Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6Q5S5

Protein Details
Accession B6Q5S5    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249YIKPQEEKGKRERQRKEKNILEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-68KPAQRHGKRDAPKEAPAAPPAAPRGGARGGRGREG
95-114GGRRGYRGRDDRGGRARTDR
232-243EKGKRERQRKEK
256-288PRGRGNGPRGSSGRGRGGRGGRGDGPRREGGRG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG tmf:PMAA_023610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MADVRSKNLYELLGNDPELDSDREPEPPTKAIDKPAQRHGKRDAPKEAPAAPPAAPRGGARGGRGREGGNDGAFRDRNAGSYNNRNRPVDEVKEGGRRGYRGRDDRGGRARTDRHPPRNAHTDSEKQIEQGWGAKKGDAEWNDEKAGEAIAKAEEAEAQAPVEGGEAAAAEEADKAKSYADYLAELAAKNRGELGVKEARAPNEGSKDKKWQNAKELKRDGQEENYIKPQEEKGKRERQRKEKNILEVDMRFVEQPRGRGNGPRGSSGRGRGGRGGRGDGPRREGGRGGAAAGPTVQVDEKNFPSLGGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.23
3 0.21
4 0.2
5 0.22
6 0.21
7 0.17
8 0.17
9 0.18
10 0.21
11 0.24
12 0.26
13 0.27
14 0.27
15 0.31
16 0.33
17 0.34
18 0.38
19 0.44
20 0.49
21 0.51
22 0.59
23 0.65
24 0.62
25 0.66
26 0.66
27 0.67
28 0.67
29 0.69
30 0.68
31 0.63
32 0.66
33 0.64
34 0.6
35 0.54
36 0.47
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.27
41 0.24
42 0.21
43 0.18
44 0.21
45 0.24
46 0.25
47 0.25
48 0.3
49 0.31
50 0.33
51 0.35
52 0.31
53 0.27
54 0.3
55 0.28
56 0.22
57 0.21
58 0.19
59 0.23
60 0.23
61 0.21
62 0.2
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.23
67 0.23
68 0.33
69 0.43
70 0.48
71 0.52
72 0.52
73 0.5
74 0.52
75 0.53
76 0.47
77 0.41
78 0.35
79 0.34
80 0.4
81 0.39
82 0.35
83 0.31
84 0.28
85 0.28
86 0.34
87 0.38
88 0.38
89 0.43
90 0.48
91 0.49
92 0.55
93 0.61
94 0.55
95 0.48
96 0.48
97 0.48
98 0.45
99 0.53
100 0.54
101 0.54
102 0.59
103 0.61
104 0.61
105 0.65
106 0.62
107 0.56
108 0.51
109 0.49
110 0.44
111 0.45
112 0.39
113 0.3
114 0.29
115 0.25
116 0.2
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.19
121 0.2
122 0.18
123 0.19
124 0.24
125 0.2
126 0.24
127 0.22
128 0.24
129 0.23
130 0.23
131 0.22
132 0.16
133 0.15
134 0.09
135 0.06
136 0.05
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.02
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.15
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.23
186 0.24
187 0.25
188 0.26
189 0.23
190 0.26
191 0.3
192 0.31
193 0.32
194 0.41
195 0.44
196 0.49
197 0.55
198 0.52
199 0.58
200 0.64
201 0.68
202 0.69
203 0.72
204 0.7
205 0.66
206 0.64
207 0.56
208 0.51
209 0.52
210 0.44
211 0.4
212 0.42
213 0.39
214 0.35
215 0.34
216 0.34
217 0.36
218 0.41
219 0.44
220 0.47
221 0.57
222 0.65
223 0.73
224 0.79
225 0.8
226 0.83
227 0.86
228 0.87
229 0.83
230 0.84
231 0.8
232 0.72
233 0.67
234 0.56
235 0.5
236 0.41
237 0.34
238 0.26
239 0.21
240 0.26
241 0.23
242 0.26
243 0.27
244 0.3
245 0.31
246 0.37
247 0.42
248 0.43
249 0.42
250 0.45
251 0.43
252 0.44
253 0.47
254 0.45
255 0.48
256 0.44
257 0.44
258 0.44
259 0.47
260 0.48
261 0.47
262 0.46
263 0.43
264 0.48
265 0.53
266 0.51
267 0.52
268 0.53
269 0.52
270 0.49
271 0.45
272 0.39
273 0.37
274 0.33
275 0.29
276 0.25
277 0.23
278 0.2
279 0.19
280 0.16
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.13
286 0.18
287 0.21
288 0.24
289 0.24