Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A067SSH6

Protein Details
Accession A0A067SSH6    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-84EQTQTPRKAAQPKSPSKRKVSDDHydrophilic
111-139TSPASASKPRTPRKPGRPRKSNARDSKGGHydrophilic
155-176GLASKQKRGRGRPRKSMPSGERBasic
217-239EEEPKPKRGRGRPRKSVPEKDDDBasic
254-276EEEPKPKRGRGRPRKSVPEKDEDBasic
285-304AEEPKPKRGRGRPRKSVEGFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-192SKPRTPRKPGRPRKSNARDSKGGSPTKTRQTRRVTTKAGLASKQKRGRGRPRKSMPSGERAAASTSVKRGRGRPRK
220-232PKPKRGRGRPRKS
257-269PKPKRGRGRPRKS
288-315PKPKRGRGRPRKSVEGFAAAPPSKSGKP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MSKTEFPWELLKAECLRLVCTQLVQGSTEGASYQGLGRKDDMIDFLRDIDERGLEPAIAKMEQTQTPRKAAQPKSPSKRKVSDDESYEEDGANYNTRYKGTKRVKLVQEDTSPASASKPRTPRKPGRPRKSNARDSKGGSPTKTRQTRRVTTKAGLASKQKRGRGRPRKSMPSGERAAASTSVKRGRGRPRKSLPETDEDDEDEDEDDEDEDETEEEEEPKPKRGRGRPRKSVPEKDDDDEDEDDEDEDETEEEEEPKPKRGRGRPRKSVPEKDEDDEDEDEDEAEEPKPKRGRGRPRKSVEGFAAAPPSKSGKPIFAGVLLKKRKVHHTEDTNPDGDVDGEEGQNKANEGGDEDGVEEDAVLAAVNGNAQADISSLGESNKENDPNDFVGNHDADADGDADADGDAEAAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.25
3 0.26
4 0.26
5 0.28
6 0.24
7 0.22
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.12
17 0.1
18 0.09
19 0.08
20 0.11
21 0.15
22 0.16
23 0.18
24 0.19
25 0.21
26 0.22
27 0.22
28 0.23
29 0.21
30 0.23
31 0.21
32 0.21
33 0.2
34 0.19
35 0.19
36 0.17
37 0.15
38 0.13
39 0.14
40 0.14
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.17
49 0.22
50 0.27
51 0.34
52 0.36
53 0.41
54 0.43
55 0.47
56 0.52
57 0.55
58 0.59
59 0.61
60 0.68
61 0.74
62 0.81
63 0.82
64 0.8
65 0.82
66 0.78
67 0.76
68 0.73
69 0.69
70 0.64
71 0.6
72 0.56
73 0.5
74 0.44
75 0.35
76 0.28
77 0.22
78 0.19
79 0.18
80 0.14
81 0.14
82 0.15
83 0.17
84 0.21
85 0.22
86 0.32
87 0.39
88 0.46
89 0.5
90 0.59
91 0.64
92 0.69
93 0.71
94 0.67
95 0.6
96 0.56
97 0.5
98 0.42
99 0.35
100 0.27
101 0.24
102 0.22
103 0.23
104 0.27
105 0.35
106 0.41
107 0.5
108 0.59
109 0.67
110 0.74
111 0.82
112 0.85
113 0.87
114 0.89
115 0.87
116 0.89
117 0.89
118 0.88
119 0.87
120 0.83
121 0.77
122 0.71
123 0.73
124 0.69
125 0.63
126 0.54
127 0.52
128 0.5
129 0.55
130 0.6
131 0.55
132 0.56
133 0.61
134 0.68
135 0.7
136 0.72
137 0.67
138 0.6
139 0.62
140 0.58
141 0.53
142 0.47
143 0.47
144 0.46
145 0.5
146 0.53
147 0.53
148 0.55
149 0.61
150 0.68
151 0.71
152 0.74
153 0.75
154 0.78
155 0.82
156 0.8
157 0.8
158 0.73
159 0.7
160 0.63
161 0.53
162 0.45
163 0.36
164 0.32
165 0.24
166 0.21
167 0.14
168 0.17
169 0.19
170 0.22
171 0.24
172 0.3
173 0.39
174 0.48
175 0.53
176 0.59
177 0.63
178 0.7
179 0.73
180 0.74
181 0.67
182 0.63
183 0.61
184 0.52
185 0.45
186 0.35
187 0.3
188 0.22
189 0.18
190 0.12
191 0.08
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.11
206 0.12
207 0.19
208 0.21
209 0.23
210 0.32
211 0.4
212 0.51
213 0.58
214 0.68
215 0.71
216 0.78
217 0.86
218 0.86
219 0.87
220 0.8
221 0.77
222 0.7
223 0.61
224 0.55
225 0.46
226 0.4
227 0.31
228 0.26
229 0.18
230 0.14
231 0.13
232 0.1
233 0.09
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.07
242 0.11
243 0.12
244 0.19
245 0.21
246 0.23
247 0.32
248 0.4
249 0.51
250 0.58
251 0.68
252 0.71
253 0.78
254 0.86
255 0.86
256 0.87
257 0.81
258 0.78
259 0.72
260 0.64
261 0.58
262 0.49
263 0.44
264 0.34
265 0.29
266 0.21
267 0.17
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.08
272 0.08
273 0.13
274 0.14
275 0.21
276 0.25
277 0.28
278 0.37
279 0.45
280 0.56
281 0.61
282 0.71
283 0.75
284 0.78
285 0.85
286 0.79
287 0.75
288 0.67
289 0.61
290 0.52
291 0.43
292 0.43
293 0.33
294 0.3
295 0.25
296 0.26
297 0.21
298 0.24
299 0.23
300 0.2
301 0.22
302 0.24
303 0.24
304 0.24
305 0.28
306 0.28
307 0.36
308 0.38
309 0.4
310 0.42
311 0.45
312 0.5
313 0.52
314 0.56
315 0.56
316 0.62
317 0.67
318 0.7
319 0.71
320 0.62
321 0.55
322 0.48
323 0.38
324 0.28
325 0.2
326 0.13
327 0.1
328 0.1
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.11
344 0.1
345 0.08
346 0.05
347 0.05
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.08
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.19
369 0.23
370 0.23
371 0.25
372 0.29
373 0.3
374 0.32
375 0.29
376 0.25
377 0.27
378 0.26
379 0.24
380 0.2
381 0.17
382 0.15
383 0.16
384 0.14
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.06
390 0.06
391 0.05