FuNGI

A0A067THD4

Protein Details

Accession

A0A067THD4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-54	TVQHRSKSAFSRNREEQRKL	Hydrophilic
118-139	GDILKRARQARIKKQEKAEENV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, mito 10.5, cyto_mito 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013929 RNA_pol_II_AP1_C IPR013930 RNA_pol_II_AP1_N IPR039913 RPAP1/Rba50
Gene Ontology	GO:0006366 P:transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08620 RPAP1_C PF08621 RPAP1_N

Amino Acid Sequences

MAQTPPIIGSIVERRPSSSNWAPKPSSSSKTGFPTVQHRSKSAFSRNREEQRKLGGSRLKDAPTVSHSNKTPLSPPPEPDDWRQQISRDNEDRVAAMTDEEREEERRQILDRFGAQVGDILKRARQARIKKQEKAEENVTLPVANRNPIEGHSQPLPIPVTQEERKNFERARSPPPSSMTSPNSSRPSSRADRRLRFAELEPGDVHVYVSAPPSPKRRAIALPPPDPNASAPTVSLGQWKGKMVPQNLGPPQPEPPKPEAVESQEPEEGSAEYIRRKFFPFAPKDDPNLAWMDVDSAPVSDSSTSSLRFDLQGNPIPPSVSLSLPTHLGLHHHAEGSRAGYTLDDIFLLSRSTVPAQRATMLGILARIARRLEEMKKGRIDGMEELVGKEGELRKRILAAGVEAMSSRGNVGTRAIEVVWECIVGWIPEAMDVEGVEMDSSPDSPINTLPLEFFLPQVTTMLSQGAIPPESATQLLSVLHRLAQHNTATATSIVSTQKLLPTVLEIFLLAPVPQHDSSQLPHPDPLALRLFHTLAVSSRANALEIEKLADPLLRFVTYSSFDSPYPPALSINLLTSTLRLYCVLASYGLYCHIAGTAVEQLAHIEQYVISEACTSNTLTITWANLVEAWIVCATDPHQTTPPHDIKWSQVVGWNWSMGISEIQDRLGSHEKDWVMWTATWQAQAAWLEGAKINGIKGGEAERSEFIDTVKTGFESGREHDIVMAALDKLQKELEGYQSEDMDQLEKMASYFRLLTSLIRLWLACIPPHSEGLPSSPPFSLLFGTLSELARRLLNHPLWSLLALPDAPLPYLYCREMSQFLSYYLRLSERLPGTAQSLWLAQAFSIVLKLIPGDEDHAQTIIKDLANQLNQQWATSQGIQVSPLIWERGGLGILEPFLFNMMRPLEDVYIGPLTMTPQSIKSSTTQRLSSLSSLQQLGLPLRRDWTMSPLDHLLRSGDSSVFKALPISWDSSEVEVARASLFLTKIAQEALLNFSITSFVLTREEAEFGCMKVFMLEHGQPQNDSAEEVFRDSVVERLMEDILRPYTASSPDAHIVSSVSQEGDLERVAARFLGPSVPFFQFYTDFVSLYDAISFSHPLFALLLIPPISMRYLIDYRKHFWCDFNHVVRTIRISPAQVLSADIREYFYPIETDPQIIASYLSSILKENVHDFMRLVALHHIASNIWPDLRDQALENEDRASALLKAVVGQASLNVLRDVVRYRQTLSGPILLPPSCFGAIDGVRSSRMELVLRWGGQSVADRLVGLLNE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.37
3	0.39
4	0.44
5	0.45
6	0.49
7	0.51
8	0.6
9	0.59
10	0.58
11	0.64
12	0.62
13	0.58
14	0.54
15	0.5
16	0.48
17	0.52
18	0.54
19	0.48
20	0.45
21	0.5
22	0.54
23	0.58
24	0.55
25	0.52
26	0.52
27	0.55
28	0.6
29	0.61
30	0.6
31	0.59
32	0.65
33	0.72
34	0.78
35	0.81
36	0.78
37	0.73
38	0.73
39	0.75
40	0.67
41	0.65
42	0.61
43	0.56
44	0.57
45	0.58
46	0.51
47	0.45
48	0.44
49	0.4
50	0.4
51	0.45
52	0.42
53	0.43
54	0.42
55	0.46
56	0.48
57	0.46
58	0.44
59	0.43
60	0.48
61	0.45
62	0.47
63	0.48
64	0.52
65	0.54
66	0.55
67	0.58
68	0.55
69	0.56
70	0.54
71	0.49
72	0.51
73	0.53
74	0.57
75	0.52
76	0.51
77	0.47
78	0.46
79	0.44
80	0.37
81	0.33
82	0.23
83	0.19
84	0.15
85	0.15
86	0.15
87	0.17
88	0.17
89	0.19
90	0.22
91	0.24
92	0.26
93	0.26
94	0.28
95	0.3
96	0.32
97	0.33
98	0.33
99	0.32
100	0.3
101	0.27
102	0.24
103	0.24
104	0.22
105	0.19
106	0.19
107	0.17
108	0.17
109	0.23
110	0.27
111	0.32
112	0.38
113	0.46
114	0.55
115	0.65
116	0.73
117	0.75
118	0.81
119	0.83
120	0.81
121	0.78
122	0.73
123	0.67
124	0.6
125	0.54
126	0.45
127	0.36
128	0.3
129	0.3
130	0.26
131	0.24
132	0.22
133	0.22
134	0.22
135	0.23
136	0.3
137	0.24
138	0.26
139	0.25
140	0.27
141	0.25
142	0.28
143	0.29
144	0.22
145	0.24
146	0.22
147	0.27
148	0.29
149	0.37
150	0.37
151	0.42
152	0.45
153	0.5
154	0.49
155	0.48
156	0.53
157	0.51
158	0.56
159	0.58
160	0.6
161	0.58
162	0.6
163	0.58
164	0.53
165	0.56
166	0.52
167	0.5
168	0.49
169	0.51
170	0.52
171	0.49
172	0.47
173	0.42
174	0.44
175	0.47
176	0.53
177	0.55
178	0.61
179	0.65
180	0.7
181	0.72
182	0.68
183	0.62
184	0.55
185	0.54
186	0.45
187	0.4
188	0.34
189	0.31
190	0.28
191	0.24
192	0.22
193	0.13
194	0.12
195	0.1
196	0.11
197	0.12
198	0.15
199	0.2
200	0.27
201	0.32
202	0.36
203	0.38
204	0.41
205	0.44
206	0.5
207	0.55
208	0.58
209	0.6
210	0.58
211	0.59
212	0.55
213	0.5
214	0.42
215	0.35
216	0.28
217	0.21
218	0.18
219	0.16
220	0.17
221	0.16
222	0.2
223	0.18
224	0.2
225	0.21
226	0.22
227	0.23
228	0.25
229	0.32
230	0.3
231	0.33
232	0.34
233	0.4
234	0.43
235	0.45
236	0.42
237	0.37
238	0.42
239	0.44
240	0.44
241	0.41
242	0.42
243	0.44
244	0.44
245	0.46
246	0.43
247	0.43
248	0.47
249	0.42
250	0.41
251	0.36
252	0.35
253	0.32
254	0.28
255	0.21
256	0.14
257	0.15
258	0.13
259	0.17
260	0.2
261	0.22
262	0.23
263	0.26
264	0.28
265	0.33
266	0.41
267	0.42
268	0.47
269	0.53
270	0.55
271	0.56
272	0.56
273	0.5
274	0.42
275	0.38
276	0.3
277	0.22
278	0.18
279	0.17
280	0.13
281	0.13
282	0.11
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.07
288	0.07
289	0.09
290	0.11
291	0.12
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.15
296	0.17
297	0.18
298	0.22
299	0.27
300	0.27
301	0.29
302	0.28
303	0.27
304	0.25
305	0.24
306	0.2
307	0.14
308	0.16
309	0.16
310	0.16
311	0.17
312	0.17
313	0.14
314	0.13
315	0.14
316	0.14
317	0.17
318	0.17
319	0.17
320	0.17
321	0.18
322	0.19
323	0.18
324	0.16
325	0.12
326	0.1
327	0.09
328	0.1
329	0.09
330	0.08
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.06
338	0.07
339	0.1
340	0.13
341	0.15
342	0.17
343	0.18
344	0.19
345	0.19
346	0.18
347	0.17
348	0.14
349	0.12
350	0.09
351	0.09
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.09
357	0.12
358	0.17
359	0.19
360	0.27
361	0.32
362	0.37
363	0.4
364	0.4
365	0.39
366	0.36
367	0.35
368	0.27
369	0.24
370	0.21
371	0.19
372	0.18
373	0.17
374	0.16
375	0.13
376	0.14
377	0.16
378	0.17
379	0.19
380	0.2
381	0.19
382	0.21
383	0.22
384	0.2
385	0.16
386	0.13
387	0.13
388	0.12
389	0.12
390	0.11
391	0.11
392	0.09
393	0.08
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.08
399	0.08
400	0.08
401	0.09
402	0.09
403	0.09
404	0.09
405	0.1
406	0.08
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.07
411	0.06
412	0.06
413	0.05
414	0.05
415	0.06
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.06
421	0.05
422	0.05
423	0.04
424	0.03
425	0.04
426	0.04
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.09
434	0.09
435	0.09
436	0.09
437	0.09
438	0.11
439	0.1
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.09
445	0.08
446	0.07
447	0.07
448	0.07
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.07
464	0.08
465	0.07
466	0.09
467	0.12
468	0.13
469	0.14
470	0.17
471	0.17
472	0.17
473	0.17
474	0.15
475	0.14
476	0.13
477	0.11
478	0.08
479	0.1
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.1
484	0.11
485	0.12
486	0.12
487	0.09
488	0.1
489	0.11
490	0.1
491	0.09
492	0.08
493	0.07
494	0.07
495	0.08
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.1
503	0.11
504	0.13
505	0.2
506	0.23
507	0.2
508	0.2
509	0.2
510	0.21
511	0.2
512	0.22
513	0.18
514	0.15
515	0.15
516	0.16
517	0.16
518	0.15
519	0.15
520	0.11
521	0.09
522	0.13
523	0.12
524	0.1
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.09
531	0.09
532	0.1
533	0.09
534	0.09
535	0.09
536	0.1
537	0.09
538	0.09
539	0.1
540	0.08
541	0.08
542	0.08
543	0.1
544	0.11
545	0.13
546	0.13
547	0.14
548	0.14
549	0.16
550	0.17
551	0.16
552	0.15
553	0.14
554	0.12
555	0.11
556	0.12
557	0.1
558	0.1
559	0.09
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.07
566	0.06
567	0.06
568	0.06
569	0.07
570	0.07
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.06
575	0.06
576	0.07
577	0.06
578	0.06
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.06
583	0.06
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.04
592	0.03
593	0.04
594	0.05
595	0.05
596	0.04
597	0.05
598	0.05
599	0.06
600	0.07
601	0.06
602	0.06
603	0.06
604	0.07
605	0.07
606	0.07
607	0.07
608	0.07
609	0.06
610	0.06
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.05
615	0.05
616	0.04
617	0.04
618	0.04
619	0.04
620	0.05
621	0.09
622	0.1
623	0.11
624	0.15
625	0.16
626	0.19
627	0.26
628	0.28
629	0.24
630	0.25
631	0.24
632	0.22
633	0.26
634	0.24
635	0.17
636	0.18
637	0.18
638	0.19
639	0.19
640	0.17
641	0.12
642	0.12
643	0.11
644	0.08
645	0.07
646	0.05
647	0.06
648	0.07
649	0.07
650	0.07
651	0.07
652	0.11
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.2
657	0.2
658	0.2
659	0.21
660	0.18
661	0.14
662	0.13
663	0.14
664	0.13
665	0.14
666	0.13
667	0.13
668	0.11
669	0.12
670	0.12
671	0.12
672	0.08
673	0.07
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.06
678	0.06
679	0.05
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.06
684	0.08
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.09
689	0.11
690	0.11
691	0.11
692	0.09
693	0.1
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.07
698	0.08
699	0.07
700	0.09
701	0.09
702	0.11
703	0.14
704	0.14
705	0.14
706	0.14
707	0.14
708	0.12
709	0.1
710	0.09
711	0.05
712	0.06
713	0.07
714	0.07
715	0.07
716	0.07
717	0.07
718	0.08
719	0.09
720	0.12
721	0.12
722	0.14
723	0.14
724	0.14
725	0.14
726	0.14
727	0.13
728	0.09
729	0.08
730	0.07
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.06
735	0.06
736	0.06
737	0.07
738	0.07
739	0.08
740	0.08
741	0.09
742	0.11
743	0.12
744	0.11
745	0.11
746	0.11
747	0.11
748	0.14
749	0.14
750	0.11
751	0.12
752	0.14
753	0.14
754	0.16
755	0.15
756	0.13
757	0.12
758	0.15
759	0.19
760	0.16
761	0.17
762	0.16
763	0.17
764	0.16
765	0.17
766	0.14
767	0.1
768	0.1
769	0.08
770	0.1
771	0.1
772	0.1
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.11
778	0.11
779	0.17
780	0.19
781	0.2
782	0.2
783	0.21
784	0.2
785	0.19
786	0.18
787	0.11
788	0.09
789	0.07
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.07
795	0.07
796	0.08
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.11
801	0.14
802	0.16
803	0.17
804	0.18
805	0.17
806	0.18
807	0.19
808	0.18
809	0.17
810	0.15
811	0.15
812	0.13
813	0.13
814	0.18
815	0.16
816	0.18
817	0.18
818	0.17
819	0.19
820	0.19
821	0.18
822	0.13
823	0.12
824	0.11
825	0.11
826	0.1
827	0.07
828	0.07
829	0.07
830	0.06
831	0.06
832	0.05
833	0.04
834	0.04
835	0.04
836	0.04
837	0.04
838	0.05
839	0.07
840	0.09
841	0.1
842	0.1
843	0.11
844	0.11
845	0.1
846	0.11
847	0.11
848	0.09
849	0.09
850	0.11
851	0.15
852	0.17
853	0.18
854	0.17
855	0.21
856	0.21
857	0.2
858	0.19
859	0.16
860	0.18
861	0.18
862	0.18
863	0.13
864	0.14
865	0.14
866	0.14
867	0.12
868	0.1
869	0.1
870	0.1
871	0.08
872	0.08
873	0.08
874	0.08
875	0.08
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.07
880	0.07
881	0.06
882	0.05
883	0.06
884	0.06
885	0.06
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.1
890	0.12
891	0.11
892	0.12
893	0.12
894	0.11
895	0.11
896	0.1
897	0.09
898	0.08
899	0.09
900	0.09
901	0.1
902	0.08
903	0.1
904	0.13
905	0.13
906	0.15
907	0.17
908	0.23
909	0.28
910	0.32
911	0.31
912	0.3
913	0.32
914	0.33
915	0.32
916	0.28
917	0.25
918	0.23
919	0.23
920	0.21
921	0.2
922	0.19
923	0.2
924	0.21
925	0.21
926	0.19
927	0.2
928	0.2
929	0.21
930	0.2
931	0.23
932	0.23
933	0.22
934	0.24
935	0.26
936	0.27
937	0.26
938	0.25
939	0.21
940	0.16
941	0.16
942	0.15
943	0.13
944	0.12
945	0.13
946	0.15
947	0.14
948	0.14
949	0.14
950	0.12
951	0.13
952	0.14
953	0.16
954	0.15
955	0.17
956	0.18
957	0.18
958	0.19
959	0.17
960	0.15
961	0.12
962	0.12
963	0.09
964	0.08
965	0.08
966	0.09
967	0.09
968	0.09
969	0.1
970	0.1
971	0.1
972	0.11
973	0.11
974	0.09
975	0.1
976	0.12
977	0.12
978	0.12
979	0.11
980	0.1
981	0.11
982	0.1
983	0.11
984	0.08
985	0.08
986	0.1
987	0.1
988	0.12
989	0.12
990	0.14
991	0.12
992	0.14
993	0.14
994	0.13
995	0.13
996	0.11
997	0.1
998	0.1
999	0.1
1000	0.08
1001	0.13
1002	0.14
1003	0.19
1004	0.23
1005	0.24
1006	0.23
1007	0.24
1008	0.24
1009	0.19
1010	0.18
1011	0.13
1012	0.12
1013	0.12
1014	0.14
1015	0.13
1016	0.11
1017	0.12
1018	0.11
1019	0.13
1020	0.11
1021	0.11
1022	0.09
1023	0.11
1024	0.12
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.12
1031	0.12
1032	0.14
1033	0.16
1034	0.17
1035	0.15
1036	0.18
1037	0.21
1038	0.21
1039	0.2
1040	0.17
1041	0.16
1042	0.15
1043	0.15
1044	0.12
1045	0.09
1046	0.09
1047	0.09
1048	0.09
1049	0.1
1050	0.09
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.08
1055	0.08
1056	0.08
1057	0.08
1058	0.08
1059	0.12
1060	0.12
1061	0.14
1062	0.18
1063	0.2
1064	0.21
1065	0.21
1066	0.23
1067	0.19
1068	0.2
1069	0.25
1070	0.22
1071	0.2
1072	0.19
1073	0.22
1074	0.19
1075	0.18
1076	0.17
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.11
1080	0.13
1081	0.1
1082	0.12
1083	0.12
1084	0.12
1085	0.12
1086	0.12
1087	0.12
1088	0.11
1089	0.13
1090	0.1
1091	0.1
1092	0.1
1093	0.1
1094	0.11
1095	0.09
1096	0.09
1097	0.13
1098	0.19
1099	0.24
1100	0.31
1101	0.35
1102	0.39
1103	0.45
1104	0.5
1105	0.46
1106	0.45
1107	0.45
1108	0.48
1109	0.52
1110	0.55
1111	0.52
1112	0.49
1113	0.5
1114	0.47
1115	0.47
1116	0.4
1117	0.36
1118	0.31
1119	0.29
1120	0.29
1121	0.29
1122	0.29
1123	0.23
1124	0.23
1125	0.21
1126	0.2
1127	0.19
1128	0.16
1129	0.16
1130	0.15
1131	0.16
1132	0.14
1133	0.13
1134	0.13
1135	0.13
1136	0.18
1137	0.17
1138	0.19
1139	0.17
1140	0.17
1141	0.17
1142	0.15
1143	0.15
1144	0.1
1145	0.1
1146	0.11
1147	0.11
1148	0.11
1149	0.12
1150	0.14
1151	0.15
1152	0.17
1153	0.18
1154	0.21
1155	0.21
1156	0.21
1157	0.2
1158	0.2
1159	0.21
1160	0.19
1161	0.18
1162	0.17
1163	0.17
1164	0.17
1165	0.17
1166	0.16
1167	0.13
1168	0.15
1169	0.17
1170	0.16
1171	0.14
1172	0.14
1173	0.15
1174	0.18
1175	0.2
1176	0.19
1177	0.17
1178	0.2
1179	0.25
1180	0.27
1181	0.26
1182	0.24
1183	0.22
1184	0.21
1185	0.2
1186	0.16
1187	0.11
1188	0.1
1189	0.11
1190	0.1
1191	0.11
1192	0.12
1193	0.12
1194	0.11
1195	0.1
1196	0.1
1197	0.13
1198	0.14
1199	0.14
1200	0.12
1201	0.12
1202	0.13
1203	0.15
1204	0.19
1205	0.21
1206	0.26
1207	0.27
1208	0.3
1209	0.35
1210	0.36
1211	0.39
1212	0.39
1213	0.4
1214	0.34
1215	0.35
1216	0.37
1217	0.31
1218	0.3
1219	0.26
1220	0.26
1221	0.2
1222	0.19
1223	0.18
1224	0.2
1225	0.2
1226	0.23
1227	0.25
1228	0.22
1229	0.23
1230	0.24
1231	0.25
1232	0.21
1233	0.23
1234	0.21
1235	0.19
1236	0.25
1237	0.3
1238	0.3
1239	0.29
1240	0.27
1241	0.24
1242	0.24
1243	0.27
1244	0.22
1245	0.19
1246	0.18
1247	0.18
1248	0.17

A0A067THD4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer