Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A067TVA1

Protein Details
Accession A0A067TVA1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-35LSPTSPTMRKRQRTVDHPGTAHydrophilic
72-93DEEKPKSDKKAGRRKIKIEFIQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-90KPKSDKKAGRRKIKIE
97-97R
237-243DKRRRRG
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR033897  MADS_SRF-like  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000987  F:cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00266  MADS_SRF_like  
Amino Acid Sequences MHAMPTLDMQKPAALSPTSPTMRKRQRTVDHPGTAAPAEGHPPPPPGPPPVGDDAFINDHDAAESGGDDDEDEEKPKSDKKAGRRKIKIEFIQDKSRRHITFSKRKAGMLALLSDHAYELSTLTGTQVLLLVVSETGLVYTFTTAKLQPLVTQPEGKNLIQACLNAPHGSLPSTMPVGPPLGRSSGPMNIPGPAPSANIPGGLSISGGANNIKEDEQDDDHHDDAAVSHGGRPNAGDKRRRRGSSTSGPAPPGSNPRGGTSPHSPNATIPPPLNIPSGQAQGQPPHPSHQPPQPQITLGSPTSPQQQHQQVTASSPGQYPAPSYGHHPGQQHHQQQQHDQPMYSPHMMSGGYSYPAPGAPPAQGGPGQQLGGLAAAAATQQPQHHWGAQQPQVGQGGAHYGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.19
4 0.28
5 0.3
6 0.33
7 0.37
8 0.43
9 0.53
10 0.61
11 0.65
12 0.67
13 0.72
14 0.76
15 0.82
16 0.81
17 0.75
18 0.68
19 0.61
20 0.53
21 0.44
22 0.37
23 0.28
24 0.18
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.18
29 0.21
30 0.22
31 0.26
32 0.28
33 0.29
34 0.3
35 0.31
36 0.33
37 0.36
38 0.35
39 0.31
40 0.28
41 0.27
42 0.26
43 0.24
44 0.22
45 0.15
46 0.14
47 0.14
48 0.13
49 0.1
50 0.08
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.08
58 0.09
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.15
63 0.2
64 0.23
65 0.3
66 0.36
67 0.45
68 0.56
69 0.64
70 0.73
71 0.77
72 0.8
73 0.8
74 0.83
75 0.79
76 0.79
77 0.78
78 0.73
79 0.75
80 0.73
81 0.68
82 0.64
83 0.66
84 0.56
85 0.53
86 0.55
87 0.55
88 0.6
89 0.65
90 0.68
91 0.62
92 0.61
93 0.57
94 0.5
95 0.44
96 0.35
97 0.28
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.14
103 0.09
104 0.07
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.08
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.13
136 0.17
137 0.22
138 0.22
139 0.28
140 0.27
141 0.31
142 0.35
143 0.32
144 0.31
145 0.26
146 0.25
147 0.2
148 0.21
149 0.16
150 0.15
151 0.16
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.12
171 0.13
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.14
206 0.16
207 0.16
208 0.16
209 0.15
210 0.13
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.06
215 0.08
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.15
221 0.22
222 0.28
223 0.35
224 0.39
225 0.49
226 0.57
227 0.59
228 0.58
229 0.56
230 0.59
231 0.61
232 0.62
233 0.58
234 0.52
235 0.51
236 0.47
237 0.42
238 0.35
239 0.32
240 0.27
241 0.25
242 0.23
243 0.24
244 0.26
245 0.26
246 0.29
247 0.29
248 0.33
249 0.32
250 0.33
251 0.31
252 0.3
253 0.35
254 0.32
255 0.28
256 0.22
257 0.21
258 0.21
259 0.23
260 0.23
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.2
265 0.18
266 0.19
267 0.19
268 0.21
269 0.25
270 0.27
271 0.25
272 0.26
273 0.29
274 0.31
275 0.34
276 0.39
277 0.45
278 0.45
279 0.5
280 0.47
281 0.45
282 0.42
283 0.4
284 0.35
285 0.26
286 0.24
287 0.19
288 0.19
289 0.26
290 0.26
291 0.25
292 0.29
293 0.36
294 0.37
295 0.38
296 0.4
297 0.33
298 0.34
299 0.36
300 0.29
301 0.22
302 0.21
303 0.19
304 0.17
305 0.16
306 0.16
307 0.16
308 0.17
309 0.16
310 0.21
311 0.26
312 0.3
313 0.34
314 0.35
315 0.34
316 0.41
317 0.5
318 0.53
319 0.54
320 0.55
321 0.55
322 0.6
323 0.66
324 0.66
325 0.6
326 0.52
327 0.46
328 0.46
329 0.48
330 0.42
331 0.33
332 0.23
333 0.22
334 0.22
335 0.2
336 0.17
337 0.14
338 0.13
339 0.13
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.13
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.17
351 0.17
352 0.19
353 0.2
354 0.19
355 0.16
356 0.16
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.07
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.08
367 0.09
368 0.12
369 0.16
370 0.2
371 0.23
372 0.25
373 0.31
374 0.38
375 0.43
376 0.45
377 0.42
378 0.42
379 0.41
380 0.39
381 0.32
382 0.23
383 0.25