSSAKPASTTKKAPVRPESSSDESSGSEADAQASDSSDSSSESESESNKKSAPKGSVKVAPTNGASTTSSSGSESESEDEAANRKKSAAKPAVNGTKVVKPASTSSSEASSSEEESSDEEEEEEDDDDDDDEGSSDEEDSSHEESNDNALAVAARRNSNDLTVPGFVGKDFVLRKAQGDEDGKDMSDFFAKAKLDGKELWYFTAPASIPINVVEKLQIPMDKAQNGDAIFKHNSEDYTVGFDIGSTAVQLLIPNKKGTRYEQASQKVDKVLHVKRVTQLIGSEPRAPRPSQPNAARPQPPGLKARFHPIGVSDDTPLGSIGFDASPDSDEDVDMAPAPALPSSSKKSKRASAQGDAMDIDEPTPKSAKKDKKRSKAAQDPVQDSQSTVIEVPNSQPLTSKKDKKSKKRRDSIESISSVGSNPKSALLKGQKVAAATPDQSKKASKRKVPADEEDASAQLEKEAASAEKKAKKAKRDADNSSLEAGQASAKKQTAIPPPTIPAASYSFSNIAAGSSPAPQISTPQPKSKSKSSKKSKGDDLVILGSSQTASARKETPIQPPAVPVHRIPSQSSPAAEQTPKKEKSKRRKSEKTEEPKSAKKETPVPTPKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.56
3	0.51
4	0.56
5	0.57
6	0.59
7	0.57
8	0.53
9	0.48
10	0.5
11	0.5
12	0.43
13	0.44
14	0.41
15	0.41
16	0.45
17	0.47
18	0.46
19	0.46
20	0.47
21	0.5
22	0.48
23	0.48
24	0.47
25	0.48
26	0.49
27	0.5
28	0.49
29	0.44
30	0.47
31	0.44
32	0.4
33	0.34
34	0.32
35	0.33
36	0.32
37	0.29
38	0.26
39	0.26
40	0.25
41	0.24
42	0.2
43	0.2
44	0.21
45	0.22
46	0.19
47	0.18
48	0.18
49	0.17
50	0.17
51	0.12
52	0.12
53	0.11
54	0.11
55	0.11
56	0.11
57	0.11
58	0.12
59	0.17
60	0.16
61	0.16
62	0.15
63	0.17
64	0.2
65	0.21
66	0.2
67	0.16
68	0.21
69	0.23
70	0.27
71	0.31
72	0.35
73	0.42
74	0.47
75	0.51
76	0.56
77	0.59
78	0.63
79	0.67
80	0.66
81	0.61
82	0.6
83	0.59
84	0.5
85	0.46
86	0.39
87	0.3
88	0.25
89	0.23
90	0.19
91	0.16
92	0.16
93	0.16
94	0.2
95	0.23
96	0.23
97	0.24
98	0.24
99	0.27
100	0.29
101	0.28
102	0.29
103	0.25
104	0.25
105	0.25
106	0.28
107	0.27
108	0.3
109	0.29
110	0.25
111	0.26
112	0.25
113	0.25
114	0.27
115	0.29
116	0.24
117	0.23
118	0.23
119	0.21
120	0.23
121	0.23
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.18
126	0.2
127	0.2
128	0.17
129	0.17
130	0.22
131	0.27
132	0.29
133	0.31
134	0.32
135	0.37
136	0.37
137	0.38
138	0.35
139	0.29
140	0.37
141	0.4
142	0.46
143	0.49
144	0.57
145	0.6
146	0.65
147	0.7
148	0.65
149	0.64
150	0.65
151	0.66
152	0.68
153	0.67
154	0.65
155	0.61
156	0.61
157	0.59
158	0.52
159	0.44
160	0.37
161	0.32
162	0.26
163	0.23
164	0.18
165	0.14
166	0.13
167	0.11
168	0.08
169	0.08
170	0.07
171	0.07
172	0.1
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.09
181	0.1
182	0.11
183	0.12
184	0.16
185	0.16
186	0.21
187	0.22
188	0.23
189	0.24
190	0.27
191	0.29
192	0.31
193	0.31
194	0.26
195	0.24
196	0.3
197	0.37
198	0.35
199	0.41
200	0.45
201	0.54
202	0.63
203	0.7
204	0.71
205	0.72
206	0.77
207	0.74
208	0.72
209	0.67
210	0.61
211	0.59
212	0.52
213	0.41
214	0.34
215	0.31
216	0.22
217	0.18
218	0.15
219	0.11
220	0.14
221	0.17
222	0.24
223	0.27
224	0.28
225	0.31
226	0.4
227	0.47
228	0.49
229	0.49
230	0.49
231	0.52
232	0.55
233	0.59
234	0.59
235	0.57
236	0.54
237	0.56
238	0.55
239	0.53
240	0.5
241	0.43
242	0.36
243	0.3
244	0.27
245	0.22
246	0.15
247	0.1
248	0.08
249	0.08
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.09
263	0.11
264	0.12
265	0.17
266	0.19
267	0.19
268	0.21
269	0.24
270	0.26
271	0.29
272	0.35
273	0.38
274	0.39
275	0.42
276	0.46
277	0.45
278	0.47
279	0.43
280	0.38
281	0.31
282	0.29
283	0.24
284	0.19
285	0.18
286	0.14
287	0.15
288	0.13
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.11
295	0.11
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.14
301	0.18
302	0.18
303	0.17
304	0.18
305	0.22
306	0.25
307	0.35
308	0.39
309	0.38
310	0.41
311	0.48
312	0.54
313	0.49
314	0.48
315	0.4
316	0.35
317	0.34
318	0.31
319	0.23
320	0.17
321	0.19
322	0.21
323	0.21
324	0.18
325	0.17
326	0.19
327	0.19
328	0.18
329	0.17
330	0.15
331	0.13
332	0.12
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.05
350	0.05
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.07
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.1
365	0.12
366	0.11
367	0.09
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.13
380	0.12
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.08
388	0.07
389	0.09
390	0.09
391	0.11
392	0.13
393	0.13
394	0.14
395	0.15
396	0.15
397	0.16
398	0.18
399	0.17
400	0.17
401	0.17
402	0.16
403	0.14
404	0.14
405	0.09
406	0.08
407	0.08
408	0.06
409	0.09
410	0.09
411	0.1
412	0.15
413	0.15
414	0.16
415	0.16
416	0.19
417	0.19
418	0.2
419	0.2
420	0.16
421	0.16
422	0.14
423	0.17
424	0.13
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.13
431	0.1
432	0.1
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.1
438	0.1
439	0.13
440	0.15
441	0.16
442	0.15
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.17
447	0.14
448	0.16
449	0.15
450	0.15
451	0.15
452	0.13
453	0.13
454	0.12
455	0.13
456	0.09
457	0.12
458	0.12
459	0.11
460	0.1
461	0.1
462	0.09
463	0.08
464	0.07
465	0.04
466	0.03
467	0.03
468	0.04
469	0.05
470	0.07
471	0.1
472	0.12
473	0.14
474	0.15
475	0.17
476	0.19
477	0.23
478	0.29
479	0.31
480	0.35
481	0.42
482	0.49
483	0.5
484	0.5
485	0.48
486	0.42
487	0.37
488	0.34
489	0.34
490	0.3
491	0.34
492	0.35
493	0.35
494	0.34
495	0.38
496	0.35
497	0.28
498	0.25
499	0.21
500	0.24
501	0.25
502	0.28
503	0.25
504	0.29
505	0.31
506	0.31
507	0.32
508	0.34
509	0.38
510	0.41
511	0.46
512	0.49
513	0.52
514	0.58
515	0.57
516	0.51
517	0.52
518	0.47
519	0.45
520	0.43
521	0.41
522	0.39
523	0.36
524	0.41
525	0.37
526	0.33
527	0.3
528	0.26
529	0.27
530	0.24
531	0.24
532	0.18
533	0.15
534	0.15
535	0.15
536	0.13
537	0.09
538	0.06
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.06
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.06
555	0.05
556	0.05
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.1
562	0.15
563	0.25
564	0.31
565	0.38
566	0.43
567	0.49
568	0.56
569	0.62
570	0.64
571	0.61
572	0.6
573	0.55
574	0.5
575	0.44
576	0.36
577	0.27
578	0.2
579	0.14
580	0.11
581	0.1
582	0.11
583	0.13
584	0.13
585	0.18
586	0.28
587	0.38
588	0.46
589	0.57
590	0.66
591	0.75
592	0.85
593	0.88
594	0.9
595	0.9
596	0.88
597	0.85
598	0.82
599	0.76
600	0.68
601	0.61
602	0.51
603	0.4
604	0.33
605	0.25
606	0.18
607	0.14
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.11
612	0.16
613	0.16
614	0.15
615	0.19
616	0.21
617	0.29
618	0.38
619	0.46
620	0.49
621	0.59
622	0.69
623	0.76
624	0.84
625	0.88
626	0.89
627	0.9
628	0.9
629	0.89
630	0.88
631	0.85
632	0.82
633	0.72
634	0.63
635	0.53
636	0.44
637	0.35
638	0.31
639	0.23
640	0.15
641	0.14
642	0.16
643	0.17
644	0.17
645	0.25
646	0.28
647	0.33
648	0.33
649	0.36
650	0.34
651	0.33
652	0.33
653	0.28
654	0.23
655	0.2
656	0.26
657	0.28
658	0.28
659	0.3
660	0.36
661	0.41
662	0.49
663	0.56
664	0.56
665	0.61
666	0.7
667	0.77
668	0.78
669	0.75
670	0.72
671	0.65
672	0.6
673	0.51
674	0.42
675	0.33
676	0.26
677	0.19
678	0.12
679	0.1
680	0.08
681	0.07
682	0.08
683	0.09
684	0.1
685	0.14
686	0.22
687	0.28
688	0.33
689	0.42
690	0.47
691	0.55
692	0.63
693	0.69
694	0.71
695	0.74
696	0.77
697	0.76
698	0.74
699	0.67
700	0.59
701	0.5
702	0.39
703	0.3
704	0.23
705	0.19
706	0.16
707	0.15
708	0.17
709	0.18
710	0.19
711	0.21
712	0.28
713	0.35
714	0.36
715	0.4
716	0.38
717	0.4
718	0.42
719	0.4
720	0.32
721	0.26
722	0.25
723	0.22
724	0.2
725	0.2
726	0.18
727	0.18
728	0.18
729	0.15
730	0.12
731	0.11
732	0.12
733	0.1
734	0.11
735	0.11
736	0.11
737	0.12
738	0.11
739	0.15
740	0.23
741	0.33
742	0.36
743	0.44
744	0.51
745	0.58
746	0.65
747	0.71
748	0.73
749	0.74
750	0.8
751	0.82
752	0.85
753	0.87
754	0.89
755	0.87
756	0.85
757	0.8
758	0.72
759	0.65
760	0.57
761	0.48
762	0.4
763	0.3
764	0.22
765	0.16
766	0.13
767	0.11
768	0.11
769	0.13
770	0.17
771	0.19
772	0.22
773	0.3
774	0.34
775	0.42
776	0.46
777	0.47
778	0.44
779	0.47
780	0.51
781	0.49
782	0.47
783	0.38
784	0.38
785	0.39
786	0.41
787	0.4
788	0.4
789	0.4
790	0.41
791	0.41
792	0.39
793	0.37
794	0.41
795	0.43
796	0.42
797	0.45
798	0.51
799	0.57
800	0.62
801	0.67
802	0.72
803	0.78
804	0.84
805	0.86
806	0.87
807	0.91
808	0.92
809	0.94
810	0.94
811	0.94
812	0.92
813	0.91
814	0.88
815	0.86
816	0.82
817	0.79
818	0.73
819	0.69
820	0.69
821	0.65
822	0.68

A0A066X2V3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer