Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A066XD06

Protein Details
Accession A0A066XD06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-270MDVERPSRSRSRSRSRSRSRSRQRFPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-150RKLRRK
250-270PSRSRSRSRSRSRSRSRQRFP
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDLVYADERRFLDERGSSASLAPNGENPATIMEKAVRERIIDSYFYKEQCFAVNEADIVDRVVEHVSFIGGTYGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDAVLETYLGFGGDKFKYLRALACFYVRMTRKPRDVYLLLEPFLEDRRKLRRKGRQGTSLTYMDDFVDDLLTKTRVCATSFRELPKRSDLVDLDELEERISPLGDIEELLEEEEEREANEREANAGGNAVDESEGEVAEDKSRDGEPMDVERPSRSRSRSRSRSRSRSRQRFP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.32
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.15
18 0.16
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.21
25 0.25
26 0.23
27 0.22
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.27
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.18
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.16
70 0.18
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.2
75 0.23
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.08
97 0.07
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.13
102 0.13
103 0.16
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.23
111 0.21
112 0.24
113 0.27
114 0.31
115 0.36
116 0.38
117 0.39
118 0.38
119 0.37
120 0.35
121 0.35
122 0.32
123 0.27
124 0.24
125 0.23
126 0.18
127 0.19
128 0.17
129 0.11
130 0.13
131 0.23
132 0.3
133 0.36
134 0.45
135 0.52
136 0.62
137 0.72
138 0.75
139 0.75
140 0.72
141 0.69
142 0.65
143 0.57
144 0.47
145 0.37
146 0.3
147 0.2
148 0.16
149 0.12
150 0.07
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.08
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.17
162 0.2
163 0.29
164 0.32
165 0.37
166 0.42
167 0.42
168 0.44
169 0.46
170 0.43
171 0.35
172 0.36
173 0.32
174 0.3
175 0.32
176 0.28
177 0.25
178 0.24
179 0.23
180 0.18
181 0.17
182 0.12
183 0.08
184 0.08
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.15
230 0.16
231 0.22
232 0.25
233 0.25
234 0.25
235 0.29
236 0.31
237 0.33
238 0.37
239 0.37
240 0.45
241 0.53
242 0.63
243 0.7
244 0.78
245 0.84
246 0.88
247 0.93
248 0.93
249 0.95
250 0.95