Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6Q5D7

Protein Details
Accession B6Q5D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-382HDPPSFNPKKKEGRKRKAKVLETBasic
578-603GEDDGTSQKKPRKRRKGRLGDVTYLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
367-378PKKKEGRKRKAK
586-595KKPRKRRKGR
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR013763  Cyclin-like_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG tmf:PMAA_022880  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences MPLVKPPVRPQPRQPVSRLQSIKPPQSGAIPLKRPVGIQIPRVGSVSSASGVSHAAAPPIKRPESKRPAETCPNPNCPDPRIIRDEDMKVCETCGAVVSEDTLVSEISFGETSAGAAVVQGSYVGADQTHTRSSGPGFHRGGGMESREITEQNGARYIQQMALALDIPESAQKAAGQVFKLAVGLNFIQGRRTKTVAAVCLYIACRRQPGNTVMLIDLSDVLMINVFKVGRAYKMLLEELRLGGTVFTMNPVDPENLILRFAKQLEFGNRTMHVAKEAARIVQRMNRDWMTTGRRPAGICGAALILAARMNNFRRTVREVVYVVKVTEVTINQRLNEFSSTDSGGLTVDQFRSVHLETAHDPPSFNPKKKEGRKRKAKVLETAAEIEESETETETDAQPTPPPAKQPRIDADGFAIPDIPIDPALTAGNYQTTTAQDAVSSIEAELLAQSVLDKEQEQTSKKGKKKQTIPEPTPEELASEEALENEMHQFLANGSDMVEAAATTRTVAAAAAAAAKPRVPVSDNIEIEASEFDSDPEVANCLLSPAEVEIKERIWVHENRDYLRAQQAKALKQALSLGEDDGTSQKKPRKRRKGRLGDVTYLQGEDGKGSRASTPAEATRLMLEQRGYSKKINYKMLFDLYGEEGAAEIEKAEAQRQSRSQSVASEAASSANIKPIISTTAAPKITIPGATAGGFNEADYDDEEDADEAGGEEPDDDQEIQNAFAGNYDEEDDYYDDQASDDGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.75
3 0.72
4 0.75
5 0.71
6 0.62
7 0.63
8 0.65
9 0.68
10 0.61
11 0.57
12 0.49
13 0.48
14 0.52
15 0.5
16 0.51
17 0.48
18 0.48
19 0.5
20 0.5
21 0.46
22 0.43
23 0.44
24 0.4
25 0.4
26 0.44
27 0.42
28 0.43
29 0.43
30 0.39
31 0.29
32 0.25
33 0.22
34 0.15
35 0.12
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.13
43 0.16
44 0.17
45 0.24
46 0.31
47 0.35
48 0.39
49 0.46
50 0.54
51 0.61
52 0.69
53 0.72
54 0.7
55 0.74
56 0.78
57 0.79
58 0.78
59 0.76
60 0.76
61 0.7
62 0.7
63 0.66
64 0.59
65 0.59
66 0.54
67 0.53
68 0.5
69 0.51
70 0.5
71 0.52
72 0.55
73 0.51
74 0.49
75 0.45
76 0.38
77 0.35
78 0.31
79 0.24
80 0.19
81 0.16
82 0.13
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.08
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.14
119 0.15
120 0.17
121 0.24
122 0.26
123 0.32
124 0.32
125 0.32
126 0.33
127 0.32
128 0.33
129 0.28
130 0.27
131 0.19
132 0.18
133 0.19
134 0.18
135 0.18
136 0.17
137 0.19
138 0.19
139 0.18
140 0.21
141 0.2
142 0.2
143 0.21
144 0.22
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.11
152 0.1
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.09
161 0.12
162 0.15
163 0.15
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.15
168 0.14
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.12
173 0.14
174 0.14
175 0.18
176 0.21
177 0.25
178 0.26
179 0.27
180 0.25
181 0.28
182 0.32
183 0.32
184 0.3
185 0.26
186 0.23
187 0.23
188 0.24
189 0.22
190 0.2
191 0.17
192 0.19
193 0.2
194 0.22
195 0.24
196 0.26
197 0.27
198 0.26
199 0.27
200 0.23
201 0.22
202 0.2
203 0.15
204 0.12
205 0.08
206 0.06
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.16
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.17
226 0.15
227 0.14
228 0.12
229 0.1
230 0.08
231 0.07
232 0.06
233 0.05
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.13
251 0.16
252 0.21
253 0.24
254 0.25
255 0.25
256 0.25
257 0.26
258 0.25
259 0.21
260 0.17
261 0.14
262 0.15
263 0.17
264 0.18
265 0.18
266 0.18
267 0.19
268 0.19
269 0.22
270 0.23
271 0.21
272 0.25
273 0.24
274 0.23
275 0.24
276 0.28
277 0.31
278 0.32
279 0.34
280 0.31
281 0.32
282 0.31
283 0.31
284 0.29
285 0.22
286 0.18
287 0.14
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.07
297 0.1
298 0.13
299 0.16
300 0.16
301 0.2
302 0.25
303 0.28
304 0.28
305 0.3
306 0.28
307 0.28
308 0.3
309 0.26
310 0.21
311 0.17
312 0.15
313 0.11
314 0.12
315 0.1
316 0.11
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.18
321 0.18
322 0.17
323 0.18
324 0.15
325 0.1
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.1
330 0.08
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.1
340 0.1
341 0.12
342 0.11
343 0.12
344 0.14
345 0.18
346 0.21
347 0.18
348 0.18
349 0.16
350 0.27
351 0.31
352 0.32
353 0.32
354 0.36
355 0.46
356 0.56
357 0.66
358 0.67
359 0.72
360 0.8
361 0.83
362 0.85
363 0.85
364 0.79
365 0.75
366 0.69
367 0.61
368 0.52
369 0.47
370 0.37
371 0.27
372 0.23
373 0.16
374 0.1
375 0.08
376 0.06
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.13
388 0.13
389 0.19
390 0.23
391 0.29
392 0.31
393 0.35
394 0.37
395 0.4
396 0.39
397 0.33
398 0.3
399 0.25
400 0.23
401 0.18
402 0.14
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.06
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.07
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.06
442 0.1
443 0.14
444 0.17
445 0.21
446 0.3
447 0.39
448 0.44
449 0.52
450 0.56
451 0.61
452 0.68
453 0.73
454 0.76
455 0.78
456 0.76
457 0.76
458 0.74
459 0.66
460 0.58
461 0.48
462 0.37
463 0.27
464 0.24
465 0.15
466 0.1
467 0.09
468 0.07
469 0.08
470 0.07
471 0.07
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.04
487 0.04
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.04
493 0.05
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.06
499 0.06
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.1
506 0.1
507 0.13
508 0.19
509 0.28
510 0.28
511 0.28
512 0.28
513 0.26
514 0.25
515 0.22
516 0.15
517 0.07
518 0.07
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.08
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.06
533 0.09
534 0.09
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.16
539 0.17
540 0.18
541 0.2
542 0.24
543 0.28
544 0.32
545 0.35
546 0.34
547 0.37
548 0.35
549 0.32
550 0.37
551 0.35
552 0.3
553 0.33
554 0.37
555 0.37
556 0.41
557 0.42
558 0.33
559 0.3
560 0.32
561 0.28
562 0.24
563 0.21
564 0.16
565 0.13
566 0.13
567 0.13
568 0.14
569 0.14
570 0.13
571 0.19
572 0.25
573 0.31
574 0.42
575 0.53
576 0.61
577 0.7
578 0.8
579 0.86
580 0.91
581 0.94
582 0.95
583 0.9
584 0.84
585 0.75
586 0.67
587 0.56
588 0.44
589 0.34
590 0.25
591 0.18
592 0.14
593 0.13
594 0.12
595 0.12
596 0.13
597 0.14
598 0.15
599 0.17
600 0.17
601 0.2
602 0.2
603 0.22
604 0.21
605 0.21
606 0.2
607 0.21
608 0.19
609 0.18
610 0.16
611 0.17
612 0.23
613 0.28
614 0.3
615 0.32
616 0.39
617 0.43
618 0.5
619 0.58
620 0.53
621 0.52
622 0.54
623 0.54
624 0.48
625 0.41
626 0.36
627 0.27
628 0.25
629 0.2
630 0.15
631 0.11
632 0.1
633 0.09
634 0.06
635 0.04
636 0.04
637 0.06
638 0.07
639 0.1
640 0.14
641 0.16
642 0.23
643 0.27
644 0.31
645 0.34
646 0.36
647 0.35
648 0.34
649 0.36
650 0.33
651 0.3
652 0.27
653 0.23
654 0.21
655 0.2
656 0.19
657 0.15
658 0.17
659 0.17
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.18
664 0.18
665 0.19
666 0.18
667 0.26
668 0.27
669 0.26
670 0.26
671 0.26
672 0.26
673 0.25
674 0.21
675 0.15
676 0.17
677 0.17
678 0.17
679 0.14
680 0.15
681 0.14
682 0.13
683 0.12
684 0.11
685 0.11
686 0.12
687 0.14
688 0.11
689 0.12
690 0.12
691 0.11
692 0.11
693 0.1
694 0.08
695 0.06
696 0.07
697 0.07
698 0.06
699 0.06
700 0.06
701 0.07
702 0.1
703 0.1
704 0.09
705 0.13
706 0.14
707 0.14
708 0.15
709 0.15
710 0.13
711 0.14
712 0.15
713 0.12
714 0.13
715 0.15
716 0.14
717 0.13
718 0.16
719 0.17
720 0.16
721 0.17
722 0.17
723 0.14
724 0.14