Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QR74

Protein Details
Accession B6QR74    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
370-391AAPERARHTRGKKRHYDDNSFVHydrophilic
406-434LYSNSEDRSGKKKRKKEHISKMSPMPERTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-423SGKKKRKKEH
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.166, mito_nucl 12.166, cyto_mito 4.666, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG tmf:PMAA_043260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDSLPLAGNLFPSSFSVSNLKANRSPGISENLYPHTPTSPPLMSVGAQNYASNFAHTHTSPSHTTTSNGQPLSSPPSSTPMSTQNSQQPTVSVTTSFPTPASSVSGHPRNTTPADDSELADKSWGQGVQNSHATGNTDLGNVDKSGYRRTDHDRHRLPEGFDTEGRPQAADVDMMDIDSKEDNSSIRDSSLDALQQDIGMAFHLCKSVPTITGPDPSFDLISLYGLGPIGRSVMRADPTTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLSGRNKAVKNENQAGGLRHLMMWPEEEWQIQKVHGKEIKVAEAESALQKLQMRAMKLEAGPLPNSEYWEDILGHEKSSKHTNVESGKRAVSTPNTLRPTVQTNGVPPTAAAPERARHTRGKKRHYDDNSFVGYGEGFVDDDDEGALYSNSEDRSGKKKRKKEHISKMSPMPERTGSYGIGMYGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.18
4 0.22
5 0.23
6 0.31
7 0.35
8 0.39
9 0.37
10 0.4
11 0.42
12 0.39
13 0.4
14 0.35
15 0.39
16 0.36
17 0.34
18 0.36
19 0.37
20 0.36
21 0.34
22 0.31
23 0.27
24 0.25
25 0.24
26 0.26
27 0.22
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.21
32 0.24
33 0.25
34 0.22
35 0.21
36 0.2
37 0.19
38 0.22
39 0.21
40 0.19
41 0.17
42 0.15
43 0.19
44 0.19
45 0.23
46 0.2
47 0.25
48 0.25
49 0.29
50 0.31
51 0.27
52 0.29
53 0.3
54 0.36
55 0.39
56 0.37
57 0.33
58 0.31
59 0.32
60 0.38
61 0.33
62 0.26
63 0.2
64 0.25
65 0.26
66 0.26
67 0.26
68 0.26
69 0.31
70 0.31
71 0.35
72 0.38
73 0.41
74 0.42
75 0.39
76 0.31
77 0.29
78 0.29
79 0.25
80 0.18
81 0.15
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.11
89 0.14
90 0.14
91 0.16
92 0.23
93 0.3
94 0.3
95 0.31
96 0.32
97 0.33
98 0.34
99 0.34
100 0.28
101 0.24
102 0.28
103 0.27
104 0.26
105 0.25
106 0.23
107 0.21
108 0.18
109 0.16
110 0.12
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.14
115 0.16
116 0.21
117 0.24
118 0.24
119 0.21
120 0.2
121 0.22
122 0.18
123 0.18
124 0.14
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.15
134 0.18
135 0.18
136 0.22
137 0.3
138 0.39
139 0.45
140 0.54
141 0.57
142 0.57
143 0.63
144 0.63
145 0.56
146 0.52
147 0.46
148 0.39
149 0.33
150 0.33
151 0.28
152 0.27
153 0.25
154 0.19
155 0.16
156 0.14
157 0.14
158 0.1
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.08
172 0.1
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.08
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.19
201 0.19
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.04
219 0.05
220 0.06
221 0.08
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.12
226 0.14
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.18
231 0.25
232 0.33
233 0.35
234 0.35
235 0.34
236 0.39
237 0.45
238 0.5
239 0.52
240 0.48
241 0.45
242 0.45
243 0.44
244 0.39
245 0.33
246 0.27
247 0.22
248 0.22
249 0.23
250 0.25
251 0.27
252 0.27
253 0.28
254 0.34
255 0.35
256 0.37
257 0.41
258 0.38
259 0.37
260 0.38
261 0.37
262 0.3
263 0.26
264 0.19
265 0.14
266 0.13
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.17
279 0.16
280 0.23
281 0.25
282 0.25
283 0.28
284 0.29
285 0.31
286 0.28
287 0.27
288 0.19
289 0.17
290 0.17
291 0.13
292 0.12
293 0.09
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.2
304 0.23
305 0.2
306 0.2
307 0.2
308 0.19
309 0.21
310 0.18
311 0.2
312 0.17
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.15
317 0.12
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.19
324 0.26
325 0.28
326 0.25
327 0.26
328 0.32
329 0.38
330 0.44
331 0.47
332 0.43
333 0.42
334 0.39
335 0.39
336 0.36
337 0.32
338 0.33
339 0.33
340 0.39
341 0.42
342 0.41
343 0.42
344 0.4
345 0.42
346 0.36
347 0.35
348 0.28
349 0.27
350 0.31
351 0.3
352 0.28
353 0.22
354 0.22
355 0.21
356 0.19
357 0.19
358 0.18
359 0.22
360 0.29
361 0.33
362 0.35
363 0.4
364 0.5
365 0.57
366 0.64
367 0.71
368 0.75
369 0.77
370 0.84
371 0.83
372 0.83
373 0.78
374 0.75
375 0.68
376 0.58
377 0.51
378 0.41
379 0.32
380 0.23
381 0.17
382 0.11
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.05
394 0.06
395 0.09
396 0.1
397 0.12
398 0.14
399 0.18
400 0.27
401 0.38
402 0.48
403 0.55
404 0.63
405 0.71
406 0.81
407 0.88
408 0.9
409 0.91
410 0.92
411 0.91
412 0.9
413 0.89
414 0.87
415 0.82
416 0.73
417 0.67
418 0.6
419 0.54
420 0.5
421 0.44
422 0.35
423 0.31
424 0.29
425 0.24
426 0.19
427 0.16