Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QEX1

Protein Details
Accession B6QEX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
276-304DNAARARLIPQKRRRRRLNTSFGKRTRTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
284-294IPQKRRRRRLN
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
KEGG tmf:PMAA_089920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MKRSRSPETDRQDKWNANINQARAHTRPGLSTLTASVSPPRLRRLASNMDRHSSNPPSNGRSNLLSLAAVEAGEVKVDDPEELFSARLAAAALPPSTSPEGGRLSIKDWIDLYSRNRHENGHHFVIHQHDHPIAGPHYDLRVQFSESSSLSWAIMYGLPGNPNSRRLNRNATETRVHCLWNHLIETASRNTGSMIIWDTGEYEVLPYYDTENPNETDDSASDISNISAEMAFNEQCPSESEKLREAFRNRKIRLRLHGTRLPKNYTISLRLSTQDDNAARARLIPQKRRRRRLNTSFGKRTRTPSTSRSPSPDVPHDQPVGLVANDEDGGENIHGTHSASESESGSTGDARMRLTNAYPGAVNSIGSIHQRRWFITLDRTNSGFVRDGKSQVWKRKSEASSDQDALGFEPFYVRGPEFERSVVTGRTGNDVLRDENVEGFTPRRGWRPILN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.65
3 0.58
4 0.58
5 0.59
6 0.54
7 0.51
8 0.51
9 0.53
10 0.44
11 0.47
12 0.43
13 0.39
14 0.38
15 0.35
16 0.35
17 0.3
18 0.29
19 0.26
20 0.23
21 0.22
22 0.21
23 0.22
24 0.25
25 0.3
26 0.32
27 0.36
28 0.37
29 0.38
30 0.42
31 0.46
32 0.5
33 0.53
34 0.6
35 0.59
36 0.6
37 0.59
38 0.56
39 0.55
40 0.52
41 0.47
42 0.45
43 0.46
44 0.47
45 0.51
46 0.52
47 0.49
48 0.43
49 0.41
50 0.35
51 0.31
52 0.24
53 0.2
54 0.17
55 0.14
56 0.11
57 0.08
58 0.08
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.09
71 0.08
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.13
86 0.15
87 0.17
88 0.19
89 0.21
90 0.18
91 0.19
92 0.24
93 0.24
94 0.21
95 0.19
96 0.2
97 0.2
98 0.23
99 0.26
100 0.3
101 0.34
102 0.36
103 0.37
104 0.37
105 0.41
106 0.45
107 0.48
108 0.43
109 0.41
110 0.37
111 0.38
112 0.41
113 0.38
114 0.3
115 0.25
116 0.2
117 0.2
118 0.2
119 0.21
120 0.16
121 0.15
122 0.14
123 0.12
124 0.14
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.18
130 0.19
131 0.19
132 0.2
133 0.17
134 0.18
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.13
148 0.14
149 0.2
150 0.24
151 0.29
152 0.32
153 0.36
154 0.45
155 0.44
156 0.52
157 0.5
158 0.49
159 0.5
160 0.47
161 0.46
162 0.38
163 0.36
164 0.27
165 0.28
166 0.26
167 0.21
168 0.21
169 0.17
170 0.16
171 0.16
172 0.19
173 0.16
174 0.15
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.07
195 0.11
196 0.12
197 0.13
198 0.15
199 0.16
200 0.17
201 0.17
202 0.15
203 0.11
204 0.1
205 0.12
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.13
225 0.15
226 0.17
227 0.19
228 0.23
229 0.25
230 0.27
231 0.31
232 0.32
233 0.38
234 0.45
235 0.53
236 0.51
237 0.56
238 0.6
239 0.6
240 0.62
241 0.63
242 0.6
243 0.58
244 0.62
245 0.61
246 0.62
247 0.6
248 0.57
249 0.5
250 0.45
251 0.42
252 0.38
253 0.36
254 0.31
255 0.28
256 0.25
257 0.24
258 0.25
259 0.22
260 0.2
261 0.21
262 0.19
263 0.2
264 0.2
265 0.19
266 0.16
267 0.16
268 0.19
269 0.22
270 0.29
271 0.36
272 0.46
273 0.56
274 0.67
275 0.77
276 0.83
277 0.85
278 0.88
279 0.89
280 0.9
281 0.89
282 0.89
283 0.89
284 0.84
285 0.81
286 0.73
287 0.68
288 0.65
289 0.59
290 0.54
291 0.5
292 0.55
293 0.55
294 0.56
295 0.56
296 0.54
297 0.54
298 0.54
299 0.54
300 0.51
301 0.47
302 0.48
303 0.43
304 0.37
305 0.32
306 0.28
307 0.23
308 0.16
309 0.13
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.06
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.13
340 0.14
341 0.15
342 0.19
343 0.18
344 0.18
345 0.17
346 0.16
347 0.17
348 0.16
349 0.15
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.16
354 0.18
355 0.18
356 0.23
357 0.25
358 0.26
359 0.28
360 0.3
361 0.3
362 0.37
363 0.42
364 0.42
365 0.44
366 0.44
367 0.43
368 0.4
369 0.39
370 0.33
371 0.28
372 0.28
373 0.27
374 0.29
375 0.3
376 0.4
377 0.45
378 0.5
379 0.56
380 0.55
381 0.57
382 0.64
383 0.63
384 0.61
385 0.62
386 0.58
387 0.57
388 0.55
389 0.51
390 0.42
391 0.4
392 0.33
393 0.25
394 0.18
395 0.11
396 0.11
397 0.1
398 0.11
399 0.14
400 0.13
401 0.15
402 0.19
403 0.22
404 0.23
405 0.24
406 0.23
407 0.24
408 0.27
409 0.25
410 0.24
411 0.24
412 0.23
413 0.27
414 0.27
415 0.25
416 0.26
417 0.27
418 0.26
419 0.25
420 0.27
421 0.22
422 0.23
423 0.24
424 0.21
425 0.21
426 0.2
427 0.22
428 0.25
429 0.27
430 0.32
431 0.34