Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6Q1K6

Protein Details
Accession B6Q1K6    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-47VSDDEPARSRPKKDKSKKRQANGDVKAKKQDSHydrophilic
378-398ALANRKGKGKDKKFNKGANKGBasic
882-901MDELKCRKRVLRRLDFINKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-41RSRPKKDKSKKRQANGDVK
382-397RKGKGKDKKFNKGANK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006401  P:RNA catabolic process  
KEGG tmf:PMAA_027130  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18024  DEXHc_Mtr4-like  
cd13154  KOW_Mtr4  
cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MDDLFDVFEDKPGAYVSDDEPARSRPKKDKSKKRQANGDVKAKKQDSQPDEEVSPDAPAADTTANGADRQSEENAQPEAKRQRIQDEPAAVVADSFETEQEREVAASAGLQATQDTGAVVLSHQVRHQVAIPPNYPYIPISQHVPPEEPARVWPFTLDPFQQTAVHSIQREESVLVSAHTSAGKTVVAEYAIAQSLKKNQRVIYTSPIKALSNQKYREFAAEFGDVGLMTGDVTINPTATCLVMTTEILRSMLYRGSEIMREVAWVVFDEIHYMRDATRGVVWEETIILLPDKVRYVFLSATIPNAMQFAEWIVNLHHQPCHVVYTDFRPTPLQHYFFPAGAEGIHLVVDEKGVFREDNFQKAMSTIAENKGDDPANALANRKGKGKDKKFNKGANKGPSDIFKIVRMIMLRSYNPVIVFSFSKRECEANALQMSKMAFNDDSEKEMVSKVFNSAIEMLSEEDRQLKQIQNLLPLLRRGIGIHHGGLLPILKETIEILFQEGLLKVLFATETFSIGLNMPAKTVVFTSVRKFDGIDTRWVTPSEFIQMSGRAGRRGLDERGIVIMMVGEEMEPSVAKEIVRGEQDRLNSAFHLGYNMILNLIRVDGISPEFMLRKCFYQFQNTSSVAGLEKELAELETKRINMSIPDEPTIQDYYDLRKQLTRFTADMQEVITHPDYCLQFLQPGRLVHIMHQGNDLGWGAIVNYKQRRSKNPNEVLAPQESYIVDVLLQVAEGSSTGTRTHTDLPAGIRPPKEGEKSHMQVVPVLLKCLQSISHVRIFLPKEVQTVDSRASVKRSVDEIKKRFPDGLPLLDPIENMNITDDSFKKLMRKVEVLESRLLANPLHNSPRLPELYDQYSEKVELGVQIKDIKKKISDAMSVIQMDELKCRKRVLRRLDFINKEDVVQLKARVACEISTGDELMLSELLFNGFFNNLTPEQIAAVLSCFVFEEKVKDAPALTRDELSKPLKEIQSQARIIAKMSMESKLAVNEEEYVQSFHWELMDVIYEWAHGMSFAKICTMTDVYEGSLIRVFRRLEELMRQMAQAAKVMGNDELEQKFETSLTKVRRDIVAAQSLYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.15
3 0.14
4 0.21
5 0.21
6 0.22
7 0.24
8 0.28
9 0.36
10 0.39
11 0.45
12 0.48
13 0.58
14 0.68
15 0.77
16 0.83
17 0.85
18 0.91
19 0.94
20 0.94
21 0.94
22 0.93
23 0.93
24 0.91
25 0.9
26 0.86
27 0.81
28 0.81
29 0.72
30 0.67
31 0.63
32 0.63
33 0.58
34 0.59
35 0.59
36 0.54
37 0.53
38 0.49
39 0.44
40 0.34
41 0.29
42 0.2
43 0.15
44 0.11
45 0.1
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.14
55 0.16
56 0.19
57 0.2
58 0.21
59 0.22
60 0.26
61 0.28
62 0.29
63 0.27
64 0.33
65 0.39
66 0.42
67 0.45
68 0.44
69 0.49
70 0.54
71 0.59
72 0.58
73 0.53
74 0.48
75 0.44
76 0.42
77 0.34
78 0.26
79 0.2
80 0.13
81 0.1
82 0.08
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.09
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.07
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.24
115 0.28
116 0.32
117 0.38
118 0.39
119 0.37
120 0.39
121 0.38
122 0.35
123 0.28
124 0.25
125 0.22
126 0.21
127 0.22
128 0.24
129 0.28
130 0.29
131 0.31
132 0.29
133 0.31
134 0.32
135 0.28
136 0.29
137 0.3
138 0.29
139 0.26
140 0.26
141 0.23
142 0.24
143 0.28
144 0.25
145 0.23
146 0.24
147 0.26
148 0.26
149 0.25
150 0.26
151 0.24
152 0.27
153 0.24
154 0.24
155 0.24
156 0.23
157 0.23
158 0.19
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.22
183 0.29
184 0.33
185 0.36
186 0.37
187 0.44
188 0.49
189 0.51
190 0.51
191 0.51
192 0.48
193 0.47
194 0.46
195 0.39
196 0.4
197 0.45
198 0.45
199 0.46
200 0.49
201 0.5
202 0.51
203 0.52
204 0.51
205 0.43
206 0.35
207 0.3
208 0.26
209 0.22
210 0.19
211 0.18
212 0.13
213 0.11
214 0.1
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.03
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.12
264 0.1
265 0.12
266 0.12
267 0.13
268 0.13
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.12
292 0.12
293 0.1
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.11
302 0.13
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.16
309 0.14
310 0.14
311 0.14
312 0.2
313 0.27
314 0.25
315 0.25
316 0.25
317 0.25
318 0.3
319 0.35
320 0.32
321 0.25
322 0.31
323 0.32
324 0.3
325 0.29
326 0.23
327 0.17
328 0.14
329 0.13
330 0.08
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.17
344 0.18
345 0.23
346 0.23
347 0.23
348 0.22
349 0.22
350 0.23
351 0.14
352 0.15
353 0.14
354 0.16
355 0.18
356 0.18
357 0.18
358 0.2
359 0.2
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.18
367 0.22
368 0.23
369 0.25
370 0.27
371 0.34
372 0.43
373 0.52
374 0.57
375 0.63
376 0.72
377 0.76
378 0.81
379 0.81
380 0.79
381 0.77
382 0.77
383 0.71
384 0.62
385 0.55
386 0.49
387 0.44
388 0.38
389 0.31
390 0.24
391 0.21
392 0.19
393 0.2
394 0.18
395 0.14
396 0.15
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.18
401 0.17
402 0.16
403 0.16
404 0.13
405 0.12
406 0.14
407 0.13
408 0.18
409 0.17
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.18
414 0.23
415 0.22
416 0.22
417 0.25
418 0.23
419 0.22
420 0.23
421 0.22
422 0.18
423 0.16
424 0.12
425 0.09
426 0.09
427 0.14
428 0.13
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.13
433 0.14
434 0.13
435 0.1
436 0.09
437 0.08
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.1
450 0.09
451 0.11
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.21
456 0.22
457 0.23
458 0.24
459 0.24
460 0.23
461 0.22
462 0.2
463 0.15
464 0.14
465 0.11
466 0.11
467 0.13
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.07
476 0.05
477 0.05
478 0.04
479 0.04
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.03
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.11
514 0.13
515 0.17
516 0.18
517 0.17
518 0.17
519 0.17
520 0.22
521 0.22
522 0.26
523 0.24
524 0.25
525 0.25
526 0.26
527 0.24
528 0.17
529 0.16
530 0.14
531 0.12
532 0.11
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.15
537 0.15
538 0.12
539 0.12
540 0.13
541 0.14
542 0.17
543 0.18
544 0.16
545 0.15
546 0.15
547 0.15
548 0.14
549 0.11
550 0.08
551 0.06
552 0.04
553 0.04
554 0.03
555 0.02
556 0.02
557 0.02
558 0.03
559 0.02
560 0.02
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.06
565 0.07
566 0.09
567 0.12
568 0.13
569 0.14
570 0.16
571 0.17
572 0.18
573 0.18
574 0.17
575 0.14
576 0.14
577 0.13
578 0.1
579 0.11
580 0.08
581 0.08
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.05
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.05
594 0.05
595 0.05
596 0.06
597 0.08
598 0.08
599 0.11
600 0.11
601 0.13
602 0.14
603 0.19
604 0.2
605 0.28
606 0.29
607 0.28
608 0.34
609 0.33
610 0.32
611 0.27
612 0.26
613 0.17
614 0.16
615 0.13
616 0.07
617 0.07
618 0.06
619 0.06
620 0.05
621 0.06
622 0.07
623 0.08
624 0.1
625 0.1
626 0.11
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.15
631 0.17
632 0.17
633 0.18
634 0.19
635 0.19
636 0.21
637 0.2
638 0.16
639 0.13
640 0.12
641 0.15
642 0.19
643 0.2
644 0.19
645 0.21
646 0.22
647 0.26
648 0.29
649 0.28
650 0.25
651 0.26
652 0.3
653 0.27
654 0.27
655 0.21
656 0.18
657 0.15
658 0.17
659 0.15
660 0.11
661 0.1
662 0.15
663 0.14
664 0.15
665 0.15
666 0.13
667 0.15
668 0.16
669 0.19
670 0.19
671 0.19
672 0.2
673 0.22
674 0.22
675 0.2
676 0.28
677 0.25
678 0.22
679 0.23
680 0.2
681 0.18
682 0.18
683 0.16
684 0.07
685 0.06
686 0.05
687 0.05
688 0.07
689 0.08
690 0.13
691 0.17
692 0.23
693 0.29
694 0.34
695 0.44
696 0.51
697 0.6
698 0.66
699 0.7
700 0.7
701 0.68
702 0.65
703 0.59
704 0.52
705 0.43
706 0.32
707 0.25
708 0.19
709 0.16
710 0.13
711 0.1
712 0.07
713 0.06
714 0.06
715 0.05
716 0.04
717 0.03
718 0.03
719 0.03
720 0.03
721 0.04
722 0.04
723 0.05
724 0.05
725 0.07
726 0.08
727 0.1
728 0.14
729 0.14
730 0.15
731 0.16
732 0.19
733 0.23
734 0.25
735 0.27
736 0.25
737 0.25
738 0.28
739 0.31
740 0.33
741 0.3
742 0.32
743 0.38
744 0.4
745 0.43
746 0.41
747 0.36
748 0.33
749 0.32
750 0.33
751 0.24
752 0.23
753 0.2
754 0.18
755 0.18
756 0.17
757 0.15
758 0.13
759 0.17
760 0.2
761 0.23
762 0.24
763 0.24
764 0.29
765 0.31
766 0.31
767 0.31
768 0.27
769 0.25
770 0.25
771 0.28
772 0.23
773 0.24
774 0.22
775 0.21
776 0.22
777 0.22
778 0.24
779 0.25
780 0.24
781 0.24
782 0.27
783 0.3
784 0.37
785 0.46
786 0.48
787 0.54
788 0.57
789 0.55
790 0.54
791 0.47
792 0.47
793 0.41
794 0.41
795 0.34
796 0.32
797 0.32
798 0.3
799 0.29
800 0.21
801 0.19
802 0.13
803 0.11
804 0.11
805 0.1
806 0.1
807 0.13
808 0.13
809 0.15
810 0.16
811 0.17
812 0.2
813 0.25
814 0.3
815 0.32
816 0.34
817 0.33
818 0.42
819 0.47
820 0.45
821 0.42
822 0.37
823 0.34
824 0.32
825 0.3
826 0.2
827 0.16
828 0.18
829 0.2
830 0.24
831 0.24
832 0.23
833 0.24
834 0.3
835 0.29
836 0.28
837 0.26
838 0.27
839 0.3
840 0.32
841 0.32
842 0.27
843 0.27
844 0.25
845 0.22
846 0.17
847 0.13
848 0.15
849 0.16
850 0.15
851 0.15
852 0.21
853 0.25
854 0.31
855 0.32
856 0.31
857 0.31
858 0.33
859 0.38
860 0.36
861 0.36
862 0.33
863 0.34
864 0.35
865 0.33
866 0.3
867 0.26
868 0.22
869 0.19
870 0.23
871 0.26
872 0.25
873 0.27
874 0.31
875 0.37
876 0.45
877 0.54
878 0.59
879 0.64
880 0.67
881 0.74
882 0.8
883 0.79
884 0.72
885 0.69
886 0.58
887 0.48
888 0.44
889 0.36
890 0.29
891 0.25
892 0.24
893 0.22
894 0.24
895 0.24
896 0.22
897 0.22
898 0.19
899 0.19
900 0.19
901 0.17
902 0.15
903 0.15
904 0.13
905 0.12
906 0.12
907 0.11
908 0.1
909 0.07
910 0.06
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.06
915 0.06
916 0.06
917 0.06
918 0.07
919 0.12
920 0.12
921 0.14
922 0.14
923 0.13
924 0.14
925 0.14
926 0.13
927 0.09
928 0.09
929 0.08
930 0.08
931 0.07
932 0.07
933 0.07
934 0.09
935 0.09
936 0.12
937 0.14
938 0.17
939 0.18
940 0.18
941 0.19
942 0.22
943 0.25
944 0.27
945 0.26
946 0.26
947 0.27
948 0.29
949 0.35
950 0.35
951 0.34
952 0.31
953 0.37
954 0.38
955 0.39
956 0.43
957 0.45
958 0.5
959 0.49
960 0.49
961 0.47
962 0.44
963 0.42
964 0.39
965 0.31
966 0.26
967 0.26
968 0.25
969 0.2
970 0.21
971 0.21
972 0.19
973 0.2
974 0.16
975 0.15
976 0.15
977 0.16
978 0.17
979 0.17
980 0.16
981 0.15
982 0.16
983 0.15
984 0.14
985 0.13
986 0.12
987 0.11
988 0.1
989 0.12
990 0.11
991 0.11
992 0.11
993 0.1
994 0.1
995 0.1
996 0.08
997 0.06
998 0.07
999 0.09
1000 0.11
1001 0.11
1002 0.13
1003 0.13
1004 0.13
1005 0.18
1006 0.18
1007 0.16
1008 0.17
1009 0.17
1010 0.16
1011 0.19
1012 0.19
1013 0.16
1014 0.18
1015 0.17
1016 0.17
1017 0.22
1018 0.22
1019 0.2
1020 0.26
1021 0.27
1022 0.28
1023 0.36
1024 0.4
1025 0.39
1026 0.4
1027 0.38
1028 0.34
1029 0.35
1030 0.32
1031 0.27
1032 0.23
1033 0.19
1034 0.19
1035 0.2
1036 0.19
1037 0.17
1038 0.18
1039 0.21
1040 0.2
1041 0.2
1042 0.21
1043 0.2
1044 0.19
1045 0.18
1046 0.19
1047 0.17
1048 0.25
1049 0.3
1050 0.36
1051 0.38
1052 0.41
1053 0.43
1054 0.45
1055 0.47
1056 0.47
1057 0.48