Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QG62

Protein Details
Accession B6QG62    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
332-352GGTPIRKKKRKGAMTNPSAYSHydrophilic
439-467LSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEALGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-342RKKKRK
446-461SKQAKRKGAKGKRGKN
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG tmf:PMAA_084500  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPPRRWIDKKNATTYQLFHRSQQDPLIHDPTADDRVLHPVYGPKQGAPALSTTASSASHKTSRNLKELEDEFSTDNIRKNEGEAANYGVYYDDSKYDYMQHLRELGTAGGNSYFVEAAPDKSKGKGKTMKLEDALRDFSIDDSQSAIGGGTSVYGSQYAPSTASSYIRKPTYQDQQSVPDAIAGFQPNMDPRLREALEALEDEAYVDDEDDQDIFGELTRNAEEVDPGDFEDTLYEDEDDGWESDATEKAYPQTSETKNIVDNEATATQEHDPSEMPDHDKPVPDLAPENSDWMREFAKFKKEGKPSNNTPAANPDAGTEKHTVASTMFTVGGTPIRKKKRKGAMTNPSAYSMTSSALARTEGLRLLDDRFEKVEALYALDEEGEYDDASFADGASMISGMTGATGMTGISTASSMVSRGDYGDVPLRSDFDNVMDDFLSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEALGIAMLDEVRSGLGPARLPAHGKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.65
4 0.57
5 0.52
6 0.54
7 0.51
8 0.5
9 0.54
10 0.48
11 0.42
12 0.47
13 0.48
14 0.39
15 0.37
16 0.35
17 0.32
18 0.31
19 0.27
20 0.21
21 0.17
22 0.25
23 0.25
24 0.23
25 0.21
26 0.24
27 0.27
28 0.34
29 0.34
30 0.28
31 0.3
32 0.32
33 0.32
34 0.26
35 0.24
36 0.19
37 0.19
38 0.18
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.19
45 0.25
46 0.28
47 0.33
48 0.41
49 0.46
50 0.52
51 0.52
52 0.48
53 0.51
54 0.49
55 0.48
56 0.41
57 0.36
58 0.3
59 0.29
60 0.3
61 0.24
62 0.28
63 0.24
64 0.25
65 0.23
66 0.23
67 0.3
68 0.29
69 0.29
70 0.24
71 0.27
72 0.25
73 0.24
74 0.22
75 0.14
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.16
84 0.2
85 0.23
86 0.24
87 0.24
88 0.25
89 0.25
90 0.25
91 0.23
92 0.19
93 0.16
94 0.14
95 0.13
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.06
102 0.09
103 0.09
104 0.12
105 0.14
106 0.18
107 0.18
108 0.22
109 0.29
110 0.28
111 0.36
112 0.42
113 0.45
114 0.52
115 0.57
116 0.59
117 0.56
118 0.58
119 0.52
120 0.48
121 0.45
122 0.35
123 0.29
124 0.23
125 0.2
126 0.18
127 0.15
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.15
152 0.18
153 0.23
154 0.24
155 0.24
156 0.26
157 0.32
158 0.38
159 0.41
160 0.43
161 0.4
162 0.43
163 0.43
164 0.41
165 0.34
166 0.25
167 0.2
168 0.16
169 0.15
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.12
177 0.1
178 0.11
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.16
185 0.16
186 0.15
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.18
241 0.19
242 0.23
243 0.24
244 0.24
245 0.25
246 0.25
247 0.25
248 0.17
249 0.15
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.16
264 0.15
265 0.19
266 0.19
267 0.2
268 0.19
269 0.19
270 0.18
271 0.15
272 0.16
273 0.14
274 0.15
275 0.14
276 0.17
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.15
282 0.14
283 0.17
284 0.18
285 0.26
286 0.3
287 0.33
288 0.4
289 0.47
290 0.53
291 0.57
292 0.61
293 0.59
294 0.64
295 0.67
296 0.58
297 0.51
298 0.48
299 0.45
300 0.36
301 0.3
302 0.22
303 0.19
304 0.19
305 0.21
306 0.18
307 0.15
308 0.16
309 0.16
310 0.16
311 0.12
312 0.13
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.12
320 0.12
321 0.17
322 0.24
323 0.35
324 0.42
325 0.47
326 0.56
327 0.63
328 0.71
329 0.76
330 0.79
331 0.79
332 0.81
333 0.81
334 0.73
335 0.65
336 0.55
337 0.44
338 0.35
339 0.25
340 0.17
341 0.13
342 0.12
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.14
354 0.18
355 0.18
356 0.18
357 0.18
358 0.18
359 0.17
360 0.16
361 0.18
362 0.14
363 0.15
364 0.13
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.05
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.11
408 0.1
409 0.13
410 0.19
411 0.19
412 0.2
413 0.21
414 0.21
415 0.2
416 0.21
417 0.19
418 0.14
419 0.18
420 0.16
421 0.17
422 0.15
423 0.14
424 0.13
425 0.14
426 0.15
427 0.11
428 0.12
429 0.14
430 0.17
431 0.23
432 0.32
433 0.41
434 0.48
435 0.57
436 0.66
437 0.7
438 0.78
439 0.83
440 0.84
441 0.85
442 0.87
443 0.87
444 0.87
445 0.9
446 0.85
447 0.83
448 0.8
449 0.74
450 0.65
451 0.56
452 0.47
453 0.37
454 0.31
455 0.22
456 0.14
457 0.1
458 0.07
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.06
464 0.09
465 0.12
466 0.13
467 0.16
468 0.19
469 0.21