Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6Q6U6

Protein Details
Accession B6Q6U6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-277YQRIENLRRNRRVNRPHYPHTNDQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001827  Homeobox_Antennapedia_CS  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG tmf:PMAA_015520  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00032  ANTENNAPEDIA  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MNPDQPEPSQGEGPTPEEMLHQVLHQMTAMRTDMADMRGRINHLEQTPAPSAQNPEPPVVPNVPPQAPNPPVLQPRHATNHPEKYDDEDRSKFMPFILELESKLIVDGPAIGDAYAQLVYAYGRFTGKARTKVYPWMRIHGSAQVMGTVTFVTLTEFFRHIRILFEDQQLVERANSELSRLRQGATPFQEFITEFERLLLLARGQAWPDDIQISRLKPALNQEIRKACIGKSMPILYEAYCEELHRVANDLEEYQRIENLRRNRRVNRPHYPHTNDQPAAATAPPLYPNAMDISNANPARPPLTCYNCQQLGHIARLCNNAYVPRYAAGPQTRRPVAPSNRRTPVTNNVNPITLPAPANIPTSATMPRDEELDLENE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.25
3 0.21
4 0.18
5 0.19
6 0.18
7 0.16
8 0.13
9 0.15
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.14
15 0.17
16 0.18
17 0.14
18 0.14
19 0.15
20 0.17
21 0.18
22 0.23
23 0.2
24 0.23
25 0.25
26 0.27
27 0.28
28 0.28
29 0.31
30 0.27
31 0.31
32 0.29
33 0.32
34 0.34
35 0.33
36 0.31
37 0.27
38 0.31
39 0.3
40 0.37
41 0.32
42 0.31
43 0.31
44 0.32
45 0.33
46 0.32
47 0.29
48 0.28
49 0.32
50 0.32
51 0.33
52 0.33
53 0.37
54 0.35
55 0.36
56 0.33
57 0.33
58 0.38
59 0.39
60 0.42
61 0.37
62 0.4
63 0.45
64 0.46
65 0.47
66 0.48
67 0.55
68 0.53
69 0.53
70 0.48
71 0.48
72 0.52
73 0.5
74 0.47
75 0.39
76 0.4
77 0.39
78 0.4
79 0.32
80 0.25
81 0.22
82 0.16
83 0.16
84 0.18
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.13
92 0.08
93 0.06
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.16
114 0.23
115 0.3
116 0.33
117 0.35
118 0.37
119 0.46
120 0.52
121 0.53
122 0.48
123 0.46
124 0.45
125 0.43
126 0.42
127 0.37
128 0.32
129 0.23
130 0.21
131 0.16
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.07
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.06
141 0.07
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.14
150 0.18
151 0.2
152 0.21
153 0.22
154 0.2
155 0.22
156 0.21
157 0.18
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.16
167 0.16
168 0.17
169 0.18
170 0.2
171 0.24
172 0.24
173 0.24
174 0.21
175 0.21
176 0.21
177 0.18
178 0.19
179 0.16
180 0.13
181 0.11
182 0.1
183 0.1
184 0.09
185 0.1
186 0.08
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.11
199 0.14
200 0.14
201 0.14
202 0.16
203 0.15
204 0.15
205 0.2
206 0.27
207 0.31
208 0.32
209 0.37
210 0.39
211 0.41
212 0.41
213 0.37
214 0.27
215 0.28
216 0.27
217 0.24
218 0.23
219 0.23
220 0.22
221 0.22
222 0.23
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.12
234 0.09
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.16
245 0.21
246 0.3
247 0.39
248 0.46
249 0.54
250 0.6
251 0.7
252 0.77
253 0.8
254 0.81
255 0.8
256 0.79
257 0.81
258 0.8
259 0.78
260 0.75
261 0.74
262 0.63
263 0.56
264 0.49
265 0.4
266 0.34
267 0.26
268 0.19
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.1
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.12
281 0.2
282 0.2
283 0.19
284 0.18
285 0.19
286 0.21
287 0.21
288 0.23
289 0.24
290 0.3
291 0.35
292 0.37
293 0.45
294 0.47
295 0.47
296 0.43
297 0.43
298 0.4
299 0.42
300 0.41
301 0.34
302 0.33
303 0.38
304 0.37
305 0.31
306 0.29
307 0.27
308 0.26
309 0.27
310 0.24
311 0.2
312 0.21
313 0.21
314 0.27
315 0.31
316 0.34
317 0.38
318 0.46
319 0.48
320 0.47
321 0.5
322 0.53
323 0.55
324 0.6
325 0.64
326 0.64
327 0.69
328 0.71
329 0.69
330 0.65
331 0.65
332 0.64
333 0.61
334 0.59
335 0.53
336 0.51
337 0.48
338 0.45
339 0.36
340 0.28
341 0.23
342 0.17
343 0.18
344 0.19
345 0.22
346 0.19
347 0.19
348 0.18
349 0.19
350 0.23
351 0.22
352 0.23
353 0.23
354 0.23
355 0.23
356 0.22
357 0.21