Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B6QF57

Protein Details
Accession B6QF57    Localization Confidence Low Confidence Score 6.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
342-361GGLKVVKLRQRRQNIRKLADHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 7, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG tmf:PMAA_081050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MASSPRKSIDSLASVTSTPSLQQLAHNTYDSPRIAPSQRIPQRRLSTASSLVSIGGILDSSTHRSSIAELGQNAISTLLQPPIVRTGLVAHTSIPATGYKPPTARDIPPVTLTNIPNVDSKEFQPYLEQVGSLYDAFQRAKEESGNDENDSNLVRNNAALSPSSALSPRPDEFEDRKSPVLERRLSGVSKNSRAISPFDLRGRRRTSYGRGPQAVTPLSTIPNVYFEEDFHLENPRTFDVVSEKSEIVRQPPKPSAGNGAAIESPAIGRKALATNAILQEKLSWYMDTVEIHLISSISTASKSFFTALGSLRELHAEAADSVRRIQILRKDLNKIDKEMAMGGLKVVKLRQRRQNIRKLADAMSQLHEVVVAVTECENIIEQGDVEDAMDGLDEVNLLLAGEQATRRRNQDVVEQRPPVDLRGLHALQGVDEELARLRQRIGARYESRFLDDLLTDLRRHISSVPGDATLQRWGASFQRNRGGHRAAPSISPAYMSFDAELRSKLHAELVGLGRSHYTMPAATSFKTAVLREMKALIRKHLPSSSDDDNESVMSASTHGGRQLSSQEKSSILARNLRVLDADSAYDMLKQIYTGVSESLRRLGVQVKVLLDITSGLGAQPSPSVGRSSPRSPDPQNTRGPRSQGSAAEVAAVQEEILQVLDMSSLLGQAVDIVQSQVVKVLKVRSEQTSYLPIGDFLRYFSLNRLFADECEAISGRSGTSLKTVVDNQIRDFIVRFSDNQRHKIVEVMDADKWDARDFGDAENAVLNRILRASTADVNQWLQVSKIWQPAETESPTPTPKAENGTAVNGSAKEKEKVRHASFDEQRYVLPESAVTIMKSIEEFEYLMANLPSMTQDIGSNLIECLKLFNSRSSQLILGAGATRSAGLKNINTKHLALSSQALSFIIALIPYVREFARRQSPSSQLMGEFDKVKRLCQEHQNGIHEKLVDIMSGRSASHVNSMKKIDWDAEKDPKVVSTYMETLTKETATLHRVLVRHFPEMTVMMIMEPVFKSYRDQWTKTFQEVSVKTESGRQRMLSDVEYFKSKMGKIDGSSDLGDTLIQVVNAKAILPEKTSASEPAQTEATSSASEASSPPVPEKDDNNQQSKPEKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.26
4 0.19
5 0.15
6 0.15
7 0.14
8 0.13
9 0.18
10 0.24
11 0.28
12 0.31
13 0.31
14 0.3
15 0.31
16 0.36
17 0.33
18 0.27
19 0.24
20 0.28
21 0.3
22 0.36
23 0.4
24 0.45
25 0.53
26 0.6
27 0.62
28 0.65
29 0.69
30 0.68
31 0.66
32 0.61
33 0.58
34 0.55
35 0.53
36 0.44
37 0.37
38 0.32
39 0.26
40 0.2
41 0.14
42 0.08
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.07
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.17
53 0.21
54 0.25
55 0.25
56 0.24
57 0.27
58 0.28
59 0.27
60 0.25
61 0.2
62 0.14
63 0.1
64 0.12
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.18
70 0.19
71 0.18
72 0.16
73 0.19
74 0.21
75 0.23
76 0.21
77 0.17
78 0.19
79 0.19
80 0.19
81 0.16
82 0.13
83 0.13
84 0.19
85 0.23
86 0.26
87 0.28
88 0.3
89 0.36
90 0.4
91 0.4
92 0.42
93 0.44
94 0.42
95 0.44
96 0.44
97 0.4
98 0.42
99 0.39
100 0.36
101 0.32
102 0.31
103 0.3
104 0.3
105 0.31
106 0.27
107 0.28
108 0.31
109 0.3
110 0.28
111 0.28
112 0.27
113 0.29
114 0.27
115 0.26
116 0.17
117 0.18
118 0.19
119 0.15
120 0.15
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.17
126 0.17
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.24
131 0.3
132 0.32
133 0.3
134 0.29
135 0.28
136 0.26
137 0.26
138 0.2
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.16
151 0.15
152 0.15
153 0.17
154 0.21
155 0.2
156 0.22
157 0.24
158 0.3
159 0.34
160 0.41
161 0.44
162 0.43
163 0.45
164 0.42
165 0.43
166 0.44
167 0.48
168 0.44
169 0.38
170 0.39
171 0.42
172 0.41
173 0.41
174 0.42
175 0.42
176 0.43
177 0.46
178 0.43
179 0.4
180 0.41
181 0.41
182 0.38
183 0.35
184 0.36
185 0.39
186 0.46
187 0.47
188 0.54
189 0.56
190 0.53
191 0.53
192 0.54
193 0.54
194 0.57
195 0.64
196 0.64
197 0.62
198 0.61
199 0.58
200 0.57
201 0.5
202 0.4
203 0.31
204 0.24
205 0.22
206 0.2
207 0.18
208 0.13
209 0.15
210 0.15
211 0.16
212 0.14
213 0.13
214 0.18
215 0.19
216 0.2
217 0.17
218 0.22
219 0.21
220 0.22
221 0.25
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.2
227 0.22
228 0.23
229 0.24
230 0.23
231 0.22
232 0.26
233 0.26
234 0.27
235 0.31
236 0.32
237 0.36
238 0.4
239 0.44
240 0.43
241 0.43
242 0.44
243 0.38
244 0.39
245 0.33
246 0.3
247 0.25
248 0.23
249 0.21
250 0.14
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.12
258 0.12
259 0.14
260 0.13
261 0.17
262 0.21
263 0.22
264 0.2
265 0.17
266 0.18
267 0.17
268 0.18
269 0.15
270 0.11
271 0.11
272 0.13
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.12
294 0.14
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.15
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.1
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.11
312 0.16
313 0.2
314 0.27
315 0.34
316 0.38
317 0.43
318 0.47
319 0.55
320 0.53
321 0.49
322 0.44
323 0.38
324 0.34
325 0.29
326 0.26
327 0.17
328 0.15
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.12
334 0.16
335 0.24
336 0.32
337 0.41
338 0.5
339 0.6
340 0.69
341 0.77
342 0.81
343 0.76
344 0.73
345 0.68
346 0.6
347 0.53
348 0.47
349 0.39
350 0.32
351 0.28
352 0.23
353 0.19
354 0.16
355 0.12
356 0.09
357 0.07
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.02
382 0.02
383 0.02
384 0.02
385 0.02
386 0.03
387 0.03
388 0.04
389 0.06
390 0.1
391 0.13
392 0.16
393 0.18
394 0.2
395 0.22
396 0.22
397 0.31
398 0.37
399 0.42
400 0.47
401 0.46
402 0.44
403 0.45
404 0.44
405 0.35
406 0.28
407 0.2
408 0.15
409 0.21
410 0.2
411 0.18
412 0.2
413 0.19
414 0.15
415 0.15
416 0.13
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.05
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.12
426 0.14
427 0.19
428 0.23
429 0.29
430 0.33
431 0.35
432 0.38
433 0.34
434 0.34
435 0.3
436 0.26
437 0.19
438 0.15
439 0.13
440 0.12
441 0.13
442 0.11
443 0.11
444 0.12
445 0.11
446 0.12
447 0.12
448 0.14
449 0.13
450 0.16
451 0.16
452 0.15
453 0.15
454 0.15
455 0.15
456 0.13
457 0.12
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.13
462 0.2
463 0.22
464 0.24
465 0.32
466 0.33
467 0.36
468 0.4
469 0.4
470 0.34
471 0.35
472 0.35
473 0.27
474 0.26
475 0.26
476 0.21
477 0.18
478 0.16
479 0.12
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.1
489 0.11
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.1
494 0.1
495 0.12
496 0.12
497 0.13
498 0.12
499 0.12
500 0.11
501 0.11
502 0.11
503 0.08
504 0.07
505 0.05
506 0.06
507 0.09
508 0.1
509 0.1
510 0.11
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.14
515 0.15
516 0.17
517 0.17
518 0.16
519 0.19
520 0.2
521 0.24
522 0.24
523 0.23
524 0.24
525 0.25
526 0.27
527 0.27
528 0.26
529 0.23
530 0.27
531 0.28
532 0.24
533 0.24
534 0.22
535 0.19
536 0.18
537 0.15
538 0.1
539 0.06
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.06
546 0.07
547 0.07
548 0.08
549 0.12
550 0.17
551 0.17
552 0.18
553 0.18
554 0.18
555 0.19
556 0.21
557 0.2
558 0.18
559 0.22
560 0.21
561 0.25
562 0.24
563 0.24
564 0.21
565 0.17
566 0.16
567 0.12
568 0.11
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.06
574 0.05
575 0.05
576 0.05
577 0.05
578 0.05
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.07
583 0.08
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.09
588 0.1
589 0.13
590 0.14
591 0.15
592 0.16
593 0.15
594 0.16
595 0.16
596 0.15
597 0.11
598 0.09
599 0.07
600 0.05
601 0.05
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.05
610 0.07
611 0.07
612 0.12
613 0.16
614 0.19
615 0.22
616 0.25
617 0.3
618 0.31
619 0.39
620 0.43
621 0.46
622 0.51
623 0.53
624 0.55
625 0.53
626 0.53
627 0.46
628 0.42
629 0.38
630 0.31
631 0.29
632 0.24
633 0.21
634 0.18
635 0.16
636 0.13
637 0.09
638 0.08
639 0.05
640 0.04
641 0.04
642 0.03
643 0.03
644 0.03
645 0.03
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.03
657 0.03
658 0.03
659 0.03
660 0.04
661 0.04
662 0.04
663 0.08
664 0.08
665 0.08
666 0.1
667 0.13
668 0.16
669 0.18
670 0.21
671 0.21
672 0.25
673 0.26
674 0.26
675 0.27
676 0.25
677 0.23
678 0.21
679 0.18
680 0.15
681 0.15
682 0.13
683 0.09
684 0.11
685 0.11
686 0.11
687 0.14
688 0.18
689 0.18
690 0.18
691 0.21
692 0.19
693 0.19
694 0.24
695 0.21
696 0.15
697 0.16
698 0.16
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.06
703 0.09
704 0.09
705 0.08
706 0.09
707 0.11
708 0.11
709 0.13
710 0.14
711 0.18
712 0.23
713 0.24
714 0.22
715 0.26
716 0.26
717 0.24
718 0.23
719 0.18
720 0.16
721 0.16
722 0.17
723 0.18
724 0.27
725 0.31
726 0.35
727 0.36
728 0.35
729 0.34
730 0.36
731 0.31
732 0.27
733 0.26
734 0.24
735 0.22
736 0.21
737 0.22
738 0.19
739 0.18
740 0.13
741 0.11
742 0.09
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.14
747 0.13
748 0.13
749 0.15
750 0.14
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.08
755 0.08
756 0.08
757 0.06
758 0.08
759 0.1
760 0.12
761 0.14
762 0.15
763 0.16
764 0.17
765 0.17
766 0.16
767 0.13
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.15
772 0.2
773 0.2
774 0.2
775 0.22
776 0.25
777 0.29
778 0.29
779 0.26
780 0.21
781 0.25
782 0.25
783 0.24
784 0.22
785 0.19
786 0.19
787 0.23
788 0.23
789 0.23
790 0.24
791 0.26
792 0.25
793 0.23
794 0.22
795 0.18
796 0.17
797 0.18
798 0.19
799 0.19
800 0.23
801 0.26
802 0.33
803 0.42
804 0.44
805 0.47
806 0.49
807 0.56
808 0.58
809 0.61
810 0.56
811 0.47
812 0.44
813 0.39
814 0.38
815 0.28
816 0.21
817 0.15
818 0.13
819 0.15
820 0.16
821 0.13
822 0.1
823 0.1
824 0.1
825 0.1
826 0.1
827 0.08
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.09
835 0.08
836 0.07
837 0.07
838 0.07
839 0.07
840 0.07
841 0.06
842 0.06
843 0.07
844 0.1
845 0.1
846 0.1
847 0.09
848 0.11
849 0.1
850 0.1
851 0.11
852 0.1
853 0.14
854 0.15
855 0.2
856 0.23
857 0.24
858 0.26
859 0.26
860 0.25
861 0.22
862 0.21
863 0.16
864 0.13
865 0.13
866 0.11
867 0.09
868 0.08
869 0.07
870 0.07
871 0.08
872 0.09
873 0.1
874 0.14
875 0.23
876 0.27
877 0.3
878 0.32
879 0.32
880 0.32
881 0.32
882 0.29
883 0.22
884 0.22
885 0.2
886 0.18
887 0.17
888 0.15
889 0.13
890 0.12
891 0.11
892 0.07
893 0.05
894 0.05
895 0.05
896 0.06
897 0.06
898 0.08
899 0.08
900 0.11
901 0.13
902 0.2
903 0.3
904 0.32
905 0.36
906 0.4
907 0.46
908 0.47
909 0.48
910 0.43
911 0.33
912 0.33
913 0.32
914 0.29
915 0.27
916 0.23
917 0.29
918 0.27
919 0.29
920 0.33
921 0.35
922 0.39
923 0.45
924 0.53
925 0.54
926 0.61
927 0.66
928 0.64
929 0.61
930 0.57
931 0.48
932 0.39
933 0.33
934 0.25
935 0.18
936 0.15
937 0.13
938 0.12
939 0.13
940 0.13
941 0.11
942 0.12
943 0.12
944 0.19
945 0.26
946 0.27
947 0.32
948 0.36
949 0.36
950 0.38
951 0.39
952 0.35
953 0.34
954 0.37
955 0.39
956 0.44
957 0.45
958 0.43
959 0.42
960 0.39
961 0.36
962 0.31
963 0.25
964 0.21
965 0.21
966 0.23
967 0.26
968 0.24
969 0.23
970 0.24
971 0.23
972 0.18
973 0.17
974 0.19
975 0.19
976 0.21
977 0.21
978 0.24
979 0.25
980 0.28
981 0.34
982 0.34
983 0.34
984 0.32
985 0.3
986 0.28
987 0.28
988 0.26
989 0.18
990 0.15
991 0.11
992 0.11
993 0.11
994 0.11
995 0.1
996 0.11
997 0.11
998 0.12
999 0.16
1000 0.22
1001 0.33
1002 0.39
1003 0.42
1004 0.45
1005 0.54
1006 0.58
1007 0.58
1008 0.55
1009 0.46
1010 0.49
1011 0.47
1012 0.47
1013 0.43
1014 0.39
1015 0.34
1016 0.38
1017 0.42
1018 0.38
1019 0.4
1020 0.37
1021 0.33
1022 0.37
1023 0.4
1024 0.35
1025 0.35
1026 0.32
1027 0.3
1028 0.33
1029 0.32
1030 0.3
1031 0.31
1032 0.29
1033 0.29
1034 0.31
1035 0.33
1036 0.32
1037 0.37
1038 0.38
1039 0.36
1040 0.36
1041 0.31
1042 0.26
1043 0.2
1044 0.18
1045 0.12
1046 0.11
1047 0.09
1048 0.08
1049 0.09
1050 0.09
1051 0.1
1052 0.1
1053 0.1
1054 0.1
1055 0.12
1056 0.14
1057 0.16
1058 0.18
1059 0.19
1060 0.21
1061 0.23
1062 0.25
1063 0.26
1064 0.3
1065 0.28
1066 0.29
1067 0.29
1068 0.26
1069 0.25
1070 0.22
1071 0.21
1072 0.15
1073 0.15
1074 0.13
1075 0.11
1076 0.12
1077 0.12
1078 0.15
1079 0.17
1080 0.18
1081 0.21
1082 0.22
1083 0.27
1084 0.3
1085 0.36
1086 0.4
1087 0.47
1088 0.54
1089 0.58
1090 0.57
1091 0.59