FuNGI

B6QSY3

Protein Details

Accession

B6QSY3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-48	TPATMSPRRRPYYKKTSSLKKKNSCCSNSSN	Hydrophilic
136-155	GTGRRNGKGRLRFRPPPQTD	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	tmf:PMAA_003080 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MATPHTAGASVPPSSTLTPATMSPRRRPYYKKTSSLKKKNSCCSNSSNRSNRSNSNSNSNSNSNNSSPNKPSPSPSPMAMRMRENSIHRAIKPIWQTWDSFAVNFFGVPDEATAFTIWTAFNRQGNIFSIDLYEDGTGRRNGKGRLRFRPPPQTDFWRNAQWQLNLSGGRKARIRVVPLFEERDMRIPSPVDPDELYPAEFDIPISTLDFGPMIGPNSMLLMRHLQKTPTEHPRLTVDLKHRQLLIFFQTPIQSSQGVSAMSHYRLKVPFSQLSTLYQHIESDETSDSVSHILRFESPPLYYRHLYNVESSFSGRDSANGWRSMDCWYRQADIVHRNGCWAVLPISLRKKNPIIDIGRWTAIRITYGQDSIHSKSYRLLCKALRDFNIKIKIDNEFKMEVPRTVPVPVVWDICDEPESSAASTLDDLFGKSFIHLPFAIRYQLEVCISHGYISEYTASKPEFVQRLKDMEERKALTLLEHVATDKKIYWDAMKIFDILFPKGVTRRNIPSYCCMIRTATVTPSTIYWNTPSMEITNRVLRRYSEHADRFLRVRFKDEKFEGRINSTHHDTMDEIFARIKRTMSNGIILGDRKYEFLAFGNSQFREHGAYFFASEAHVTAANIRAWMGEFSEIRNIAKYAARLGQCFSTTRAINTCTVELKRIPDVERGGYTFSDGVGRISRFLAQMTQQELKIKTPDKEPPSAYQFRLGGCKGMLVLSDVPRGREIQIRPSQEKFPANHQGLEIIRWSQFSSATLNRQLIAVLSSLGVSDEVFHEKLRRMVSNLEEATRDDRAAMRLLQKYIDPNEMTLVLSKMVSDGFLQSRDPFVTSIITLWKAWSIKYLKEKAKITIEDGACLLGVLDETATLQGFSYEKVKKPHLSRESKLDALPEIFLQVYRADEKKYCVIKGVCILARNPSLHPGDIRVVRAVDRPELAHLKDVVVLPQLGDRDIASMCSGGDLDGDDYLVIWDKDLVPNQWFRAPMDYAPIKGVNLDRSVTVNDITTFFVNYMKNDSLPRIAHAHLAWSDFLMNGVESPKCIRLAQLHSNAVDYNKTGEPAYLPRDLRPRRWPHFMEKNYKPKDQTYQSKKILGQLYDAVDRVDFHPDFDVPFDKRVLESGVSVTDNIMQFARELKVDYDLALKRIMAQHEIRTEFEVWSTFVLSHANLSKDYKFHEELGGITKALKERFQKECYDKVGGRDFNHIKPMAVAIYSVTNDEVNAALAEFRKNNPDTKIKPEPENLPMISFAWLFPDVLGRVALRYFDSANRAARTAAAVEDNVPQEDQKQDREEELVGSDVEKANSDTTDCYSISNRDDNTEDVTDISEVIPDEEVEIIEDKAQIKPSALDVLEMLFDSDDDS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.21
3	0.19
4	0.16
5	0.17
6	0.2
7	0.27
8	0.32
9	0.38
10	0.45
11	0.54
12	0.59
13	0.65
14	0.7
15	0.72
16	0.76
17	0.8
18	0.8
19	0.8
20	0.85
21	0.88
22	0.91
23	0.92
24	0.91
25	0.9
26	0.91
27	0.91
28	0.86
29	0.81
30	0.79
31	0.79
32	0.79
33	0.79
34	0.79
35	0.76
36	0.78
37	0.78
38	0.77
39	0.74
40	0.74
41	0.67
42	0.68
43	0.66
44	0.63
45	0.63
46	0.59
47	0.54
48	0.5
49	0.51
50	0.43
51	0.47
52	0.47
53	0.48
54	0.5
55	0.54
56	0.57
57	0.54
58	0.57
59	0.55
60	0.58
61	0.55
62	0.52
63	0.51
64	0.52
65	0.57
66	0.56
67	0.54
68	0.49
69	0.51
70	0.53
71	0.5
72	0.48
73	0.5
74	0.52
75	0.46
76	0.5
77	0.46
78	0.47
79	0.49
80	0.48
81	0.46
82	0.42
83	0.43
84	0.4
85	0.46
86	0.4
87	0.34
88	0.3
89	0.25
90	0.23
91	0.21
92	0.18
93	0.11
94	0.1
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.14
107	0.17
108	0.2
109	0.22
110	0.24
111	0.25
112	0.28
113	0.3
114	0.26
115	0.22
116	0.2
117	0.18
118	0.17
119	0.15
120	0.12
121	0.09
122	0.1
123	0.14
124	0.17
125	0.18
126	0.23
127	0.27
128	0.33
129	0.42
130	0.51
131	0.57
132	0.63
133	0.7
134	0.75
135	0.78
136	0.83
137	0.8
138	0.76
139	0.74
140	0.74
141	0.71
142	0.68
143	0.65
144	0.62
145	0.57
146	0.58
147	0.57
148	0.5
149	0.46
150	0.43
151	0.42
152	0.36
153	0.36
154	0.36
155	0.31
156	0.33
157	0.33
158	0.33
159	0.37
160	0.38
161	0.42
162	0.42
163	0.46
164	0.48
165	0.5
166	0.53
167	0.46
168	0.45
169	0.4
170	0.4
171	0.37
172	0.32
173	0.29
174	0.26
175	0.26
176	0.3
177	0.29
178	0.25
179	0.23
180	0.24
181	0.26
182	0.26
183	0.24
184	0.17
185	0.17
186	0.15
187	0.14
188	0.13
189	0.09
190	0.09
191	0.09
192	0.09
193	0.1
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.09
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.1
205	0.11
206	0.1
207	0.11
208	0.16
209	0.19
210	0.24
211	0.26
212	0.26
213	0.3
214	0.37
215	0.43
216	0.46
217	0.51
218	0.47
219	0.47
220	0.5
221	0.51
222	0.48
223	0.46
224	0.43
225	0.46
226	0.49
227	0.49
228	0.46
229	0.42
230	0.39
231	0.36
232	0.35
233	0.29
234	0.26
235	0.25
236	0.25
237	0.26
238	0.26
239	0.24
240	0.18
241	0.15
242	0.16
243	0.16
244	0.15
245	0.13
246	0.15
247	0.16
248	0.19
249	0.22
250	0.2
251	0.24
252	0.25
253	0.28
254	0.31
255	0.34
256	0.36
257	0.36
258	0.39
259	0.35
260	0.38
261	0.38
262	0.34
263	0.3
264	0.25
265	0.21
266	0.19
267	0.19
268	0.14
269	0.14
270	0.13
271	0.11
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.11
276	0.12
277	0.1
278	0.09
279	0.1
280	0.13
281	0.14
282	0.17
283	0.17
284	0.17
285	0.2
286	0.23
287	0.28
288	0.26
289	0.27
290	0.31
291	0.32
292	0.33
293	0.34
294	0.32
295	0.28
296	0.27
297	0.27
298	0.21
299	0.18
300	0.18
301	0.14
302	0.12
303	0.13
304	0.19
305	0.23
306	0.24
307	0.25
308	0.23
309	0.24
310	0.29
311	0.32
312	0.27
313	0.26
314	0.26
315	0.26
316	0.28
317	0.3
318	0.32
319	0.33
320	0.38
321	0.37
322	0.35
323	0.34
324	0.32
325	0.29
326	0.23
327	0.18
328	0.12
329	0.12
330	0.14
331	0.19
332	0.28
333	0.33
334	0.34
335	0.37
336	0.4
337	0.41
338	0.44
339	0.46
340	0.42
341	0.41
342	0.45
343	0.43
344	0.41
345	0.37
346	0.34
347	0.27
348	0.22
349	0.19
350	0.15
351	0.15
352	0.14
353	0.16
354	0.15
355	0.16
356	0.19
357	0.21
358	0.27
359	0.25
360	0.23
361	0.27
362	0.35
363	0.38
364	0.38
365	0.4
366	0.36
367	0.44
368	0.51
369	0.51
370	0.49
371	0.48
372	0.47
373	0.5
374	0.56
375	0.48
376	0.42
377	0.38
378	0.39
379	0.38
380	0.37
381	0.33
382	0.26
383	0.26
384	0.31
385	0.3
386	0.25
387	0.23
388	0.22
389	0.2
390	0.19
391	0.19
392	0.13
393	0.15
394	0.16
395	0.16
396	0.15
397	0.15
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.11
402	0.1
403	0.1
404	0.11
405	0.09
406	0.1
407	0.09
408	0.09
409	0.09
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.07
417	0.07
418	0.11
419	0.1
420	0.13
421	0.13
422	0.14
423	0.16
424	0.18
425	0.19
426	0.15
427	0.15
428	0.14
429	0.16
430	0.15
431	0.14
432	0.13
433	0.14
434	0.14
435	0.13
436	0.13
437	0.12
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.11
442	0.11
443	0.14
444	0.13
445	0.12
446	0.13
447	0.18
448	0.22
449	0.23
450	0.27
451	0.27
452	0.29
453	0.32
454	0.37
455	0.35
456	0.32
457	0.37
458	0.34
459	0.32
460	0.3
461	0.27
462	0.22
463	0.21
464	0.18
465	0.13
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.12
471	0.11
472	0.1
473	0.11
474	0.12
475	0.13
476	0.16
477	0.17
478	0.19
479	0.19
480	0.18
481	0.17
482	0.19
483	0.19
484	0.15
485	0.14
486	0.11
487	0.12
488	0.15
489	0.2
490	0.2
491	0.23
492	0.29
493	0.36
494	0.39
495	0.4
496	0.41
497	0.43
498	0.41
499	0.38
500	0.33
501	0.25
502	0.24
503	0.25
504	0.22
505	0.17
506	0.17
507	0.17
508	0.16
509	0.16
510	0.18
511	0.15
512	0.14
513	0.13
514	0.14
515	0.14
516	0.15
517	0.14
518	0.13
519	0.14
520	0.16
521	0.17
522	0.22
523	0.22
524	0.23
525	0.24
526	0.23
527	0.25
528	0.29
529	0.31
530	0.33
531	0.34
532	0.38
533	0.39
534	0.4
535	0.38
536	0.36
537	0.38
538	0.29
539	0.33
540	0.35
541	0.35
542	0.41
543	0.42
544	0.44
545	0.43
546	0.47
547	0.42
548	0.38
549	0.38
550	0.33
551	0.33
552	0.3
553	0.26
554	0.22
555	0.21
556	0.19
557	0.17
558	0.18
559	0.15
560	0.11
561	0.13
562	0.14
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.13
567	0.16
568	0.2
569	0.19
570	0.2
571	0.18
572	0.19
573	0.2
574	0.19
575	0.16
576	0.13
577	0.12
578	0.11
579	0.1
580	0.1
581	0.08
582	0.09
583	0.12
584	0.11
585	0.13
586	0.17
587	0.17
588	0.17
589	0.17
590	0.17
591	0.16
592	0.16
593	0.14
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.1
599	0.07
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.06
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.07
612	0.08
613	0.08
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.11
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.11
622	0.1
623	0.12
624	0.11
625	0.11
626	0.15
627	0.16
628	0.16
629	0.17
630	0.17
631	0.16
632	0.17
633	0.17
634	0.16
635	0.15
636	0.16
637	0.16
638	0.17
639	0.18
640	0.18
641	0.17
642	0.16
643	0.16
644	0.17
645	0.16
646	0.16
647	0.16
648	0.18
649	0.18
650	0.19
651	0.2
652	0.19
653	0.19
654	0.18
655	0.17
656	0.14
657	0.13
658	0.1
659	0.08
660	0.08
661	0.07
662	0.08
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.1
670	0.1
671	0.09
672	0.12
673	0.15
674	0.16
675	0.15
676	0.19
677	0.2
678	0.2
679	0.22
680	0.22
681	0.21
682	0.23
683	0.3
684	0.3
685	0.34
686	0.34
687	0.34
688	0.39
689	0.41
690	0.37
691	0.34
692	0.31
693	0.27
694	0.29
695	0.25
696	0.19
697	0.15
698	0.14
699	0.1
700	0.09
701	0.09
702	0.07
703	0.08
704	0.08
705	0.13
706	0.13
707	0.13
708	0.14
709	0.15
710	0.14
711	0.18
712	0.18
713	0.23
714	0.3
715	0.34
716	0.36
717	0.38
718	0.39
719	0.38
720	0.42
721	0.34
722	0.34
723	0.39
724	0.37
725	0.35
726	0.33
727	0.31
728	0.27
729	0.26
730	0.2
731	0.12
732	0.11
733	0.11
734	0.11
735	0.09
736	0.09
737	0.09
738	0.12
739	0.13
740	0.16
741	0.19
742	0.19
743	0.18
744	0.18
745	0.17
746	0.13
747	0.11
748	0.08
749	0.05
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.04
755	0.04
756	0.04
757	0.05
758	0.07
759	0.07
760	0.08
761	0.1
762	0.11
763	0.15
764	0.17
765	0.17
766	0.16
767	0.19
768	0.21
769	0.26
770	0.26
771	0.23
772	0.21
773	0.21
774	0.22
775	0.19
776	0.17
777	0.1
778	0.11
779	0.11
780	0.12
781	0.14
782	0.17
783	0.19
784	0.19
785	0.2
786	0.19
787	0.21
788	0.22
789	0.24
790	0.18
791	0.16
792	0.17
793	0.17
794	0.16
795	0.13
796	0.11
797	0.08
798	0.07
799	0.07
800	0.06
801	0.05
802	0.06
803	0.05
804	0.07
805	0.08
806	0.09
807	0.1
808	0.1
809	0.11
810	0.11
811	0.12
812	0.1
813	0.09
814	0.09
815	0.09
816	0.09
817	0.1
818	0.11
819	0.1
820	0.1
821	0.12
822	0.12
823	0.12
824	0.17
825	0.18
826	0.22
827	0.3
828	0.38
829	0.4
830	0.47
831	0.49
832	0.47
833	0.51
834	0.47
835	0.41
836	0.4
837	0.35
838	0.29
839	0.27
840	0.22
841	0.15
842	0.14
843	0.11
844	0.04
845	0.04
846	0.03
847	0.03
848	0.02
849	0.03
850	0.03
851	0.03
852	0.03
853	0.03
854	0.04
855	0.05
856	0.06
857	0.12
858	0.15
859	0.2
860	0.24
861	0.29
862	0.35
863	0.4
864	0.49
865	0.53
866	0.57
867	0.56
868	0.6
869	0.6
870	0.56
871	0.51
872	0.42
873	0.33
874	0.26
875	0.24
876	0.15
877	0.11
878	0.09
879	0.08
880	0.08
881	0.07
882	0.08
883	0.11
884	0.12
885	0.13
886	0.15
887	0.18
888	0.25
889	0.27
890	0.26
891	0.29
892	0.29
893	0.29
894	0.31
895	0.33
896	0.27
897	0.26
898	0.26
899	0.24
900	0.27
901	0.26
902	0.23
903	0.23
904	0.23
905	0.22
906	0.22
907	0.21
908	0.22
909	0.23
910	0.24
911	0.2
912	0.19
913	0.19
914	0.22
915	0.21
916	0.18
917	0.17
918	0.16
919	0.19
920	0.22
921	0.21
922	0.21
923	0.19
924	0.18
925	0.19
926	0.19
927	0.16
928	0.14
929	0.13
930	0.1
931	0.12
932	0.12
933	0.09
934	0.09
935	0.08
936	0.08
937	0.08
938	0.09
939	0.07
940	0.07
941	0.07
942	0.07
943	0.07
944	0.05
945	0.05
946	0.05
947	0.05
948	0.05
949	0.05
950	0.04
951	0.04
952	0.05
953	0.06
954	0.06
955	0.05
956	0.06
957	0.07
958	0.1
959	0.12
960	0.14
961	0.15
962	0.19
963	0.2
964	0.23
965	0.23
966	0.21
967	0.23
968	0.23
969	0.2
970	0.25
971	0.24
972	0.22
973	0.23
974	0.23
975	0.18
976	0.19
977	0.21
978	0.17
979	0.17
980	0.17
981	0.15
982	0.16
983	0.17
984	0.16
985	0.15
986	0.13
987	0.12
988	0.12
989	0.13
990	0.12
991	0.11
992	0.1
993	0.14
994	0.14
995	0.14
996	0.17
997	0.17
998	0.18
999	0.2
1000	0.21
1001	0.23
1002	0.22
1003	0.24
1004	0.22
1005	0.22
1006	0.23
1007	0.22
1008	0.24
1009	0.2
1010	0.2
1011	0.18
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.11
1015	0.12
1016	0.08
1017	0.07
1018	0.06
1019	0.08
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.11
1023	0.13
1024	0.14
1025	0.14
1026	0.16
1027	0.21
1028	0.28
1029	0.36
1030	0.41
1031	0.41
1032	0.4
1033	0.41
1034	0.4
1035	0.34
1036	0.27
1037	0.19
1038	0.16
1039	0.14
1040	0.15
1041	0.14
1042	0.13
1043	0.15
1044	0.18
1045	0.22
1046	0.24
1047	0.25
1048	0.28
1049	0.38
1050	0.42
1051	0.47
1052	0.53
1053	0.59
1054	0.58
1055	0.67
1056	0.67
1057	0.67
1058	0.74
1059	0.75
1060	0.74
1061	0.74
1062	0.78
1063	0.75
1064	0.76
1065	0.69
1066	0.63
1067	0.64
1068	0.64
1069	0.65
1070	0.64
1071	0.68
1072	0.67
1073	0.7
1074	0.66
1075	0.64
1076	0.61
1077	0.51
1078	0.44
1079	0.38
1080	0.36
1081	0.32
1082	0.31
1083	0.24
1084	0.18
1085	0.18
1086	0.16
1087	0.2
1088	0.16
1089	0.16
1090	0.18
1091	0.18
1092	0.18
1093	0.19
1094	0.23
1095	0.18
1096	0.2
1097	0.2
1098	0.19
1099	0.18
1100	0.19
1101	0.2
1102	0.16
1103	0.15
1104	0.14
1105	0.16
1106	0.15
1107	0.15
1108	0.14
1109	0.15
1110	0.14
1111	0.14
1112	0.13
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.13
1116	0.14
1117	0.11
1118	0.13
1119	0.12
1120	0.16
1121	0.16
1122	0.16
1123	0.21
1124	0.21
1125	0.22
1126	0.21
1127	0.2
1128	0.19
1129	0.24
1130	0.25
1131	0.23
1132	0.25
1133	0.29
1134	0.35
1135	0.38
1136	0.36
1137	0.35
1138	0.34
1139	0.29
1140	0.27
1141	0.22
1142	0.16
1143	0.15
1144	0.15
1145	0.11
1146	0.1
1147	0.11
1148	0.1
1149	0.13
1150	0.16
1151	0.17
1152	0.18
1153	0.22
1154	0.23
1155	0.24
1156	0.28
1157	0.3
1158	0.29
1159	0.29
1160	0.3
1161	0.27
1162	0.26
1163	0.3
1164	0.27
1165	0.21
1166	0.19
1167	0.2
1168	0.21
1169	0.23
1170	0.27
1171	0.29
1172	0.35
1173	0.42
1174	0.46
1175	0.52
1176	0.54
1177	0.59
1178	0.59
1179	0.59
1180	0.54
1181	0.53
1182	0.58
1183	0.54
1184	0.49
1185	0.53
1186	0.52
1187	0.47
1188	0.53
1189	0.47
1190	0.38
1191	0.34
1192	0.34
1193	0.25
1194	0.2
1195	0.17
1196	0.11
1197	0.13
1198	0.13
1199	0.13
1200	0.12
1201	0.11
1202	0.1
1203	0.11
1204	0.1
1205	0.08
1206	0.08
1207	0.07
1208	0.08
1209	0.09
1210	0.13
1211	0.15
1212	0.16
1213	0.23
1214	0.26
1215	0.3
1216	0.35
1217	0.44
1218	0.45
1219	0.52
1220	0.61
1221	0.58
1222	0.62
1223	0.63
1224	0.62
1225	0.57
1226	0.59
1227	0.51
1228	0.41
1229	0.37
1230	0.32
1231	0.28
1232	0.23
1233	0.18
1234	0.15
1235	0.15
1236	0.13
1237	0.12
1238	0.16
1239	0.14
1240	0.15
1241	0.16
1242	0.12
1243	0.13
1244	0.13
1245	0.14
1246	0.12
1247	0.14
1248	0.15
1249	0.17
1250	0.22
1251	0.25
1252	0.3
1253	0.31
1254	0.31
1255	0.29
1256	0.28
1257	0.26
1258	0.22
1259	0.2
1260	0.16
1261	0.15
1262	0.15
1263	0.2
1264	0.2
1265	0.19
1266	0.19
1267	0.17
1268	0.17
1269	0.24
1270	0.26
1271	0.28
1272	0.31
1273	0.31
1274	0.33
1275	0.35
1276	0.34
1277	0.28
1278	0.26
1279	0.21
1280	0.17
1281	0.16
1282	0.16
1283	0.16
1284	0.15
1285	0.15
1286	0.15
1287	0.15
1288	0.16
1289	0.16
1290	0.16
1291	0.17
1292	0.2
1293	0.19
1294	0.2
1295	0.23
1296	0.26
1297	0.3
1298	0.34
1299	0.31
1300	0.31
1301	0.34
1302	0.33
1303	0.35
1304	0.32
1305	0.28
1306	0.22
1307	0.22
1308	0.19
1309	0.17
1310	0.15
1311	0.11
1312	0.1
1313	0.1
1314	0.1
1315	0.09
1316	0.09
1317	0.09
1318	0.09
1319	0.09
1320	0.1
1321	0.1
1322	0.1
1323	0.13
1324	0.13
1325	0.16
1326	0.2
1327	0.19
1328	0.2
1329	0.21
1330	0.22
1331	0.26
1332	0.25
1333	0.23
1334	0.19
1335	0.19
1336	0.18
1337	0.17
1338	0.15
1339	0.08

B6QSY3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer