Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B6QBM2

Protein Details
Accession B6QBM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-411SPLHCARPPSPKRRKRTVAEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
402-406PKRRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, nucl 10.5, cyto_mito 8.333, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
KEGG tmf:PMAA_075320  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAISKPAASQTPKMKRPPPSFTQTGMVNGIKQSPSASSSPALASKRLPGANQPSAANGIATPTTNGALNRPVNRPRKDIQKPADISASRPQRAMTRNSVAEADRRVTKIPPEPFVKTTSYILKKYSKSPPSLILHLHPTHFRFDQQDGSFPYNSEMKVIIEHIRSQTVPHDMLEELLRAGVKFYEGCLIVKVVDHKSVSAQTNKTTVTSTDEKNTPFSIHNYNQHVTPSPYVPYPKQNQIKSEANDLSKPDSPEKKPDAESTDSTKPAEASTVGKANESEKQPEHKPKVFTTVLHPTPLSLLAELTYLSTTPHPHANVISAANKKLPPSAQPQTKTTSGQPPAKRQKMLVDPEDLPKFEATLISAVAPPVYLDPVDSFESAQELLKLMESPLHCARPPSPKRRKRTVAELAADEALAAEEERFMLIMDERLEPATSGAAAGAKIAVDDTAGAVPFEPRFSRFKTIENIRMQHEEKAKREHEKKLQQEQAKRQQQQEAERERRRLLEQRQAEEHAKEERRQQLAAQQAQAQLAAQQQQRLANGLGQVSQGQMSSPVVRNQTPHATSSPVVGSGIGTQGGVSMSMTASAQGAGSPPRPPSTMQHAHPGVMGHPMAPSRSQQSQSRNGTPQMTQGTPAMSHATPVMRNVTPTQRMAHASPPNTSITQTPVMGNTMINTPQMGGIGIQFTQQQQQQHMILQQQRQQAMIAAQQQGITPQQFAQLQAQQNIQNHQHQQQLLNQQVQQNQIPQQHQQMQMQSHQAYQAQLIRNQMAQMQMAQHKQNQQQQGAMQMTPQQQQQQQQHQQQQQQQQQQQQQQMLIAAAQANANQGQVPQNPQQARYQQMFKQRLQLMRADMQKRLQSQYGTPQQYPPPVAQQYYAGLENNARAWVQDLMRRENMQQQQRQAALLQQQHQQQMMANGMGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.67
3 0.7
4 0.73
5 0.77
6 0.78
7 0.76
8 0.74
9 0.71
10 0.66
11 0.63
12 0.55
13 0.5
14 0.47
15 0.39
16 0.33
17 0.3
18 0.31
19 0.26
20 0.24
21 0.22
22 0.18
23 0.21
24 0.21
25 0.22
26 0.19
27 0.2
28 0.23
29 0.28
30 0.28
31 0.26
32 0.26
33 0.29
34 0.35
35 0.35
36 0.34
37 0.36
38 0.43
39 0.47
40 0.49
41 0.44
42 0.38
43 0.39
44 0.38
45 0.29
46 0.2
47 0.16
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.15
55 0.15
56 0.22
57 0.28
58 0.32
59 0.38
60 0.47
61 0.54
62 0.59
63 0.63
64 0.62
65 0.67
66 0.7
67 0.73
68 0.71
69 0.72
70 0.7
71 0.67
72 0.7
73 0.59
74 0.54
75 0.53
76 0.54
77 0.45
78 0.43
79 0.41
80 0.4
81 0.45
82 0.47
83 0.46
84 0.45
85 0.45
86 0.46
87 0.47
88 0.41
89 0.4
90 0.37
91 0.33
92 0.3
93 0.3
94 0.3
95 0.3
96 0.34
97 0.38
98 0.4
99 0.43
100 0.44
101 0.48
102 0.48
103 0.49
104 0.46
105 0.4
106 0.39
107 0.41
108 0.42
109 0.4
110 0.43
111 0.47
112 0.47
113 0.52
114 0.58
115 0.56
116 0.55
117 0.56
118 0.59
119 0.57
120 0.58
121 0.53
122 0.47
123 0.47
124 0.44
125 0.43
126 0.39
127 0.36
128 0.36
129 0.34
130 0.33
131 0.29
132 0.3
133 0.36
134 0.33
135 0.37
136 0.36
137 0.4
138 0.37
139 0.33
140 0.33
141 0.28
142 0.27
143 0.22
144 0.19
145 0.15
146 0.15
147 0.18
148 0.2
149 0.18
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.23
155 0.24
156 0.24
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.08
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.07
172 0.08
173 0.11
174 0.12
175 0.13
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.14
180 0.18
181 0.16
182 0.19
183 0.19
184 0.18
185 0.21
186 0.26
187 0.28
188 0.31
189 0.31
190 0.29
191 0.33
192 0.33
193 0.31
194 0.27
195 0.23
196 0.23
197 0.26
198 0.26
199 0.28
200 0.31
201 0.31
202 0.33
203 0.33
204 0.29
205 0.26
206 0.28
207 0.3
208 0.32
209 0.38
210 0.41
211 0.41
212 0.4
213 0.39
214 0.38
215 0.33
216 0.3
217 0.24
218 0.2
219 0.23
220 0.26
221 0.27
222 0.33
223 0.36
224 0.43
225 0.49
226 0.51
227 0.51
228 0.54
229 0.59
230 0.53
231 0.55
232 0.49
233 0.43
234 0.42
235 0.4
236 0.38
237 0.33
238 0.34
239 0.33
240 0.37
241 0.38
242 0.44
243 0.47
244 0.48
245 0.46
246 0.48
247 0.47
248 0.43
249 0.43
250 0.41
251 0.41
252 0.38
253 0.36
254 0.32
255 0.26
256 0.22
257 0.2
258 0.15
259 0.12
260 0.14
261 0.18
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.19
266 0.23
267 0.23
268 0.25
269 0.24
270 0.29
271 0.36
272 0.45
273 0.51
274 0.51
275 0.52
276 0.49
277 0.54
278 0.5
279 0.44
280 0.41
281 0.43
282 0.38
283 0.36
284 0.34
285 0.27
286 0.26
287 0.26
288 0.2
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.06
296 0.05
297 0.06
298 0.07
299 0.09
300 0.1
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.18
308 0.22
309 0.2
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.21
314 0.22
315 0.21
316 0.19
317 0.25
318 0.33
319 0.38
320 0.4
321 0.42
322 0.43
323 0.45
324 0.43
325 0.39
326 0.39
327 0.38
328 0.43
329 0.45
330 0.52
331 0.6
332 0.63
333 0.6
334 0.53
335 0.53
336 0.54
337 0.55
338 0.47
339 0.41
340 0.37
341 0.41
342 0.41
343 0.34
344 0.27
345 0.21
346 0.18
347 0.14
348 0.12
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.04
361 0.04
362 0.05
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.09
378 0.09
379 0.13
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.19
384 0.22
385 0.3
386 0.38
387 0.44
388 0.53
389 0.59
390 0.67
391 0.76
392 0.81
393 0.75
394 0.77
395 0.75
396 0.72
397 0.66
398 0.59
399 0.5
400 0.41
401 0.36
402 0.25
403 0.16
404 0.08
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.05
416 0.07
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.02
436 0.02
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.06
445 0.06
446 0.08
447 0.11
448 0.14
449 0.2
450 0.21
451 0.24
452 0.3
453 0.35
454 0.41
455 0.42
456 0.42
457 0.38
458 0.41
459 0.39
460 0.37
461 0.39
462 0.36
463 0.35
464 0.4
465 0.41
466 0.45
467 0.49
468 0.52
469 0.54
470 0.58
471 0.63
472 0.65
473 0.69
474 0.66
475 0.68
476 0.7
477 0.71
478 0.71
479 0.67
480 0.6
481 0.58
482 0.56
483 0.56
484 0.56
485 0.55
486 0.56
487 0.57
488 0.57
489 0.53
490 0.51
491 0.47
492 0.47
493 0.43
494 0.42
495 0.43
496 0.43
497 0.44
498 0.46
499 0.44
500 0.36
501 0.32
502 0.31
503 0.29
504 0.27
505 0.31
506 0.34
507 0.34
508 0.33
509 0.32
510 0.3
511 0.35
512 0.35
513 0.3
514 0.26
515 0.25
516 0.25
517 0.24
518 0.19
519 0.12
520 0.11
521 0.15
522 0.14
523 0.14
524 0.16
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.17
529 0.13
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.08
536 0.08
537 0.07
538 0.05
539 0.06
540 0.06
541 0.09
542 0.11
543 0.14
544 0.16
545 0.17
546 0.18
547 0.21
548 0.26
549 0.25
550 0.25
551 0.23
552 0.23
553 0.22
554 0.23
555 0.2
556 0.14
557 0.12
558 0.1
559 0.09
560 0.07
561 0.08
562 0.06
563 0.05
564 0.04
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.04
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.05
579 0.07
580 0.08
581 0.1
582 0.12
583 0.13
584 0.15
585 0.16
586 0.2
587 0.28
588 0.33
589 0.33
590 0.4
591 0.39
592 0.38
593 0.38
594 0.34
595 0.24
596 0.2
597 0.19
598 0.1
599 0.11
600 0.11
601 0.11
602 0.11
603 0.12
604 0.14
605 0.18
606 0.22
607 0.27
608 0.33
609 0.42
610 0.47
611 0.51
612 0.51
613 0.49
614 0.48
615 0.42
616 0.41
617 0.35
618 0.3
619 0.25
620 0.22
621 0.2
622 0.18
623 0.18
624 0.16
625 0.12
626 0.12
627 0.12
628 0.13
629 0.13
630 0.14
631 0.18
632 0.14
633 0.16
634 0.19
635 0.25
636 0.26
637 0.28
638 0.28
639 0.27
640 0.29
641 0.29
642 0.34
643 0.33
644 0.32
645 0.32
646 0.32
647 0.32
648 0.29
649 0.28
650 0.21
651 0.19
652 0.2
653 0.19
654 0.17
655 0.16
656 0.16
657 0.16
658 0.15
659 0.12
660 0.11
661 0.11
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.08
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.08
674 0.09
675 0.13
676 0.15
677 0.17
678 0.18
679 0.23
680 0.23
681 0.24
682 0.27
683 0.29
684 0.32
685 0.35
686 0.38
687 0.39
688 0.38
689 0.36
690 0.34
691 0.29
692 0.25
693 0.24
694 0.23
695 0.2
696 0.2
697 0.2
698 0.2
699 0.19
700 0.2
701 0.17
702 0.13
703 0.12
704 0.15
705 0.16
706 0.17
707 0.21
708 0.24
709 0.27
710 0.29
711 0.32
712 0.32
713 0.34
714 0.37
715 0.37
716 0.36
717 0.37
718 0.39
719 0.41
720 0.39
721 0.39
722 0.4
723 0.45
724 0.43
725 0.43
726 0.42
727 0.41
728 0.42
729 0.43
730 0.39
731 0.35
732 0.36
733 0.38
734 0.38
735 0.37
736 0.41
737 0.45
738 0.47
739 0.47
740 0.47
741 0.44
742 0.45
743 0.48
744 0.41
745 0.35
746 0.32
747 0.3
748 0.25
749 0.25
750 0.27
751 0.24
752 0.26
753 0.28
754 0.28
755 0.27
756 0.27
757 0.25
758 0.21
759 0.18
760 0.17
761 0.19
762 0.23
763 0.27
764 0.29
765 0.32
766 0.38
767 0.45
768 0.51
769 0.52
770 0.49
771 0.48
772 0.46
773 0.49
774 0.43
775 0.36
776 0.3
777 0.29
778 0.31
779 0.31
780 0.32
781 0.31
782 0.33
783 0.41
784 0.49
785 0.54
786 0.59
787 0.65
788 0.72
789 0.73
790 0.77
791 0.76
792 0.78
793 0.76
794 0.76
795 0.73
796 0.72
797 0.74
798 0.73
799 0.71
800 0.65
801 0.57
802 0.48
803 0.43
804 0.34
805 0.26
806 0.2
807 0.14
808 0.11
809 0.11
810 0.1
811 0.11
812 0.11
813 0.11
814 0.1
815 0.11
816 0.15
817 0.18
818 0.23
819 0.27
820 0.35
821 0.37
822 0.39
823 0.45
824 0.46
825 0.49
826 0.49
827 0.49
828 0.46
829 0.55
830 0.59
831 0.54
832 0.58
833 0.58
834 0.58
835 0.55
836 0.54
837 0.5
838 0.5
839 0.57
840 0.51
841 0.48
842 0.49
843 0.52
844 0.51
845 0.5
846 0.47
847 0.41
848 0.42
849 0.48
850 0.52
851 0.52
852 0.5
853 0.5
854 0.51
855 0.54
856 0.53
857 0.45
858 0.44
859 0.42
860 0.42
861 0.38
862 0.35
863 0.32
864 0.33
865 0.32
866 0.24
867 0.21
868 0.21
869 0.22
870 0.21
871 0.19
872 0.16
873 0.14
874 0.15
875 0.19
876 0.2
877 0.23
878 0.27
879 0.32
880 0.38
881 0.4
882 0.4
883 0.44
884 0.5
885 0.56
886 0.57
887 0.57
888 0.6
889 0.59
890 0.57
891 0.49
892 0.46
893 0.44
894 0.44
895 0.42
896 0.4
897 0.44
898 0.46
899 0.46
900 0.41
901 0.36
902 0.33
903 0.32